seq1 = pF1KA0987.tfa, 3261 bp
seq2 = pF1KA0987/gi568815580r_5294686.tfa (gi568815580r:5294686_5589183), 294498 bp

>pF1KA0987 3261
>gi568815580r:5294686_5589183 (Chr18)

(complement)

1-183  (100001-100183)   100% ->
184-381  (110746-110943)   100% ->
382-486  (143940-144044)   100% ->
487-529  (145304-145346)   100% ->
530-605  (151074-151149)   100% ->
606-824  (155063-155281)   100% ->
825-912  (155628-155715)   100% ->
913-1065  (160719-160871)   100% ->
1066-1163  (164825-164922)   100% ->
1164-1339  (165631-165806)   100% ->
1340-1506  (169307-169473)   100% ->
1507-2067  (172806-173366)   100% ->
2068-2121  (178565-178618)   98% ->
2122-2157  (181448-181483)   100% ->
2158-2349  (182216-182407)   100% ->
2350-2472  (191041-191163)   100% ->
2473-2841  (191758-192126)   100% ->
2842-2973  (192852-192983)   100% ->
2974-3072  (193477-193575)   100% ->
3073-3153  (194037-194117)   100% ->
3154-3261  (194391-194498)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACGACCGAATCTGGATCAGACTCGGAATCCAAGCCGGACCAGGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACGACCGAATCTGGATCAGACTCGGAATCCAAGCCGGACCAGGAGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGAGCCCCAGGAGGCGGCGGGGGCGCAGGGGCGCGCGGGGGCGCCCGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGAGCCCCAGGAGGCGGCGGGGGCGCAGGGGCGCGCGGGGGCGCCCGTGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGGAGCCGCCCAAGGAGGAGCAGCAGCAGGCCCTGGAGCAGTTCGCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGGAGCCGCCCAAGGAGGAGCAGCAGCAGGCCCTGGAGCAGTTCGCCGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCTGCAGCGCACAGCACCCCGGTGCGGAGGGAG         GTCACTGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 100151 GCTGCAGCGCACAGCACCCCGGTGCGGAGGGAGGTG...CAGGTCACTGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CAAGGAACAGGAGTTTGCTGCCAGGGCTGCAAAACAGCTCGAATATCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110754 CAAGGAACAGGAGTTTGCTGCCAGGGCTGCAAAACAGCTCGAATATCAGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AATTAGAAGACGATAAACTTTCTCAGAAATCATCTAGCAGTAAACTCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110804 AATTAGAAGACGATAAACTTTCTCAGAAATCATCTAGCAGTAAACTCTCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CGGTCTCCATTAAAGATTGTCAAAAAGCCTAAAAGCATGCAGTGCAAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110854 CGGTCTCCATTAAAGATTGTCAAAAAGCCTAAAAGCATGCAGTGCAAAGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GATACTTCTCGATGGATCAGAATATACCTGTGATGTAGAG         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 110904 GATACTTCTCGATGGATCAGAATATACCTGTGATGTAGAGGTA...TAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AACGCTCCAGAGGACAAGTGCTGTTTGATAAAGTGTGTGAACACTTGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143941 AACGCTCCAGAGGACAAGTGCTGTTTGATAAAGTGTGTGAACACTTGAAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TTGCTAGAGAAAGACTACTTTGGGCTTACGTATCGAGATGCTGAAAACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143991 TTGCTAGAGAAAGACTACTTTGGGCTTACGTATCGAGATGCTGAAAACCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GAAG         AATTGGTTGGACCCTGCTAAGGAAATAAAAAAACAGG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144041 GAAGGTG...CAGAATTGGTTGGACCCTGCTAAGGAAATAAAAAAACAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TTCGAA         GTGGTGCTTGGCACTTTTCATTTAATGTGAAATTT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145341 TTCGAAGTA...CAGGTGGTGCTTGGCACTTTTCATTTAATGTGAAATTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 TATCCACCAGACCCTGCCCAACTATCTGAAGATATCACCAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 151109 TATCCACCAGACCCTGCCCAACTATCTGAAGATATCACCAGGTA...AAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GTACTACCTCTGCTTGCAGTTGCGAGATGACATCGTGTCCGGAAGGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155063 GTACTACCTCTGCTTGCAGTTGCGAGATGACATCGTGTCCGGAAGGCTGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 CCTGCTCCTTTGTTACCCTGGCCTTGCTGGGCTCCTACACTGTCCAGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155113 CCTGCTCCTTTGTTACCCTGGCCTTGCTGGGCTCCTACACTGTCCAGTCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GAGCTCGGAGACTATGACCCAGATGAATGTGGGAGCGATTACATTAGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155163 GAGCTCGGAGACTATGACCCAGATGAATGTGGGAGCGATTACATTAGTGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 GTTCCGCTTTGCACCAAACCACACTAAAGAACTGGAAGACAAAGTGATCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155213 GTTCCGCTTTGCACCAAACCACACTAAAGAACTGGAAGACAAAGTGATCG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 AGCTGCACAAGAGCCACAG         AGGAATGACGCCAGCAGAAGCA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 155263 AGCTGCACAAGAGCCACAGGTT...CAGAGGAATGACGCCAGCAGAAGCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GAGATGCATTTCTTGGAAAATGCCAAAAAATTATCAATGTATGGGGTAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155650 GAGATGCATTTCTTGGAAAATGCCAAAAAATTATCAATGTATGGGGTAGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 TTTACATCATGCTAAG         GACTCAGAAGGGGTAGAAATTATGT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 155700 TTTACATCATGCTAAGGTA...CAGGACTCAGAAGGGGTAGAAATTATGT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 TAGGAGTTTGTGCAAGTGGTCTGTTGATATATCGCGACCGGCTGCGAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160744 TAGGAGTTTGTGCAAGTGGTCTGTTGATATATCGCGACCGGCTGCGAATA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 AACAGATTTGCCTGGCCCAAGGTTCTAAAGATTTCATACAAACGGAACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160794 AACAGATTTGCCTGGCCCAAGGTTCTAAAGATTTCATACAAACGGAACAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 CTTTTACATTAAGATCCGGCCGGGAGAG         TTTGAACAATTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 160844 CTTTTACATTAAGATCCGGCCGGGAGAGGTA...TAGTTTGAACAATTTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 AAAGCACCATTGGGTTTAAGCTGCCAAACCATCGAGCTGCCAAGCGTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164838 AAAGCACCATTGGGTTTAAGCTGCCAAACCATCGAGCTGCCAAGCGTTTA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 TGGAAAGTATGTGTTGAGCATCATACATTTTTCAG         ACTACT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 164888 TGGAAAGTATGTGTTGAGCATCATACATTTTTCAGGTA...TAGACTACT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 GTTACCAGAAGCACCTCCCAAGAAATTCCTAACCTTGGGTTCCAAGTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165637 GTTACCAGAAGCACCTCCCAAGAAATTCCTAACCTTGGGTTCCAAGTTTC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 GTTATAGTGGCAGGACACAAGCGCAAACGAGAAGAGCCAGTGCGTTGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165687 GTTATAGTGGCAGGACACAAGCGCAAACGAGAAGAGCCAGTGCGTTGATA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 GATCGCCCAGCACCTTACTTTGAACGCTCATCCAGCAAACGTTATACCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165737 GATCGCCCAGCACCTTACTTTGAACGCTCATCCAGCAAACGTTATACCAT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 GTCTCGCAGCTTGGATGGAG         AGGTTGGTACTGGCCAGTACG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 165787 GTCTCGCAGCTTGGATGGAGGTA...CAGAGGTTGGTACTGGCCAGTACG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 CCACAACAAAAGGCATCTCTCAGACCAACTTGATCACCACTGTGACTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169328 CCACAACAAAAGGCATCTCTCAGACCAACTTGATCACCACTGTGACTCCG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 GAGAAGAAGGCTGAGGAGGAGCGGGACGAGGAAGAGGACAAACGGAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169378 GAGAAGAAGGCTGAGGAGGAGCGGGACGAGGAAGAGGACAAACGGAGGAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 GGGGGAAGAAGTCACGCCCATCTCGGCCATCCGGCACGAGGGAAAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 169428 GGGGGAAGAAGTCACGCCCATCTCGGCCATCCGGCACGAGGGAAAGGTA.

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1507      TCACCTGGGCTTGGCACTGACTCATGTCCCTTGTCACCCCCATCC
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169478 ..CAGTCACCTGGGCTTGGCACTGACTCATGTCCCTTGTCACCCCCATCC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 ACCCATTGTGCCCCCACATCTCCCACAGAGCTCCGTAGGAGGTGTAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172851 ACCCATTGTGCCCCCACATCTCCCACAGAGCTCCGTAGGAGGTGTAAGGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 GAATGACTGCAAACTGCCAGGTTATGAGCCGTCCAGAGCTGAGCACCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172901 GAATGACTGCAAACTGCCAGGTTATGAGCCGTCCAGAGCTGAGCACCTGC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1652 CTGGAGAGCCCGCCTTGGACTCTGATGGCCCAGGGAGGCCTTACCTAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172951 CTGGAGAGCCCGCCTTGGACTCTGATGGCCCAGGGAGGCCTTACCTAGGG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1702 GATCAAGATGTGGCTTTTAGCTACAGACAGCAAACTGGCAAGGGGACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173001 GATCAAGATGTGGCTTTTAGCTACAGACAGCAAACTGGCAAGGGGACCAC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1752 CCTGTTCTCCTTCTCCTTGCAGCTCCCTGAGTCATTCCCCTCCCTCCTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173051 CCTGTTCTCCTTCTCCTTGCAGCTCCCTGAGTCATTCCCCTCCCTCCTAG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1802 ATGATGATGGATACCTCTCTTTCCCCAACCTTTCTGAAACCAACCTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173101 ATGATGATGGATACCTCTCTTTCCCCAACCTTTCTGAAACCAACCTCCTG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1852 CCCCAGAGCTTGCAGCATTACCTCCCGATCCGCTCACCGTCCCTTGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173151 CCCCAGAGCTTGCAGCATTACCTCCCGATCCGCTCACCGTCCCTTGTGCC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1902 CTGTTTCCTCTTCATCTTTTTCTTTCTGCTGTCTGCCTCCTTCTCAGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173201 CTGTTTCCTCTTCATCTTTTTCTTTCTGCTGTCTGCCTCCTTCTCAGTGC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1952 CATACGCTCTCACTCTCTCCTTCCCTCTGGCTCTGTGCCTCTGCTACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173251 CATACGCTCTCACTCTCTCCTTCCCTCTGGCTCTGTGCCTCTGCTACCTG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2002 GAGCCCAAGGCGGCCTCCTTGAGCGCCTCCCTAGACAATGACCCGAGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173301 GAGCCCAAGGCGGCCTCCTTGAGCGCCTCCCTAGACAATGACCCGAGTGA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2052 CAGTTCAGAGGAAGAG         ACTGACAGTGAGCGCACGGACACCG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 173351 CAGTTCAGAGGAAGAGGTG...CAGACTGACAGTGAGCGCACGGACACCG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2093 CAGCCGACGGGGAGACCACCGCCACTGAG         TCGGACCAGGAG
        ||||||||||||||||||| |||||||||>>>...>>>||||||||||||
 178590 CAGCCGACGGGGAGACCACTGCCACTGAGGTT...CAGTCGGACCAGGAG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2134 GAAGATGCAGAGCTCAAGGCACAG         GAGCTAGAAAAAACTCA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 181460 GAAGATGCAGAGCTCAAGGCACAGGTA...TAGGAGCTAGAAAAAACTCA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2175 AGATGACCTGATGAAACATCAAACCAACATTAGCGAGCTGAAAAGAACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182233 AGATGACCTGATGAAACATCAAACCAACATTAGCGAGCTGAAAAGAACCT

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2225 TCTTAGAAACCTCAACAGACACTGCCGTAACGAATGAATGGGAGAAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182283 TCTTAGAAACCTCAACAGACACTGCCGTAACGAATGAATGGGAGAAGAGG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2275 CTTTCCACCTCCCCCGTGCGACTGGCCGCCAGGCAGGAGGATGCCCCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182333 CTTTCCACCTCCCCCGTGCGACTGGCCGCCAGGCAGGAGGATGCCCCCAT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2325 GATCGAACCACTTGTCCCTGAAGAG         ACTAAGCAGTCTTCTG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 182383 GATCGAACCACTTGTCCCTGAAGAGGTC...CAGACTAAGCAGTCTTCTG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2366 GGGAAAAGCTCATGGATGGCTCTGAAATCTTCAGTTTATTAGAGTCTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191057 GGGAAAAGCTCATGGATGGCTCTGAAATCTTCAGTTTATTAGAGTCTGCG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2416 CGAAAACCAACAGAATTCATAGGAGGGGTTACTTCTACTTCTCAAAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191107 CGAAAACCAACAGAATTCATAGGAGGGGTTACTTCTACTTCTCAAAGCTG

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2466 GGTTCAG         AAAATGGAAACCAAGACGGAGTCCAGTGGAATAG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191157 GGTTCAGGTG...CAGAAAATGGAAACCAAGACGGAGTCCAGTGGAATAG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2507 AGACGGAACCCACCGTGCACCACCTGCCGCTTAGCACTGAGAAGGTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191792 AGACGGAACCCACCGTGCACCACCTGCCGCTTAGCACTGAGAAGGTGGTG

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2557 CAGGAGACCGTGTTGGTGGAGGAGCGGCGTGTGGTGCACGCGAGTGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191842 CAGGAGACCGTGTTGGTGGAGGAGCGGCGTGTGGTGCACGCGAGTGGGGA

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2607 TGCTTCTTACTCGGCGGGAGACAGCGGGGATGCTGCAGCACAGCCCGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191892 TGCTTCTTACTCGGCGGGAGACAGCGGGGATGCTGCAGCACAGCCCGCAT

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2657 TCACAGGCATTAAAGGGAAAGAGGGCTCTGCCTTGACGGAGGGGGCTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191942 TCACAGGCATTAAAGGGAAAGAGGGCTCTGCCTTGACGGAGGGGGCTAAA

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2707 GAGGAAGGAGGGGAGGAGGTCGCTAAAGCTGTCCTGGAACAGGAAGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191992 GAGGAAGGAGGGGAGGAGGTCGCTAAAGCTGTCCTGGAACAGGAAGAGAC

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2757 AGCCGCTGCTTCCCGTGAGCGACAAGAGGAGCAGAGTGCAGCCATCCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 192042 AGCCGCTGCTTCCCGTGAGCGACAAGAGGAGCAGAGTGCAGCCATCCACA

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2807 TTTCAGAAACTTTGGAACAAAAACCTCATTTTGAG         TCCTCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 192092 TTTCAGAAACTTTGGAACAAAAACCTCATTTTGAGGTA...CAGTCCTCA

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2848 ACGGTGAAGACGGAAACCATCAGTTTTGGCAGTGTTTCACCGGGAGGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 192858 ACGGTGAAGACGGAAACCATCAGTTTTGGCAGTGTTTCACCGGGAGGAGT

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2898 AAAGCTAGAAATTTCCACGAAGGAAGTGCCAGTAGTTCACACCGAAACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 192908 AAAGCTAGAAATTTCCACGAAGGAAGTGCCAGTAGTTCACACCGAAACCA

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2948 AAACCATCACATATGAATCATCACAG         GTCGATCCAGGCACA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 192958 AAACCATCACATATGAATCATCACAGGTG...TAGGTCGATCCAGGCACA

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2989 GATCTGGAGCCAGGCGTGCTGATGAGTGCACAGACGATCACATCTGAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193492 GATCTGGAGCCAGGCGTGCTGATGAGTGCACAGACGATCACATCTGAAAC

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3039 CACCAGTACCACCACCACTACGCACATCACCAAA         ACTGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 193542 CACCAGTACCACCACCACTACGCACATCACCAAAGTA...CAGACTGTGA

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3080 AAGGGGGCATTTCAGAGACAAGAATTGAGAAGCGAATAGTCATCACGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 194044 AAGGGGGCATTTCAGAGACAAGAATTGAGAAGCGAATAGTCATCACGGGG

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3130 GATGCAGACATTGACCATGACCAG         GCGCTGGCTCAGGCAAT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 194094 GATGCAGACATTGACCATGACCAGGTA...TAGGCGCTGGCTCAGGCAAT

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3171 TAAAGAGGCCAAAGAGCAGCACCCTGACATGTCAGTGACCAAAGTAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 194408 TAAAGAGGCCAAAGAGCAGCACCCTGACATGTCAGTGACCAAAGTAGTGG

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :
   3221 TCCATAAAGAGACAGAGATCACACCAGAAGATGGAGAGGAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 194458 TCCATAAAGAGACAGAGATCACACCAGAAGATGGAGAGGAT