Result of SIM4 for
pF1KA0954
seq1 = pF1KA0954.tfa, 3453 bp
seq2 = pF1KA0954/gi568815587f_61652745.tfa (gi568815587f:61652745_61886140), 233396 bp
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>gi568815587f:61652745_61886140 (Chr11)
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3376-3453 (133319-133396) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGGAGGTGGTGGACGAGACGGAGGCGCTGCAGCGCTTCTTCGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
100001 ATGGAGGTGGTGGACGAGACGGAGGCGCTGCAGCGCTTCTTCGAAGGTG.
50 . : . : . : . : . :
47 GCCACGACATCAACGGTGCCCTGGAGCCCTCCAACATAGACACCA
..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 ..CAGGCCACGACATCAACGGTGCCCTGGAGCCCTCCAACATAGACACCA
100 . : . : . : . : . :
92 GCATCCTGGAGGAGTACATCAGCAAGGAGGATGCCTCCGACCT
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
112926 GCATCCTGGAGGAGTACATCAGCAAGGAGGATGCCTCCGACCTGTG...C
150 . : . : . : . : . :
135 CTGCTTCCCTGACATCTCTGCTCCAGCCAGCTCGGCCTCCTACTCCCA
>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
113212 AGCTGCTTCCCTGACATCTCTGCTCCAGCCAGCTCGGCCTCCTACTCCCA
200 . : . : . : . : . :
183 CGGGCAGCCTGCGATGCCTGGCTCCAGCGGGGTCCACCACCTGAGCCCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
113262 CGGGCAGCCTGCGATGCCTGGCTCCAGCGGGGTCCACCACCTGAGCCCCC
250 . : . : . : . : . :
233 CTGGGGGTGGACCCTCCCCGGGGCGCCATGGTCCCCTCCCACCCCCGGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
113312 CTGGGGGTGGACCCTCCCCGGGGCGCCATGGTCCCCTCCCACCCCCGGGC
300 . : . : . : . : . :
283 TACGGCACCCCGCTGAACTGCAACAACAACAACGGCATGGGCGCTGCCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
113362 TACGGCACCCCGCTGAACTGCAACAACAACAACGGCATGGGCGCTGCCCC
350 . : . : . : . : . :
333 CAAGCCCTTCCCGGGGGGCACCGGGCCCCCCATCAAGGCTGAGCCCAAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
113412 CAAGCCCTTCCCGGGGGGCACCGGGCCCCCCATCAAGGCTGAGCCCAAGG
400 . : . : . : . : . :
383 CTCCCTATGCCCCAGG CACACTGCCGGACTCTCCCCCAGAC
||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
113462 CTCCCTATGCCCCAGGGTG...CAGCACACTGCCGGACTCTCCCCCAGAC
450 . : . : . : . : . :
424 TCGGGCTCCGAGGCCTACTCCCCCCAGCAGGTGAATG AGCC
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
116541 TCGGGCTCCGAGGCCTACTCCCCCCAGCAGGTGAATGGTG...CAGAGCC
500 . : . : . : . : . :
465 CCACCTCCTGCGCACGATAACCCCTGAGACACTGTGCCACGTGGGAGTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
117506 CCACCTCCTGCGCACGATAACCCCTGAGACACTGTGCCACGTGGGAGTGC
550 . : . : . : . : . :
515 CCTCCCGCCTGGAGCATCCGCCCCCACCTCCAGCCCACTTGCCAGGCCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
117556 CCTCCCGCCTGGAGCATCCGCCCCCACCTCCAGCCCACTTGCCAGGCCCC
600 . : . : . : . : . :
565 CCGCCACCCCCACCACCCCCACCTCACTACCCTGTCCTGCAGCGGGATCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
117606 CCGCCACCCCCACCACCCCCACCTCACTACCCTGTCCTGCAGCGGGATCT
650 . : . : . : . : . :
615 GTACATGAAGGCCGAGCCCCCGATCCCCCACTACGCTGCCATGGGGCAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
117656 GTACATGAAGGCCGAGCCCCCGATCCCCCACTACGCTGCCATGGGGCAGG
700 . : . : . : . : . :
665 GGCTGGTGCCCACTGATCTTCACCACACCCAGCAGTCCCAGATGCTGCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
117706 GGCTGGTGCCCACTGATCTTCACCACACCCAGCAGTCCCAGATGCTGCAC
750 . : . : . : . : . :
715 CAGCTCCTGCAGCAGCACGGAGCTGA GCTCCCTACACACCC
||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
117756 CAGCTCCTGCAGCAGCACGGAGCTGAGTA...CAGGCTCCCTACACACCC
800 . : . : . : . : . :
756 CTCCAAGAAGAGGAAGCACTCTGAATCCCCCCCCAGCACCCTCAATGCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118771 CTCCAAGAAGAGGAAGCACTCTGAATCCCCCCCCAGCACCCTCAATGCCC
850 . : . : . : . : . :
806 AGATGCTGAATGGAATGATCAAACAGGAGCCTGGGACCGTGACAGCCCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118821 AGATGCTGAATGGAATGATCAAACAGGAGCCTGGGACCGTGACAGCCCTG
900 . : . : . : . : . :
856 CCTCTGCACCCCACTCGAGCCCCATCGCCACCCTGGCCTCCCCAGGGTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118871 CCTCTGCACCCCACTCGAGCCCCATCGCCACCCTGGCCTCCCCAGGGTCC
950 . : . : . : . : . :
906 GCTCTCCCCGGGCCCTGGTTCCTTGCCTCTCAGCATTGCCCGTGTCCAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118921 GCTCTCCCCGGGCCCTGGTTCCTTGCCTCTCAGCATTGCCCGTGTCCAGA
1000 . : . : . : . : . :
956 CACCGCCTTGGCACCCGCCAGGTGCCCCCTCCCCAG GCCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
118971 CACCGCCTTGGCACCCGCCAGGTGCCCCCTCCCCAGGTA...CAGGCCTC
1050 . : . : . : . : . :
997 CTGCAGGACAGTGACAGCCTCAGTGGCTCCTACCTGGACCCCAACTACCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
119090 CTGCAGGACAGTGACAGCCTCAGTGGCTCCTACCTGGACCCCAACTACCA
1100 . : . : . : . : . :
1047 GTCCATCAAGTGGCAGCCTCATCAGCAGAACAAGTGGGCAACCCTGTACG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
119140 GTCCATCAAGTGGCAGCCTCATCAGCAGAACAAGTGGGCGACCCTGTACG
1150 . : . : . : . : . :
1097 ATGCTAACTACAAGGAGCT GCCCATGCTCACCTACCGCGTG
|||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
119190 ATGCTAACTACAAGGAGCTGTG...CAGGCCCATGCTCACCTACCGCGTG
1200 . : . : . : . : . :
1138 GATGCGGACAAGGGCTTCAACTTTTCGGTGGGCGACGACGCCTTTGTGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121245 GATGCGGACAAGGGCTTCAACTTTTCGGTGGGCGACGACGCCTTTGTGTG
1250 . : . : . : . : . :
1188 CCAGAAGAAGAACCACTTCCAGGTGACAGTGTACATCGGCATGCTGGGCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121295 CCAGAAGAAGAACCACTTCCAGGTGACAGTGTACATCGGCATGCTGGGCG
1300 . : . : . : . : . :
1238 AGCCCAAGTACGTCAAGACGCCCGAGGGCCTCAAGCCCCTCGACTGCTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121345 AGCCCAAGTACGTCAAGACGCCCGAGGGCCTCAAGCCCCTCGACTGCTTC
1350 . : . : . : . : . :
1288 TATCTGAAGCTGCACGGAGTGAAG CTGGAGGCCCTGAACCA
||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
121395 TATCTGAAGCTGCACGGAGTGAAGGCA...CAGCTGGAGGCCCTGAACCA
1400 . : . : . : . : . :
1329 GTCCATTAACATCGAGCAGTCCCAGTCAGACCGGAGCAAGCGGCCCTTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123329 GTCCATTAACATCGAGCAGTCCCAGTCAGACCGGAGCAAGCGGCCCTTCA
1450 . : . : . : . : . :
1379 ACCCGGTCAC GGTCAATCTGCCCCCTGAGCAGGTCACGAAG
||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
123379 ACCCGGTCACGTG...CAGGGTCAATCTGCCCCCTGAGCAGGTCACGAAG
1500 . : . : . : . : . :
1420 GTGACTGTGGGGCGGCTGCACTTCAGCGAGACCACCGCTAACAACATGCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123609 GTGACTGTGGGGCGGCTGCACTTCAGCGAGACCACCGCTAACAACATGCG
1550 . : . : . : . : . :
1470 TAAGAAGGGCAAGCCCAACCCGGACCAGAG GTACTTCATGC
||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
123659 TAAGAAGGGCAAGCCCAACCCGGACCAGAGGTG...CAGGTACTTCATGC
1600 . : . : . : . : . :
1511 TGGTGGTGGCCCTCCAGGCTCATGCACAGAACCAGAACTACACGCTGGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
124054 TGGTGGTGGCCCTCCAGGCTCATGCACAGAACCAGAACTACACGCTGGCC
1650 . : . : . : . : . :
1561 GCCCAGATCTCAGAGCGCATCATTGTGCGG GCCTCCAACCC
||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
124104 GCCCAGATCTCAGAGCGCATCATTGTGCGGGTG...TAGGCCTCCAACCC
1700 . : . : . : . : . :
1602 AGGCCAGTTCGAGAGCGACAGCGATGTGTTGTGGCAGCGGGCACAGGTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
124531 AGGCCAGTTCGAGAGCGACAGCGATGTGTTGTGGCAGCGGGCACAGGTGC
1750 . : . : . : . : . :
1652 CCGACACCGTCTTCCACCACGGCCGCGTGGGCATCAACACAGACCGGCCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
124581 CCGACACCGTCTTCCACCACGGCCGCGTGGGCATCAACACAGACCGGCCG
1800 . : . : . : . : . :
1702 GATGAGGCGCTGGTTGTGCACGGGAATGTCAAGGTCATGGGCTCGCTTAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
124631 GATGAGGCGCTGGTTGTGCACGGGAATGTCAAGGTCATGGGCTCGCTTAT
1850 . : . : . : . : . :
1752 GCACCCCTCCGACCTGCGCGCCAAGGAACACGTGCAGGAG G
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
124681 GCACCCCTCCGACCTGCGCGCCAAGGAACACGTGCAGGAGGTG...CAGG
1900 . : . : . : . : . :
1793 TGGACACCACCGAGCAATTGAAGAGGATCTCGCGCATGCGGCTGGTGCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
124991 TGGACACCACCGAGCAATTGAAGAGGATCTCGCGCATGCGGCTGGTGCAC
1950 . : . : . : . : . :
1843 TACAGATACAAGCCCGAGTTCGCCGCCAGCGCGGGCATCGAGGCCACCGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
125041 TACAGATACAAGCCCGAGTTCGCCGCCAGCGCGGGCATCGAGGCCACCGC
2000 . : . : . : . : . :
1893 GCCAGAGACAG GTGTCATCGCTCAGGAGGTGAAGGAGATCT
|||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
125091 GCCAGAGACAGGTA...CAGGTGTCATCGCTCAGGAGGTGAAGGAGATCT
2050 . : . : . : . : . :
1934 TGCCTGAGGCTGTGAAAGACACCGGAGACATGGTCTTTGCCAATGGGAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
125666 TGCCTGAGGCTGTGAAAGACACCGGAGACATGGTCTTTGCCAATGGGAAA
2100 . : . : . : . : . :
1984 ACCATAGAGAACTTCCTGGTGGTGAACAAG GAGCGCATCTT
||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
125716 ACCATAGAGAACTTCCTGGTGGTGAACAAGGTC...CAGGAGCGCATCTT
2150 . : . : . : . : . :
2025 CATGGAGAACGTAGGGGCCGTGAAGGAGCTGTGCAAGCTGACAGACAACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
126530 CATGGAGAACGTAGGGGCCGTGAAGGAGCTGTGCAAGCTGACAGACAACC
2200 . : . : . : . : . :
2075 TGGAGACGCGCATTGATGAGCTGGAGCGCTGGAGCCACAAGCTGGCCAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
126580 TGGAGACGCGCATTGATGAGCTGGAGCGCTGGAGCCACAAGCTGGCCAAG
2250 . : . : . : . : . :
2125 CTGCGGCGGCTCGACAGCCTCAAGTCCACCGGCAGCTCGGGCGCCTTCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
126630 CTGCGGCGGCTCGACAGCCTCAAGTCCACCGGCAGCTCGGGCGCCTTCAG
2300 . : . : . : . : . :
2175 CCATGCAGGGAGCCAGTTCAGTCGGGCGGGCAGCGTCCCCC
>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
126680 GTA...CAGCCATGCAGGGAGCCAGTTCAGTCGGGCGGGCAGCGTCCCCC
2350 . : . : . : . : . :
2216 ACAAGAAGAGGCCCCCCAAGGTGGCCAGCAAG TCATCGTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
126795 ACAAGAAGAGGCCCCCCAAGGTGGCCAGCAAGGTA...CAGTCATCGTCC
2400 . : . : . : . : . :
2257 GTGGTTCCGGACCAGGCCTGCATCAGCCAGCGCTTCCTGCAGGGAACCAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
127107 GTGGTTCCGGACCAGGCCTGCATCAGCCAGCGCTTCCTGCAGGGAACCAT
2450 . : . : . : . : . :
2307 CATTGCCCTGGTGGTGGTCATGGCCTTCAG CGTGGTGTCCA
||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
127157 CATTGCCCTGGTGGTGGTCATGGCCTTCAGGTG...CAGCGTGGTGTCCA
2500 . : . : . : . : . :
2348 TGTCCACACTGTACGTGCTGAGCCTGCGCACAGAGGAGGACCTGGTAGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
127489 TGTCCACACTGTACGTGCTGAGCCTGCGCACAGAGGAGGACCTGGTAGAC
2550 . : . : . : . : . :
2398 ACTGATGG CTCTTTTGCCGTGTCCACTTCCTGTCTCCTGGC
||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
127539 ACTGATGGGTA...TAGCTCTTTTGCCGTGTCCACTTCCTGTCTCCTGGC
2600 . : . : . : . : . :
2439 CCTGCTCCGGCCCCAGCCCCCTGGGGGGAGTGAGGCCTTGTGCCCATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
128001 CCTGCTCCGGCCCCAGCCCCCTGGGGGGAGTGAGGCCTTGTGCCCATGGT
2650 . : . : . : . : . :
2487 GTCCAGCCAGAGCTTTGGGACCACGCAGCTCCGACAGTCCCCC
>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
128051 A...CAGGTCCAGCCAGAGCTTTGGGACCACGCAGCTCCGACAGTCCCCC
2700 . : . : . : . : . :
2530 TTGACCACGGGGCTACCAGGCATACAGCCCTCTTTGCTGCTGG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
128259 TTGACCACGGGGCTACCAGGCATACAGCCCTCTTTGCTGCTGGGTG...C
2750 . : . : . : . : . :
2573 TGACCACCAGCCTCACCAGCTCGGCCCCAGGTTCTGCTGTCCGCACCT
>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
128392 AGTGACCACCAGCCTCACCAGCTCGGCCCCAGGTTCTGCTGTCCGCACCT
2800 . : . : . : . : . :
2621 TGGACATGTGTTCCAGCCACCCCTGCCCTGTCATCTGCTGTTCCTCACCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
128442 TGGACATGTGTTCCAGCCACCCCTGCCCTGTCATCTGCTGTTCCTCACCC
2850 . : . : . : . : . :
2671 ACTACCAACCCTACCACTGGTCCTAGTCTTGGCCCCAGCTTTAACCCTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
128492 ACTACCAACCCTACCACTGGTCCTAGTCTTGGCCCCAGCTTTAACCCTGG
2900 . : . : . : . : . :
2721 CCATGTTCTCAGCCCAAGTCCCAGCCCCAGCACCAACCGCTCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
128542 CCATGTTCTCAGCCCAAGTCCCAGCCCCAGCACCAACCGCTCAGGTA...
2950 . : . : . : . : . :
2765 GCCCCAGCCAGATGGCCCTTCTGCCAGTCACCAACATCAGAGCCAAG
>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
128826 CAGGCCCCAGCCAGATGGCCCTTCTGCCAGTCACCAACATCAGAGCCAAG
3000 . : . : . : . : . :
2812 TCCTGGGGTCTTTCAGTCAATGGCATTGGCCACTCCAAGCATCACAAGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
128876 TCCTGGGGTCTTTCAGTCAATGGCATTGGCCACTCCAAGCATCACAAGAG
3050 . : . : . : . : . :
2862 TCTGGAGCCTCTGGCCAGCCCTGCAGTCCCCTTCCCTGGGGGGCAGGGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
128926 TCTGGAGCCTCTGGCCAGCCCTGCAGTCCCCTTCCCTGGGGGGCAGGGCA
3100 . : . : . : . : . :
2912 AAGCCAAGAACAGTCCCAGCCTTGGTTTCCATGGCCGGGCCCGCCGAGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
128976 AAGCCAAGAACAGTCCCAGCCTTGGTTTCCATGGCCGGGCCCGCCGAGGG
3150 . : . : . : . : . :
2962 GCCCTCCAGTCCAGCGTGGGCCCTGCTGAGCCCACCTGGGCCCAGGGCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
129026 GCCCTCCAGTCCAGCGTGGGCCCTGCTGAGCCCACCTGGGCCCAGGGCCA
3200 . : . : . : . : . :
3012 GTCAG CCTCTCTCCTTGCAGAGCCAGTGCCCTCCCTGACCT
|||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
129076 GTCAGGTA...CAGCCTCTCTCCTTGCAGAGCCAGTGCCCTCCCTGACCT
3250 . : . : . : . : . :
3053 CCATCCAGGTGCTGGAGAATTCGATGTCCATCACCTCCCAGTACTGTGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
130790 CCATCCAGGTGCTGGAGAATTCGATGTCCATCACCTCCCAGTACTGTGCT
3300 . : . : . : . : . :
3103 CCAGGGGATGCCTGCAG GCCTGGGAACTTCACCTACCACAT
|||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
130840 CCAGGGGATGCCTGCAGGTG...CAGGCCTGGGAACTTCACCTACCACAT
3350 . : . : . : . : . :
3144 CCCTGTCAGTAGTGGCACCCCACTGCACCTCAGCCTGACTCTGCAGATGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
131131 CCCTGTCAGTAGTGGCACCCCACTGCACCTCAGCCTGACTCTGCAGATGA
3400 . : . : . : . : . :
3194 A CTCCTCCTCCCCCGTGTCTGTGGTGCTGTGCAGCCTGAGG
|>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
131181 AGTG...CAGCTCCTCCTCCCCCGTGTCTGTGGTGCTGTGCAGCCTGAGG
3450 . : . : . : . : . :
3235 TCAAAGGAGGAACCATGTGAGGAGGGGAGCCTTCCACAGAGTCTCCACAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
131576 TCAAAGGAGGAACCATGTGAGGAGGGGAGCCTTCCACAGAGTCTCCACAC
3500 . : . : . : . : . :
3285 CCACCAGGACACCCAG GGCACCTCTCACCGGTGGCCAATAA
||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
131626 CCACCAGGACACCCAGGTA...CAGGGCACCTCTCACCGGTGGCCAATAA
3550 . : . : . : . : . :
3326 CCATCCTGTCCTTCCGTGAATTCACCTACCACTTCCGGGTGGCACTGCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
133081 CCATCCTGTCCTTCCGTGAATTCACCTACCACTTCCGGGTGGCACTGCTG
3600 . : . : . : . : . :
3376 GGTCAGGCCAACTGCAGTTCAGAGGCTCTCGCCCAGCCAGC
>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
133131 GTG...CAGGGTCAGGCCAACTGCAGTTCAGAGGCTCTCGCCCAGCCAGC
3650 . : . : . : .
3417 CACAGACTACCACTTCCACTTCTACCGCCTGTGTGAC
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
133360 CACAGACTACCACTTCCACTTCTACCGCCTGTGTGAC