seq1 = pF1KA0919.tfa, 2016 bp
seq2 = pF1KA0919/gi568815596r_72365126.tfa (gi568815596r:72365126_72925910), 560785 bp

>pF1KA0919 2016
>gi568815596r:72365126_72925910 (Chr2)

(complement)

1-113  (100001-100113)   100% ->
114-279  (184442-184607)   100% ->
280-327  (192793-192840)   100% ->
328-418  (194666-194756)   100% ->
419-464  (194859-194904)   100% ->
465-669  (207604-207808)   100% ->
670-846  (350243-350419)   100% ->
847-915  (366390-366458)   100% ->
916-999  (410785-410868)   100% ->
1000-1046  (411231-411277)   100% ->
1047-1167  (412659-412779)   100% ->
1168-1239  (425939-426010)   100% ->
1240-1337  (427360-427457)   100% ->
1338-1443  (429352-429457)   100% ->
1444-1553  (430372-430481)   100% ->
1554-1665  (433482-433593)   100% ->
1666-1800  (445161-445295)   100% ->
1801-2016  (460572-460785)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGCGGGGTAAGATGGCGGAGGCGGAGAGCCTGGAGACAGCGGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGCGGGGTAAGATGGCGGAGGCGGAGAGCCTGGAGACAGCGGCAGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCACGAGCGGATCCTGCGAGAGATCGAGAGCACTGACACGGCCTGCATCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCACGAGCGGATCCTGCGAGAGATCGAGAGCACTGACACGGCCTGCATCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGCCCACGCTCAG         GTCTGTTTATGATGGTGAAGAACATGGA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGCCCACGCTCAGGTA...AAGGTCTGTTTATGATGGTGAAGAACATGGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CGTTTCATGGAGAAGCTTGAAACTCGTATCCGTAATCACGACCGAGAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 184470 CGTTTCATGGAGAAGCTTGAAACTCGTATCCGTAATCACGACCGAGAAAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGAGAAAATGTGCAACTTTCATTACCAGGGCTTTGTGGACTCTATAACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 184520 TGAGAAAATGTGCAACTTTCATTACCAGGGCTTTGTGGACTCTATAACTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AACTGCTGAAAGTGAGAGGAGAAGCCCAGAAACTCAAA         AAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 184570 AACTGCTGAAAGTGAGAGGAGAAGCCCAGAAACTCAAAGTA...CAGAAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CAAGTGACGGATACTAATAGAAAACTACAACATGAGGGAAAGGAA     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 192796 CAAGTGACGGATACTAATAGAAAACTACAACATGAGGGAAAGGAAGTA..

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    328     CTGGTAATAGCAATGGAAGAGCTGAAGCAGTGTCGACTACAACAGA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 192846 .AAGCTGGTAATAGCAATGGAAGAGCTGAAGCAGTGTCGACTACAACAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GAAATATTTCTGCCACTGTTGATAAATTAATGCTGTGTCTTCCAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 194712 GAAATATTTCTGCCACTGTTGATAAATTAATGCTGTGTCTTCCAGGTG..

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    419     TCCTAGAGATGTACAGCAAACTGAGGGACCAGATGAAAACTAAAAG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 194762 .AAGTCCTAGAGATGTACAGCAAACTGAGGGACCAGATGAAAACTAAAAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465          GCATTATCCTGCACTGAAAACTCTGGAACATCTAGAGCATA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 194905 GTA...TAGGCATTATCCTGCACTGAAAACTCTGGAACATCTAGAGCATA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 CCTACCTGCCTCAAGTAAGCCACTATCGATTCTGCAAGGTGATGGTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 207645 CCTACCTGCCTCAAGTAAGCCACTATCGATTCTGCAAGGTGATGGTGGAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 AACATCCCCAAGCTTCGAGAAGAAATAAAAGATGTTTCTATGTCCGATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 207695 AACATCCCCAAGCTTCGAGAAGAAATAAAAGATGTTTCTATGTCCGATCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 CAAAGACTTTCTGGAGAGCATCCGCAAACATTCAGACAAAATTGGAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 207745 CAAAGACTTTCTGGAGAGCATCCGCAAACATTCAGACAAAATTGGAGAGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 CTGCCATGAAGCAA         GCCCAGCAGCAAAGAAACCTGGATAAC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 207795 CTGCCATGAAGCAAGTA...TAGGCCCAGCAGCAAAGAAACCTGGATAAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 ATCGTCTTGCAACAACCCAGAATAGGTAGCAAGAGGAAATCTAAGAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 350270 ATCGTCTTGCAACAACCCAGAATAGGTAGCAAGAGGAAATCTAAGAAAGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 TGCATATATAATCTTTGATACAGAGATAGAAAGTACTAGTCCGAAGTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 350320 TGCATATATAATCTTTGATACAGAGATAGAAAGTACTAGTCCGAAGTCTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 AACAGGATTCAGGAATTCTGGATGTTGAAGACGAGGAAGATGATGAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 350370 AACAGGATTCAGGAATTCTGGATGTTGAAGACGAGGAAGATGATGAAGAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847          GTACCTGGGGCCCAAGATTTGGTGGATTTCTCTCCAGTTTA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 350420 GTA...CAGGTACCTGGGGCCCAAGATTTGGTGGATTTCTCTCCAGTTTA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 TCGATGTCTACATATATATTCTGTCCTG         GGTGCCCGGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 366431 TCGATGTCTACATATATATTCTGTCCTGGTG...CAGGGTGCCCGGGAAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 CATTTGAGAATTACTACCGAAAACAGAGGCGAAAACAGGCTCGTTTGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 410798 CATTTGAGAATTACTACCGAAAACAGAGGCGAAAACAGGCTCGTTTGGTA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 CTTCAACCTCCATCTAACATG         CATGAAACTTTAGATGGCTA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 410848 CTTCAACCTCCATCTAACATGGTA...CAGCATGAAACTTTAGATGGCTA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 CAGGAAGTATTTTAATCAAATTGTAGG         CTTTTTTGTGGTTG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 411251 CAGGAAGTATTTTAATCAAATTGTAGGGTA...TAGCTTTTTTGTGGTTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1061 AAGATCACATTTTACATACAACCCAGGGCTTAGTAAATAGAGCCTACATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 412673 AAGATCACATTTTACATACAACCCAGGGCTTAGTAAATAGAGCCTACATT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 GATGAACTGTGGGAAATGGCACTTTCAAAAACCATCGCAGCACTCCGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 412723 GATGAACTGTGGGAAATGGCACTTTCAAAAACCATCGCAGCACTCCGTAC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 CCACTCG         TCTTACTGTTCTGATCCAAACCTTGTGTTAGATT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 412773 CCACTCGGTA...TAGTCTTACTGTTCTGATCCAAACCTTGTGTTAGATT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1202 TGAAGAACCTCATTGTGCTTTTTGCTGACACACTTCAG         GTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 425973 TGAAGAACCTCATTGTGCTTTTTGCTGACACACTTCAGGTA...CAGGTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1243 TATGGTTTCCCTGTAAATCAGCTTTTTGACATGCTGTTAGAAATCAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 427363 TATGGTTTCCCTGTAAATCAGCTTTTTGACATGCTGTTAGAAATCAGAGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1293 CCAATATAGTGAAACTCTGCTAAAGAAGTGGGCAGGTATTTTCAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 427413 CCAATATAGTGAAACTCTGCTAAAGAAGTGGGCAGGTATTTTCAGGTG..

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338     AAACATACTTGATTCTGACAACTACAGTCCTATACCAGTAACAAGT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 427463 .TAGAAACATACTTGATTCTGACAACTACAGTCCTATACCAGTAACAAGT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1384 GAAGAGATGTACAAAAAGGTGGTAGGACAATTCCCATTTCAAGATATAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 429398 GAAGAGATGTACAAAAAGGTGGTAGGACAATTCCCATTTCAAGATATAGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1434 ACTGGAAAAG         CAACCATTTCCAAAAAAGTTTCCTTTCTCTG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 429448 ACTGGAAAAGGTA...CAGCAACCATTTCCAAAAAAGTTTCCTTTCTCTG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1475 AATTTGTGCCAAAAGTTTACAACCAAATTAAAGAATTTATCTACGCTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 430403 AATTTGTGCCAAAAGTTTACAACCAAATTAAAGAATTTATCTACGCTTGT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1525 CTGAAGTTTTCAGAAGATCTTCATCTAAG         CTCAACTGAAGT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 430453 CTGAAGTTTTCAGAAGATCTTCATCTAAGGTA...CAGCTCAACTGAAGT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1566 TGATGACATGATTCGGAAATCAACAAACCTGTTGCTAACCAGGACTCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 433494 TGATGACATGATTCGGAAATCAACAAACCTGTTGCTAACCAGGACTCTGA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1616 GCAACTCTCTGCAGAATGTAATTAAAAGGAAGAATATTGGGCTTACTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 433544 GCAACTCTCTGCAGAATGTAATTAAAAGGAAGAATATTGGGCTTACTGAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1666          CTTGTTCAGATTATTATCAATACAACACATTTGGAGAAATC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 433594 GTA...TAGCTTGTTCAGATTATTATCAATACAACACATTTGGAGAAATC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1707 CTGTAAGTACTTGGAAGAATTTATCACCAACATCACTAATGTGCTTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 445202 CTGTAAGTACTTGGAAGAATTTATCACCAACATCACTAATGTGCTTCCAG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1757 AGACAGTTCACACTACCAAGCTCTATGGCACCACAACTTTTAAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 445252 AGACAGTTCACACTACCAAGCTCTATGGCACCACAACTTTTAAGGTG...

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1801    GATGCTAGACATGCAGCTGAAGAAGAGATTTATACCAACTTAAACCA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 460569 CAGGATGCTAGACATGCAGCTGAAGAAGAGATTTATACCAACTTAAACCA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1848 GAAGATTGACCAGTTCCTACAGCTGGCAGACTATGACTGGATGACCGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 460619 GAAGATTGACCAGTTCCTACAGCTGGCAGACTATGACTGGATGACCGGAG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1898 ATTTGGGCAACAAAGCTAGTGATTACCTGGTAGACCTCATTGCCTTTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 460669 ATTTGGGCAACAAAGCTAGTGATTACCTGGTAGACCTCATTGCCTTTCTT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1948 CGTAGCACCTTTGCTGTATTCACACACCTTCCTGTAAGTGGCAGTTGCTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-
 460719 CGTAGCACCTTTGCTGTATTCACACACCTTCCTGTAAGTGGCAGTTGCT 

   2150     .    :    .
   1998 TTACTTTGTCCTTTATATA
        |-|||||||||||||||||
 460768 T ACTTTGTCCTTTATATA