seq1 = pF1KA0909.tfa, 3606 bp
seq2 = pF1KA0909/gi568815581r_4868759.tfa (gi568815581r:4868759_5085984), 217226 bp

>pF1KA0909 3606
>gi568815581r:4868759_5085984 (Chr17)

(complement)

1-31  (99763-99793)   100% ->
32-135  (100002-100105)   100% ->
136-203  (102942-103009)   100% ->
204-339  (103093-103228)   100% ->
340-411  (103825-103896)   100% ->
412-565  (104154-104307)   100% ->
566-700  (104626-104760)   100% ->
701-1638  (105364-106301)   99% ->
1639-1765  (107355-107481)   100% ->
1766-1900  (108793-108927)   100% ->
1901-2016  (111485-111600)   100% ->
2017-2201  (112216-112400)   100% ->
2202-2280  (112732-112810)   100% ->
2281-2503  (112994-113216)   100% ->
2504-2808  (113449-113753)   99% ->
2809-3005  (115449-115645)   100% ->
3006-3189  (115900-116083)   100% ->
3190-3261  (116284-116355)   100% ->
3262-3282  (116465-116485)   100% ->
3283-3470  (116648-116835)   100% ->
3471-3545  (117004-117078)   100% ->
3546-3606  (117166-117226)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAATACCAAGGACACCACCGAGGTTGCTG         AAAACAGCCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
  99763 ATGAATACCAAGGACACCACCGAGGTTGCTGGTA...TAGAAAACAGCCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 CCACCTGAAGATCTTTCTCCCCAAGAAGCTGCTGGAGTGTCTTCCTCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100012 CCACCTGAAGATCTTTCTCCCCAAGAAGCTGCTGGAGTGTCTTCCTCGCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GCCCGCTGCTGCCTCCAGAGAGGCTACGGTGGAATACAAATGAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 100062 GCCCGCTGCTGCCTCCAGAGAGGCTACGGTGGAATACAAATGAGGTT...

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    136    GAGATTGCATCCTACCTGATCACCTTTGAGAAGCATGATGAGTGGCT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102939 CAGGAGATTGCATCCTACCTGATCACCTTTGAGAAGCATGATGAGTGGCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GTCTTGTGCCCCAAAGACAAG         GCCTCAGAATGGCTCCATCA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 102989 GTCTTGTGCCCCAAAGACAAGGTG...CAGGCCTCAGAATGGCTCCATCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 TCCTCTACAATCGCAAGAAGGTGAAATATCGGAAGGATGGTTACCTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103113 TCCTCTACAATCGCAAGAAGGTGAAATATCGGAAGGATGGTTACCTCTGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 AAGAAGCGGAAGGATGGGAAGACCACCCGAGAGGACCACATGAAGCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103163 AAGAAGCGGAAGGATGGGAAGACCACCCGAGAGGACCACATGAAGCTGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GGTCCAGGGCATGGAG         TGTCTCTATGGCTGCTACGTTCACT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 103213 GGTCCAGGGCATGGAGGTA...CAGTGTCTCTATGGCTGCTACGTTCACT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 CTTCCATCGTCCCCACATTCCATCGGCGCTGCTACTGGCTGCTCCAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 103850 CTTCCATCGTCCCCACATTCCATCGGCGCTGCTACTGGCTGCTCCAGGTA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    412       AACCCTGACATCGTCCTTGTGCACTACCTGAACGTCCCAGCCCT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103900 ...CAGAACCCTGACATCGTCCTTGTGCACTACCTGAACGTCCCAGCCCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 GGAGGACTGTGGAAAGGGCTGCAGCCCCATCTTTTGTTCCATCAGCAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104198 GGAGGACTGTGGAAAGGGCTGCAGCCCCATCTTTTGTTCCATCAGCAGCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 ACCGTCGAGAGTGGCTGAAGTGGTCCCGGGAGGAGTTGTTGGGACAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104248 ACCGTCGAGAGTGGCTGAAGTGGTCCCGGGAGGAGTTGTTGGGACAGCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 AAGCCCATGT         TTCATGGCATCAAGTGGAGCTGCGGGAATGG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 104298 AAGCCCATGTGTA...TAGTTCATGGCATCAAGTGGAGCTGCGGGAATGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 AACAGAAGAGTTCTCTGTAGAACACCTGGTGCAGCAGATTTTGGACACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104657 AACAGAAGAGTTCTCTGTAGAACACCTGGTGCAGCAGATTTTGGACACCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 ACCCAACCAAGCCTGCTCCCCGAACCCACGCCTGTCTCTGCAGTGGGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104707 ACCCAACCAAGCCTGCTCCCCGAACCCACGCCTGTCTCTGCAGTGGGGGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 CTTG         GTTCTGGGAGCCTTACCCACAAATGCAGCAGCACGAA
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104757 CTTGGTA...CAGGTTCTGGGAGCCTTACCCACAAATGCAGCAGCACGAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 ACACCGCATCATCTCTCCCAAAGTGGAGCCCCGAGCTTTAACCCTGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105401 ACACCGCATCATCTCTCCCAAAGTGGAGCCCCGAGCTTTAACCCTGACCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 CTATCCCCCACCCTCACCCCCCAGAGCCTCCTCCACTGATAGCCCCACTT
        ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105451 CTATCCCCCACGCTCACCCCCCAGAGCCTCCTCCACTGATAGCCCCACTT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 CCCCCAGAGCTCCCCAAGGCACACACCTCCCCATCTTCTTCCTCTTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105501 CCCCCAGAGCTCCCCAAGGCACACACCTCCCCATCTTCTTCCTCTTCTTC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 CTCCTCATCAGGTTTTGCAGAGCCCCTAGAAATCAGACCTAGCCCTCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105551 CTCCTCATCAGGTTTTGCAGAGCCCCTAGAAATCAGACCTAGCCCTCCCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 CTTCTCGAGGGGGTTCTTCAAGAGGAGGCACTGCTATCCTCCTCCTGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105601 CTTCTCGAGGGGGTTCTTCAAGAGGAGGCACTGCTATCCTCCTCCTGACA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 GGACTGGAGCAGCGGGCTGGAGGCTTGACGCCCACCAGGCACTTGGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105651 GGACTGGAGCAGCGGGCTGGAGGCTTGACGCCCACCAGGCACTTGGCTCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 ACAGGCTGATCCTAGGCCTTCCATGAGTTTGGCAGTGGTTGTAGGCACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105701 ACAGGCTGATCCTAGGCCTTCCATGAGTTTGGCAGTGGTTGTAGGCACTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 AGCCTTCTGCCCCACCAGCTCCTCCCAGTCCTGCCTTTGACCCTGATCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105751 AGCCTTCTGCCCCACCAGCTCCTCCCAGTCCTGCCTTTGACCCTGATCGT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 TTTCTCAACAGCCCCCAGAGGGGCCAGACATATGGAGGGGGGCAGGGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105801 TTTCTCAACAGCCCCCAGAGGGGCCAGACATATGGAGGGGGGCAGGGAGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 AAGCCCAGACTTCCCCGAGGCAGAGGCCGCTCATACCCCCTGTTCTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105851 AAGCCCAGACTTCCCCGAGGCAGAGGCCGCTCATACCCCCTGTTCTGCCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 TAGAGCCTGCTGCTGCCCTGGAGCCCCAGGCAGCTGCTCGGGGTCCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105901 TAGAGCCTGCTGCTGCCCTGGAGCCCCAGGCAGCTGCTCGGGGTCCCCCA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 CCACAGTCAGTAGCAGGTGGGAGAAGAGGAAACTGCTTCTTCATCCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105951 CCACAGTCAGTAGCAGGTGGGAGAAGAGGAAACTGCTTCTTCATCCAAGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 TGATGACAGTGGGGAGGAGCTCAAGGGTCACGGGGCTGCCCCACCCATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106001 TGATGACAGTGGGGAGGAGCTCAAGGGTCACGGGGCTGCCCCACCCATAC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1388 CTTCACCCCCTCCCTCACCCCCACCCTCACCTGCCCCCTTGGAGCCGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106051 CTTCACCCCCTCCCTCACCCCCACCCTCACCTGCCCCCTTGGAGCCGTCA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1438 AGCAGGGTAGGAAGAGGAGAGGCCTTGTTTGGAGGACCTGTTGGGGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106101 AGCAGGGTAGGAAGAGGAGAGGCCTTGTTTGGAGGACCTGTTGGGGCCAG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1488 TGAACTGGAGCCCTTCAGTCTTTCATCATTCCCAGACCTTATGGGAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106151 TGAACTGGAGCCCTTCAGTCTTTCATCATTCCCAGACCTTATGGGAGAAC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1538 TCATCAGTGACGAAGCTCCAAGCATCCCTGCTCCGACCCCCCAGCTGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106201 TCATCAGTGACGAAGCTCCAAGCATCCCTGCTCCGACCCCCCAGCTGTCT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1588 CCTGCTCTTAGCACCATCACAGACTTCTCCCCAGAGTGGTCCTACCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106251 CCTGCTCTTAGCACCATCACAGACTTCTCCCCAGAGTGGTCCTACCCAGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1638 G         GGTGGGGTCAAGGTGCTCATCACAGGTCCTTGGACCGAAG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106301 GGTG...CAGGGTGGGGTCAAGGTGCTCATCACAGGTCCTTGGACCGAAG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1679 CCGCCGAGCATTACTCCTGTGTCTTTGATCACATCGCAGTGCCAGCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107395 CCGCCGAGCATTACTCCTGTGTCTTTGATCACATCGCAGTGCCAGCCTCA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1729 CTTGTCCAGCCTGGTGTCTTACGCTGCTACTGTCCCG         CCCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 107445 CTTGTCCAGCCTGGTGTCTTACGCTGCTACTGTCCCGGTA...CAGCCCA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1770 TGAGGTAGGGCTGGTGTCTTTGCAGGTGGCAGGGCGGGAGGGGCCCCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108797 TGAGGTAGGGCTGGTGTCTTTGCAGGTGGCAGGGCGGGAGGGGCCCCTTT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1820 CTGCTTCTGTGCTCTTTGAGTATCGAGCCCGCCGATTCCTGTCTCTGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108847 CTGCTTCTGTGCTCTTTGAGTATCGAGCCCGCCGATTCCTGTCTCTGCCT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1870 AGTACTCAACTTGACTGGCTGTCACTGGACG         ACAACCAGTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 108897 AGTACTCAACTTGACTGGCTGTCACTGGACGGTG...CAGACAACCAGTT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1911 CCGGATGTCCATACTAGAGCGACTGGAGCAGATGGAGAAGCGGATGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111495 CCGGATGTCCATACTAGAGCGACTGGAGCAGATGGAGAAGCGGATGGCAG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1961 AGATCGCAGCAGCTGGGCAGGTGCCTTGCCAGGGTCCTGATGCTCCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111545 AGATCGCAGCAGCTGGGCAGGTGCCTTGCCAGGGTCCTGATGCTCCTCCA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2011 GTTCAG         GATGAAGGCCAGGGGCCTGGGTTCGAAGCACGGGT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111595 GTTCAGGTA...CAGGATGAAGGCCAGGGGCCTGGGTTCGAAGCACGGGT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2052 AGTGGTCTTGGTAGAAAGCATGATCCCACGCTCCACCTGGAAGGGTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112251 AGTGGTCTTGGTAGAAAGCATGATCCCACGCTCCACCTGGAAGGGTCCTG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2102 AACGTCTGGCCCATGGAAGCCCCTTCCGGGGCATGAGCCTTCTGCACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112301 AACGTCTGGCCCATGGAAGCCCCTTCCGGGGCATGAGCCTTCTGCACCTG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2152 GCTGCTGCCCAGGGCTATGCCCGCCTCATCGAGACCCTGAGCCAGTGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112351 GCTGCTGCCCAGGGCTATGCCCGCCTCATCGAGACCCTGAGCCAGTGGCG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2202          GAGTGTGGAGACTGGAAGCTTGGACTTAGAGCAGGAGGTTG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112401 GTG...CAGGAGTGTGGAGACTGGAAGCTTGGACTTAGAGCAGGAGGTTG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2243 ACCCGCTCAACGTGGATCATTTCTCTTGCACCCCTCTG         ATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 112773 ACCCGCTCAACGTGGATCATTTCTCTTGCACCCCTCTGGTG...CAGATG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2284 TGGGCTTGTGCCCTGGGACACCTGGAAGCTGCTGTGCTCCTTTTCCGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112997 TGGGCTTGTGCCCTGGGACACCTGGAAGCTGCTGTGCTCCTTTTCCGTTG

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2334 GAACCGACAGGCACTGAGCATTCCCGACTCTCTGGGCCGTCTGCCATTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113047 GAACCGACAGGCACTGAGCATTCCCGACTCTCTGGGCCGTCTGCCATTGT

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2384 CTGTGGCTCATTCCCGGGGTCATGTGCGCCTTGCCCGCTGCCTTGAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113097 CTGTGGCTCATTCCCGGGGTCATGTGCGCCTTGCCCGCTGCCTTGAGGAA

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2434 CTACAGAGACAGGAGCCTTCGGTGGAGCCCCCATTTGCCCTATCGCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113147 CTACAGAGACAGGAGCCTTCGGTGGAGCCCCCATTTGCCCTATCGCCACC

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2484 CTCCTCCAGCCCAGACACTG         GTCTGAGCAGCGTCTCCTCGC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 113197 CTCCTCCAGCCCAGACACTGGTG...CAGGTCTGAGCAGCGTCTCCTCGC

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2525 CCTCGGAGCTGTCGGATGGCACCTTTTCCGTCACGTCAGCCTATTCTAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113470 CCTCGGAGCTGTCGGATGGCACCTTTTCCGTCACGTCAGCCTATTCTAGT

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2575 GCCCCAGATGGCAGTCCCCCCCCTGCACCTCTGCCAGCCTCTGAGATGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113520 GCCCCAGATGGCAGTCCCCCCCCTGCACCTCTGCCAGCCTCTGAGATGAC

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2625 TATGGAGGACATGGCCCCAGGCCAGCTTTCCTCTGGTGTCCCAGAAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113570 TATGGAGGACATGGCCCCAGGCCAGCTTTCCTCTGGTGTCCCAGAAGCCC

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2675 CCCTACTCCTCATGGACTATGAGGCTACCAACCCCAAGGGGCCCCTCTCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
 113620 CCCTACTCCTCATGGACTATGAGGCTACCAACTCCAAGGGGCCCCTCTCC

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2725 TCCCTTCCTGCCCTCCCACCAGCTTCAGATGATGGGGCTGCTCCAGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113670 TCCCTTCCTGCCCTCCCACCAGCTTCAGATGATGGGGCTGCTCCAGAGGA

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2775 CGCTGACAGCCCACAGGCTGTGGATGTGATCCCG         GTGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 113720 CGCTGACAGCCCACAGGCTGTGGATGTGATCCCGGTA...CAGGTGGACA

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2816 TGATCTCACTAGCCAAGCAGATCATCGAAGCCACACCGGAGCGGATTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115456 TGATCTCACTAGCCAAGCAGATCATCGAAGCCACACCGGAGCGGATTAAA

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2866 CGAGAGGACTTCGTGGGGCTGCCCGAGGCTGGAGCCTCAATGCGGGAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115506 CGAGAGGACTTCGTGGGGCTGCCCGAGGCTGGAGCCTCAATGCGGGAGCG

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2916 GACAGGGGCTGTGGGGCTCAGTGAGACCATGTCCTGGCTGGCCAGCTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115556 GACAGGGGCTGTGGGGCTCAGTGAGACCATGTCCTGGCTGGCCAGCTACC

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2966 TGGAGAATGTGGACCATTTCCCCAGCTCAACCCCTCCCAG         C
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 115606 TGGAGAATGTGGACCATTTCCCCAGCTCAACCCCTCCCAGGTG...CAGC

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3007 GAACTGCCCTTTGAGCGAGGTCGCCTGGCTGTCCCTTCAGCACCCTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115901 GAACTGCCCTTTGAGCGAGGTCGCCTGGCTGTCCCTTCAGCACCCTCCTG

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3057 GGCAGAGTTTCTCTCTGCATCCACCAGTGGCAAGATGGAAAGTGATTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115951 GGCAGAGTTTCTCTCTGCATCCACCAGTGGCAAGATGGAAAGTGATTTTG

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3107 CCCTGCTGACACTATCAGATCACGAGCAGCGGGAACTGTATGAGGCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116001 CCCTGCTGACACTATCAGATCACGAGCAGCGGGAACTGTATGAGGCTGCC

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3157 CGAGTCATCCAGACGGCCTTCCGAAAGTACAAG         GGCCGGCG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 116051 CGAGTCATCCAGACGGCCTTCCGAAAGTACAAGGTC...CAGGGCCGGCG

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3198 GCTGAAGGAGCAGCAGGAGGTAGCAGCAGCTGTAATCCAGCGCTGTTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116292 GCTGAAGGAGCAGCAGGAGGTAGCAGCAGCTGTAATCCAGCGCTGTTACC

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3248 GGAAGTACAAGCAG         CTGACCTGGATTGCACTTAAG      
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||>>>...
 116342 GGAAGTACAAGCAGGTG...AAGCTGACCTGGATTGCACTTAAGGTA...

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3283    TTTGCACTCTATAAGAAGATGACCCAGGCGGCCATCCTGATCCAGAG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116645 CAGTTTGCACTCTATAAGAAGATGACCCAGGCGGCCATCCTGATCCAGAG

   3500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3330 CAAGTTCCGAAGCTACTATGAACAGAAGCGATTTCAGCAGAGCCGCCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116695 CAAGTTCCGAAGCTACTATGAACAGAAGCGATTTCAGCAGAGCCGCCGAG

   3550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3380 CGGCTGTGCTCATCCAGCAGCACTACCGCTCCTACCGCCGCAGGCCCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116745 CGGCTGTGCTCATCCAGCAGCACTACCGCTCCTACCGCCGCAGGCCCGGC

   3600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3430 CCTCCCCACCGGACTTCGGCCACCCTGCCTGCCCGCAACAA         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 116795 CCTCCCCACCGGACTTCGGCCACCCTGCCTGCCCGCAACAAGTA...CAG

   3650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3471 AGGCTCCTTTCTCACCAAGAAGCAGGACCAGGCAGCCCGGAAGATCATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117004 AGGCTCCTTTCTCACCAAGAAGCAGGACCAGGCAGCCCGGAAGATCATGA

   3700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3521 GATTCCTGCGGCGCTGCCGACACAG         GATGAGGGAACTGAAG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 117054 GATTCCTGCGGCGCTGCCGACACAGGTA...CAGGATGAGGGAACTGAAG

   3750     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   3562 CAGAACCAGGAGCTGGAAGGGCTTCCCCAGCCGGGACTGGCCACA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117182 CAGAACCAGGAGCTGGAAGGGCTTCCCCAGCCGGGACTGGCCACA