seq1 = pF1KA0877.tfa, 1656 bp
seq2 = pF1KA0877/gi568815591r_34831576.tfa (gi568815591r:34831576_35111411), 279836 bp

>pF1KA0877 1656
>gi568815591r:34831576_35111411 (Chr7)

(complement)

1-82  (100001-100082)   100% ->
83-176  (100851-100944)   100% ->
177-234  (121471-121528)   100% ->
235-326  (137807-137898)   100% ->
327-426  (141880-141979)   100% ->
427-504  (144441-144518)   100% ->
505-591  (153342-153428)   100% ->
592-651  (156045-156104)   100% ->
652-732  (156634-156714)   100% ->
733-834  (161514-161615)   100% ->
835-906  (163711-163782)   100% ->
907-956  (165696-165745)   100% ->
957-981  (168773-168797)   100% ->
982-1101  (169528-169647)   100% ->
1102-1276  (171085-171259)   100% ->
1277-1376  (172037-172136)   100% ->
1377-1502  (173293-173418)   100% ->
1503-1656  (179683-179836)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACTTGATTGGTATTCAAACCAAGATATGTTGGACGGTTACCAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGACTTGATTGGTATTCAAACCAAGATATGTTGGACGGTTACCAGAGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGAAGGACTCAGTCCTATTGAAAGCTGTGAAG         GATTGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 100051 AGAAGGACTCAGTCCTATTGAAAGCTGTGAAGGTA...AAGGATTGGGAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ATCCTGCTTGCTTTTATGTTGCTGTAATTTTTATTTTAAATGGACTAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100860 ATCCTGCTTGCTTTTATGTTGCTGTAATTTTTATTTTAAATGGACTAATG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATGGCATTATTCTTCATATATGGCACATATTTAAG         TGGCAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 100910 ATGGCATTATTCTTCATATATGGCACATATTTAAGGTA...CAGTGGCAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CCGATTAGGAGGCCTGGTTACAGTGTTGTGCTTCTTTTTCAATCATGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121477 CCGATTAGGAGGCCTGGTTACAGTGTTGTGCTTCTTTTTCAATCATGGAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AG         TGTACCCGTGTAATGTGGACACCACCTCTCCGTGAAAGC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121527 AGGTA...CAGTGTACCCGTGTAATGTGGACACCACCTCTCCGTGAAAGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 TTCTCATATCCATTTCTTGTTCTTCAGATGTTGCTAGTGACTCATATTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137846 TTCTCATATCCATTTCTTGTTCTTCAGATGTTGCTAGTGACTCATATTCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CAG         GGCTACAAAACTTTATAGAGGAAGCTTGATTGCACTCT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137896 CAGGTA...AAGGGCTACAAAACTTTATAGAGGAAGCTTGATTGCACTCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 GCATTTCCAATGTATTTTTCATGCTTCCTTGGCAGTTTGCTCAGTTTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141918 GCATTTCCAATGTATTTTTCATGCTTCCTTGGCAGTTTGCTCAGTTTGTA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 CTTCTTACTCAG         ATTGCATCATTATTTGCAGTATATGTTGT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 141968 CTTCTTACTCAGGTG...CAGATTGCATCATTATTTGCAGTATATGTTGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 CGGGTACATTGATATATGTAAATTACGGAAGATCATTTATATACACATG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 144470 CGGGTACATTGATATATGTAAATTACGGAAGATCATTTATATACACATGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    505         ATTTCTCTTGCACTTTGTTTTGTTTTGATGTTTGGGAACTCA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144520 TA...CAGATTTCTCTTGCACTTTGTTTTGTTTTGATGTTTGGGAACTCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 ATGTTATTAACTTCTTATTATGCTTCTTCTTTGGTAATTATTTGG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 153384 ATGTTATTAACTTCTTATTATGCTTCTTCTTTGGTAATTATTTGGGTA..

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592     GGTATTCTGGCAATGAAACCACATTTCCTGAAAATAAATGTATCTG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153434 .CAGGGTATTCTGGCAATGAAACCACATTTCCTGAAAATAAATGTATCTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    638 AACTTAGTTTATGG         GTTATTCAAGGATGTTTTTGGTTATTT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 156091 AACTTAGTTTATGGGTG...TAGGTTATTCAAGGATGTTTTTGGTTATTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    679 GGAACTGTCATACTTAAATACTTGACATCTAAAATTTTTGGTATTGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156661 GGAACTGTCATACTTAAATACTTGACATCTAAAATTTTTGGTATTGCAGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    729 TGAC         GCTCATATTGGCAACTTACTAACATCAAAATTCTTTA
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156711 TGACGTA...CAGGCTCATATTGGCAACTTACTAACATCAAAATTCTTTA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    770 GTTATAAGGATTTTGATACTTTATTGTATACCTGTGCAGCGGAGTTTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161551 GTTATAAGGATTTTGATACTTTATTGTATACCTGTGCAGCGGAGTTTGAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    820 TTTATGGAAAAAGAG         ACTCCACTGAGATACACAAAGACATT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 161601 TTTATGGAAAAAGAGGTA...CAGACTCCACTGAGATACACAAAGACATT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    861 ATTGCTTCCAGTTGTTCTTGTAGTGTTTGTTGCTATTGTTAGAAAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 163737 ATTGCTTCCAGTTGTTCTTGTAGTGTTTGTTGCTATTGTTAGAAAGGTA.

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    907      ATTATTAGTGATATGTGGGGTGTCTTAGCTAAACAACAGACACAT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163787 ..CAGATTATTAGTGATATGTGGGGTGTCTTAGCTAAACAACAGACACAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    952 GTAAG         AAAACACCAGTTTGATCATGGAGAG         CT
        |||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 165741 GTAAGGTA...CAGAAAACACCAGTTTGATCATGGAGAGGTA...CAGCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    984 GGTTTACCATGCATTGCAATTGTTAGCATATACAGCCCTTGGTATTTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169530 GGTTTACCATGCATTGCAATTGTTAGCATATACAGCCCTTGGTATTTTAA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1034 TTATGAGACTAAAACTCTTCTTGACACCACACATGTGTGTTATGGCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169580 TTATGAGACTAAAACTCTTCTTGACACCACACATGTGTGTTATGGCATCA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1084 CTGATCTGCTCAAGACAG         CTATTTGGATGGCTCTTTTGCAA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 169630 CTGATCTGCTCAAGACAGGTA...CAGCTATTTGGATGGCTCTTTTGCAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1125 AGTACATCCTGGTGCTATTGTGTTTGCTATATTAGCAGCAATGTCAATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171108 AGTACATCCTGGTGCTATTGTGTTTGCTATATTAGCAGCAATGTCAATAC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1175 AAGGTTCAGCAAATCTGCAAACCCAGTGGAATATTGTAGGGGAGTTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171158 AAGGTTCAGCAAATCTGCAAACCCAGTGGAATATTGTAGGGGAGTTCAGC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1225 AATTTGCCCCAAGAAGAACTTATAGAATGGATCAAATATAGTACTAAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171208 AATTTGCCCCAAGAAGAACTTATAGAATGGATCAAATATAGTACTAAACC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1275 AG         ATGCAGTGTTTGCGGGTGCCATGCCCACGATGGCAAGTG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171258 AGGTA...CAGATGCAGTGTTTGCGGGTGCCATGCCCACGATGGCAAGTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1316 TTAAGCTCTCTGCACTTCGGCCCATTGTGAATCATCCACATTATGAAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172076 TTAAGCTCTCTGCACTTCGGCCCATTGTGAATCATCCACATTATGAAGAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1366 GCAGGCTTGAG         AGCCAGAACAAAAATAGTATACTCAATGTA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 172126 GCAGGCTTGAGGTC...AAGAGCCAGAACAAAAATAGTATACTCAATGTA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1407 TAGTCGGAAAGCAGCCGAAGAAGTGAAGCGAGAACTGATAAAGTTAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173323 TAGTCGGAAAGCAGCCGAAGAAGTGAAGCGAGAACTGATAAAGTTAAAAG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1457 TGAACTATTACATTCTAGAAGAGTCATGGTGTGTAAGAAGATCCAA    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 173373 TGAACTATTACATTCTAGAAGAGTCATGGTGTGTAAGAAGATCCAAGTG.

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1503      GCCTGGTTGCAGTATGCCTGAAATTTGGGATGTAGAAGATCCTGC
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173423 ..TAGGCCTGGTTGCAGTATGCCTGAAATTTGGGATGTAGAAGATCCTGC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1548 CAATGCTGGGAAAACTCCCTTATGTAACCTCTTGGTGAAGGATTCCAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 179728 CAATGCTGGGAAAACTCCCTTATGTAACCTCTTGGTGAAGGATTCCAAAC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1598 CTCACTTCACCACTGTATTCCAGAACAGTGTTTACAAAGTCCTAGAAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 179778 CTCACTTCACCACTGTATTCCAGAACAGTGTTTACAAAGTCCTAGAAGTT

   1800     .
   1648 GTAAAAGAA
        |||||||||
 179828 GTAAAAGAA