Result of SIM4 for
pF1KA0864
seq1 = pF1KA0864.tfa, 3114 bp
seq2 = pF1KA0864/gi568815595r_44477922.tfa (gi568815595r:44477922_44681026), 203105 bp
>pF1KA0864 3114
>gi568815595r:44477922_44681026 (Chr3)
(complement)
1-3114 (100001-103105) 97%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGTCGGCAGCCAAGGAGAACCCGTGCAGGAAATTCCAGGCCAACATCTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGTCGGCAGCCAAGGAGAACCCGTGCAGGAAATTCCAGGCCAACATCTT
50 . : . : . : . : . :
51 CAACAAGAGCAAGTGTCAGAACTGCTTCAAGCCCCGCGAGTCGCATCTGC
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
100051 CAACAAGAGCAAGTGTCAGAACTGCTTCCAGCCCCGCGAGTCGCATCTCC
100 . : . : . : . : . :
101 TCAACGACGAGGACCTGACGCAGGCAAAACCCATTTATGGCGGTTGGCTG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100101 TCAACGACGAGGACCTGACGCAGGCAAAACCCATTTATGGCGGTTGGCTC
150 . : . : . : . : . :
151 CTCCTGGCTCCAGATGGGACCGACTTTGACAACCCAGTGCACCGGTCTCG
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
100151 CTCCTGGCTCCAGATGGGACCGACTTTGACAACTCAGTGCACCGGTCTCC
200 . : . : . : . : . :
201 GAAATGGCAGCGACGGTTCTTCATCCTTTACGAGCACGGCCTCTTGCGCT
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||
100201 GAAATGGCAGCGACAGTTCTTCATCCTTTACGAGCATGGCCTCTTGCGCT
250 . : . : . : . : . :
251 ACGCCCTGGATGAGATGCCCACGACCCTTCCTCAGGGCACCATCAACATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100251 ACGCCCTGGATGAGATGCCCACGACCCTTCCTCAGGGCACCATCAACATG
300 . : . : . : . : . :
301 AACCAGTGCACAGATGTGGTGGATGGGGAGGGCCGCACGGGCCAGAAGTT
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
100301 AACCAGTGCACAGATGTGGTGGATGGGGAGGGCCGCACGGGCCAGAGGTT
350 . : . : . : . : . :
351 CTCCCTGTGTATTCTGACGCCTGAGAAGGAGCATTTCATCCGGGCGGAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100351 CTCCCTGTGTATTCTGACGCCTGAGAAGGAGCATTTCATCCGGGCGGAGA
400 . : . : . : . : . :
401 CCAAGGAGATCGTCAGTGGGTGGCTGGAGATGCTCATGGTCTATCCCCGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100401 CCAAGGAGATCGTCAGTGGGTGGCTGGAGATGCTCATGGTCTATCCCCGG
450 . : . : . : . : . :
451 ACCAACAAGCAGAATCAGAAGAAGAAACGGAAAGTGGAGCCCCCCACACC
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
100451 ACCAACAAGCAGAATCAGAAGAAGAAATGGAAAGTGGAGCCCCCCACACC
500 . : . : . : . : . :
501 ACAGGAGCCTGGGCCTGCCAAGGTGGCTGTTACCAGCAGCAGCAGCAGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||-------|--|||||
100501 GCAGGAGCCTGGGCCTGCCAAGGTGGCTGTTACCA C CAGCA
550 . : . : . : . : . :
551 GCAGCAGCAGCAGCAGCATCCCCAGTGCTGAGAAAGTCCCCACCACCAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100542 GCAGCAGCAGCAGCAGCATCCCCAGTGCTGAGAAAGTCCCCACCACCAAG
600 . : . : . : . : . :
601 TCCACACTCTGGCAGGAAGAAATGAGGACCAAGGACCAGCCAGATGGCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100592 TCCACACTCTGGCAGGAAGAAATGAGGACCAAGGACCAGCCAGATGGCAG
650 . : . : . : . : . :
651 CAGCCTGAGTCCAGCTCAGAGTCCCAGCCAGAGCCAGCCTCCTGCTGCCA
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100642 CAGTCTGAGTCCAGCTCAGAGTCCCAGCCAGAGCCAGCCTCCTGCTGCCA
700 . : . : . : . : . :
701 GCTCCCTGCGGGAACCTGGGCTAGAGAGCAAAGAAGAGGAGAGCGCCATG
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
100692 GCTCCCTGCGGGAACCTGGGCTGGAGAGCAAAGAAGAGGAGAGCGCCATG
750 . : . : . : . : . :
751 AGTAGCGACCGCATGGACTGTGGCCGCAAAGTCCGGGTGGAGAGCGGCTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||
100742 AGTAGCGACCGCATGGACTGTGGCCGCAAAGTCCGGGGGGAGAGCAGCTA
800 . : . : . : . : . :
801 CTTCTCTCTGGAGAAGACCAAACAGGACTTGAAGGCTGAAGAACAGCAGC
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||
100792 CTTCTCTCTGGAGAAGACCAAACACGACTTGAAGGCCGAAGAACAGCAGC
850 . : . : . : . : . :
851 TGCCCCCGCCGCTCTCCCCTCCCAGCCCCAGCACCCCCAACCACAGGAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100842 TGCCCCCGCCGCTCTCCCCTCCCAGCCCCAGCACCCCCAACCACAGGAGG
900 . : . : . : . : . :
901 TCCCAGGTGATTGAAAAGTTTGAGGCCTTGGACATTGAGAAGGCAGAGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100892 TCCCAGGTGATTGAAAAGTTTGAGGCCTTGGACATTGAGAAGGCAGAGCA
950 . : . : . : . : . :
951 CATGGAGACCAATGCAGTGGGGCCCTCACCATCCAGCGACACACGCCAGG
||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||
100942 CATGGAGACCAATGCAGTGGGGCCCTCGCCATCCAGTGACACACGCCAGG
1000 . : . : . : . : . :
1001 GCCGCAGCGAGAAGAGGGCGTTCCCTAGGAAGCGGGACTTCACCAATGAA
||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||
100992 GCCGCAGCGAGAAAAGGGCGTTCCCTAGCAAGCAGGACTTCACCAATGAA
1050 . : . : . : . : . :
1051 G CCCCCCCA GCTCCTCTCCCAGACGCCTCGGCTTCCCCCCTGTCTCC
|--||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||--||||||
101042 GCCCCCCCCCAAGCTCCTCTCCCAGACGCCTCGGCTTCCCCC GTCTCC
1100 . : . : . : . : . :
1098 ACACCGAAGAGCCAAGTCACTGGACAGGAGGTCCACGGAGCCCTCCGTGA
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
101090 ACACCGAAGAGCCAAGTCACTGGACAGGAGGTCCACAGAGCCCTCCGTGA
1150 . : . : . : . : . :
1148 CGCCCGACCTGCTGAATTTCAAGAAAGGCTGGCTGACTAAGCAGTATGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101140 CGCCCGACCTGCTGAATTTCAAGAAAGGCTGGCTGACTAAGCAGTATGAG
1200 . : . : . : . : . :
1198 GACGGCCAGTGGAAGAAACACTGGTTTGTCCTCGCCGATCAAAGCCTGAG
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101190 GACAGCCAGTGGAAGAAACACTGGTTTGTCCTCGCCGATCAAAGCCTGAG
1250 . : . : . : . : . :
1248 ATACTACAGGGATTCAGTGGCTGAGGAGGCAGCCGACTTGGATGGAGAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101240 ATACTACAGGGATTCAGTGGCTGAGGAGGCAGCCGACTTGGATGGAGAAA
1300 . : . : . : . : . :
1298 TTGACTTGTCCGCATGTTACGATGTCACAGAGTATCCAGTTCAGAGAAAC
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101290 TTGACTTGTCTGCATGTTACGATGTCACAGAGTATCCAGTTCAGAGAAAC
1350 . : . : . : . : . :
1348 TATGGCTTCCAGATACATACAAAGGAGGGCGAGTTTACCCTGTCGGCCAT
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
101340 TATGGCTTCCAGATACATACAAAGGAGGGCGAGTTTACCCCGTCGGCCAT
1400 . : . : . : . : . :
1398 GACATCTGGGATTCGGCGGAACTGGATCCAGACCATCATGAAGCACGTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
101390 GACATCTGGGATTCGGCGGAACTGGATCCAGACCATCATGAAGCATGTGC
1450 . : . : . : . : . :
1448 ACCCGACCACTGCCCCGGATGTGACCAGCTCGTTGCCAGAGGAAAAAAAC
|||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
101440 ACCCGACCACCGCCCCGGATGTGACCAGCTGGTTGCCAGAGGAAAAAAAC
1500 . : . : . : . : . :
1498 AAGAGCAGCTGCTCTTTTGAGACCTGCCCGAGGCCTACTGAGAAGCAAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101490 AAGAGCAGCTGCTCTTTTGAGACCTGCCCGAGGCCTACTGAGAAGCAAGA
1550 . : . : . : . : . :
1548 GGCAGAGCTGGGGGAGCCGGACCCTGAGCAGAAGAGGAGCCGCGCACGGG
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||
101540 GGCAGAGCCGGGGGAGCCGGACCCTGAGCAGAAGAGGAGCCGCACGTGGG
1600 . : . : . : . : . :
1598 AGCGGAGGCGAGAGGGCCGCTCCAAGACCTTTGACTGGGCTGAGTTCCGT
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
101590 AGCGGAGGCGAGAGGGCCTCTCCAAGACCTTTGACTGGGCTGAGTTCCGT
1650 . : . : . : . : . :
1648 CCCATCCAGCAGGCCCTGGCTCAGGAGCGGGTGGGCGGCGTGGGGCCTGC
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||
101640 CCCATCCAGCAGGCCCTGAATCAGGAGCGGGTGGGCGGTGTGGGGCCTGC
1700 . : . : . : . : . :
1698 TGACACCCACGAGCCCCTGCGCCCTGAGGCGGAGCCTGGGGAGCTGGAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101690 TGACACCCACGAGCCCCTGCGCCCTGAGGCGGAGCCTGGGGAGCTGGAGC
1750 . : . : . : . : . :
1748 GGGAGCGTGCACGGAGGCGGGAGGAGCGCCGCAAGCGCTTCGGGATGCTC
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
101740 GGGAGCGTGCACGGAGGCGGGAGGAGCGCCGCAAGCACTTCGGGATGCTG
1800 . : . : . : . : . :
1798 GACGCCACAGACGGGCCAGGCACTGAGGATGCAGCCCTGCGCATGGAGGT
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101790 GACGCCACAGGCGGGCCAGGCACTGAGGATGCAGCCCTGCGCATGGAGGT
1850 . : . : . : . : . :
1848 GGACCGGAGCCCAGGGCTGCCTATGAGCGACCTCAAAACGCATAACGTCC
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||
101840 GGACCGGAGCCCAGGGCTGCCTGTGAGCGACCTCAAGACGCATAACGTCC
1900 . : . : . : . : . :
1898 ACGTGGAGATTGAGCAGCGGTGGCATCAGGTGGAGACCACACCTCTCCGG
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
101890 ACGTGGAGATCGAGCAGCGGTGGCATCAGGTGGAGACCACGCCTCTCCGG
1950 . : . : . : . : . :
1948 GAAGAGAAGCAGGTGCCCATCGCCCCCGTCCACCTGTCTTCTGAAGATGG
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
101940 GAAGAGAAGCAGGTGCCCATCGTCCCCGTCCACCTGTCTTCTGAAGATGG
2000 . : . : . : . : . :
1998 GGGTGACCGGCTCTCCACACACGAGCTGACCTCTCTGCTCGAGAAGGAGC
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
101990 GGGTGACCGGCTCTCCACACACGAGCTGACCTCTCTGCTCAAGAAGGAGC
2050 . : . : . : . : . :
2048 TGGAGCAGAGCCAGAAGGAGGCCTCAGACCTTCTGGAGCAGAACCGGCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102040 TGGAGCAGAGCCAGAAGGAGGCCTCAGACCTTCTGGAGCAGAACCGGCTC
2100 . : . : . : . : . :
2098 CTGCAGGACCAGCTGAGGGTGGCCCTGGGCCGGGAGCAGAGCGCCCGTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102090 CTGCAGGACCAGCTGAGGGTGGCCCTGGGCCGGGAGCAGAGCGCCCGTGA
2150 . : . : . : . : . :
2148 GGGCTACGTGCTGCAGGCCACGTGCGAGCGAGGGTTTGCAGCAATGGAAG
||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||
102140 GGGCTACATGCTGCAGGCCACGTGCAAGTGAGGGTTTGCAGCAATGGAAG
2200 . : . : . : . : . :
2198 AAACGCACCAGAAGAAGATTGAAGATCTCCAGAGGCAGCACCAGCGGGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102190 AAACGCACCAGAAGAAGATTGAAGATCTCCAGAGGCAGCACCAGCGGGAG
2250 . : . : . : . : . :
2248 CTAGAGAAACTTCGAGAAGAGAAAGACCGCCTCCTAGCCGAGGAGACAGC
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
102240 CTAGAGAAACTTCGAGAAGAGAAAGACCGACTCCTAGCCGAGGAGACAGC
2300 . : . : . : . : . :
2298 GGCCACCATCTCAGCCATCGAAGCCATGAAGAACGCCCACCGGGAGGAAA
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
102290 GGCCACCATCTCAGCCATCGAAGCCATGAAGAACGCCCACCGGGAGGAGA
2350 . : . : . : . : . :
2348 TGGAGCGGGAGCTGGAGAAGAGCCAGCGGTCCCAGATCAGCAGCGTCAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102340 TGGAGCGGGAGCTGGAGAAGAGCCAGCGGTCCCAGATCAGCAGCGTCAAC
2400 . : . : . : . : . :
2398 TCGGATGTTGAGGCCCTGCGGCGCCAGTACCTGGAGGAGCTGCAGTCGGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102390 TCGGATGTTGAGGCCCTGCGGCGCCAGTACCTGGAGGAGCTGCAGTCGGT
2450 . : . : . : . : . :
2448 GCAGCGGGAACTGGAGGTCCTCTCGGAGCAGTACTCGCAGAAGTGCCTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102440 GCAGCGGGAACTGGAGGTCCTCTCGGAGCAGTACTCGCAGAAGTGCCTGG
2500 . : . : . : . : . :
2498 AGAATGCCCATCTGGCCCAGGCGCTGGAGGCCGAGCGGCAGGCCCTGCGG
||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||
102490 AGAATGCCCATCTGGCCCAGGCGCTGGAGGCCGGGCAGCAGGCCCTGCGG
2550 . : . : . : . : . :
2548 CAGTGCCAGCGTGAGAACCAGGAGCTCAATGCCCACAACCAGGAGCTGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102540 CAGTGCCAGCGTGAGAACCAGGAGCTCAATGCCCACAACCAGGAGCTGAA
2600 . : . : . : . : . :
2598 CAACCGCCTGGCTGCAGAGATCACACGGTTGCGGACGCTGCTGACTGGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102590 CAACCGCCTGGCTGCAGAGATCACACGGTTGCGGACGCTGCTGACTGGGG
2650 . : . : . : . : . :
2648 ACGGCGGTGGGGAGGCCACTGGGTCACCCCTTGCACAGGGCAAGGATGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102640 ACGGCGGTGGGGAGGCCACTGGGTCACCCCTTGCACAGGGCAAGGATGCC
2700 . : . : . : . : . :
2698 TATGAACTAGAGGTCTTATTGCGGGTAAAGGAATCGGAAATACAGTACCT
||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||
102690 TATGAACTAGAAGTCTTATTGCGGATATAGGAATCGGAAATACAGTACCT
2750 . : . : . : . : . :
2748 GAAACAGGAGATTAGCTCCCTCAAGGATGAGCTGCAGACGGCACTGCGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||
102740 GAAACAGGAGATTAGCTCCCTCAAGGATGAGCTGCAGACAGCACTGTGGG
2800 . : . : . : . : . :
2798 ACAAGAAGTACGCAAGTGACAAGTACAAAGACATCTACACAGAGCTCAGC
||||||||||||||||||||| -||||||||||||||||||||||||||
102790 ACAAGAAGTACGCAAGTGACACC ACAAAGACATCTACACAGAGCTCAGC
2850 . : . : . : . : . :
2848 ATCGCGAAGGCTAAGGCTGACTGTGACATCAGCAGGTTGAAGGAGCAGCT
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
102839 ATCGCAAAGGCTAAGGCTGACTGTGACATCAGCAGGTTGAAAGAGCAGCT
2900 . : . : . : . : . :
2898 CAAGGCTGCAACGGAAGCACTGGGGGAGAAGTCCCCTGACAGTGCCACGG
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||
102889 TAAGGCTGCAACGGAAGCACTGGGGGAAAAGTCCCCTGACAGTGCCATGG
2950 . : . : . : . : . :
2948 TGTCCGGATATGATATAATGAAATCTAAAAGCAACCCTGACTTCTTGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102939 TGTCCGGATATGATATAATGAAATCTAAAAGCAACCCTGACTTCTTGAAG
3000 . : . : . : . : . :
2998 AAAGACAGATCCTGTGTCACCCGGCAACTCAGAAACATCAGGTCCAAGAG
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
102989 AAAGACAGATCCTGTGTCACCTGGCAACTCAGAAACATCAGGTCCAAGAG
3050 . : . : . : . : . :
3048 TCTGAAGGAAGGCCTGACGGTGCAAGAACGGTTGAAGCTCTTTGAATCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103039 TCTGAAGGAAGGCCTGACGGTGCAAGAACGGTTGAAGCTCTTTGAATCCA
3100 . : .
3098 GGGACTTGAAGAAAGAC
|||||||||||||||||
103089 GGGACTTGAAGAAAGAC