seq1 = pF1KA0864.tfa, 3114 bp
seq2 = pF1KA0864/gi568815581f_16942849.tfa (gi568815581f:16942849_17284891), 342043 bp

>pF1KA0864 3114
>gi568815581f:16942849_17284891 (Chr17)

1-123  (100001-100123)   100% ->
124-201  (132862-132939)   100% ->
202-267  (135163-135228)   100% ->
268-419  (183854-184005)   100% ->
420-504  (188769-188853)   100% ->
505-736  (193371-193602)   100% ->
737-896  (195068-195227)   100% ->
897-1035  (199779-199917)   100% ->
1036-1149  (200708-200821)   100% ->
1150-1206  (203188-203244)   100% ->
1207-1275  (204471-204539)   100% ->
1276-1365  (207296-207385)   100% ->
1366-1475  (211458-211567)   100% ->
1476-2046  (215584-216154)   100% ->
2047-2163  (218392-218508)   100% ->
2164-2311  (228870-229017)   100% ->
2312-2429  (229850-229967)   100% ->
2430-2589  (231068-231227)   100% ->
2590-2709  (232445-232564)   100% ->
2710-2796  (233578-233664)   100% ->
2797-2959  (234402-234564)   100% ->
2960-3045  (237155-237240)   100% ->
3046-3114  (241975-242043)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCGGCAGCCAAGGAGAACCCGTGCAGGAAATTCCAGGCCAACATCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCGGCAGCCAAGGAGAACCCGTGCAGGAAATTCCAGGCCAACATCTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAACAAGAGCAAGTGTCAGAACTGCTTCAAGCCCCGCGAGTCGCATCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAACAAGAGCAAGTGTCAGAACTGCTTCAAGCCCCGCGAGTCGCATCTGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCAACGACGAGGACCTGACGCAG         GCAAAACCCATTTATGGC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 100101 TCAACGACGAGGACCTGACGCAGGTG...TAGGCAAAACCCATTTATGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGTTGGCTGCTCCTGGCTCCAGATGGGACCGACTTTGACAACCCAGTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132880 GGTTGGCTGCTCCTGGCTCCAGATGGGACCGACTTTGACAACCCAGTGCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCGGTCTCGG         AAATGGCAGCGACGGTTCTTCATCCTTTACG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 132930 CCGGTCTCGGGTA...CAGAAATGGCAGCGACGGTTCTTCATCCTTTACG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGCACGGCCTCTTGCGCTACGCCCTGGATGAGATG         CCCACG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 135194 AGCACGGCCTCTTGCGCTACGCCCTGGATGAGATGGTA...CAGCCCACG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 ACCCTTCCTCAGGGCACCATCAACATGAACCAGTGCACAGATGTGGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183860 ACCCTTCCTCAGGGCACCATCAACATGAACCAGTGCACAGATGTGGTGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TGGGGAGGGCCGCACGGGCCAGAAGTTCTCCCTGTGTATTCTGACGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183910 TGGGGAGGGCCGCACGGGCCAGAAGTTCTCCCTGTGTATTCTGACGCCTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AGAAGGAGCATTTCATCCGGGCGGAGACCAAGGAGATCGTCAGTGG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 183960 AGAAGGAGCATTTCATCCGGGCGGAGACCAAGGAGATCGTCAGTGGGTG.

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    420      GTGGCTGGAGATGCTCATGGTCTATCCCCGGACCAACAAGCAGAA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 184010 ..CAGGTGGCTGGAGATGCTCATGGTCTATCCCCGGACCAACAAGCAGAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TCAGAAGAAGAAACGGAAAGTGGAGCCCCCCACACCACAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 188814 TCAGAAGAAGAAACGGAAAGTGGAGCCCCCCACACCACAGGTA...CAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 AGCCTGGGCCTGCCAAGGTGGCTGTTACCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193372 AGCCTGGGCCTGCCAAGGTGGCTGTTACCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 AGCAGCAGCAGCATCCCCAGTGCTGAGAAAGTCCCCACCACCAAGTCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193422 AGCAGCAGCAGCATCCCCAGTGCTGAGAAAGTCCCCACCACCAAGTCCAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 ACTCTGGCAGGAAGAAATGAGGACCAAGGACCAGCCAGATGGCAGCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193472 ACTCTGGCAGGAAGAAATGAGGACCAAGGACCAGCCAGATGGCAGCAGCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TGAGTCCAGCTCAGAGTCCCAGCCAGAGCCAGCCTCCTGCTGCCAGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193522 TGAGTCCAGCTCAGAGTCCCAGCCAGAGCCAGCCTCCTGCTGCCAGCTCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 CTGCGGGAACCTGGGCTAGAGAGCAAAGAAG         AGGAGAGCGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 193572 CTGCGGGAACCTGGGCTAGAGAGCAAAGAAGGTG...CAGAGGAGAGCGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 CATGAGTAGCGACCGCATGGACTGTGGCCGCAAAGTCCGGGTGGAGAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 195078 CATGAGTAGCGACCGCATGGACTGTGGCCGCAAAGTCCGGGTGGAGAGCG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 GCTACTTCTCTCTGGAGAAGACCAAACAGGACTTGAAGGCTGAAGAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 195128 GCTACTTCTCTCTGGAGAAGACCAAACAGGACTTGAAGGCTGAAGAACAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 CAGCTGCCCCCGCCGCTCTCCCCTCCCAGCCCCAGCACCCCCAACCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 195178 CAGCTGCCCCCGCCGCTCTCCCCTCCCAGCCCCAGCACCCCCAACCACAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897          GAGGTCCCAGGTGATTGAAAAGTTTGAGGCCTTGGACATTG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 195228 GTA...CAGGAGGTCCCAGGTGATTGAAAAGTTTGAGGCCTTGGACATTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 AGAAGGCAGAGCACATGGAGACCAATGCAGTGGGGCCCTCACCATCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 199820 AGAAGGCAGAGCACATGGAGACCAATGCAGTGGGGCCCTCACCATCCAGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 GACACACGCCAGGGCCGCAGCGAGAAGAGGGCGTTCCCTAGGAAGCGG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 199870 GACACACGCCAGGGCCGCAGCGAGAAGAGGGCGTTCCCTAGGAAGCGGGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1036        GACTTCACCAATGAAGCCCCCCCAGCTCCTCTCCCAGACGCCT
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 199920 G...CAGGACTTCACCAATGAAGCCCCCCCAGCTCCTCTCCCAGACGCCT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 CGGCTTCCCCCCTGTCTCCACACCGAAGAGCCAAGTCACTGGACAGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 200751 CGGCTTCCCCCCTGTCTCCACACCGAAGAGCCAAGTCACTGGACAGGAGG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 TCCACGGAGCCCTCCGTGACG         CCCGACCTGCTGAATTTCAA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 200801 TCCACGGAGCCCTCCGTGACGGTG...CAGCCCGACCTGCTGAATTTCAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 GAAAGGCTGGCTGACTAAGCAGTATGAGGACGGCCAG         TGGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 203208 GAAAGGCTGGCTGACTAAGCAGTATGAGGACGGCCAGGTG...TAGTGGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 AGAAACACTGGTTTGTCCTCGCCGATCAAAGCCTGAGATACTACAGGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 204475 AGAAACACTGGTTTGTCCTCGCCGATCAAAGCCTGAGATACTACAGGGAT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 TCAGTGGCTGAGGAG         GCAGCCGACTTGGATGGAGAAATTGA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 204525 TCAGTGGCTGAGGAGGTG...CAGGCAGCCGACTTGGATGGAGAAATTGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1302 CTTGTCCGCATGTTACGATGTCACAGAGTATCCAGTTCAGAGAAACTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 207322 CTTGTCCGCATGTTACGATGTCACAGAGTATCCAGTTCAGAGAAACTATG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 GCTTCCAGATACAT         ACAAAGGAGGGCGAGTTTACCCTGTCG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 207372 GCTTCCAGATACATGTG...TAGACAAAGGAGGGCGAGTTTACCCTGTCG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1393 GCCATGACATCTGGGATTCGGCGGAACTGGATCCAGACCATCATGAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 211485 GCCATGACATCTGGGATTCGGCGGAACTGGATCCAGACCATCATGAAGCA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1443 CGTGCACCCGACCACTGCCCCGGATGTGACCAG         CTCGTTGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 211535 CGTGCACCCGACCACTGCCCCGGATGTGACCAGGTA...CAGCTCGTTGC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1484 CAGAGGAAAAAAACAAGAGCAGCTGCTCTTTTGAGACCTGCCCGAGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 215592 CAGAGGAAAAAAACAAGAGCAGCTGCTCTTTTGAGACCTGCCCGAGGCCT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1534 ACTGAGAAGCAAGAGGCAGAGCTGGGGGAGCCGGACCCTGAGCAGAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 215642 ACTGAGAAGCAAGAGGCAGAGCTGGGGGAGCCGGACCCTGAGCAGAAGAG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1584 GAGCCGCGCACGGGAGCGGAGGCGAGAGGGCCGCTCCAAGACCTTTGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 215692 GAGCCGCGCACGGGAGCGGAGGCGAGAGGGCCGCTCCAAGACCTTTGACT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1634 GGGCTGAGTTCCGTCCCATCCAGCAGGCCCTGGCTCAGGAGCGGGTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 215742 GGGCTGAGTTCCGTCCCATCCAGCAGGCCCTGGCTCAGGAGCGGGTGGGC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1684 GGCGTGGGGCCTGCTGACACCCACGAGCCCCTGCGCCCTGAGGCGGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 215792 GGCGTGGGGCCTGCTGACACCCACGAGCCCCTGCGCCCTGAGGCGGAGCC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1734 TGGGGAGCTGGAGCGGGAGCGTGCACGGAGGCGGGAGGAGCGCCGCAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 215842 TGGGGAGCTGGAGCGGGAGCGTGCACGGAGGCGGGAGGAGCGCCGCAAGC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1784 GCTTCGGGATGCTCGACGCCACAGACGGGCCAGGCACTGAGGATGCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 215892 GCTTCGGGATGCTCGACGCCACAGACGGGCCAGGCACTGAGGATGCAGCC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1834 CTGCGCATGGAGGTGGACCGGAGCCCAGGGCTGCCTATGAGCGACCTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 215942 CTGCGCATGGAGGTGGACCGGAGCCCAGGGCTGCCTATGAGCGACCTCAA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1884 AACGCATAACGTCCACGTGGAGATTGAGCAGCGGTGGCATCAGGTGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 215992 AACGCATAACGTCCACGTGGAGATTGAGCAGCGGTGGCATCAGGTGGAGA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1934 CCACACCTCTCCGGGAAGAGAAGCAGGTGCCCATCGCCCCCGTCCACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 216042 CCACACCTCTCCGGGAAGAGAAGCAGGTGCCCATCGCCCCCGTCCACCTG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1984 TCTTCTGAAGATGGGGGTGACCGGCTCTCCACACACGAGCTGACCTCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 216092 TCTTCTGAAGATGGGGGTGACCGGCTCTCCACACACGAGCTGACCTCTCT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2034 GCTCGAGAAGGAG         CTGGAGCAGAGCCAGAAGGAGGCCTCAG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 216142 GCTCGAGAAGGAGGTA...CAGCTGGAGCAGAGCCAGAAGGAGGCCTCAG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2075 ACCTTCTGGAGCAGAACCGGCTCCTGCAGGACCAGCTGAGGGTGGCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 218420 ACCTTCTGGAGCAGAACCGGCTCCTGCAGGACCAGCTGAGGGTGGCCCTG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2125 GGCCGGGAGCAGAGCGCCCGTGAGGGCTACGTGCTGCAG         GC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 218470 GGCCGGGAGCAGAGCGCCCGTGAGGGCTACGTGCTGCAGGTA...CAGGC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2166 CACGTGCGAGCGAGGGTTTGCAGCAATGGAAGAAACGCACCAGAAGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 228872 CACGTGCGAGCGAGGGTTTGCAGCAATGGAAGAAACGCACCAGAAGAAGA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2216 TTGAAGATCTCCAGAGGCAGCACCAGCGGGAGCTAGAGAAACTTCGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 228922 TTGAAGATCTCCAGAGGCAGCACCAGCGGGAGCTAGAGAAACTTCGAGAA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2266 GAGAAAGACCGCCTCCTAGCCGAGGAGACAGCGGCCACCATCTCAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 228972 GAGAAAGACCGCCTCCTAGCCGAGGAGACAGCGGCCACCATCTCAGGTT.

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2312      CCATCGAAGCCATGAAGAACGCCCACCGGGAGGAAATGGAGCGGG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 229022 ..CAGCCATCGAAGCCATGAAGAACGCCCACCGGGAGGAAATGGAGCGGG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2357 AGCTGGAGAAGAGCCAGCGGTCCCAGATCAGCAGCGTCAACTCGGATGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 229895 AGCTGGAGAAGAGCCAGCGGTCCCAGATCAGCAGCGTCAACTCGGATGTT

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2407 GAGGCCCTGCGGCGCCAGTACCT         GGAGGAGCTGCAGTCGGT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 229945 GAGGCCCTGCGGCGCCAGTACCTGTA...CAGGGAGGAGCTGCAGTCGGT

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2448 GCAGCGGGAACTGGAGGTCCTCTCGGAGCAGTACTCGCAGAAGTGCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 231086 GCAGCGGGAACTGGAGGTCCTCTCGGAGCAGTACTCGCAGAAGTGCCTGG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2498 AGAATGCCCATCTGGCCCAGGCGCTGGAGGCCGAGCGGCAGGCCCTGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 231136 AGAATGCCCATCTGGCCCAGGCGCTGGAGGCCGAGCGGCAGGCCCTGCGG

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2548 CAGTGCCAGCGTGAGAACCAGGAGCTCAATGCCCACAACCAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 231186 CAGTGCCAGCGTGAGAACCAGGAGCTCAATGCCCACAACCAGGTG...CA

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2590  GAGCTGAACAACCGCCTGGCTGCAGAGATCACACGGTTGCGGACGCTGC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 232444 GGAGCTGAACAACCGCCTGGCTGCAGAGATCACACGGTTGCGGACGCTGC

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2639 TGACTGGGGACGGCGGTGGGGAGGCCACTGGGTCACCCCTTGCACAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 232494 TGACTGGGGACGGCGGTGGGGAGGCCACTGGGTCACCCCTTGCACAGGGC

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2689 AAGGATGCCTATGAACTAGAG         GTCTTATTGCGGGTAAAGGA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 232544 AAGGATGCCTATGAACTAGAGGTA...TAGGTCTTATTGCGGGTAAAGGA

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2730 ATCGGAAATACAGTACCTGAAACAGGAGATTAGCTCCCTCAAGGATGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 233598 ATCGGAAATACAGTACCTGAAACAGGAGATTAGCTCCCTCAAGGATGAGC

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2780 TGCAGACGGCACTGCGG         GACAAGAAGTACGCAAGTGACAAG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 233648 TGCAGACGGCACTGCGGGTA...AAGGACAAGAAGTACGCAAGTGACAAG

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2821 TACAAAGACATCTACACAGAGCTCAGCATCGCGAAGGCTAAGGCTGACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 234426 TACAAAGACATCTACACAGAGCTCAGCATCGCGAAGGCTAAGGCTGACTG

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2871 TGACATCAGCAGGTTGAAGGAGCAGCTCAAGGCTGCAACGGAAGCACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 234476 TGACATCAGCAGGTTGAAGGAGCAGCTCAAGGCTGCAACGGAAGCACTGG

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2921 GGGAGAAGTCCCCTGACAGTGCCACGGTGTCCGGATATG         AT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 234526 GGGAGAAGTCCCCTGACAGTGCCACGGTGTCCGGATATGGTG...CAGAT

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2962 ATAATGAAATCTAAAAGCAACCCTGACTTCTTGAAGAAAGACAGATCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 237157 ATAATGAAATCTAAAAGCAACCCTGACTTCTTGAAGAAAGACAGATCCTG

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3012 TGTCACCCGGCAACTCAGAAACATCAGGTCCAAG         AGTCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 237207 TGTCACCCGGCAACTCAGAAACATCAGGTCCAAGGTG...CAGAGTCTGA

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3053 AGGAAGGCCTGACGGTGCAAGAACGGTTGAAGCTCTTTGAATCCAGGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 241982 AGGAAGGCCTGACGGTGCAAGAACGGTTGAAGCTCTTTGAATCCAGGGAC

   3300     .    :
   3103 TTGAAGAAAGAC
        ||||||||||||
 242032 TTGAAGAAAGAC