seq1 = pF1KA0815.tfa, 3687 bp
seq2 = pF1KA0815/gi568815597r_3390531.tfa (gi568815597r:3390531_3631245), 240715 bp

>pF1KA0815 3687
>gi568815597r:3390531_3631245 (Chr1)

(complement)

1-166  (100001-100166)   100% ->
167-289  (107000-107122)   100% ->
290-415  (115719-115844)   100% ->
416-538  (116574-116696)   100% ->
539-661  (119118-119240)   100% ->
662-799  (119559-119696)   100% ->
800-919  (120344-120463)   100% ->
920-1042  (121254-121376)   100% ->
1043-1213  (122001-122171)   100% ->
1214-1345  (122557-122688)   100% ->
1346-1474  (123323-123451)   100% ->
1475-1603  (125010-125138)   100% ->
1604-1738  (125690-125824)   100% ->
1739-1873  (125904-126038)   100% ->
1874-1999  (129325-129450)   99% ->
2000-2131  (129938-130069)   100% ->
2132-2260  (130152-130280)   100% ->
2261-2392  (130482-130613)   100% ->
2393-2521  (131322-131450)   99% ->
2522-2650  (131530-131658)   100% ->
2651-2779  (132747-132875)   100% ->
2780-2908  (133885-134013)   99% ->
2909-3037  (134463-134591)   100% ->
3038-3166  (135228-135356)   100% ->
3167-3295  (136505-136633)   100% ->
3296-3424  (136747-136875)   100% ->
3425-3451  (137449-137475)   100% ->
3452-3580  (138479-138607)   100% ->
3581-3628  (140287-140334)   100% ->
3629-3687  (140657-140715)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGGCGTCCCGGGACCGCGGGCTGGCCGCGCTCTGGTGCCTTGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGGGCGTCCCGGGACCGCGGGCTGGCCGCGCTCTGGTGCCTTGGGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTGGGGGGCCTGGCGCGCGTCGCGGGCACGCACTACCGCTACCTCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTGGGGGGCCTGGCGCGCGTCGCGGGCACGCACTACCGCTACCTCTGGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGGGCTGCTACCCATGTCACCTGGGCCAGGCCGGCTACCCCGTGAGCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGGGCTGCTACCCATGTCACCTGGGCCAGGCCGGCTACCCCGTGAGCGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGTGACCAGAGGCCAG         ATGTGGACGAATGCCGAACCCACAA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 100151 GGTGACCAGAGGCCAGGTG...CAGATGTGGACGAATGCCGAACCCACAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CGGTGGCTGCCAGCACCGGTGCGTGAACACCCCAGGCTCCTACCTCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107025 CGGTGGCTGCCAGCACCGGTGCGTGAACACCCCAGGCTCCTACCTCTGTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGTGCAAGCCCGGCTTCCGGCTCCACACTGACAGCAGGACCTGCCTGG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 107075 AGTGCAAGCCCGGCTTCCGGCTCCACACTGACAGCAGGACCTGCCTGGGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    290        CCATTAACTCCTGCGCCCTGGGCAATGGCGGCTGCCAGCACCA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107125 G...CAGCCATTAACTCCTGCGCCCTGGGCAATGGCGGCTGCCAGCACCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CTGTGTCCAGCTCACAATCACTCGGCATCGCTGCCAGTGCCGGCCCGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115762 CTGTGTCCAGCTCACAATCACTCGGCATCGCTGCCAGTGCCGGCCCGGGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TCCAGCTCCAGGAGGACGGCAGGCATTGTGTCC         GTAGAAGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 115812 TCCAGCTCCAGGAGGACGGCAGGCATTGTGTCCGTG...CAGGTAGAAGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CCGTGTGCCAACAGGAACGGCAGCTGCATGCACAGGTGCCAGGTGGTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116582 CCGTGTGCCAACAGGAACGGCAGCTGCATGCACAGGTGCCAGGTGGTCCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GGGCCTCGCCCGCTGTGAGTGCCACGTGGGCTATCAGCTAGCAGCGGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116632 GGGCCTCGCCCGCTGTGAGTGCCACGTGGGCTATCAGCTAGCAGCGGACG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GCAAGGCCTGTGAAG         ATGTGGACGAATGTGCCGCAGGGCTG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 116682 GCAAGGCCTGTGAAGGTA...CAGATGTGGACGAATGTGCCGCAGGGCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GCCCAGTGTGCCCATGGCTGCCTCAACACCCAGGGGTCCTTCAAGTGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119144 GCCCAGTGTGCCCATGGCTGCCTCAACACCCAGGGGTCCTTCAAGTGCGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GTGTCACGCGGGCTATGAGCTGGGCGCCGATGGCCGGCAGTGCTACC   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 119194 GTGTCACGCGGGCTATGAGCTGGGCGCCGATGGCCGGCAGTGCTACCGTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    662       GGATTGAGATGGAAATCGTGAACAGCTGTGAGGCCAACAACGGC
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119244 ...CAGGGATTGAGATGGAAATCGTGAACAGCTGTGAGGCCAACAACGGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GGCTGCTCCCATGGCTGCAGCCACACCAGTGCTGGGCCCCTGTGCACATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119603 GGCTGCTCCCATGGCTGCAGCCACACCAGTGCTGGGCCCCTGTGCACATG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 TCCCCGCGGCTACGAGCTGGACACAGATCAGAGGACCTGCATCG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 119653 TCCCCGCGGCTACGAGCTGGACACAGATCAGAGGACCTGCATCGGTG...

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    800    ATGTCGACGACTGTGCAGACAGCCCGTGCTGCCAGCAGGTGTGCACC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120341 CAGATGTCGACGACTGTGCAGACAGCCCGTGCTGCCAGCAGGTGTGCACC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 AACAACCCTGGCGGGTACGAGTGCGGCTGCTACGCCGGCTACCGGCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120391 AACAACCCTGGCGGGTACGAGTGCGGCTGCTACGCCGGCTACCGGCTCAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 TGCCGATGGCTGCGGCTGTGAGG         ATGTGGATGAGTGCGCCT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 120441 TGCCGATGGCTGCGGCTGTGAGGGTG...CAGATGTGGATGAGTGCGCCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 CCAGCCGTGGCGGCTGCGAGCACCACTGCACCAACCTGGCCGGCTCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121272 CCAGCCGTGGCGGCTGCGAGCACCACTGCACCAACCTGGCCGGCTCCTTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 CAGTGCTCCTGCGAGGCCGGCTACCGGCTGCACGAGGACCGTAGGGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121322 CAGTGCTCCTGCGAGGCCGGCTACCGGCTGCACGAGGACCGTAGGGGCTG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 CAGCC         CCCTGGAGGAGCCGATGGTGGACCTGGACGGCGAGC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121372 CAGCCGTG...CAGCCCTGGAGGAGCCGATGGTGGACCTGGACGGCGAGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 TGCCTTTCGTGCGGCCCCTGCCCCACATTGCCGTGCTCCAGGACGAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122037 TGCCTTTCGTGCGGCCCCTGCCCCACATTGCCGTGCTCCAGGACGAGCTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 CCGCAACTCTTCCAGGATGACGACGTCGGGGCCGATGAGGAAGAGGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122087 CCGCAACTCTTCCAGGATGACGACGTCGGGGCCGATGAGGAAGAGGCAGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 GTTGCGGGGCGAACACACGCTCACAGAGAAGTTTG         TCTGCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 122137 GTTGCGGGGCGAACACACGCTCACAGAGAAGTTTGGTG...CAGTCTGCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 TGGATGACTCCTTTGGCCATGACTGCAGCTTGACCTGTGATGACTGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122563 TGGATGACTCCTTTGGCCATGACTGCAGCTTGACCTGTGATGACTGCAGG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 AACGGAGGGACCTGCCTCCTGGGCCTGGATGGCTGTGATTGCCCCGAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122613 AACGGAGGGACCTGCCTCCTGGGCCTGGATGGCTGTGATTGCCCCGAGGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 CTGGACTGGGCTCATCTGCAATGAGA         CTTGTCCTCCGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 122663 CTGGACTGGGCTCATCTGCAATGAGAGTG...TAGCTTGTCCTCCGGACA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 CCTTTGGGAAGAACTGCAGCTTCTCCTGCAGCTGTCAGAATGGTGGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123338 CCTTTGGGAAGAACTGCAGCTTCTCCTGCAGCTGTCAGAATGGTGGGACC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 TGCGACTCTGTCACGGGGGCCTGCCGCTGCCCCCCGGGTGTCAGTGGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123388 TGCGACTCTGTCACGGGGGCCTGCCGCTGCCCCCCGGGTGTCAGTGGAAC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 TAACTGTGAGGATG         GCTGCCCCAAGGGCTACTATGGCAAGC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 123438 TAACTGTGAGGATGGTG...CAGGCTGCCCCAAGGGCTACTATGGCAAGC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 ACTGTCGCAAGAAATGCAACTGTGCCAACCGGGGCCGGTGCCACCGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125037 ACTGTCGCAAGAAATGCAACTGTGCCAACCGGGGCCGGTGCCACCGCCTC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 TACGGGGCCTGCCTCTGCGACCCAGGGCTCTACGGCCGCTTCTGCCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125087 TACGGGGCCTGCCTCTGCGACCCAGGGCTCTACGGCCGCTTCTGCCACCT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 CA         CCTGCCCGCCGTGGGCCTTTGGGCCGGGCTGCTCGGAGG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125137 CAGTG...CAGCCTGCCCGCCGTGGGCCTTTGGGCCGGGCTGCTCGGAGG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 AGTGCCAGTGTGTGCAGCCCCACACGCAGTCCTGTGACAAGAGGGATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125729 AGTGCCAGTGTGTGCAGCCCCACACGCAGTCCTGTGACAAGAGGGATGGC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 AGCTGCTCCTGCAAGGCTGGCTTCCGGGGCGAGCGCTGTCAGGCAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 125779 AGCTGCTCCTGCAAGGCTGGCTTCCGGGGCGAGCGCTGTCAGGCAGGTG.

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1739      AGTGTGAGCTGGGCTACTTTGGGCCGGGGTGCTGGCAGGCATGCA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125829 ..CAGAGTGTGAGCTGGGCTACTTTGGGCCGGGGTGCTGGCAGGCATGCA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1784 CCTGCCCAGTGGGCGTGGCCTGTGACTCCGTGAGCGGCGAGTGTGGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125949 CCTGCCCAGTGGGCGTGGCCTGTGACTCCGTGAGCGGCGAGTGTGGGAAG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1834 CGGTGTCCTGCTGGCTTCCAGGGAGAGGACTGTGGCCAAG         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 125999 CGGTGTCCTGCTGGCTTCCAGGGAGAGGACTGTGGCCAAGGTG...CAGA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1875 GTGCCCGGTGGGGACGTTTGGCGTGAACTGCTCGAGCTCCTGCTCCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129326 GTGCCCGGTGGGGACGTTTGGCGTGAACTGCTCGAGCTCCTGCTCCTGTG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1925 GGGGGGCCCCCTGCCACGGGGTCACGGGGCAGTGCCGGTGTCCACCGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
 129376 GGGGGGCCCCCTGCCACGGGGTCACGGGGCAGTGCCGGTGTCCGCCGGGG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1975 AGGACTGGGGAAGACTGTGAGGCAG         ATTGTCCCGAGGGCCG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 129426 AGGACTGGGGAAGACTGTGAGGCAGGTG...TAGATTGTCCCGAGGGCCG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2016 CTGGGGGCTGGGCTGCCAGGAGATCTGCCCAGCATGCCAGCACGCTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129954 CTGGGGGCTGGGCTGCCAGGAGATCTGCCCAGCATGCCAGCACGCTGCCC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2066 GCTGCGACCCTGAGACCGGAGCCTGCCTGTGCCTCCCTGGCTTCGTCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130004 GCTGCGACCCTGAGACCGGAGCCTGCCTGTGCCTCCCTGGCTTCGTCGGC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2116 AGCCGCTGCCAGGACG         TGTGCCCAGCAGGCTGGTATGGTCC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 130054 AGCCGCTGCCAGGACGGTG...TAGTGTGCCCAGCAGGCTGGTATGGTCC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2157 CAGCTGCCAGACAAGGTGCTCTTGTGCCAATGATGGGCACTGCCACCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130177 CAGCTGCCAGACAAGGTGCTCTTGTGCCAATGATGGGCACTGCCACCCAG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2207 CCACCGGACACTGCAGCTGTGCCCCCGGGTGGACCGGCTTTAGCTGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130227 CCACCGGACACTGCAGCTGTGCCCCCGGGTGGACCGGCTTTAGCTGCCAG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2257 AGAG         CCTGTGATACTGGGCACTGGGGACCTGACTGCAGCCA
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130277 AGAGGTA...CAGCCTGTGATACTGGGCACTGGGGACCTGACTGCAGCCA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2298 CCCCTGCAACTGCAGCGCTGGCCACGGGAGCTGTGATGCCATCAGCGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130519 CCCCTGCAACTGCAGCGCTGGCCACGGGAGCTGTGATGCCATCAGCGGCC

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2348 TGTGTCTGTGTGAGGCTGGCTACGTGGGCCCGCGGTGCGAGCAGC     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 130569 TGTGTCTGTGTGAGGCTGGCTACGTGGGCCCGCGGTGCGAGCAGCGTG..

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2393     AGTGTCCCCAGGGCCACTTTGGGCCCGGCTGTGAGCAGCTGTGCCA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
 130619 .CAGAGTGTCCCCAGGGCCACTTTGGGCCCGGCTGTGAGCAGCGGTGCCA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2439 GTGTCAGCATGGAGCAGCCTGTGACCACGTCAGCGGGGCCTGCACCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131368 GTGTCAGCATGGAGCAGCCTGTGACCACGTCAGCGGGGCCTGCACCTGCC

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2489 CGGCCGGCTGGAGGGGCACCTTCTGCGAGCATG         CCTGCCCG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 131418 CGGCCGGCTGGAGGGGCACCTTCTGCGAGCATGGTG...CAGCCTGCCCG

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2530 GCCGGCTTCTTTGGATTGGACTGTCGCAGTGCCTGCAACTGCACCGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131538 GCCGGCTTCTTTGGATTGGACTGTCGCAGTGCCTGCAACTGCACCGCCGG

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2580 AGCTGCCTGTGATGCCGTGAATGGCTCCTGCCTCTGCCCCGCTGGCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131588 AGCTGCCTGTGATGCCGTGAATGGCTCCTGCCTCTGCCCCGCTGGCCGCC

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2630 GGGGCCCCCGCTGTGCCGAGA         AGTGCCTCCCCCGGGACGTC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 131638 GGGGCCCCCGCTGTGCCGAGAGTG...TAGAGTGCCTCCCCCGGGACGTC

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2671 AGAGCTGGCTGCCGGCACAGCGGCGGTTGCCTCAACGGGGGCCTGTGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132767 AGAGCTGGCTGCCGGCACAGCGGCGGTTGCCTCAACGGGGGCCTGTGTGA

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2721 CCCGCACACGGGCCGCTGCCTCTGCCCAGCCGGCTGGACTGGGGACAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132817 CCCGCACACGGGCCGCTGCCTCTGCCCAGCCGGCTGGACTGGGGACAAGT

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2771 GTCAGAGCC         CCTGCCTGCGGGGCTGGTTTGGAGAGGCCTGT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 132867 GTCAGAGCCGTG...CAGCCTGCCTGCGGGGCTGGTTTGGAGAGGCCTGT

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2812 GCCCAGCGCTGCAGCTGCCCGCCTGCCGCTGCCTGCCACCACGTCACTGG
        ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
 133917 GCCCAGCGCTGCAGCTGCCCGCCTGGCGCTGCCTGCCACCACGTCACTGG

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2862 GGCCTGCCGCTGTCCCCCTGGCTTCACTGGCTCCGGCTGCGAGCAGG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 133967 GGCCTGCCGCTGTCCCCCTGGCTTCACTGGCTCCGGCTGCGAGCAGGGTA

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2909       GATGTCCGCCCGGGCGGTATGGGCCAGGCTGTGAACAGCTGTGT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134017 ...CAGGATGTCCGCCCGGGCGGTATGGGCCAGGCTGTGAACAGCTGTGT

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2953 GGGTGTCTCAACGGGGGCTCCTGTGATGCGGCCACGGGGGCCTGCCGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134507 GGGTGTCTCAACGGGGGCTCCTGTGATGCGGCCACGGGGGCCTGCCGCTG

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3003 CCCCACTGGGTTCCTCGGGACGGACTGCAACCTCA         CCTGTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 134557 CCCCACTGGGTTCCTCGGGACGGACTGCAACCTCAGTG...CAGCCTGTC

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3044 CGCAGGGCCGCTTCGGCCCCAACTGCACCCACGTGTGTGGGTGTGGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135234 CGCAGGGCCGCTTCGGCCCCAACTGCACCCACGTGTGTGGGTGTGGGCAG

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3094 GGGGCGGCCTGCGACCCTGTGACCGGCACCTGCCTCTGCCCCCCGGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135284 GGGGCGGCCTGCGACCCTGTGACCGGCACCTGCCTCTGCCCCCCGGGGAG

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3144 AGCCGGCGTCCGCTGTGAGCGAG         GCTGCCCCCAGAACCGGT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 135334 AGCCGGCGTCCGCTGTGAGCGAGGTG...CAGGCTGCCCCCAGAACCGGT

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3185 TTGGCGTGGGCTGCGAGCACACCTGCTCCTGCAGAAATGGGGGCCTGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136523 TTGGCGTGGGCTGCGAGCACACCTGCTCCTGCAGAAATGGGGGCCTGTGC

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3235 CACGCCAGCAACGGCAGCTGCTCCTGTGGCCTGGGCTGGACGGGGCGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136573 CACGCCAGCAACGGCAGCTGCTCCTGTGGCCTGGGCTGGACGGGGCGGCA

   3500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3285 CTGCGAGCTGG         CCTGTCCCCCTGGGCGCTACGGAGCCGCCT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 136623 CTGCGAGCTGGGTG...CAGCCTGTCCCCCTGGGCGCTACGGAGCCGCCT

   3550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3326 GCCATCTGGAGTGCTCCTGCCACAACAACAGCACGTGTGAGCCTGCCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136777 GCCATCTGGAGTGCTCCTGCCACAACAACAGCACGTGTGAGCCTGCCACG

   3600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3376 GGCACCTGCCGCTGCGGCCCCGGCTTCTATGGCCAGGCCTGCGAGCACC 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 136827 GGCACCTGCCGCTGCGGCCCCGGCTTCTATGGCCAGGCCTGCGAGCACCG

   3650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3425         GGCGCTCAGGAGCCACCTGTAACCTGG         ATTGCA
        >>...>>>|||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 136877 TG...CAGGGCGCTCAGGAGCCACCTGTAACCTGGGTG...CAGATTGCA

   3700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3458 GAAGGGGCCAGTTTGGGCCCAGCTGCACCCTGCACTGTGACTGCGGGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138485 GAAGGGGCCAGTTTGGGCCCAGCTGCACCCTGCACTGTGACTGCGGGGGT

   3750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3508 GGGGCTGACTGCGACCCTGTCAGTGGGCAGTGTCACTGTGTGGATGGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138535 GGGGCTGACTGCGACCCTGTCAGTGGGCAGTGTCACTGTGTGGATGGCTA

   3800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3558 CATGGGGCCCACGTGCCGGGAAG         GTGGGCCCCTCCGGCTCC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 138585 CATGGGGCCCACGTGCCGGGAAGGTG...CAGGTGGGCCCCTCCGGCTCC

   3850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3599 CCGAGAACCCGTCCTTAGCCCAGGGCTCAG         CGGGCACACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 140305 CCGAGAACCCGTCCTTAGCCCAGGGCTCAGGTA...CAGCGGGCACACTG

   3900     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   3640 CCCGCCTCCAGCAGACCCACATCCCGGAGCGGTGGACCAGCGAGGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140668 CCCGCCTCCAGCAGACCCACATCCCGGAGCGGTGGACCAGCGAGGCAC