seq1 = pF1KA0806.tfa, 3195 bp
seq2 = pF1KA0806/gi568815597f_112973407.tfa (gi568815597f:112973407_113224098), 250692 bp
>pF1KA0806 3195
>gi568815597f:112973407_113224098 (Chr1)
1-239 (100001-100239) 100% ->
240-305 (117912-117977) 100% ->
306-380 (119800-119874) 100% ->
381-515 (120024-120158) 100% ->
516-659 (120933-121076) 100% ->
660-803 (121206-121349) 100% ->
804-947 (122468-122611) 100% ->
948-1091 (122816-122959) 100% ->
1092-1172 (125299-125379) 100% ->
1173-1244 (126805-126876) 100% ->
1245-1313 (127014-127082) 100% ->
1314-1477 (134188-134351) 100% ->
1478-1798 (136836-137156) 100% ->
1799-2080 (139073-139354) 100% ->
2081-2530 (141021-141470) 99% ->
2531-2680 (142881-143030) 100% ->
2681-2971 (145827-146117) 100% ->
2972-3195 (150469-150692) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGGCGCCGGCGCCCCTAGGCGTCCCGGAGGAGCAGTTGCTGGGGTGTCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGGCGCCGGCGCCCCTAGGCGTCCCGGAGGAGCAGTTGCTGGGGTGTCG
50 . : . : . : . : . :
51 ATCTAGAGTGCTTTCTCGGTTACTCTTCATTGCCCAGACCGCTCTCCTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 ATCTAGAGTGCTTTCTCGGTTACTCTTCATTGCCCAGACCGCTCTCCTCC
100 . : . : . : . : . :
101 TGTTGCCCGCCGCCGGAGCAGGTCTCTGCCCCGCGCCCTGCTCCTGCCGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100101 TGTTGCCCGCCGCCGGAGCAGGTCTCTGCCCCGCGCCCTGCTCCTGCCGC
150 . : . : . : . : . :
151 ATTCCTCTCCTGGACTGCAGTCGCAGGAAATTGCCCGCACCGAGCTGGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100151 ATTCCTCTCCTGGACTGCAGTCGCAGGAAATTGCCCGCACCGAGCTGGAG
200 . : . : . : . : . :
201 GGCGCTGTCGGGCTTGCTGCCCCCCGACACCGCTATCCT GG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
100201 GGCGCTGTCGGGCTTGCTGCCCCCCGACACCGCTATCCTGTG...CAGGG
250 . : . : . : . : . :
242 ATTTCAGTCATAATCGGTTGTCTAACTGGAACATCAGCTTGGAATCACAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
117914 ATTTCAGTCATAATCGGTTGTCTAACTGGAACATCAGCTTGGAATCACAA
300 . : . : . : . : . :
292 ACATTACAGGAAGT GAAAATGAATTACAATGAACTAACAGA
||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
117964 ACATTACAGGAAGTGTA...TAGGAAAATGAATTACAATGAACTAACAGA
350 . : . : . : . : . :
333 AATCCCGTATTTTGGAGAACCTACATCTAATATTACTCTACTTTCATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
119827 AATCCCGTATTTTGGAGAACCTACATCTAATATTACTCTACTTTCATTGT
400 . : . : . : . : . :
381 AGTCCATAATATAATCCCAGAAATAAATGCACAGGCACTCCAG
>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
119877 A...CAGAGTCCATAATATAATCCCAGAAATAAATGCACAGGCACTCCAG
450 . : . : . : . : . :
424 TTTTACCCTGCTCTGGAGAGTTTAGACCTCAGCTCAAATATAATATCAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120067 TTTTACCCTGCTCTGGAGAGTTTAGACCTCAGCTCAAATATAATATCAGA
500 . : . : . : . : . :
474 AATCAAGACATCTTCATTTCCTCGCATGCAGCTTAAATACCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
120117 AATCAAGACATCTTCATTTCCTCGCATGCAGCTTAAATACCTGTA...TA
550 . : . : . : . : . :
516 GAATTTAAGTAATAACAGAATAACCACCTTGGAGGCTGGTTGCTTCGAT
>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120932 GGAATTTAAGTAATAACAGAATAACCACCTTGGAGGCTGGTTGCTTCGAT
600 . : . : . : . : . :
565 AATTTATCAAGTTCCTTATTAGTGGTAAAGTTAAACCGTAACCGAATGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120982 AATTTATCAAGTTCCTTATTAGTGGTAAAGTTAAACCGTAACCGAATGAG
650 . : . : . : . : . :
615 CATGATTCCACCTAAGATCTTCAAGCTGCCTCACCTCCAATTCTT
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
121032 CATGATTCCACCTAAGATCTTCAAGCTGCCTCACCTCCAATTCTTGTG..
700 . : . : . : . : . :
660 GGAACTTAAAAGAAACAGAATTAAAATTGTGGAAGGTCTTACATTC
.>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121082 .AAGGGAACTTAAAAGAAACAGAATTAAAATTGTGGAAGGTCTTACATTC
750 . : . : . : . : . :
706 CAAGGGCTTGACTCCTTAAGATCTTTGAAAATGCAGCGGAATGGAATTAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121252 CAAGGGCTTGACTCCTTAAGATCTTTGAAAATGCAGCGGAATGGAATTAG
800 . : . : . : . : . :
756 CAAACTTAAGGATGGAGCATTTTTTGGCTTGAATAACATGGAAGAACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
121302 CAAACTTAAGGATGGAGCATTTTTTGGCTTGAATAACATGGAAGAACTGT
850 . : . : . : . : . :
804 AGAACTGGAACACAACAACCTTACACGAGTAAACAAGGGGTGG
>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121352 A...CAGAGAACTGGAACACAACAACCTTACACGAGTAAACAAGGGGTGG
900 . : . : . : . : . :
847 TTGTATGGCTTGCGAATGTTACAGCAGCTCTATGTGAGCCAGAATGCTAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
122511 TTGTATGGCTTGCGAATGTTACAGCAGCTCTATGTGAGCCAGAATGCTAT
950 . : . : . : . : . :
897 TGAAAGAATCAGCCCTGATGCATGGGAGTTCTGCCAAAGACTATCCGAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
122561 TGAAAGAATCAGCCCTGATGCATGGGAGTTCTGCCAAAGACTATCCGAAC
1000 . : . : . : . : . :
947 T TGATTTGTCCTATAACCAGCTGACCCGCCTGGATGAATCT
|>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
122611 TGTA...CAGTGATTTGTCCTATAACCAGCTGACCCGCCTGGATGAATCT
1050 . : . : . : . : . :
988 GCCTTTGTGGGTCTGAGCTTATTGGAGAGATTGAATTTAGGAGACAACAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
122856 GCCTTTGTGGGTCTGAGCTTATTGGAGAGATTGAATTTAGGAGACAACAG
1100 . : . : . : . : . :
1038 AGTCACTCATATTGCTGATGGTGTATTTAGATTTCTTTCCAATCTTCAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
122906 AGTCACTCATATTGCTGATGGTGTATTTAGATTTCTTTCCAATCTTCAGA
1150 . : . : . : . : . :
1088 CATT AGACTTAAGAAACAATGAAATTTCATGGGCCATAGAA
||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
122956 CATTGTA...TAGAGACTTAAGAAACAATGAAATTTCATGGGCCATAGAA
1200 . : . : . : . : . :
1129 GATGCTAGTGAAGCCTTTGCTGGACTCACAAGTCTCACTAAACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
125336 GATGCTAGTGAAGCCTTTGCTGGACTCACAAGTCTCACTAAACTGTA...
1250 . : . : . : . : . :
1173 AATCTTACAAGGAAACCAGATTAAGTCAATTACAAAGAAAGCATTCA
>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
126802 CAGAATCTTACAAGGAAACCAGATTAAGTCAATTACAAAGAAAGCATTCA
1300 . : . : . : . : . :
1220 TTGGTCTTGAATCCCTTGAGCATCT AGATTTGAACAATAAT
|||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
126852 TTGGTCTTGAATCCCTTGAGCATCTGTA...CAGAGATTTGAACAATAAT
1350 . : . : . : . : . :
1261 GCTATAATGTCTATCCAAGAAAATGCTTTTTCTCAGACTCATTTAAAAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
127030 GCTATAATGTCTATCCAAGAAAATGCTTTTTCTCAGACTCATTTAAAAGA
1400 . : . : . : . : . :
1311 ACT GATTCTGAACACAAGCAGTTTGCTCTGTGACTGCCATT
|||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
127080 ACTGTA...CAGGATTCTGAACACAAGCAGTTTGCTCTGTGACTGCCATT
1450 . : . : . : . : . :
1352 TGAAGTGGCTACTTCAATGGTTGGTTGATAATAACTTTCAACATTCTGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
134226 TGAAGTGGCTACTTCAATGGTTGGTTGATAATAACTTTCAACATTCTGTG
1500 . : . : . : . : . :
1402 AATGTAAGCTGTGCACACCCTGAATGGCTAGCAGGGCAAAGCATCCTGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
134276 AATGTAAGCTGTGCACACCCTGAATGGCTAGCAGGGCAAAGCATCCTGAA
1550 . : . : . : . : . :
1452 TGTGGATCTGAAAGATTTTGTCTGTG ATGATTTTCTCAAGC
||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
134326 TGTGGATCTGAAAGATTTTGTCTGTGGTT...TAGATGATTTTCTCAAGC
1600 . : . : . : . : . :
1493 CACAGATAAGGACACATCCTGAAACCATAATTGCTCTAAGAGGCATGAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
136851 CACAGATAAGGACACATCCTGAAACCATAATTGCTCTAAGAGGCATGAAT
1650 . : . : . : . : . :
1543 GTGACTCTGACGTGCACTGCAGTGAGCAGCAGTGATTCACCCATGTCCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
136901 GTGACTCTGACGTGCACTGCAGTGAGCAGCAGTGATTCACCCATGTCCAC
1700 . : . : . : . : . :
1593 TGTGTGGCGCAAAGACAGTGAAATCCTGTATGACGTGGATACTGAGAATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
136951 TGTGTGGCGCAAAGACAGTGAAATCCTGTATGACGTGGATACTGAGAATT
1750 . : . : . : . : . :
1643 TTGTTCGTTATTGGCAGCAAGCTGGAGAAGCTCTGGAATATACTAGTATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
137001 TTGTTCGTTATTGGCAGCAAGCTGGAGAAGCTCTGGAATATACTAGTATC
1800 . : . : . : . : . :
1693 TTACATCTTTTCAATGTGAATTTCACAGATGAAGGAAAATATCAGTGTAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
137051 TTACATCTTTTCAATGTGAATTTCACAGATGAAGGAAAATATCAGTGTAT
1850 . : . : . : . : . :
1743 TGTTACTAATCACTTTGGTTCTAATTATTCTCAGAAAGCCAAACTGACTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
137101 TGTTACTAATCACTTTGGTTCTAATTATTCTCAGAAAGCCAAACTGACTG
1900 . : . : . : . : . :
1793 TAAATG AGATGCCATCTTTTCTGAAAACGCCAATGGATCTG
||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
137151 TAAATGGTA...CAGAGATGCCATCTTTTCTGAAAACGCCAATGGATCTG
1950 . : . : . : . : . :
1834 ACTATTCGCACTGGTGCCATGGCCAGATTAGAATGTGCTGCAGAGGGACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
139108 ACTATTCGCACTGGTGCCATGGCCAGATTAGAATGTGCTGCAGAGGGACA
2000 . : . : . : . : . :
1884 CCCTGCACCTCAGATTTCCTGGCAGAAAGATGGTGGTACTGACTTTCCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
139158 CCCTGCACCTCAGATTTCCTGGCAGAAAGATGGTGGTACTGACTTTCCTG
2050 . : . : . : . : . :
1934 CGGCTCGAGAAAGACGCATGCACGTCATGCCCGAGGATGACGTCTTCTTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
139208 CGGCTCGAGAAAGACGCATGCACGTCATGCCCGAGGATGACGTCTTCTTT
2100 . : . : . : . : . :
1984 ATTGCCAATGTGAAAATAGAAGATATGGGAATCTATAGCTGCATGGCACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
139258 ATTGCCAATGTGAAAATAGAAGATATGGGAATCTATAGCTGCATGGCACA
2150 . : . : . : . : . :
2034 AAATACAGCAGGAGGTCTCTCAGCAAATGCTTCCCTAACAGTGTTAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
139308 AAATACAGCAGGAGGTCTCTCAGCAAATGCTTCCCTAACAGTGTTAGGTA
2200 . : . : . : . : . :
2081 AGACACCCTCATTTATTAGACCCCTGGAGGATAAGACAGTAACC
...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
139358 ...TAGAGACACCCTCATTTATTAGACCCCTGGAGGATAAGACAGTAACA
2250 . : . : . : . : . :
2125 CGAGGTGAAACTGCGGTGTTACAGTGCATAGCTGGAGGGAGTCCTGCCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
141065 CGAGGTGAAACTGCGGTGTTACAGTGCATAGCTGGAGGGAGTCCTGCCCC
2300 . : . : . : . : . :
2175 TCGTCTCAACTGGACTAAAGATGATGGGCCTTTGCTGGTGACAGAACGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
141115 TCGTCTCAACTGGACTAAAGATGATGGGCCTTTGCTGGTGACAGAACGAC
2350 . : . : . : . : . :
2225 ATTTCTTTGCTGCAGCCAATCAGCTTCTCATCATTGTAGATGCCGGGCTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
141165 ATTTCTTTGCTGCAGCCAATCAGCTTCTCATCATTGTAGATGCCGGGCTA
2400 . : . : . : . : . :
2275 GAAGATGCTGGGAAATATACCTGCATTATGTCTAACACCCTTGGGACAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
141215 GAAGATGCTGGGAAATATACCTGCATTATGTCTAACACCCTTGGGACAGA
2450 . : . : . : . : . :
2325 ACGTGGCCACATTTACCTAAATGTCATTTCATCCCCCAATTGTGACTCTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
141265 ACGTGGCCACATTTACCTAAATGTCATTTCATCCCCCAATTGTGACTCTT
2500 . : . : . : . : . :
2375 CCCAGAGTAGCATTGGGCATGAAGATGATGGCTGGACCACAGTTGGCATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
141315 CCCAGAGTAGCATTGGGCATGAAGATGATGGCTGGACCACAGTTGGCATT
2550 . : . : . : . : . :
2425 GTCATCATTGTTGTGGTCTGCTGTGTTGTTGGCACTTCTTTGATCTGGGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
141365 GTCATCATTGTTGTGGTCTGCTGTGTTGTTGGCACTTCTTTGATCTGGGT
2600 . : . : . : . : . :
2475 CATTGTTATTTACCACATGAGAAGGAAAAATGAAGACTATAGTATCACAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
141415 CATTGTTATTTACCACATGAGAAGGAAAAATGAAGACTATAGTATCACAA
2650 . : . : . : . : . :
2525 ACACAG AGGAGCTCAATCTGCCTGCAGACATTCCCAGCTAC
||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
141465 ACACAGGTA...CAGAGGAGCTCAATCTGCCTGCAGACATTCCCAGCTAC
2700 . : . : . : . : . :
2566 TTGTCTTCCCAAGGAACGCTGTCTGAGCCACAGGAAGGCTACAGCAACTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
142916 TTGTCTTCCCAAGGAACGCTGTCTGAGCCACAGGAAGGCTACAGCAACTC
2750 . : . : . : . : . :
2616 TGAGGCAGGCAGTCATCAGCAACTTATGCCTCCTGCCAATGGATATATAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
142966 TGAGGCAGGCAGTCATCAGCAACTTATGCCTCCTGCCAATGGATATATAC
2800 . : . : . : . : . :
2666 ACAAAGGCACTGACG GTGGCACTGGTACCCGGGTGATTTGC
|||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
143016 ACAAAGGCACTGACGGTA...TAGGTGGCACTGGTACCCGGGTGATTTGC
2850 . : . : . : . : . :
2707 TCAGATTGTTATGACAATGCCAACATCTACTCCAGGACCCGAGAATACTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
145853 TCAGATTGTTATGACAATGCCAACATCTACTCCAGGACCCGAGAATACTG
2900 . : . : . : . : . :
2757 TCCATACACCTATATTGCTGAGGAGGACGTTCTTGATCAGACACTGTCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
145903 TCCATACACCTATATTGCTGAGGAGGACGTTCTTGATCAGACACTGTCCA
2950 . : . : . : . : . :
2807 GCCTCATGGTCCAAATGCCTAAAGAGACATATTTAGTACATCCTCCCCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
145953 GCCTCATGGTCCAAATGCCTAAAGAGACATATTTAGTACATCCTCCCCAG
3000 . : . : . : . : . :
2857 GATACTACTGCCCTAGAGAGCCTGATACCGTCAGCCAACAGAGAGCCATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
146003 GATACTACTGCCCTAGAGAGCCTGATACCGTCAGCCAACAGAGAGCCATC
3050 . : . : . : . : . :
2907 TGCCTTTCCCACCAACCATGAGAGGATAAGTGAGAAGAAACTTCCCTCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
146053 TGCCTTTCCCACCAACCATGAGAGGATAAGTGAGAAGAAACTTCCCTCCA
3100 . : . : . : . : . :
2957 CACAGATGAGCGGTG AAACATTGCAGCGGCCCGTGTGGAAC
|||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
146103 CACAGATGAGCGGTGGTA...CAGAAACATTGCAGCGGCCCGTGTGGAAC
3150 . : . : . : . : . :
2998 ATAAACAGAGAACTAGGCCTGCCTCATCCTCCTTTTTCCCAGCAGCCAGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
150495 ATAAACAGAGAACTAGGCCTGCCTCATCCTCCTTTTTCCCAGCAGCCAGT
3200 . : . : . : . : . :
3048 CCATGAGTCACCACAACTTCATCAAAATGAGGGCCTGGCAGGGAGAGAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
150545 CCATGAGTCACCACAACTTCATCAAAATGAGGGCCTGGCAGGGAGAGAGC
3250 . : . : . : . : . :
3098 CAGACTGTTCTGCTTCTTCCATGTCCTGCCACAGGTTACAGGATCATGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
150595 CAGACTGTTCTGCTTCTTCCATGTCCTGCCACAGGTTACAGGATCATGCT
3300 . : . : . : . : .
3148 TTTGATTTTAGTAGGACTCGGAACATTCAAGATGGTAGTGAGGGCACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
150645 TTTGATTTTAGTAGGACTCGGAACATTCAAGATGGTAGTGAGGGCACA