seq1 = pF1KA0790.tfa, 3741 bp
seq2 = pF1KA0790/gi568815592f_148243168.tfa (gi568815592f:148243168_148648555), 405388 bp

>pF1KA0790 3741
>gi568815592f:148243168_148648555 (Chr6)

1-156  (99901-100056)   100% ->
157-285  (146967-147095)   100% ->
286-336  (197017-197067)   100% ->
337-386  (197191-197240)   100% ->
387-427  (225378-225418)   100% ->
428-514  (228250-228336)   100% ->
515-627  (230943-231055)   100% ->
628-729  (244447-244548)   100% ->
730-862  (271157-271289)   100% ->
863-1209  (276380-276726)   100% ->
1210-1284  (282124-282198)   100% ->
1285-1428  (284286-284429)   100% ->
1429-1564  (288359-288494)   100% ->
1565-1734  (289630-289799)   100% ->
1735-1944  (290604-290813)   100% ->
1945-2095  (291584-291734)   99% ->
2096-2209  (297276-297389)   100% ->
2210-3348  (300513-301651)   100% ->
3349-3480  (302848-302979)   100% ->
3481-3741  (305128-305388)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGGACGCGGGAGCAGCTGGCCCGGGGCCGGAGCCTGAGCCCGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99901 ATGGAGGACGCGGGAGCAGCTGGCCCGGGGCCGGAGCCTGAGCCCGAGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGAGCCGGAGCCCGAGCCCGCGCCGGAGCCGGAACCGGAGCCCAAGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99951 CGAGCCGGAGCCCGAGCCCGCGCCGGAGCCGGAACCGGAGCCCAAGCCGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GTGCTGGCACATCCGAGGCGTTCTCCCGACTCTGGACCGACGTGATGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 GTGCTGGCACATCCGAGGCGTTCTCCCGACTCTGGACCGACGTGATGGGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATCCTG         GACGGTTCACTGGGAAACATCGATGACCTGGCGCA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ATCCTGGTA...CAGGACGGTTCACTGGGAAACATCGATGACCTGGCGCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCAGTATGCAGATTATTACAACACCTGTTTCTCCGACGTGTGCGAGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147002 GCAGTATGCAGATTATTACAACACCTGTTTCTCCGACGTGTGCGAGAGGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGGAGGAGCTGCGGAAACGGCGGGTTTCCCAGGACCTGGAAGTG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 147052 TGGAGGAGCTGCGGAAACGGCGGGTTTCCCAGGACCTGGAAGTGGTG...

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    286    GAGAAACCCGATGCTAGCCCCACGTCACTTCAGCTGCGGTCCCAGAT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 197014 TAGGAGAAACCCGATGCTAGCCCCACGTCACTTCAGCTGCGGTCCCAGAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CGAA         GAGTCGCTTGGCTTCTGTAGCGCCGTGTCAACCCCAG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 197064 CGAAGTA...TAGGAGTCGCTTGGCTTCTGTAGCGCCGTGTCAACCCCAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AAGTGGAAAGAAA         GAACCCTCTTCATAAATCAAACTCAGAA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 197228 AAGTGGAAAGAAAGTA...TAGGAACCCTCTTCATAAATCAAACTCAGAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GACAGCTCTGTAG         GAAAAGGAGACTGGAAGAAGAAAAATAA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 225406 GACAGCTCTGTAGGTC...AAGGAAAAGGAGACTGGAAGAAGAAAAATAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 GTATTTCTGGCAGAACTTCCGAAAGAACCAGAAAGGAATAATGAGACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 228278 GTATTTCTGGCAGAACTTCCGAAAGAACCAGAAAGGAATAATGAGACAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 CTTCAAAAG         GAGAAGACGTTGGTTATGTTGCCAGTGAAATA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 228328 CTTCAAAAGGTA...CAGGAGAAGACGTTGGTTATGTTGCCAGTGAAATA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 ACGATGAGCGATGAGGAGCGGATTCAGCTAATGATGATGGTCAAAGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 230975 ACGATGAGCGATGAGGAGCGGATTCAGCTAATGATGATGGTCAAAGAAAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 GATGATCACAATTGAGGAAGCACTTGCTAGG         CTCAAGGAAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 231025 GATGATCACAATTGAGGAAGCACTTGCTAGGGTA...CAGCTCAAGGAAT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    638 ACGAGGCCCAGCACCGGCAGTCGGCTGCCCTGGACCCTGCTGACTGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 244457 ACGAGGCCCAGCACCGGCAGTCGGCTGCCCTGGACCCTGCTGACTGGCCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 GATGGTTCTTACCCAACGTTTGATGGCTCATCAAACTGCAAT        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 244507 GATGGTTCTTACCCAACGTTTGATGGCTCATCAAACTGCAATGTG...CA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    730  TCAAGAGAACAATCGGATGATGAGACTGAGGAGTCGGTGAAGTTTAAGA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 271156 GTCAAGAGAACAATCGGATGATGAGACTGAGGAGTCGGTGAAGTTTAAGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 GGTTACACAAGCTGGTAAACTCCACTCGCAGAGTCAGAAAGAAACTAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 271206 GGTTACACAAGCTGGTAAACTCCACTCGCAGAGTCAGAAAGAAACTAATT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 AGGGTGGAAGAAATGAAAAAACCCAGCACTGAAG         GTGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 271256 AGGGTGGAAGAAATGAAAAAACCCAGCACTGAAGGTA...CAGGTGGGGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    870 GGAGCACGTGTTTGAGAATTCGCCGGTCCTGGATGAACGGTCCGCCCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 276387 GGAGCACGTGTTTGAGAATTCGCCGGTCCTGGATGAACGGTCCGCCCTCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 ACTCTGGCGTGCACAAGAAGCCCCTTTTCTTTGATGGCTCTCCTGAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 276437 ACTCTGGCGTGCACAAGAAGCCCCTTTTCTTTGATGGCTCTCCTGAGAAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 CCTCCCGAAGATGACTCAGACTCTCTCACCACGTCTCCATCCTCCAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 276487 CCTCCCGAAGATGACTCAGACTCTCTCACCACGTCTCCATCCTCCAGCAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 CCTGGACACCTGGGGGGCTGGCCGGAAGTTGGTCAAAACCTTCAGCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 276537 CCTGGACACCTGGGGGGCTGGCCGGAAGTTGGTCAAAACCTTCAGCAAAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 GAGAGAGCCGGGGCCTGATTAAGCCCCCCAAGAAGATGGGGACATTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 276587 GAGAGAGCCGGGGCCTGATTAAGCCCCCCAAGAAGATGGGGACATTCTTC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 TCCTACCCAGAAGAAGAAAAGGCCCAGAAAGTGTCCCGCTCCCTCACCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 276637 TCCTACCCAGAAGAAGAAAAGGCCCAGAAAGTGTCCCGCTCCCTCACCGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 GGGGGAGATGAAGAAGGGTCTCGGGTCCCTAAGCCACGGG         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 276687 GGGGGAGATGAAGAAGGGTCTCGGGTCCCTAAGCCACGGGGTA...CAGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 GAACCTGCAGTTTTGGAGGATTTGACTTGACGAATCGCTCTCTGCACGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 282125 GAACCTGCAGTTTTGGAGGATTTGACTTGACGAATCGCTCTCTGCACGTT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 GGCAGTAATAATTCTGACCCAATG         GGTAAAGAAGGAGACTT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 282175 GGCAGTAATAATTCTGACCCAATGGTG...CAGGGTAAAGAAGGAGACTT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1302 TGTGTACAAAGAAGTCATCAAATCACCTACTGCCTCTCGCATCTCTCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 284303 TGTGTACAAAGAAGTCATCAAATCACCTACTGCCTCTCGCATCTCTCTTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 GGAAAAAGGTGAAATCAGTGAAAGAGACGATGAGAAAGAGAATGTCTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 284353 GGAAAAAGGTGAAATCAGTGAAAGAGACGATGAGAAAGAGAATGTCTAAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 AAATACAGCAGCTCTGTCTCTGAGCAG         GACTCGGGCCTTGA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 284403 AAATACAGCAGCTCTGTCTCTGAGCAGGTA...CAGGACTCGGGCCTTGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1443 TGGAATGCCTGGCTCCCCTCCGCCTTCACAGCCCGACCCCGAACACTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 288373 TGGAATGCCTGGCTCCCCTCCGCCTTCACAGCCCGACCCCGAACACTTGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1493 ACAAGCCCAAGCTCAAGGCCGGGGGTTCTGTAGAAAGTCTTCGCAGTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 288423 ACAAGCCCAAGCTCAAGGCCGGGGGTTCTGTAGAAAGTCTTCGCAGTTCT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1543 CTCAGTGGGCAGAGCTCCATGA         GCGGTCAAACAGTGAGCAC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 288473 CTCAGTGGGCAGAGCTCCATGAGTA...CAGGCGGTCAAACAGTGAGCAC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1584 CACTGATTCCTCAACCAGCAACCGGGAAAGCGTCAAGTCGGAAGATGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 289649 CACTGATTCCTCAACCAGCAACCGGGAAAGCGTCAAGTCGGAAGATGGGG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1634 ATGACGAAGAGCCGCCTTACCGAGGCCCGTTCTGCGGGCGTGCCAGGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 289699 ATGACGAAGAGCCGCCTTACCGAGGCCCGTTCTGCGGGCGTGCCAGGGTG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1684 CACACCGACTTCACCCCCAGTCCCTATGACACAGACTCACTCAAGCTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 289749 CACACCGACTTCACCCCCAGTCCCTATGACACAGACTCACTCAAGCTCAA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1734 G         AAAGGAGATATCATCGATATAATCAGCAAGCCACCCATGG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 289799 GGTA...CAGAAAGGAGATATCATCGATATAATCAGCAAGCCACCCATGG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1775 GGACCTGGATGGGCCTGCTGAACAACAAAGTCGGCACGTTCAAGTTCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 290644 GGACCTGGATGGGCCTGCTGAACAACAAAGTCGGCACGTTCAAGTTCATC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1825 TACGTGGACGTGCTCAGTGAAGACGAGGAGAAACCCAAACGCCCCACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 290694 TACGTGGACGTGCTCAGTGAAGACGAGGAGAAACCCAAACGCCCCACCAG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1875 GAGGCGTCGGAAAGGACGACCACCCCAGCCCAAGTCTGTGGAGGATCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 290744 GAGGCGTCGGAAAGGACGACCACCCCAGCCCAAGTCTGTGGAGGATCTCC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1925 TGGATCGGATTAACCTAAAA         GAGCACATGCCCACTTTCCTG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 290794 TGGATCGGATTAACCTAAAAGTC...CAGGAGCACATGCCCACTTTCCTG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1966 TTCAATGGATATGAAGATTTGGACACCTTTAAGCTGCTGGAGGAGGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 291605 TTCAATGGATATGAAGATTTGGACACCTTTAAGCTGCTGGAGGAGGAAGA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2016 CTTGGATGAGTTAAAAATCAGGGACCCGGAACACAGAGCTGTTCTCTTGA
        ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 291655 CTTGGATGAGTTAAATATCAGGGACCCGGAACACAGAGCTGTTCTCTTGA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2066 CAGCAGTGGAGCTGTTACAAGAGTATGACA         GTAACAGCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 291705 CAGCAGTGGAGCTGTTACAAGAGTATGACAGTA...TAGGTAACAGCGAC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2107 CAGTCAGGATCCCAGGAGAAGCTGCTCGTTGACAGCCAGGGCCTGAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 297287 CAGTCAGGATCCCAGGAGAAGCTGCTCGTTGACAGCCAGGGCCTGAGTGG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2157 ATGCTCACCCCGAGACTCAGGATGCTACGAAAGCAGTGAGAACCTGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 297337 ATGCTCACCCCGAGACTCAGGATGCTACGAAAGCAGTGAGAACCTGGAAA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2207 ACG         GCAAGACTCGGAAAGCTAGCCTCCTATCTGCCAAGTCA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 297387 ACGGTA...CAGGCAAGACTCGGAAAGCTAGCCTCCTATCTGCCAAGTCA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2248 TCCACCGAGCCCAGCTTGAAGTCTTTTAGCAGAAACCAGTTGGGCAATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 300551 TCCACCGAGCCCAGCTTGAAGTCTTTTAGCAGAAACCAGTTGGGCAATTA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2298 CCCAACATTGCCTTTAATGAAATCAGGGGATGCACTGAAGCAGGGACAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 300601 CCCAACATTGCCTTTAATGAAATCAGGGGATGCACTGAAGCAGGGACAGG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2348 AGGAGGGCAGGCTGGGTGGTGGCCTTGCCCCAGACACGTCCAAGAGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 300651 AGGAGGGCAGGCTGGGTGGTGGCCTTGCCCCAGACACGTCCAAGAGCTGT

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2398 GACCCACCTGGTGTGACTGGTTTGAATAAAAACCGAAGAAGCCTCCCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 300701 GACCCACCTGGTGTGACTGGTTTGAATAAAAACCGAAGAAGCCTCCCAGT

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2448 TTCCATCTGCCGGAGCTGTGAGACCCTGGAGGGCCCCCAGACTGTGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 300751 TTCCATCTGCCGGAGCTGTGAGACCCTGGAGGGCCCCCAGACTGTGGACA

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2498 CTTGGCCCCGATCCCATTCCCTGGATGACCTTCAAGTGGAGCCTGGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 300801 CTTGGCCCCGATCCCATTCCCTGGATGACCTTCAAGTGGAGCCTGGTGCT

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2548 GAGCAAGACGTGCCTACCGAGGTGACAGAACCGCCCCCTCAGATTGTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 300851 GAGCAAGACGTGCCTACCGAGGTGACAGAACCGCCCCCTCAGATTGTACC

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2598 TGAAGTGCCACAGAAGACGACCGCCTCTTCCACGAAGGCCCAGCCCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 300901 TGAAGTGCCACAGAAGACGACCGCCTCTTCCACGAAGGCCCAGCCCCTGG

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2648 AGCAAGACTCTGCTGTCGACAATGCATTGCTACTGACCCAAAGCAAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 300951 AGCAAGACTCTGCTGTCGACAATGCATTGCTACTGACCCAAAGCAAGAGA

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2698 TTTTCTGAACCTCAGAAATTGACAACTAAGAAACTGGAGGGCTCAATCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 301001 TTTTCTGAACCTCAGAAATTGACAACTAAGAAACTGGAGGGCTCAATCGC

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2748 AGCCTCTGGTCGCGGCCTGTCACCCCCTCAGTGTTTGCCCAGAAACTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 301051 AGCCTCTGGTCGCGGCCTGTCACCCCCTCAGTGTTTGCCCAGAAACTATG

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2798 ATGCTCAGCCTCCTGGAGCTAAACACGGTTTAGCAAGGACGCCTCTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 301101 ATGCTCAGCCTCCTGGAGCTAAACACGGTTTAGCAAGGACGCCTCTGGAG

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2848 GGCCACAGAAAAGGACACGAGTTTGAAGGAACACACCATCCCCTGGGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 301151 GGCCACAGAAAAGGACACGAGTTTGAAGGAACACACCATCCCCTGGGCAC

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2898 CAAAGAAGGGGTAGATGCTGAGCAGAGAATGCAGCCCAAAATTCCATCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 301201 CAAAGAAGGGGTAGATGCTGAGCAGAGAATGCAGCCCAAAATTCCATCAC

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2948 AGCCTCCACCTGTTCCTGCCAAAAAGAGCAGAGAACGCCTTGCTAACGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 301251 AGCCTCCACCTGTTCCTGCCAAAAAGAGCAGAGAACGCCTTGCTAACGGA

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2998 CTCCACCCTGTTCCCATGGGCCCCAGTGGGGCCCTCCCCAGTCCCGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 301301 CTCCACCCTGTTCCCATGGGCCCCAGTGGGGCCCTCCCCAGTCCCGATGC

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3048 GCCATGCCTGCCAGTGAAAAGGGGCAGCCCCGCCAGCCCCACCAGCCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 301351 GCCATGCCTGCCAGTGAAAAGGGGCAGCCCCGCCAGCCCCACCAGCCCTA

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3098 GCGACTGTCCCCCAGCACTGGCTCCCAGGCCTCTCTCAGGGCAGGCGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 301401 GCGACTGTCCCCCAGCACTGGCTCCCAGGCCTCTCTCAGGGCAGGCGCCT

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3148 GGCAGCCCACCAAGCACAAGGCCGCCCCCCTGGCTCTCAGAGCTCCCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 301451 GGCAGCCCACCAAGCACAAGGCCGCCCCCCTGGCTCTCAGAGCTCCCCGA

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3198 GAACACAAGCCTCCAGGAGCACGGTGTGAAGCTGGGCCCGGCTTTGACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 301501 GAACACAAGCCTCCAGGAGCACGGTGTGAAGCTGGGCCCGGCTTTGACCA

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3248 GGAAGGTCTCCTGTGCCCGGGGAGTGGATCTAGAAACGCTCACTGAAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 301551 GGAAGGTCTCCTGTGCCCGGGGAGTGGATCTAGAAACGCTCACTGAAAAC

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3298 AAGCTGCACGCTGAAGGCATCGATCTCACGGAGGAGCCGTATTCTGATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 301601 AAGCTGCACGCTGAAGGCATCGATCTCACGGAGGAGCCGTATTCTGATAA

   3500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3348 G         CATGGCCGCTGTGGGATTCCTGAAGCCCTGGTGCAGAGAT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 301651 GGTA...CAGCATGGCCGCTGTGGGATTCCTGAAGCCCTGGTGCAGAGAT

   3550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3389 ACGCAGAGGACTTGGATCAGCCCGAGCGGGACGTCGCCGCCAACATGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 302888 ACGCAGAGGACTTGGATCAGCCCGAGCGGGACGTCGCCGCCAACATGGAC

   3600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3439 CAGATCCGGGTGAAGCAGCTTCGGAAGCAGCACCGCATGGCG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 302938 CAGATCCGGGTGAAGCAGCTTCGGAAGCAGCACCGCATGGCGGTG...CA

   3650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3481  ATTCCAAGTGGTGGACTCACGGAAATCTGCCGAAAGCCCGTCTCTCCTG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 305127 GATTCCAAGTGGTGGACTCACGGAAATCTGCCGAAAGCCCGTCTCTCCTG

   3700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3530 GGTGCATTTCGTCTGTGTCAGATTGGCTCATTTCCATCGGTCTGCCCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 305177 GGTGCATTTCGTCTGTGTCAGATTGGCTCATTTCCATCGGTCTGCCCATG

   3750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3580 TACGCCGGCACCCTCTCCACCGCGGGCTTCAGCACACTGAGCCAAGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 305227 TACGCCGGCACCCTCTCCACCGCGGGCTTCAGCACACTGAGCCAAGTGCC

   3800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3630 TTCTCTGTCTCACACTTGCCTTCAGGAGGCCGGCATCACAGAGGAGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 305277 TTCTCTGTCTCACACTTGCCTTCAGGAGGCCGGCATCACAGAGGAGAGAC

   3850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3680 ACATAAGAAAGCTCCTATCTGCAGCCAGACTCTTCAAACTGCCGCCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 305327 ACATAAGAAAGCTCCTATCTGCAGCCAGACTCTTCAAACTGCCGCCAGGC

   3900     .    :
   3730 CCTGAGGCCATG
        ||||||||||||
 305377 CCTGAGGCCATG