seq1 = pF1KA0628.tfa, 1608 bp
seq2 = pF1KA0628/gi568815590f_143549873.tfa (gi568815590f:143549873_143751480), 201608 bp

>pF1KA0628 1608
>gi568815590f:143549873_143751480 (Chr8)

1-1608  (100001-101608)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATTTTGTTGTCTTTTGTTTCAGATTCTAATGTAGGAACTGGTGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATTTTGTTGTCTTTTGTTTCAGATTCTAATGTAGGAACTGGTGAGAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAAGGTGACTGAAGCCTGGATTTCTGAGGATGAAAACTCACATAGGACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GAAGGTGACTGAAGCCTGGATTTCTGAGGATGAAAACTCACATAGGACGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGTCAGACAGACTCACGGTGATGGAGCTCCCCTCTCCCGAGTCTGAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGTCAGACAGACTCACGGTGATGGAGCTCCCCTCTCCCGAGTCTGAGGAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTCCACGAGCCCAGATTAGGGGAGCTCTTGGGAAATCCAGAAGGTCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTCCACGAGCCCAGATTAGGGGAGCTCTTGGGAAATCCAGAAGGTCAGAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCTGGGGAGTTCCCCCTCTCAGGACAGGGGCTGCAAGCAGGTGACAGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCTGGGGAGTTCCCCCTCTCAGGACAGGGGCTGCAAGCAGGTGACAGTGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCCATTGGAAGATCCAGACAGGAGAGACAGCTCAAGTGTGCACCAAGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CCCATTGGAAGATCCAGACAGGAGAGACAGCTCAAGTGTGCACCAAGTCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGAAGAAACCATATTCTGAACTCAGACCTTCTTCTGCTTCAGAGAGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GGAAGAAACCATATTCTGAACTCAGACCTTCTTCTGCTTCAGAGAGAGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CATAGAGGGGGAAGCCAATCCTTGCGATATCTGTGGCAAAACCTTCACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CATAGAGGGGGAAGCCAATCCTTGCGATATCTGTGGCAAAACCTTCACGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TTAATTCGGACCTAGTTAGGCATCGGATTTCGCATGCTGGGGAGAAACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TTAATTCGGACCTAGTTAGGCATCGGATTTCGCATGCTGGGGAGAAACCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TACACGTGCGATCAGTGTGGGAAAGGCTTTGGCCAGAGCTCACACCTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TACACGTGCGATCAGTGTGGGAAAGGCTTTGGCCAGAGCTCACACCTTAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GGAGCATCAGAGAATTCACACTGGAGAGAGACTCTACGTCTGTAATGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GGAGCATCAGAGAATTCACACTGGAGAGAGACTCTACGTCTGTAATGTGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GTGGGAAAGACTTCATTCACTATTCAGGTCTCATTGAGCATCAGCGCGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GTGGGAAAGACTTCATTCACTATTCAGGTCTCATTGAGCATCAGCGCGTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CATTCAGGAGAAAAGCCCTTCAAATGTGCGCAGTGTGGGAAGGCGTTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CATTCAGGAGAAAAGCCCTTCAAATGTGCGCAGTGTGGGAAGGCGTTTTG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TCACAGTTCAGACCTGATTAGGCACCAGAGAGTTCACACCAGAGAGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TCACAGTTCAGACCTGATTAGGCACCAGAGAGTTCACACCAGAGAGAGAC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CTTTTGAATGCAAAGAGTGTGGGAAAGGCTTCAGTCAGAGCTCCTTACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CTTTTGAATGCAAAGAGTGTGGGAAAGGCTTCAGTCAGAGCTCCTTACTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 ATTCGCCATCAGAGGATTCACACGGGAGAAAGGCCCTATGAGTGCAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 ATTCGCCATCAGAGGATTCACACGGGAGAAAGGCCCTATGAGTGCAATGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 ATGTGGGAAATCCTTCATAAGGAGCTCGAGCCTCATTCGCCATTATCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 ATGTGGGAAATCCTTCATAAGGAGCTCGAGCCTCATTCGCCATTATCAGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TCCACACAGAAGTGAAACAGTATGAATGCAAAGAATGTGGGAAGGCATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TCCACACAGAAGTGAAACAGTATGAATGCAAAGAATGTGGGAAGGCATTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CGTCATCGCTCAGACCTTATTGAACACCAGAGAATTCACACCGGAGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CGTCATCGCTCAGACCTTATTGAACACCAGAGAATTCACACCGGAGAGAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 ACCCTTTGAATGCAATGAGTGTGGGAAAGCCTTTATTCGGAGTTCAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 ACCCTTTGAATGCAATGAGTGTGGGAAAGCCTTTATTCGGAGTTCAAAGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 TCATTCAGCATCAGAGGATCCATACTGGGGAGAGGCCTTACGTATGCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 TCATTCAGCATCAGAGGATCCATACTGGGGAGAGGCCTTACGTATGCAAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GAGTGTGGGAAGCGCTTCAGCCAGACGTCAAACTTCACCCAGCATCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GAGTGTGGGAAGCGCTTCAGCCAGACGTCAAACTTCACCCAGCATCAGAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 AATTCACACTGGAGAGAAACTCTATGAATGTAACGAGTGTGGGAAAGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 AATTCACACTGGAGAGAAACTCTATGAATGTAACGAGTGTGGGAAAGCTT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 TCTTTCTGAGTTCATACCTTATTCGACACCAGAAAATCCACACTGGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 TCTTTCTGAGTTCATACCTTATTCGACACCAGAAAATCCACACTGGAGAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 AGAGTGTATGAATGTAAGGAATGTGGGAAAGCGTTTCTCCAGAAAGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 AGAGTGTATGAATGTAAGGAATGTGGGAAAGCGTTTCTCCAGAAAGCCCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 TCTCACTGAGCACCAGAAGATCCACTCTGGGGACAGGCCCTTCGAATGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 TCTCACTGAGCACCAGAAGATCCACTCTGGGGACAGGCCCTTCGAATGTA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 AAGACTGTGGGAAAGCCTTCATCCAGAGCTCCAAGCTGCTTCTGCACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 AAGACTGTGGGAAAGCCTTCATCCAGAGCTCCAAGCTGCTTCTGCACCAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 ATTATTCACACTGGAGAAAAGCCCTATGTGTGCAGTTATTGTGGGAAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 ATTATTCACACTGGAGAAAAGCCCTATGTGTGCAGTTATTGTGGGAAAGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 CTTTATTCAGAGGTCAAACTTCCTTCAACACCAGAAAATTCATACTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 CTTTATTCAGAGGTCAAACTTCCTTCAACACCAGAAAATTCATACTGAAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 AGAAGCTCTATGAATGTAGTCAGTATGGGAGAGATTTTAACTCAACTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 AGAAGCTCTATGAATGTAGTCAGTATGGGAGAGATTTTAACTCAACTACA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 AACGTTAAAAATAATCAAAGGGTTCACCAAGAGGGACTCTCCTTGAGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 AACGTTAAAAATAATCAAAGGGTTCACCAAGAGGGACTCTCCTTGAGTAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 GGCCCCCATACATTTGGGTGAGAGGTCTGTAGATAAGGGGGAACACACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 GGCCCCCATACATTTGGGTGAGAGGTCTGTAGATAAGGGGGAACACACAG

   1600     .
   1601 GTAACTTA
        ||||||||
 101601 GTAACTTA