seq1 = pF1KA0598.tfa, 1683 bp
seq2 = pF1KA0598/gi568815588r_123910152.tfa (gi568815588r:123910152_124146212), 236061 bp

>pF1KA0598 1683
>gi568815588r:123910152_124146212 (Chr10)

(complement)

1-546  (100001-100546)   100% ->
547-886  (101294-101633)   100% ->
887-1033  (103766-103912)   100% ->
1034-1190  (107542-107698)   100% ->
1191-1347  (124801-124957)   100% ->
1348-1495  (133733-133880)   100% ->
1496-1683  (135874-136061)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGGCACTGCATTAATTGCTGCATACAGCTGTTACCCGACGGCGCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGGCACTGCATTAATTGCTGCATACAGCTGTTACCCGACGGCGCACA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAAGCAGCAGGTCAACTGCCAAGGGGGCCCCCATCACGGTCACCAGGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAAGCAGCAGGTCAACTGCCAAGGGGGCCCCCATCACGGTCACCAGGCGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCCCCACGTGCAAAGGAGAAAACAAAATTCTGTTTCGTGTGGACAGTAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCCCCACGTGCAAAGGAGAAAACAAAATTCTGTTTCGTGTGGACAGTAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CAGATGAACTTGCTTGCTGTTCTCGAAGTGAGGACTGAAGGGAACGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CAGATGAACTTGCTTGCTGTTCTCGAAGTGAGGACTGAAGGGAACGAAAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTGGGGTGGGTTTTTGCGCTTCAAAAAGGGGAAGCGATGTAGCCTCGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTGGGGTGGGTTTTTGCGCTTCAAAAAGGGGAAGCGATGTAGCCTCGTTT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TTGGACTGATAATAATGACCTTGGTAATGGCTTCTTACATCCTTTCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TTGGACTGATAATAATGACCTTGGTAATGGCTTCTTACATCCTTTCTGGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GCCCACCAAGAGCTTCTGATCTCATCACCTTTCCATTACGGAGGCTTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GCCCACCAAGAGCTTCTGATCTCATCACCTTTCCATTACGGAGGCTTCCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CAGCAACCCCAGCTTGATGGACAGCGAAAACCCAAGTGACACAAAGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CAGCAACCCCAGCTTGATGGACAGCGAAAACCCAAGTGACACAAAGGAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ATCACCACCAATCCTCTGTAAATAATATTTCATACATGAAGGACTATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ATCACCACCAATCCTCTGTAAATAATATTTCATACATGAAGGACTATCCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AGCATTAAATTAATTATCAACAGCATCACAACTAGGATTGAGTTCACGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AGCATTAAATTAATTATCAACAGCATCACAACTAGGATTGAGTTCACGAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CAGACAGCTCCCAGACTTAGAAGACCTTAAGAAGCAGGAGTTGCAT    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 100501 CAGACAGCTCCCAGACTTAGAAGACCTTAAGAAGCAGGAGTTGCATGTG.

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547      ATGTTTTCAGTCATCCCCAACAAATTCCTTCCAAACAGTAAGAGC
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ..CAGATGTTTTCAGTCATCCCCAACAAATTCCTTCCAAACAGTAAGAGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 CCCTGTTGGTACGAGGAGTTCTCGGGGCAGAACACCACCGACCCCTACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101339 CCCTGTTGGTACGAGGAGTTCTCGGGGCAGAACACCACCGACCCCTACCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 CACCAACTCCTACGTGCTCTACTCCAAGCGCTTCCGCTCCACCTTCGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101389 CACCAACTCCTACGTGCTCTACTCCAAGCGCTTCCGCTCCACCTTCGACG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 CCCTGCGCAAGGCCTTCTGGGGCCACCTGGCGCACGCGCACGGGAAGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101439 CCCTGCGCAAGGCCTTCTGGGGCCACCTGGCGCACGCGCACGGGAAGCAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 TTCCGCCTGCGCTGCCTGCCGCACTTCTACATCATAGGGCAGCCCAAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101489 TTCCGCCTGCGCTGCCTGCCGCACTTCTACATCATAGGGCAGCCCAAGTG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 CGGGACCACAGACCTCTATGACCGCCTGCGGCTGCACCCTGAGGTCAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101539 CGGGACCACAGACCTCTATGACCGCCTGCGGCTGCACCCTGAGGTCAAGT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 TCTCCGCCATCAAGGAGCCACACTGGTGGACCCGGAAGCGCTTTG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 101589 TCTCCGCCATCAAGGAGCCACACTGGTGGACCCGGAAGCGCTTTGGTG..

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    887     GAATCGTCCGCCTAAGAGATGGGCTGCGAGACCGCTATCCCGTGGA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101639 .TAGGAATCGTCCGCCTAAGAGATGGGCTGCGAGACCGCTATCCCGTGGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 AGATTATCTGGACCTCTTTGACCTGGCCGCACACCAGATCCATCAAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103812 AGATTATCTGGACCTCTTTGACCTGGCCGCACACCAGATCCATCAAGGAC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 TGCAGGCCAGCTCTGCAAAGGAGCAGAGCAAGATGAATACAATCATTATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103862 TGCAGGCCAGCTCTGCAAAGGAGCAGAGCAAGATGAATACAATCATTATC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 G         GGGAGGCCAGTGCCTCCACGATGTGGGATAATAATGCCTG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103912 GGTA...CAGGGGAGGCCAGTGCCTCCACGATGTGGGATAATAATGCCTG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 GACGTTCTTCTACGACAACAGCACGGATGGCGAGCCACCGTTTCTGACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107582 GACGTTCTTCTACGACAACAGCACGGATGGCGAGCCACCGTTTCTGACGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 AGGACTTCATCCACGCCTTTCAGCCAAATGCCAGACTGATTGTCATGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107632 AGGACTTCATCCACGCCTTTCAGCCAAATGCCAGACTGATTGTCATGCTC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 AGGGACCCTGTGGAGAG         GTTGTACTCAGACTATCTCTACTT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 107682 AGGGACCCTGTGGAGAGGTG...CAGGTTGTACTCAGACTATCTCTACTT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1215 TGCAAGTTCGAATAAATCCGCGGACGACTTCCATGAGAAAGTGACAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124825 TGCAAGTTCGAATAAATCCGCGGACGACTTCCATGAGAAAGTGACAGAAG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1265 CACTGCAGCTGTTTGAAAATTGCATGCTTGATTATTCACTGCGCGCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124875 CACTGCAGCTGTTTGAAAATTGCATGCTTGATTATTCACTGCGCGCCTGC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1315 GTCTACAACAACACCCTCAACAACGCCATGCCT         GTGAGGCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 124925 GTCTACAACAACACCCTCAACAACGCCATGCCTGTG...TAGGTGAGGCT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1356 CCAGGTTGGGCTCTATGCTGTGTACCTTCTGGACTGGCTCAGCGTTTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133741 CCAGGTTGGGCTCTATGCTGTGTACCTTCTGGACTGGCTCAGCGTTTTTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1406 ACAAGCAACAGTTTCTCATTCTTCGCCTGGAAGATCATGCATCCAACGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133791 ACAAGCAACAGTTTCTCATTCTTCGCCTGGAAGATCATGCATCCAACGTC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1456 AAGTACACCATGCACAAGGTCTTCCAGTTTCTGAACCTAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 133841 AAGTACACCATGCACAAGGTCTTCCAGTTTCTGAACCTAGGTA...TAGG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1497 GCCCTTAAGTGAGAAGCAGGAGGCTTTGATGACCAAGAGCCCCGCATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135875 GCCCTTAAGTGAGAAGCAGGAGGCTTTGATGACCAAGAGCCCCGCATCCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1547 ATGCACGGCGTCCCGAGGACCGGAACCTGGGGCCCATGTGGCCCATCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135925 ATGCACGGCGTCCCGAGGACCGGAACCTGGGGCCCATGTGGCCCATCACA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1597 CAGAAGATTCTGCGGGATTTCTACAGGCCCTTCAACGCTAGGCTGGCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135975 CAGAAGATTCTGCGGGATTTCTACAGGCCCTTCAACGCTAGGCTGGCGCA

   1700     .    :    .    :    .    :    .
   1647 GGTCCTCGCGGATGAGGCGTTTGCGTGGAAGACGACG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136025 GGTCCTCGCGGATGAGGCGTTTGCGTGGAAGACGACG