seq1 = pF1KA0519.tfa, 2757 bp
seq2 = pF1KA0519/gi568815590f_28616060.tfa (gi568815590f:28616060_28850863), 234804 bp

>pF1KA0519 2757
>gi568815590f:28616060_28850863 (Chr8)

1-2148  (100001-102148)   100% ->
2149-2276  (115164-115291)   100% ->
2277-2421  (121460-121604)   100% ->
2422-2550  (127027-127155)   100% ->
2551-2757  (134598-134804)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACAGGCTATACCATGCTGCGGAATGGGGGCGCGGGGAACGGAGGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACAGGCTATACCATGCTGCGGAATGGGGGCGCGGGGAACGGAGGTCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GACCTGCATGCTGCGCTGGTCCAACCGCATCCGCCTCACGTGGCTCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GACCTGCATGCTGCGCTGGTCCAACCGCATCCGCCTCACGTGGCTCAGCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCACGCTCTTTGTCATCCTGGTCTTCTTCCCGCTCATCGCCCACTATTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCACGCTCTTTGTCATCCTGGTCTTCTTCCCGCTCATCGCCCACTATTAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTCACCACTCTGGATGAGGCTGATGAGGCAGGCAAGCGGATTTTTGGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTCACCACTCTGGATGAGGCTGATGAGGCAGGCAAGCGGATTTTTGGTCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCGGGTGGGGAACGAGCTGTGCGAGGTGAAGCACGTGCTGGATCTGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCGGGTGGGGAACGAGCTGTGCGAGGTGAAGCACGTGCTGGATCTGTGCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCATCCGGGAGTCGGTGAGTGAAGAGCTCCTGCAGCTGGAGGCCAAGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCATCCGGGAGTCGGTGAGTGAAGAGCTCCTGCAGCTGGAGGCCAAGCGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CAAGAGCTGAACAGCGAGATCGCCAAGCTGAATCTGAAGATCGAAGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CAAGAGCTGAACAGCGAGATCGCCAAGCTGAATCTGAAGATCGAAGCCTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TAAGAAGAGCATTGAGAACGCCAAGCAGGACCTGCTCCAGCTCAAGAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TAAGAAGAGCATTGAGAACGCCAAGCAGGACCTGCTCCAGCTCAAGAATG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TCATCAGCCAGACCGAGCATTCCTACAAGGAGCTCATGGCCCAGAACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TCATCAGCCAGACCGAGCATTCCTACAAGGAGCTCATGGCCCAGAACCAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CCCAAGCTGTCCCTGCCCATCCGACTGCTCCCAGAGAAGGACGATGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CCCAAGCTGTCCCTGCCCATCCGACTGCTCCCAGAGAAGGACGATGCCGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CCTCCCTCCCCCGAAGGCCACTCGGGGCTGCCGGCTACACAACTGCTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CCTCCCTCCCCCGAAGGCCACTCGGGGCTGCCGGCTACACAACTGCTTTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ATTATTCTCGTTGCCCTCTCACCTCTGGCTTCCCGGTCTACGTCTATGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ATTATTCTCGTTGCCCTCTCACCTCTGGCTTCCCGGTCTACGTCTATGAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 AGTGACCAGTTTGTCTTTGGCAGCTACCTGGATCCCTTGGTCAAGCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 AGTGACCAGTTTGTCTTTGGCAGCTACCTGGATCCCTTGGTCAAGCAGGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TTTTCAGGCGACAGCACGAGCTAACGTTTATGTTACAGAAAATGCAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TTTTCAGGCGACAGCACGAGCTAACGTTTATGTTACAGAAAATGCAGACA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TCGCCTGCCTTTACGTGATACTAGTGGGAGAGATGCAGGAGCCGGTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TCGCCTGCCTTTACGTGATACTAGTGGGAGAGATGCAGGAGCCGGTGGTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CTGCGGCCTGCTGAGCTGGAGAAGCAGTTGTATTCCCTGCCACACTGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CTGCGGCCTGCTGAGCTGGAGAAGCAGTTGTATTCCCTGCCACACTGGCG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GACGGATGGACACAACCATGTCATCATCAATCTGTCACGTAAGTCAGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GACGGATGGACACAACCATGTCATCATCAATCTGTCACGTAAGTCAGATA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CACAGAACCTTCTCTATAACGTCAGTACTGGCCGTGCCATGGTGGCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CACAGAACCTTCTCTATAACGTCAGTACTGGCCGTGCCATGGTGGCCCAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 TCCACCTTCTACACTGTCCAGTACAGACCTGGCTTTGACTTGGTCGTATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 TCCACCTTCTACACTGTCCAGTACAGACCTGGCTTTGACTTGGTCGTATC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 ACCGCTGGTCCATGCCATGTCTGAGCCCAACTTCATGGAAATCCCACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 ACCGCTGGTCCATGCCATGTCTGAGCCCAACTTCATGGAAATCCCACCAC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 AGGTGCCGGTGAAGCGGAAATATCTCTTCACCTTCCAGGGCGAGAAGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 AGGTGCCGGTGAAGCGGAAATATCTCTTCACCTTCCAGGGCGAGAAGATT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GAGTCTCTGAGGTCTAGCCTTCAGGAGGCCCGCTCCTTCGAAGAGGAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GAGTCTCTGAGGTCTAGCCTTCAGGAGGCCCGCTCCTTCGAAGAGGAAAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 GGAGGGCGACCCTCCCGCCGACTACGATGACCGGATCATTGCCACCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 GGAGGGCGACCCTCCCGCCGACTACGATGACCGGATCATTGCCACCCTGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 AGGCGGTGCAGGACAGCAAGCTGGATCAGGTCCTGGTGGAATTCACCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 AGGCGGTGCAGGACAGCAAGCTGGATCAGGTCCTGGTGGAATTCACCTGC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 AAAAACCAGCCCAAACCCAGCCTGCCGACTGAGTGGGCACTGTGTGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 AAAAACCAGCCCAAACCCAGCCTGCCGACTGAGTGGGCACTGTGTGGAGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 GCGGGAGGACCGCTTGGAATTGCTGAAGCTCTCCACCTTCGCCCTCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 GCGGGAGGACCGCTTGGAATTGCTGAAGCTCTCCACCTTCGCCCTCATCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 TTACCCCCGGGGACCCTCGCTTGGTTATTTCCTCTGGGTGTGCAACACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 TTACCCCCGGGGACCCTCGCTTGGTTATTTCCTCTGGGTGTGCAACACGG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 CTCTTCGAAGCCCTGGAAGTCGGTGCCGTCCCGGTGGTGCTGGGGGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 CTCTTCGAAGCCCTGGAAGTCGGTGCCGTCCCGGTGGTGCTGGGGGAGCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 GGTCCAGCTTCCCTACCAGGACATGCTGCAGTGGAACGAGGCGGCCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 GGTCCAGCTTCCCTACCAGGACATGCTGCAGTGGAACGAGGCGGCCCTGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 TGGTGCCAAAGCCTCGTGTTACCGAGGTTCATTTCCTGCTCAGAAGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 TGGTGCCAAAGCCTCGTGTTACCGAGGTTCATTTCCTGCTCAGAAGCCTC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 TCCGATAGTGACCTCCTGGCTATGAGGCGGCAAGGCCGCTTTCTCTGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 TCCGATAGTGACCTCCTGGCTATGAGGCGGCAAGGCCGCTTTCTCTGGGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 GACTTACTTCTCCACTGCTGACAGTATTTTTAATACCGTGCTGGCTATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 GACTTACTTCTCCACTGCTGACAGTATTTTTAATACCGTGCTGGCTATGA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1601 TTAGGACTCGCATCCAGATCCCAGCCGCTCCCATCCGGGAAGAGGCGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101601 TTAGGACTCGCATCCAGATCCCAGCCGCTCCCATCCGGGAAGAGGCGGCA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1651 GCTGAGATCCCCCACCGTTCAGGCAAGGCGGCTGGAACTGACCCCAACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101651 GCTGAGATCCCCCACCGTTCAGGCAAGGCGGCTGGAACTGACCCCAACAT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1701 GGCTGACAACGGGGACCTGGACCTGGGGCCAGTGGAGACGGAGCCGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101701 GGCTGACAACGGGGACCTGGACCTGGGGCCAGTGGAGACGGAGCCGCCCT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1751 ACGCCTCACCCAGATACCTCCGCAATTTCACTCTGACTGTCACTGACTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101751 ACGCCTCACCCAGATACCTCCGCAATTTCACTCTGACTGTCACTGACTTT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1801 TACCGCAGCTGGAACTGTGCTCCAGGGCCTTTCCATCTTTTCCCCCACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101801 TACCGCAGCTGGAACTGTGCTCCAGGGCCTTTCCATCTTTTCCCCCACAC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1851 TCCCTTTGACCCTGTGTTGCCCTCAGAGGCCAAATTCTTGGGCTCAGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101851 TCCCTTTGACCCTGTGTTGCCCTCAGAGGCCAAATTCTTGGGCTCAGGGA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1901 CTGGCTTTCGGCCTATTGGTGGTGGAGCTGGGGGTTCTGGCAAGGAATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101901 CTGGCTTTCGGCCTATTGGTGGTGGAGCTGGGGGTTCTGGCAAGGAATTT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1951 CAGGCAGCGCTTGGAGGCAATGTTCCCCGAGAGCAGTTCACGGTGGTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101951 CAGGCAGCGCTTGGAGGCAATGTTCCCCGAGAGCAGTTCACGGTGGTGAT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2001 GTTGACTTATGAGCGGGAGGAAGTGCTTATGAACTCTTTAGAGAGGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102001 GTTGACTTATGAGCGGGAGGAAGTGCTTATGAACTCTTTAGAGAGGCTGA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2051 ATGGCCTCCCTTACCTGAACAAGGTCGTGGTGGTGTGGAATTCTCCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102051 ATGGCCTCCCTTACCTGAACAAGGTCGTGGTGGTGTGGAATTCTCCCAAG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2101 CTGCCATCAGAGGACCTTCTGTGGCCTGACATTGGCGTCCCCATCATG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 102101 CTGCCATCAGAGGACCTTCTGTGGCCTGACATTGGCGTCCCCATCATGGT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2149        GTGGTCCGTACTGAGAAGAACAGTTTGAACAACCGATTCTTAC
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102151 A...CAGGTGGTCCGTACTGAGAAGAACAGTTTGAACAACCGATTCTTAC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2192 CCTGGAATGAAATTGAGACAGAGGCCATCCTGTCCATTGATGACGATGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115207 CCTGGAATGAAATTGAGACAGAGGCCATCCTGTCCATTGATGACGATGCT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2242 CACCTCCGCCATGACGAAATCATGTTTGGGTTCCG         GGTGTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 115257 CACCTCCGCCATGACGAAATCATGTTTGGGTTCCGGTG...AAGGGTGTG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2283 GAGAGAAGCTCGGGACCGCATCGTGGGCTTCCCTGGCCGTTACCACGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121466 GAGAGAAGCTCGGGACCGCATCGTGGGCTTCCCTGGCCGTTACCACGCAT

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2333 GGGACATCCCCCATCAGTCCTGGCTCTACAACTCCAACTACTCCTGTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121516 GGGACATCCCCCATCAGTCCTGGCTCTACAACTCCAACTACTCCTGTGAG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2383 CTGTCCATGGTGCTGACAGGTGCTGCCTTCTTTCACAAG         TA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 121566 CTGTCCATGGTGCTGACAGGTGCTGCCTTCTTTCACAAGGTA...CAGTA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2424 TTATGCCTACCTGTATTCTTATGTGATGCCCCAGGCCATCCGGGACATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127029 TTATGCCTACCTGTATTCTTATGTGATGCCCCAGGCCATCCGGGACATGG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2474 TGGATGAATACATCAACTGTGAGGACATTGCCATGAACTTCCTTGTCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127079 TGGATGAATACATCAACTGTGAGGACATTGCCATGAACTTCCTTGTCTCC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2524 CACATCACTCGGAAGCCCCCCATCAAG         GTGACCTCACGGTG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 127129 CACATCACTCGGAAGCCCCCCATCAAGGTG...CAGGTGACCTCACGGTG

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2565 GACATTCCGATGCCCAGGATGCCCTCAGGCCCTGTCTCATGATGACTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134612 GACATTCCGATGCCCAGGATGCCCTCAGGCCCTGTCTCATGATGACTCCC

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2615 ACTTCCACGAGCGGCACAAGTGCATCAACTTCTTCGTGAAGGTGTACGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134662 ACTTCCACGAGCGGCACAAGTGCATCAACTTCTTCGTGAAGGTGTACGGC

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2665 TACATGCCCCTCCTGTACACGCAGTTCAGGGTGGATTCTGTGCTCTTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134712 TACATGCCCCTCCTGTACACGCAGTTCAGGGTGGATTCTGTGCTCTTCAA

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :
   2715 GACACGCCTGCCCCATGACAAGACCAAGTGCTTCAAGTTCATC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134762 GACACGCCTGCCCCATGACAAGACCAAGTGCTTCAAGTTCATC