seq1 = pF1KA0386.tfa, 3204 bp
seq2 = pF1KA0386/gi568815592r_24706376.tfa (gi568815592r:24706376_24975791), 269416 bp

>pF1KA0386 3204
>gi568815592r:24706376_24975791 (Chr6)

(complement)

1-101  (100001-100101)   100% ->
102-257  (101993-102148)   100% ->
258-336  (102833-102911)   100% ->
337-360  (104903-104926)   100% ->
361-414  (106645-106698)   100% ->
415-564  (110342-110491)   100% ->
565-628  (114756-114819)   100% ->
629-672  (123174-123217)   100% ->
673-798  (125070-125195)   100% ->
799-947  (125842-125990)   100% ->
948-1077  (127638-127767)   99% ->
1078-1227  (128101-128250)   100% ->
1228-1920  (132238-132930)   100% ->
1921-2102  (136520-136701)   100% ->
2103-2271  (139921-140089)   100% ->
2272-2407  (143401-143536)   100% ->
2408-2569  (145122-145283)   100% ->
2570-2728  (147497-147655)   99% ->
2729-2931  (150364-150566)   99% ->
2932-3015  (157167-157250)   100% ->
3016-3106  (165985-166075)   100% ->
3107-3204  (169319-169416)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTGGTAGGATCCCAGTCTTTTTCGCCTGGAGGGCCCAATGGGATCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTTGGTAGGATCCCAGTCTTTTTCGCCTGGAGGGCCCAATGGGATCAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TAGAAGCCAGTCCTTTGCGGGTTTCAGCGGCCTCCAGGAAAGGCGATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TAGAAGCCAGTCCTTTGCGGGTTTCAGCGGCCTCCAGGAAAGGCGATCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 G         GTGTAACTCCTTCATTGAAAATTCCTCCGCTCTCAAGAAG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGCA...TAGGTGTAACTCCTTCATTGAAAATTCCTCCGCTCTCAAGAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CCTCAGGCCAAACTGAAGAAAATGCACAATTTAGGCCACAAAAACAACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102033 CCTCAGGCCAAACTGAAGAAAATGCACAATTTAGGCCACAAAAACAACAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TCCCCCCAAAGAGCCTCAGCCTAAAAGGGTGGAAGAAGTCTACAGGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102083 TCCCCCCAAAGAGCCTCAGCCTAAAAGGGTGGAAGAAGTCTACAGGGCCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGAAAAATGGACTTGA         TGAATATCTGGAGGTTCACCAGACG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 102133 TGAAAAATGGACTTGAGTA...CAGTGAATATCTGGAGGTTCACCAGACG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GAGCTGGACAAGTTGACAGCTCAGTTAAAAGATATGAAAAGAAACTCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102858 GAGCTGGACAAGTTGACAGCTCAGTTAAAAGATATGAAAAGAAACTCTCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CCTG         GGTGTACTGTATGACCTAGACAAG         CAAA
        ||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 102908 CCTGGTA...TAGGGTGTACTGTATGACCTAGACAAGGTA...CAGCAAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 TTAAAACAATTGAAAGATACATGAGACGCCTGGAGTTTCATATAAGTAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106649 TTAAAACAATTGAAAGATACATGAGACGCCTGGAGTTTCATATAAGTAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415          GTAGATGAACTCTATGAAGCTTATTGTATCCAGCGACGCCT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106699 GTA...CAGGTAGATGAACTCTATGAAGCTTATTGTATCCAGCGACGCCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 CCAGGATGGTGCCAGCAAAATGAAGCAAGCCTTCGCAACATCCCCTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110383 CCAGGATGGTGCCAGCAAAATGAAGCAAGCCTTCGCAACATCCCCTGCCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 GCAAAGCTGCCCGGGAGAGTCTGACAGAGATCAATCGGAGCTTCAAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110433 GCAAAGCTGCCCGGGAGAGTCTGACAGAGATCAATCGGAGCTTCAAGGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 TACACAGAG         AATATGTGCACCATTGAAGTGGAGCTAGAGAA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 110483 TACACAGAGGTA...CAGAATATGTGCACCATTGAAGTGGAGCTAGAGAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 TCTGCTGGGAGAATTCTCCATCAAGATGAAAG         GTCTGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 114788 TCTGCTGGGAGAATTCTCCATCAAGATGAAAGGTA...CAGGTCTGGCTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    638 GCTTTGCACGCCTCTGTCCTGGAGATCAATATGAA         ATTTTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 123183 GCTTTGCACGCCTCTGTCCTGGAGATCAATATGAAGTA...CAGATTTTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    679 ATGAAGTATGGCCGGCAGCGGTGGAAACTGAAAGGCAAAATAGAAGTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125076 ATGAAGTATGGCCGGCAGCGGTGGAAACTGAAAGGCAAAATAGAAGTAAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    729 TGGCAAGCAGAGCTGGGATGGAGAAGAAACAGTTTTTCTGCCCCTGATAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125126 TGGCAAGCAGAGCTGGGATGGAGAAGAAACAGTTTTTCTGCCCCTGATAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 TTGGGTTCATCTCCATCAAG         GTCACGGAGCTCAAAGGGCTA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 125176 TTGGGTTCATCTCCATCAAGGTA...TAGGTCACGGAGCTCAAAGGGCTA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    820 GCAACTCACATCCTGGTAGGTAGCGTGACCTGTGAGACCAAAGAGCTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125863 GCAACTCACATCCTGGTAGGTAGCGTGACCTGTGAGACCAAAGAGCTGTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    870 TGCAGCCCGACCTCAGGTAGTGGCTGTCGACATCAATGACCTTGGTACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125913 TGCAGCCCGACCTCAGGTAGTGGCTGTCGACATCAATGACCTTGGTACCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 TCAAACTGAACCTGGAAATCACCTGGTA         TCCATTTGACATG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||| ||
 125963 TCAAACTGAACCTGGAAATCACCTGGTAGTA...CAGTCCATTTGACGTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    961 GAGGACATGACCGCATCCTCAGGCGCTGGGAACAAGGCAGCAGCCCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127651 GAGGACATGACCGCATCCTCAGGCGCTGGGAACAAGGCAGCAGCCCTTCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1011 GAGGAGAATGTCCATGTACAGCCAGGGTACCCCGGAAACGCCCACCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127701 GAGGAGAATGTCCATGTACAGCCAGGGTACCCCGGAAACGCCCACCTTCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1061 AAGACCACTCCTTCTTT         AGGTGGCTGCATCCTTCCCCAGAC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 127751 AAGACCACTCCTTCTTTGTA...AAGAGGTGGCTGCATCCTTCCCCAGAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1102 AAGCCCAGGCGGCTGTCTGTCTTGAGTGCCTTGCAAGACACTTTCTTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128125 AAGCCCAGGCGGCTGTCTGTCTTGAGTGCCTTGCAAGACACTTTCTTTGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1152 CAAGCTGCACCGCAGCCGCTCCTTCAGTGACCTGCCCTCCCTCAGGCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128175 CAAGCTGCACCGCAGCCGCTCCTTCAGTGACCTGCCCTCCCTCAGGCCGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1202 GTCCCAAGGCCGTGCTAGAGCTCTAT         TCAAATCTACCTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 128225 GTCCCAAGGCCGTGCTAGAGCTCTATGTG...TAGTCAAATCTACCTGAT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1243 GACATCTTTGAAAATGGAAAGGCAGCCGAGGAGAAAATGCCACTGTCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132253 GACATCTTTGAAAATGGAAAGGCAGCCGAGGAGAAAATGCCACTGTCGCT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1293 CAGCTTCAGTGACCTGCCCAACGGGGACTGCGCCCTCACCTCCCACTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132303 CAGCTTCAGTGACCTGCCCAACGGGGACTGCGCCCTCACCTCCCACTCAA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1343 CAGGCTCCCCTTCCAACTCAACAAATCCAGAAATTACCATCACCCCTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132353 CAGGCTCCCCTTCCAACTCAACAAATCCAGAAATTACCATCACCCCTGCG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1393 GAGTTTAACCTCAGCAGCTTGGCCTCCCAGAATGAGGGTATGGATGACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132403 GAGTTTAACCTCAGCAGCTTGGCCTCCCAGAATGAGGGTATGGATGACAC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1443 CAGCTCAGCATCTTCCAGGAACTCCCTGGGAGAAGGCCAAGAGCCAAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132453 CAGCTCAGCATCTTCCAGGAACTCCCTGGGAGAAGGCCAAGAGCCAAAGT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1493 CACACCTGAAGGAGGAAGACCCAGAGGAGCCCAGAAAACCTGCCTCGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132503 CACACCTGAAGGAGGAAGACCCAGAGGAGCCCAGAAAACCTGCCTCGGCC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1543 CCATCTGAGGCTTGCCGCCGACAGTCCTCAGGTGCTGGGGCTGAGCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132553 CCATCTGAGGCTTGCCGCCGACAGTCCTCAGGTGCTGGGGCTGAGCACCT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 GTTCCTTGAGAATGATGTTGCAGAAGCACTTCTGCAAGAGTCTGAGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132603 GTTCCTTGAGAATGATGTTGCAGAAGCACTTCTGCAAGAGTCTGAGGAGG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 CCTCTGAGCTCAAGCCTGTGGAACTGGACACTTCGGAAGGAAACATCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132653 CCTCTGAGCTCAAGCCTGTGGAACTGGACACTTCGGAAGGAAACATCACA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 AAGCAGCTGGTCAAGAGGCTCACATCTGCAGAGGTGCCAATGGCCACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132703 AAGCAGCTGGTCAAGAGGCTCACATCTGCAGAGGTGCCAATGGCCACAGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1743 CAGGCTGCTCTCTGAGGGTTCTGTTGGTGGAGAATCTGAAGGCTGCAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132753 CAGGCTGCTCTCTGAGGGTTCTGTTGGTGGAGAATCTGAAGGCTGCAGAT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1793 CCTTTCTAGATGGAAGCTTAGAGGATGCTTTTAATGGGCTTTTACTTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132803 CCTTTCTAGATGGAAGCTTAGAGGATGCTTTTAATGGGCTTTTACTTGCA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1843 TTAGAACCACATAAAGAGCAGTATAAAGAGTTTCAGGATCTGAACCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132853 TTAGAACCACATAAAGAGCAGTATAAAGAGTTTCAGGATCTGAACCAAGA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1893 AGTCATGAATTTGGATGATATTCTAAAA         TGCAAGCCAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 132903 AGTCATGAATTTGGATGATATTCTAAAAGTA...CAGTGCAAGCCAGCAG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1934 TAAGCCGCAGCAGGTCTTCCAGTTTAAGTCTCACAGTTGAAAGTGCTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136533 TAAGCCGCAGCAGGTCTTCCAGTTTAAGTCTCACAGTTGAAAGTGCTTTA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1984 GAAAGCTTTGATTTCCTGAACACCTCTGATTTTGACGAGGAGGAGGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136583 GAAAGCTTTGATTTCCTGAACACCTCTGATTTTGACGAGGAGGAGGATGG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2034 TGATGAGGTTTGTAATGTTGGCGGAGGTGCTGACTCAGTATTTTCAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136633 TGATGAGGTTTGTAATGTTGGCGGAGGTGCTGACTCAGTATTTTCAGACA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2084 CTGAGACTGAGAAACACAG         TTACAGGTCGGTTCACCCAGAA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 136683 CTGAGACTGAGAAACACAGGTA...TAGTTACAGGTCGGTTCACCCAGAA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2125 GCCAGGGGGCATCTCAGTGAAGCGCTCACTGAAGACACAGGAGTTGGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139943 GCCAGGGGGCATCTCAGTGAAGCGCTCACTGAAGACACAGGAGTTGGGAC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2175 CAGTGTGGCAGGAAGTCCTCTCCCACTGACCACAGGCAACGAGAGCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139993 CAGTGTGGCAGGAAGTCCTCTCCCACTGACCACAGGCAACGAGAGCCTGG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2225 ACATCACCATCGTCAGGCACCTCCAGTACTGCACCCAACTCGTGCAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 140043 ACATCACCATCGTCAGGCACCTCCAGTACTGCACCCAACTCGTGCAGGTA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2272       CAAATTGTTTTCTCAAGCAAAACCCCATTTGTGGCAAGAAGTCT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140093 ...CAGCAAATTGTTTTCTCAAGCAAAACCCCATTTGTGGCAAGAAGTCT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2316 CTTAGAGAAGCTTTCTAGGCAGATCCAAGTGATGGAGAAACTCGCAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143445 CTTAGAGAAGCTTTCTAGGCAGATCCAAGTGATGGAGAAACTCGCAGCTG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2366 TCAGTGATGAGAACATAGGAAATATCAGTTCTGTTGTGGAAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 143495 TCAGTGATGAGAACATAGGAAATATCAGTTCTGTTGTGGAAGGTA...CA

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2408  CCATACCAGAATTTCACAAAAAGCTGTCTTTGCTGTCATTCTGGACCAA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145121 GCCATACCAGAATTTCACAAAAAGCTGTCTTTGCTGTCATTCTGGACCAA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2457 GTGCTGCAGCCCTGTTGGTGTCTACCACAGCCCAGCGGACAGAGTGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145171 GTGCTGCAGCCCTGTTGGTGTCTACCACAGCCCAGCGGACAGAGTGATGA

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2507 AGCAGCTGGAGGCCAGCTTTGCCAGAACTGTCAACAAAGAATATCCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145221 AGCAGCTGGAGGCCAGCTTTGCCAGAACTGTCAACAAAGAATATCCAGGA

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2557 CTTGCAGACCCAG         TGTTTCGAACCCTGGTGTCCCAAATTCT
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 145271 CTTGCAGACCCAGGTA...TAGTGTTTCGAACCCTGGTGTCCCAAATTCT

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2598 GGACCAGGCTGAGCCTCTGCTTTCCTCCAGCCTGTCCTCGGAAGTCGTCA
        ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147525 GGACCGGGCTGAGCCTCTGCTTTCCTCCAGCCTGTCCTCGGAAGTCGTCA

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2648 CTGTTTTCCAGTATTACAGTTACTTCACCAGCCACGGCGTCAGTGACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147575 CTGTTTTCCAGTATTACAGTTACTTCACCAGCCACGGCGTCAGTGACCTG

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2698 GAGAGTTACCTGAGCCAGCTGGCCAGGCAAG         TTTCCATGGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 147625 GAGAGTTACCTGAGCCAGCTGGCCAGGCAAGGTG...CAGTTTCCATGGT

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2739 TCAGACTCTGCAATCACTAAGAGATGAAAAACTGCTACAAACCATGAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150374 TCAGACTCTGCAATCACTAAGAGATGAAAAACTGCTACAAACCATGAGTG

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2789 ACCTTGCTCCCAGCAACCTCCTGGCCCAGCAGGAAGTACTCAGGACTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150424 ACCTTGCTCCCAGCAACCTCCTGGCCCAGCAGGAAGTACTCAGGACTCTG

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2839 GCTCTGCTATTAACCAGAGAGGACAACGAAGTTAGCGAGGCTGTGACGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
 150474 GCTCTGCTATTAACCAGAGAGGACAACGAAGTTAGTGAGGCTGTGACGCT

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2889 TTACTTGGCAGCAGCCTCCAAAAATCAGCATTTCAGGGAAAAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 150524 TTACTTGGCAGCAGCCTCCAAAAATCAGCATTTCAGGGAAAAGGTA...C

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2932   GCCTTGCTCTATTACTGTGAAGCACTAACAAAGACAAACCTCCAGCTC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157165 AGGCCTTGCTCTATTACTGTGAAGCACTAACAAAGACAAACCTCCAGCTC

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2980 CAGAAAGCAGCTTGCCTGGCTCTGAAAATCCTTGAG         GCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 157215 CAGAAAGCAGCTTGCCTGGCTCTGAAAATCCTTGAGGTA...TAGGCTAC

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3021 TGAAAGCATTAAAATGCTGGTGACATTGTGTCAATCTGATACTGAAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165990 TGAAAGCATTAAAATGCTGGTGACATTGTGTCAATCTGATACTGAAGAAA

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3071 TCAGAAATGTGGCCTCAGAAACCCTCTTGTCTCTGG         GAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 166040 TCAGAAATGTGGCCTCAGAAACCCTCTTGTCTCTGGGTG...TAGGAGAA

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3112 GATGGGCGGCTGGCATATGAACAATTGGACAAATTTCCTCGAGACTGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169324 GATGGGCGGCTGGCATATGAACAATTGGACAAATTTCCTCGAGACTGTGT

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :
   3162 TAAAGTCGGAGGTCGTCATGGAACTGAAGTTGCCACAGCCTTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169374 TAAAGTCGGAGGTCGTCATGGAACTGAAGTTGCCACAGCCTTT