seq1 = pF1KA0369.tfa, 2187 bp
seq2 = pF1KA0369/gi568815585r_35674645.tfa (gi568815585r:35674645_36226137), 551493 bp

>pF1KA0369 2187
>gi568815585r:35674645_36226137 (Chr13)

(complement)

1-376  (100001-100376)   100% ->
377-723  (113923-114269)   100% ->
724-823  (278681-278780)   100% ->
824-940  (354798-354914)   100% ->
941-1035  (371545-371639)   100% ->
1036-1120  (386962-387046)   100% ->
1121-1229  (389997-390105)   100% ->
1230-1287  (397831-397888)   98% ->
1288-1407  (398384-398503)   100% ->
1408-1554  (403263-403409)   100% ->
1555-1688  (415170-415303)   100% ->
1689-1766  (417043-417120)   100% ->
1767-1863  (417818-417914)   100% ->
1864-1944  (420359-420439)   100% ->
1945-2058  (432659-432772)   100% ->
2059-2132  (437853-437926)   100% ->
2133-2187  (451439-451493)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCTTCGGCAGAGACATGGAGCTGGAGCACTTCGACGAGCGGGATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCCTTCGGCAGAGACATGGAGCTGGAGCACTTCGACGAGCGGGATAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCGCAGAGATACAGCCGAGGGTCGCGGGTGAACGGCCTGCCGAGCCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCGCAGAGATACAGCCGAGGGTCGCGGGTGAACGGCCTGCCGAGCCCGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGCACAGCGCCCACTGCAGCTTCTACCGCACCCGCACGCTGCAGACGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGCACAGCGCCCACTGCAGCTTCTACCGCACCCGCACGCTGCAGACGCTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AGCTCCGAGAAGAAGGCCAAGAAAGTTCGTTTCTATCGAAACGGAGATCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AGCTCCGAGAAGAAGGCCAAGAAAGTTCGTTTCTATCGAAACGGAGATCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 ATACTTCAAAGGGATTGTGTATGCCATCTCCCCAGACCGGTTCCGATCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 ATACTTCAAAGGGATTGTGTATGCCATCTCCCCAGACCGGTTCCGATCTT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TTGAGGCCCTGCTGGCTGATTTGACCCGAACTCTGTCGGATAACGTGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TTGAGGCCCTGCTGGCTGATTTGACCCGAACTCTGTCGGATAACGTGAAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTGCCCCAGGGAGTGAGAACAATCTACACCATTGATGGGCTCAAGAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TTGCCCCAGGGAGTGAGAACAATCTACACCATTGATGGGCTCAAGAAGAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TTCCAGCCTGGACCAACTGGTGGAAG         GAGAGAGTTATGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 100351 TTCCAGCCTGGACCAACTGGTGGAAGGTG...TAGGAGAGAGTTATGTAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 GTGGCTCCATAGAGCCCTTCAAGAAACTGGAGTACACCAAGAATGTGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113938 GTGGCTCCATAGAGCCCTTCAAGAAACTGGAGTACACCAAGAATGTGAAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CCCAACTGGTCGGTGAACGTCAAGACCACCTCGGCTTCTCGGGCAGTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113988 CCCAACTGGTCGGTGAACGTCAAGACCACCTCGGCTTCTCGGGCAGTGTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 TTCACTGGCCACTGCCAAAGGAAGCCCTTCAGAGGTGCGAGAGAATAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114038 TTCACTGGCCACTGCCAAAGGAAGCCCTTCAGAGGTGCGAGAGAATAAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 ATTTCATTCGGCCCAAGCTGGTCACCATCATCAGAAGTGGCGTGAAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114088 ATTTCATTCGGCCCAAGCTGGTCACCATCATCAGAAGTGGCGTGAAGCCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 CGGAAAGCTGTCAGGATTCTGCTGAACAAGAAAACGGCTCATTCCTTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114138 CGGAAAGCTGTCAGGATTCTGCTGAACAAGAAAACGGCTCATTCCTTTGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 GCAGGTCCTCACCGATATCACCGATGCCATCAAGCTGGACTCGGGAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114188 GCAGGTCCTCACCGATATCACCGATGCCATCAAGCTGGACTCGGGAGTGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 TGAAACGCCTGTACACGTTGGATGGGAAACAG         GTGATGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 114238 TGAAACGCCTGTACACGTTGGATGGGAAACAGGTA...TAGGTGATGTGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 CTTCAGGACTTTTTTGGTGATGATGACATTTTTATTGCATGTGGACCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 278690 CTTCAGGACTTTTTTGGTGATGATGACATTTTTATTGCATGTGGACCGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 GAAGTTCCGTTACCAGGATGATTTCTTGCTAGATGAAAGTG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 278740 GAAGTTCCGTTACCAGGATGATTTCTTGCTAGATGAAAGTGGTA...CAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 AATGTCGAGTGGTAAAGTCCACTTCTTACACCAAAATAGCTTCATCATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 354798 AATGTCGAGTGGTAAAGTCCACTTCTTACACCAAAATAGCTTCATCATCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 CGCAGGAGCACCACCAAGAGCCCAGGACCGTCCAGGCGTAGCAAGTCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 354848 CGCAGGAGCACCACCAAGAGCCCAGGACCGTCCAGGCGTAGCAAGTCCCC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 TGCCTCCACCAGCTCAG         TTAATGGAACCCCTGGTAGTCAGC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 354898 TGCCTCCACCAGCTCAGGTA...TAGTTAATGGAACCCCTGGTAGTCAGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 TCTCTACTCCGCGCTCAGGCAAGTCGCCAAGCCCATCACCCACCAGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 371569 TCTCTACTCCGCGCTCAGGCAAGTCGCCAAGCCCATCACCCACCAGCCCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 GGAAGCCTGCGGAAGCAGAGG         AGCTCTCAGCATGGCGGCTC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 371619 GGAAGCCTGCGGAAGCAGAGGGTA...CAGAGCTCTCAGCATGGCGGCTC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 CTCTACGTCACTTGCGTCCACCAAAGTCTGCAGCTCGATGGATGAGAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 386982 CTCTACGTCACTTGCGTCCACCAAAGTCTGCAGCTCGATGGATGAGAACG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 ATGGCCCTGGAGAAG         AAGTGTCGGAGGAAGGCTTCCAGATT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 387032 ATGGCCCTGGAGAAGGTG...CAGAAGTGTCGGAGGAAGGCTTCCAGATT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 CCAGCTACAATAACAGAACGATATAAAGTCGGAAGAACAATAGGAGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 390023 CCAGCTACAATAACAGAACGATATAAAGTCGGAAGAACAATAGGAGATGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 AAATTTTGCTGTTGTCAAGGAATGTGTAGAAAG         ATCGACTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 390073 AAATTTTGCTGTTGTCAAGGAATGTGTAGAAAGGTG...CAGATCGACTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 CTAGAGAGTACGCTCTGAAAATTATCAAGAAAAGCAAATGTCGAGGCAAA
        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 397839 CTAGAGAGTATGCTCTGAAAATTATCAAGAAAAGCAAATGTCGAGGCAAA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288          GAGCACATGATCCAGAATGAAGTGTCTATTTTAAGAAGAGT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 397889 GTA...CAGGAGCACATGATCCAGAATGAAGTGTCTATTTTAAGAAGAGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 GAAGCATCCCAATATCGTTCTTCTGATTGAGGAGATGGATGTGCCAACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 398425 GAAGCATCCCAATATCGTTCTTCTGATTGAGGAGATGGATGTGCCAACTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 AACTGTATCTTGTCATGGAATTAGTAAAG         GGGGGAGACCTT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 398475 AACTGTATCTTGTCATGGAATTAGTAAAGGTG...CAGGGGGGAGACCTT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 TTTGATGCCATTACTTCCACTAACAAATACACCGAGAGAGACGCCAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 403275 TTTGATGCCATTACTTCCACTAACAAATACACCGAGAGAGACGCCAGTGG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 GATGCTGTACAACCTAGCCAGCGCCATCAAATACCTGCATAGCCTGAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 403325 GATGCTGTACAACCTAGCCAGCGCCATCAAATACCTGCATAGCCTGAACA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1520 TCGTCCACCGTGATATCAAGCCAGAGAACCTGCTG         GTGTAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 403375 TCGTCCACCGTGATATCAAGCCAGAGAACCTGCTGGTA...TAGGTGTAT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 GAGCACCAAGATGGCAGCAAATCACTGAAGCTGGGTGACTTTGGACTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 415176 GAGCACCAAGATGGCAGCAAATCACTGAAGCTGGGTGACTTTGGACTGGC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1611 CACCATTGTAGACGGCCCCCTGTACACAGTCTGTGGCACCCCAACATACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 415226 CACCATTGTAGACGGCCCCCTGTACACAGTCTGTGGCACCCCAACATACG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1661 TGGCTCCAGAAATCATTGCAGAGACTGG         ATACGGCCTCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 415276 TGGCTCCAGAAATCATTGCAGAGACTGGGTA...CAGATACGGCCTCAAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1702 GTGGACATCTGGGCAGCAGGTGTAATCACTTATATCCTGCTGTGTGGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 417056 GTGGACATCTGGGCAGCAGGTGTAATCACTTATATCCTGCTGTGTGGTTT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1752 CCCTCCATTCCGTGG         AAGTGGTGATGACCAGGAGGTGCTTT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 417106 CCCTCCATTCCGTGGGTA...CAGAAGTGGTGATGACCAGGAGGTGCTTT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1793 TTGATCAGATTTTGATGGGGCAGGTGGACTTTCCTTCTCCATACTGGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 417844 TTGATCAGATTTTGATGGGGCAGGTGGACTTTCCTTCTCCATACTGGGAT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1843 AATGTTTCCGATTCTGCAAAG         GAGCTCATTACCATGATGCT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 417894 AATGTTTCCGATTCTGCAAAGGTA...CAGGAGCTCATTACCATGATGCT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1884 GTTGGTCGATGTAGATCAGCGATTTTCTGCTGTTCAAGTACTTGAGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 420379 GTTGGTCGATGTAGATCAGCGATTTTCTGCTGTTCAAGTACTTGAGCATC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1934 CCTGGGTTAAT         GATGATGGCCTCCCAGAAAATGAACATCAG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 420429 CCTGGGTTAATGTA...CAGGATGATGGCCTCCCAGAAAATGAACATCAG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1975 CTGTCAGTAGCTGGAAAGATAAAGAAGCATTTCAACACAGGCCCCAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 432689 CTGTCAGTAGCTGGAAAGATAAAGAAGCATTTCAACACAGGCCCCAAGCC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2025 GAATAGCACAGCAGCTGGAGTTTCTGTCATAGCA         CTGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 432739 GAATAGCACAGCAGCTGGAGTTTCTGTCATAGCAGTA...CAGCTGGACC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2066 ACGGGTTTACCATCAAGAGATCAGGGTCTTTGGACTACTACCAGCAACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 437860 ACGGGTTTACCATCAAGAGATCAGGGTCTTTGGACTACTACCAGCAACCA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2116 GGAATGTATTGGATAAG         ACCACCGCTCTTGATAAGGAGAGG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 437910 GGAATGTATTGGATAAGGTA...TAGACCACCGCTCTTGATAAGGAGAGG

   2300     .    :    .    :    .    :
   2157 CAGGTTTTCCGACGAAGACGCAACCAGGATG
        |||||||||||||||||||||||||||||||
 451463 CAGGTTTTCCGACGAAGACGCAACCAGGATG