seq1 = pF1KA0350.tfa, 3159 bp
seq2 = pF1KA0350/gi568815582f_10844718.tfa (gi568815582f:10844718_11278687), 433970 bp

>pF1KA0350 3159
>gi568815582f:10844718_11278687 (Chr16)

1-80  (100001-100080)   100% ->
81-209  (113065-113193)   100% ->
210-343  (117738-117871)   100% ->
344-492  (124444-124592)   100% ->
493-604  (126408-126519)   97% ->
605-728  (128221-128344)   100% ->
729-903  (132508-132682)   100% ->
904-957  (134612-134665)   100% ->
958-1071  (138161-138274)   100% ->
1072-1303  (158357-158588)   100% ->
1304-1436  (175476-175608)   100% ->
1437-1537  (180104-180204)   100% ->
1538-1660  (195037-195159)   100% ->
1661-1770  (197537-197646)   100% ->
1771-1815  (199311-199355)   100% ->
1816-1866  (202575-202625)   100% ->
1867-1995  (206796-206924)   100% ->
1996-2116  (216185-216305)   100% ->
2117-2268  (275898-276049)   100% ->
2269-2473  (279025-279229)   100% ->
2474-2641  (281262-281429)   100% ->
2642-2806  (321671-321835)   100% ->
2807-3159  (333618-333970)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTTGGCCGCTCGCGGAGCTGGGTGGGCGGGGGCCATGGCAAGACTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTTTGGCCGCTCGCGGAGCTGGGTGGGCGGGGGCCATGGCAAGACTTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCGCAACATCCACTCCTTGGACCACCTCAA         GTATCTGTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 100051 CCGCAACATCCACTCCTTGGACCACCTCAAGTG...CAGGTATCTGTACC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ACGTTTTGACCAAAAACACCACAGTCACAGAACAGAACCGGAACCTGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113076 ACGTTTTGACCAAAAACACCACAGTCACAGAACAGAACCGGAACCTGCTA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GTGGAGACCATCCGTTCCATCACTGAGATCCTGATCTGGGGAGATCAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113126 GTGGAGACCATCCGTTCCATCACTGAGATCCTGATCTGGGGAGATCAAAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGACAGCTCTGTATTTGA         CTTCTTCCTGGAGAAGAATATGT
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 113176 TGACAGCTCTGTATTTGAGTA...CAGCTTCTTCCTGGAGAAGAATATGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TTGTTTTCTTCTTGAACATCTTGCGGCAAAAGTCGGGCCGTTACGTGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117761 TTGTTTTCTTCTTGAACATCTTGCGGCAAAAGTCGGGCCGTTACGTGTGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GTTCAGCTGCTGCAGACCTTGAACATCCTCTTTGAGAACATCAGTCACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117811 GTTCAGCTGCTGCAGACCTTGAACATCCTCTTTGAGAACATCAGTCACGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GACCTCACTTT         ATTATTTGCTCTCAAATAACTACGTAAATT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 117861 GACCTCACTTTGTA...TAGATTATTTGCTCTCAAATAACTACGTAAATT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CTATCATCGTTCATAAATTTGACTTTTCTGATGAGGAGATTATGGCCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124474 CTATCATCGTTCATAAATTTGACTTTTCTGATGAGGAGATTATGGCCTAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TATATATCGTTCCTGAAAACACTTTCGTTAAAACTCAACAACCACACTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124524 TATATATCGTTCCTGAAAACACTTTCGTTAAAACTCAACAACCACACTGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CCATTTCTTTTATAATGAG         CACACCAATGACTTTGCCCTGT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 124574 CCATTTCTTTTATAATGAGGTA...TAGCACACCAATGACTTTGCCCTGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 ACACAGAAGCCATCAAGTTTTTCAACCACCCTGAAAGCATGGTTAGAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126430 ACACAGAAGCCATCAAGTTTTTCAACCACCCTGAAAGCATGGTTAGAATT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GCTGTAAGAACCATAACTTTGAATGTCTATAAAGTGTCA T         
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||-|| |-|>>>...>>>
 126480 GCTGTAAGAACCATAACTTTGAATGTCTATAAAG GTAAGTGTC...CAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    605 TGGATAACCAGGCCATGCTGCACTACATCCGAGATAAAACTGCTGTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128221 TGGATAACCAGGCCATGCTGCACTACATCCGAGATAAAACTGCTGTTCCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    655 TACTTCTCCAATTTGGTCTGGTTCATTGGGAGCCATGTGATCGAACTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128271 TACTTCTCCAATTTGGTCTGGTTCATTGGGAGCCATGTGATCGAACTCGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    705 TGACTGCGTGCAGACTGATGAGGA         GCATCGGAATCGGGGTA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 128321 TGACTGCGTGCAGACTGATGAGGAGTA...CAGGCATCGGAATCGGGGTA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    746 AACTGAGTGATCTGGTGGCAGAGCACCTAGACCACCTGCACTATCTCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132525 AACTGAGTGATCTGGTGGCAGAGCACCTAGACCACCTGCACTATCTCAAT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    796 GACATCCTGATCATCAACTGTGAGTTCCTCAACGATGTGCTCACTGACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132575 GACATCCTGATCATCAACTGTGAGTTCCTCAACGATGTGCTCACTGACCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    846 CCTGCTCAACAGGCTCTTCCTGCCCCTCTACGTGTACTCACTGGAGAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132625 CCTGCTCAACAGGCTCTTCCTGCCCCTCTACGTGTACTCACTGGAGAACC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    896 AGGACAAG         GGAGGAGAACGGCCGAAAATTAGCCTGCCGGTG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 132675 AGGACAAGGTG...TAGGGAGGAGAACGGCCGAAAATTAGCCTGCCGGTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    937 TCTCTTTATCTTCTGTCACAG         GTCTTCTTAATTATACATCA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 134645 TCTCTTTATCTTCTGTCACAGGTA...CAGGTCTTCTTAATTATACATCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    978 TGCACCGCTGGTGAACTCGTTAGCTGAAGTCATTCTGAATGGTGATCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138181 TGCACCGCTGGTGAACTCGTTAGCTGAAGTCATTCTGAATGGTGATCTGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1028 CTGAGATGTACGCTAAGACTGAACAGGATATTCAGAGAAGTTCT      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 138231 CTGAGATGTACGCTAAGACTGAACAGGATATTCAGAGAAGTTCTGTA...

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1072    GCCAAGCCCAGCATTCGGTGCTTCATTAAACCCACCGAGACACTCGA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158354 TAGGCCAAGCCCAGCATTCGGTGCTTCATTAAACCCACCGAGACACTCGA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1119 GCGGTCCCTTGAGATGAACAAGCACAAGGGCAAGAGGCGGGTGCAAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158404 GCGGTCCCTTGAGATGAACAAGCACAAGGGCAAGAGGCGGGTGCAAAAGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1169 GACCCAACTACAAAAACGTTGGGGAAGAAGAAGATGAGGAGAAAGGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158454 GACCCAACTACAAAAACGTTGGGGAAGAAGAAGATGAGGAGAAAGGGCCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1219 ACCGAGGATGCCCAAGAAGACGCCGAGAAGGCTAAAGGTACAGAGGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158504 ACCGAGGATGCCCAAGAAGACGCCGAGAAGGCTAAAGGTACAGAGGGTGG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1269 TTCAAAAGGCATCAAGACGAGTGGGGAGAGTGAAG         AGATCG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 158554 TTCAAAAGGCATCAAGACGAGTGGGGAGAGTGAAGGTG...CAGAGATCG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1310 AGATGGTGATCATGGAGCGTAGCAAGCTCTCAGAGCTGGCCGCCAGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 175482 AGATGGTGATCATGGAGCGTAGCAAGCTCTCAGAGCTGGCCGCCAGCACC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1360 TCCGTGCAGGAGCAGAACACCACGGACGAGGAGAAAAGCGCCGCCGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 175532 TCCGTGCAGGAGCAGAACACCACGGACGAGGAGAAAAGCGCCGCCGCCAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1410 CTGCTCTGAGAGCACGCAATGGAGCAG         ACCCTTCCTGGATA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 175582 CTGCTCTGAGAGCACGCAATGGAGCAGGTA...CAGACCCTTCCTGGATA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 TGGTGTACCACGCGCTGGACAGCCCGGATGATGATTACCATGCCCTGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180118 TGGTGTACCACGCGCTGGACAGCCCGGATGATGATTACCATGCCCTGTTC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 GTGCTCTGCCTCCTCTATGCCATGTCTCATAATAAAG         GCAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 180168 GTGCTCTGCCTCCTCTATGCCATGTCTCATAATAAAGGTA...CAGGCAT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1542 GGATCCTGAAAAATTAGAGCGAATCCAGCTCCCCGTGCCAAATGCGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 195041 GGATCCTGAAAAATTAGAGCGAATCCAGCTCCCCGTGCCAAATGCGGCCG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1592 AGAAGACCACCTACAACCACCCGCTAGCTGAAAGACTCATCAGGATCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 195091 AGAAGACCACCTACAACCACCCGCTAGCTGAAAGACTCATCAGGATCATG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1642 AACAACGCTGCCCAGCCAG         ATGGGAAGATCCGGCTGGCGAC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 195141 AACAACGCTGCCCAGCCAGGTG...CAGATGGGAAGATCCGGCTGGCGAC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1683 GCTGGAGCTGAGCTGCCTGCTTCTGAAGCAGCAAGTCCTGATGAGTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 197559 GCTGGAGCTGAGCTGCCTGCTTCTGAAGCAGCAAGTCCTGATGAGTGCTG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1733 GCTGCATCATGAAGGACGTGCACCTGGCCTGCCTGGAG         GGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 197609 GCTGCATCATGAAGGACGTGCACCTGGCCTGCCTGGAGGTA...CAGGGT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1774 GCGAGAGAAGAAAGTGTTCACCTTGTACGACATTTTTATAAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 199314 GCGAGAGAAGAAAGTGTTCACCTTGTACGACATTTTTATAAGGTA...TA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1816  GGAGAAGACATTTTTTTGGACATGTTTGAAGATGAGTATAGGAGCATGA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202574 GGGAGAAGACATTTTTTTGGACATGTTTGAAGATGAGTATAGGAGCATGA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1865 CA         ATGAAGCCCATGAACGTGGAATATCTCATGATGGACGCC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202624 CAGTA...TAGATGAAGCCCATGAACGTGGAATATCTCATGATGGACGCC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1906 TCCATCCTGCTGCCCCCAACAGGCACGCCACTGACGGGCATTGACTTCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206835 TCCATCCTGCTGCCCCCAACAGGCACGCCACTGACGGGCATTGACTTCGT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1956 GAAGCGGCTGCCGTGTGGCGATGTGGAGAAGACCCGGCGG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 206885 GAAGCGGCTGCCGTGTGGCGATGTGGAGAAGACCCGGCGGGTG...CAGG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1997 CCATCCGGGTGTTCTTCATGCTGCGTTCCCTGTCACTGCAATTGCGAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 216186 CCATCCGGGTGTTCTTCATGCTGCGTTCCCTGTCACTGCAATTGCGAGGG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2047 GAGCCTGAGACACAGTTGCCGCTGACTCGGGAGGAGGACCTGATCAAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 216236 GAGCCTGAGACACAGTTGCCGCTGACTCGGGAGGAGGACCTGATCAAGAC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2097 TGATGATGTCCTGGATCTGA         ATAACAGCGACTTGATTGCAT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 216286 TGATGATGTCCTGGATCTGAGTG...CAGATAACAGCGACTTGATTGCAT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2138 GTACAGTGATCACCAAGGATGGCGGCATGGTCCAGCGATTCCTGGCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 275919 GTACAGTGATCACCAAGGATGGCGGCATGGTCCAGCGATTCCTGGCTGTG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2188 GATATTTACCAGATGAGTTTGGTGGAGCCTGATGTGTCCAGGCTTGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 275969 GATATTTACCAGATGAGTTTGGTGGAGCCTGATGTGTCCAGGCTTGGCTG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2238 GGGAGTGGTCAAGTTTGCAGGCCTATTGCAG         GACATGCAGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 276019 GGGAGTGGTCAAGTTTGCAGGCCTATTGCAGGTA...CAGGACATGCAGG

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2279 TGACTGGCGTGGAGGACGACAGCCGTGCCCTGAACATCACCATCCACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 279035 TGACTGGCGTGGAGGACGACAGCCGTGCCCTGAACATCACCATCCACAAG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2329 CCTGCGTCCAGCCCCCATTCCAAGCCCTTCCCCATCCTCCAGGCCACCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 279085 CCTGCGTCCAGCCCCCATTCCAAGCCCTTCCCCATCCTCCAGGCCACCTT

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2379 CATCTTCTCAGACCACATCCGCTGCATCATCGCCAAGCAGCGCCTGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 279135 CATCTTCTCAGACCACATCCGCTGCATCATCGCCAAGCAGCGCCTGGCCA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2429 AAGGCCGCATCCAGGCAAGGCGCATGAAGATGCAGAGAATAGCTG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 279185 AAGGCCGCATCCAGGCAAGGCGCATGAAGATGCAGAGAATAGCTGGTG..

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2474     CCCTCCTGGACCTCCCAATCCAGCCCACCACTGAAGTCCTGGGGTT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 279235 .TAGCCCTCCTGGACCTCCCAATCCAGCCCACCACTGAAGTCCTGGGGTT

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2520 TGGACTCGGCTCCTCCACCTCCACTCAGCACCTGCCTTTCCGCTTCTACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 281308 TGGACTCGGCTCCTCCACCTCCACTCAGCACCTGCCTTTCCGCTTCTACG

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2570 ACCAGGGGCGCCGGGGCAGCAGCGACCCCACAGTGCAGCGCTCCGTGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 281358 ACCAGGGGCGCCGGGGCAGCAGCGACCCCACAGTGCAGCGCTCCGTGTTT

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2620 GCATCGGTGGACAAGGTGCCAG         GCTTCGCCGTGGCCCAGTG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 281408 GCATCGGTGGACAAGGTGCCAGGTG...CAGGCTTCGCCGTGGCCCAGTG

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2661 CATAAACCAGCACAGCTCCCCGTCCCTGTCCTCACAGTCGCCACCCTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 321690 CATAAACCAGCACAGCTCCCCGTCCCTGTCCTCACAGTCGCCACCCTCCG

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2711 CCAGCGGGAGCCCCAGCGGCAGCGGGAGCACCAGCCACTGCGACTCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 321740 CCAGCGGGAGCCCCAGCGGCAGCGGGAGCACCAGCCACTGCGACTCTGGA

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2761 GGCACCAGCTCGTCCTCCACCCCCTCCACAGCCCAGAGTCCAGCAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 321790 GGCACCAGCTCGTCCTCCACCCCCTCCACAGCCCAGAGTCCAGCAGGTA.

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2807      ATGCCCCCATGAGTCCAGAACTGCCTAAGCCTCACCTTCCTGACC
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 321840 ..CAGATGCCCCCATGAGTCCAGAACTGCCTAAGCCTCACCTTCCTGACC

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2852 AGTTGGTAATCGTCAACGAAACGGAAGCAGACTCTAAGCCCAGCAAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 333663 AGTTGGTAATCGTCAACGAAACGGAAGCAGACTCTAAGCCCAGCAAGAAC

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2902 GTGGCCAGGAGCGCAGCCGTGGAGACAGCCAGCCTGTCCCCCAGCCTCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 333713 GTGGCCAGGAGCGCAGCCGTGGAGACAGCCAGCCTGTCCCCCAGCCTCGT

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2952 CCCTGCCCGGCAGCCCACCATTTCCCTGCTCTGCGAGGACACGGCTGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 333763 CCCTGCCCGGCAGCCCACCATTTCCCTGCTCTGCGAGGACACGGCTGACA

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3002 CGCTGAGCGTCGAATCGCTGACCCTTGTCCCCCCAGTTGACCCCCACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 333813 CGCTGAGCGTCGAATCGCTGACCCTTGTCCCCCCAGTTGACCCCCACAGC

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3052 CTCCGCAGCCTCACCGGCATGCCCCCGCTGTCCACGCCGGCTGCCGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 333863 CTCCGCAGCCTCACCGGCATGCCCCCGCTGTCCACGCCGGCTGCCGCCTG

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3102 CACAGAGCCCGTGGGCGAAGAGGCTGCATGTGCTGAGCCTGTGGGCACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 333913 CACAGAGCCCGTGGGCGAAGAGGCTGCATGTGCTGAGCCTGTGGGCACCG

   3350     .
   3152 CTGAGGAC
        ||||||||
 333963 CTGAGGAC