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seq2 = pF1KA0226/gi568815595r_197575021.tfa (gi568815595r:197575021_197818015), 242995 bp

>pF1KA0226 2781
>gi568815595r:197575021_197818015 (Chr3)

(complement)

1-39  (100001-100039)   100% ->
40-123  (112841-112924)   100% ->
124-283  (113315-113474)   100% ->
284-390  (114362-114468)   100% ->
391-547  (116152-116308)   100% ->
548-1081  (116870-117403)   100% ->
1082-1126  (118785-118829)   100% ->
1127-1222  (120967-121062)   100% ->
1223-1338  (122035-122150)   100% ->
1339-1549  (123431-123641)   100% ->
1550-1651  (124200-124301)   100% ->
1652-1712  (133799-133859)   100% ->
1713-1845  (134577-134709)   100% ->
1846-1991  (135401-135546)   100% ->
1992-2056  (136117-136181)   100% ->
2057-2295  (136649-136887)   100% ->
2296-2357  (140475-140536)   100% ->
2358-2511  (140978-141131)   100% ->
2512-2605  (142501-142594)   100% ->
2606-2781  (142820-142995)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAGAGCATCCTCTATCACGGGCTTATCCGTGACCAG         GC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 100001 ATGCAGAGCATCCTCTATCACGGGCTTATCCGTGACCAGGTA...CAGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 GTGCCGCCGCCAGACGGATTACTGGCAGTTCGTGAAAGACATCCGGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112843 GTGCCGCCGCCAGACGGATTACTGGCAGTTCGTGAAAGACATCCGGTGGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TCAGTCCCCACTCAGCCCTTCACGTGGAGAAG         TTCATCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 112893 TCAGTCCCCACTCAGCCCTTCACGTGGAGAAGGTA...CAGTTCATCAGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 GTGCACGAGAACGACCAGAGCAGTGCTGATGGTGCCAGTGAACGTGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113324 GTGCACGAGAACGACCAGAGCAGTGCTGATGGTGCCAGTGAACGTGCTGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TGCCGAGCTGTGGCTGCAGCACAGCCTGCAGTACCACTGCCTCTCAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113374 TGCCGAGCTGTGGCTGCAGCACAGCCTGCAGTACCACTGCCTCTCAGCCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGCTCCGGCCCCTGCTCGGGGATAGACAGTATATCAGAAAATTCTACACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113424 AGCTCCGGCCCCTGCTCGGGGATAGACAGTATATCAGAAAATTCTACACA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 G         ATGCTGCCTTCCTGCTAAGTGACGCTCATGTCACGGCCAT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113474 GGTA...CAGATGCTGCCTTCCTGCTAAGTGACGCTCATGTCACGGCCAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GCTGCAGTGCCTGGAAGCAGTGGAACAGAACAACCCCCGCCTCCTGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114402 GCTGCAGTGCCTGGAAGCAGTGGAACAGAACAACCCCCGCCTCCTGGCTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AGATCGATGCGTCCATG         TTTGCCAGAAAGCACGAGAGCCCG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 114452 AGATCGATGCGTCCATGGTA...TAGTTTGCCAGAAAGCACGAGAGCCCG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 CTCCTGGTGACAAAGAGCCAGAGCCTGACAGCCCTGCCCAGTTCCACATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116176 CTCCTGGTGACAAAGAGCCAGAGCCTGACAGCCCTGCCCAGTTCCACATA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CACCCCTCCAAACAGCTATGCTCAGCATTCCTACTTTGGGTCCTTCTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116226 CACCCCTCCAAACAGCTATGCTCAGCATTCCTACTTTGGGTCCTTCTCTA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GCCTCCACCAATCCGTGCCCAACAATGGCTCAG         AGAGAAGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 116276 GCCTCCACCAATCCGTGCCCAACAATGGCTCAGGTA...TAGAGAGAAGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 TCTACTTCCTTTCCACTCTCTGGCCCTCCCCGGAAACCTCAAGAAAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116878 TCTACTTCCTTTCCACTCTCTGGCCCTCCCCGGAAACCTCAAGAAAGCAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 AGGGCACGTCTCACCAGCAGAGGATCAAACCATCCAAGCCCCCCCAGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116928 AGGGCACGTCTCACCAGCAGAGGATCAAACCATCCAAGCCCCCCCAGTTT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 CAGTCTCTGCACTAGCCAGGGATTCCCCTTTGACCCCAAATGAAATGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116978 CAGTCTCTGCACTAGCCAGGGATTCCCCTTTGACCCCAAATGAAATGAGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 TCCAGTACTCTGACCAGCCCCATAGAGGCATCCTGGGTCAGCAGCCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117028 TCCAGTACTCTGACCAGCCCCATAGAGGCATCCTGGGTCAGCAGCCAGAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 TGATTCCCCAGGTGATGCCAGTGAGGGGCCTGAGTACCTGGCCATTGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117078 TGATTCCCCAGGTGATGCCAGTGAGGGGCCTGAGTACCTGGCCATTGGCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 ACTTGGACCCCCGAGGCCGGACTGCCAGCTGTCAGAGTCACAGCAGCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117128 ACTTGGACCCCCGAGGCCGGACTGCCAGCTGTCAGAGTCACAGCAGCAAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 GCCGAGAGCAGCAGTTCCAATTTGTTCTCCTCCAGCAGCTCCCAGAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117178 GCCGAGAGCAGCAGTTCCAATTTGTTCTCCTCCAGCAGCTCCCAGAAGCC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 AGATTCTGCTGCCTCTTCCTTAGGGGACCAGGAAGGAGGTGGGGAGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117228 AGATTCTGCTGCCTCTTCCTTAGGGGACCAGGAAGGAGGTGGGGAGAGCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 AGCTGTCCAGTGTCCTCCGCAGGTCCAGCTTCTCAGAGGGGCAGACACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117278 AGCTGTCCAGTGTCCTCCGCAGGTCCAGCTTCTCAGAGGGGCAGACACTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 ACTGTCACCAGTGGGGCAAAGAAAAGCCACATTCGCTCCCATTCGGATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117328 ACTGTCACCAGTGGGGCAAAGAAAAGCCACATTCGCTCCCATTCGGATAC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 CAGCATTGCCTCCAGGGGAGCTCCAG         GAGGCCCCAGGAATA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 117378 CAGCATTGCCTCCAGGGGAGCTCCAGGTA...CAGGAGGCCCCAGGAATA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 TCACCATTATAGTTGAAGATCCCATTGCAG         AATCCTGCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 118800 TCACCATTATAGTTGAAGATCCCATTGCAGGTT...TAGAATCCTGCAAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 GATAAGGCGAAGTTGAGAGGCCCTTTGCCCTACTCTGGTCAAAGCAGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120978 GATAAGGCGAAGTTGAGAGGCCCTTTGCCCTACTCTGGTCAAAGCAGTGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 AGTCAGCACACCCAGCTCTCTGTACATGGAATATG         AAGGTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 121028 AGTCAGCACACCCAGCTCTCTGTACATGGAATATGGTG...CAGAAGGTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 GTCGGTACCTGTGCTCAGGGGAAGGCATGTTCCGAAGACCATCAGAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122041 GTCGGTACCTGTGCTCAGGGGAAGGCATGTTCCGAAGACCATCAGAAGGA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 CAGTCCCTCATCAGCTACCTCTCTGAGCAAGACTTCGGCAGCTGTGCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122091 CAGTCCCTCATCAGCTACCTCTCTGAGCAAGACTTCGGCAGCTGTGCCGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 CCTGGAAAAG         GAGAATGCCCACTTCAGCATCTCAGAGTCCT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 122141 CCTGGAAAAGGTG...CAGGAGAATGCCCACTTCAGCATCTCAGAGTCCT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 TAATTGCTGCCATCGAGCTAATGAAGTGCAACATGATGAGCCAGTGCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123462 TAATTGCTGCCATCGAGCTAATGAAGTGCAACATGATGAGCCAGTGCCTA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 GAGGAGGAGGAAGTGGAAGAGGAAGACAGTGATAGAGAGATCCAGGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123512 GAGGAGGAGGAAGTGGAAGAGGAAGACAGTGATAGAGAGATCCAGGAGCT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 GAAGCAGAAGATCCGCCTTCGGCGCCAGCAAATCCGCACCAAGAACCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123562 GAAGCAGAAGATCCGCCTTCGGCGCCAGCAAATCCGCACCAAGAACCTGC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1520 TCCCCATGTACCAGGAGGCTGAGCACGGAA         GCTTTCGGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 123612 TCCCCATGTACCAGGAGGCTGAGCACGGAAGTC...CAGGCTTTCGGGTC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 ACCTCCAGCAGCTCCCAGTTCAGCTCACGTGATTCGGCACAGCTCTCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124211 ACCTCCAGCAGCTCCCAGTTCAGCTCACGTGATTCGGCACAGCTCTCTGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1611 CTCTGGCTCTGCTGATGAGGTTGATGAATTTGAAATCCAAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 124261 CTCTGGCTCTGCTGATGAGGTTGATGAATTTGAAATCCAAGGTA...TAG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1652 ATGCTGACATCAGAAGGAACACAGCCTCAAGCAGCAAATCCTTCGTTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133799 ATGCTGACATCAGAAGGAACACAGCCTCAAGCAGCAAATCCTTCGTTTCC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1702 TCCCAGTCCTT         CTCCCACTGCTTCCTGCACTCCACGTCTGC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 133849 TCCCAGTCCTTGTG...CAGCTCCCACTGCTTCCTGCACTCCACGTCTGC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1743 TGAGGCGGTGGCCATGGGGCTCCTGAAGCAGTTTGAGGGGATGCAGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134607 TGAGGCGGTGGCCATGGGGCTCCTGAAGCAGTTTGAGGGGATGCAGCTTC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1793 CAGCCGCCTCGGAGCTGGAGTGGCTTGTCCCGGAGCATGATGCCCCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134657 CAGCCGCCTCGGAGCTGGAGTGGCTTGTCCCGGAGCATGATGCCCCTCAG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1843 AAG         CTCCTGCCCATTCCTGACTCACTGCCCATCTCACCGGA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134707 AAGGTA...CAGCTCCTGCCCATTCCTGACTCACTGCCCATCTCACCGGA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1884 TGACGGGCAGCACGCTGACATCTACAAGCTGCGGATTCGTGTTCGTGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135439 TGACGGGCAGCACGCTGACATCTACAAGCTGCGGATTCGTGTTCGTGGCA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1934 ACTTGGAGTGGGCCCCGCCCCGGCCTCAGATAATTTTTAATGTTCATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135489 ACTTGGAGTGGGCCCCGCCCCGGCCTCAGATAATTTTTAATGTTCATCCA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1984 GCCCCAAC         GAGGAAAATTGCCGTGGCCAAGCAGAATTACCG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 135539 GCCCCAACGTG...CAGGAGGAAAATTGCCGTGGCCAAGCAGAATTACCG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2025 CTGTGCAGGATGTGGCATCCGGACTGACCCTG         ATTACATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 136150 CTGTGCAGGATGTGGCATCCGGACTGACCCTGGTG...CAGATTACATCA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2066 AGCGACTGCGGTACTGTGAGTACCTGGGCAAGTACTTCTGCCAGTGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136658 AGCGACTGCGGTACTGTGAGTACCTGGGCAAGTACTTCTGCCAGTGCTGC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2116 CACGAGAATGCCCAGATGGCCATCCCCAGCCGGGTTCTGCGCAAGTGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136708 CACGAGAATGCCCAGATGGCCATCCCCAGCCGGGTTCTGCGCAAGTGGGA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2166 CTTCAGCAAGTACTACGTCAGCAACTTCTCCAAGGACCTGCTCATTAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136758 CTTCAGCAAGTACTACGTCAGCAACTTCTCCAAGGACCTGCTCATTAAGA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2216 TCTGGAATGATCCTCTCTTCAACGTGCAGGACATAAACAGTGCCCTCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136808 TCTGGAATGATCCTCTCTTCAACGTGCAGGACATAAACAGTGCCCTCTAT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2266 AGGAAGGTCAAGCTGCTCAATCAAGTCCGG         CTGCTGCGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 136858 AGGAAGGTCAAGCTGCTCAATCAAGTCCGGGTA...CAGCTGCTGCGGGT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2307 CCAGCTGTGTCACATGAAGAACATGTTCAAGACTTGCCGACTGGCCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140486 CCAGCTGTGTCACATGAAGAACATGTTCAAGACTTGCCGACTGGCCAAGG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2357 A         GCTTCTGGATTCCTTTGACACAGTCCCAGGCCACCTGACA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140536 AGTA...TAGGCTTCTGGATTCCTTTGACACAGTCCCAGGCCACCTGACA

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2398 GAGGACCTCCACCTGTACTCACTGAATGACCTGACTGCGACCAGGAAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141018 GAGGACCTCCACCTGTACTCACTGAATGACCTGACTGCGACCAGGAAGGG

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2448 GGAGCTGGGGCCCCGGCTTGCTGAGCTCACCAGGGCAGGGGCTACCCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141068 GGAGCTGGGGCCCCGGCTTGCTGAGCTCACCAGGGCAGGGGCTACCCATG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2498 TGGAGAGATGCATG         CTCTGCCAAGCCAAAGGCTTCATCTGT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 141118 TGGAGAGATGCATGGTG...CAGCTCTGCCAAGCCAAAGGCTTCATCTGT

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2539 GAGTTCTGTCAGAATGAGGATGACATCATCTTTCCCTTTGAGCTCCATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142528 GAGTTCTGTCAGAATGAGGATGACATCATCTTTCCCTTTGAGCTCCATAA

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2589 GTGCCGGACCTGTGAAG         AGTGTAAAGCGTGTTACCATAAAG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 142578 GTGCCGGACCTGTGAAGGTG...TAGAGTGTAAAGCGTGTTACCATAAAG

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2630 CCTGCTTCAAGTCTGGAAGCTGTCCGCGCTGCGAGCGGCTGCAGGCCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142844 CCTGCTTCAAGTCTGGAAGCTGTCCGCGCTGCGAGCGGCTGCAGGCCCGG

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2680 CGGGAGGCACTGGCCAGGCAGAGCCTGGAGTCTTACCTGTCAGACTACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142894 CGGGAGGCACTGGCCAGGCAGAGCCTGGAGTCTTACCTGTCAGACTACGA

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2730 GGAGGAGCCCGCGGAAGCGCTGGCCCTGGAAGCCGCCGTCCTGGAGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142944 GGAGGAGCCCGCGGAAGCGCTGGCCCTGGAAGCCGCCGTCCTGGAGGCCA

   2950 
   2780 CC
        ||
 142994 CC