seq1 = pF1KA0164.tfa, 2760 bp
seq2 = pF1KA0164/gi568815592r_136161328.tfa (gi568815592r:136161328_136379866), 218539 bp

>pF1KA0164 2760
>gi568815592r:136161328_136379866 (Chr6)

(complement)

1-104  (100001-100104)   100% ->
105-1016  (101091-102002)   100% ->
1017-1682  (103359-104024)   100% ->
1683-1852  (104166-104335)   100% ->
1853-1958  (106680-106785)   100% ->
1959-2043  (107788-107872)   100% ->
2044-2219  (110255-110430)   100% ->
2220-2397  (111528-111705)   100% ->
2398-2544  (112692-112838)   100% ->
2545-2760  (118390-118605)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGTCGCTCCAATTCTAGATCACATTCTTCAAGGTCAAAGTCTAGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGTCGCTCCAATTCTAGATCACATTCTTCAAGGTCAAAGTCTAGATC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ACAGTCTAGTTCTCGATCAAGATCAAGATCTCATTCTAGAAAGAAGCGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ACAGTCTAGTTCTCGATCAAGATCAAGATCTCATTCTAGAAAGAAGCGAT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACAG         TTCTAGGTCTCGTTCCAGAACATATTCAAGGTCTCGT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACAGGTG...TAGTTCTAGGTCTCGTTCCAGAACATATTCAAGGTCTCGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AGTAGAGATCGTATGTATTCTAGAGATTATCGTCGCGATTACAGAAATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101128 AGTAGAGATCGTATGTATTCTAGAGATTATCGTCGCGATTACAGAAATAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TAGAGGAATGAGACGACCTTATGGGTACAGAGGAAGGGGTAGAGGGTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101178 TAGAGGAATGAGACGACCTTATGGGTACAGAGGAAGGGGTAGAGGGTATT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ATCAAGGAGGAGGAGGTAGATATCATCGAGGTGGTTATAGACCTGTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101228 ATCAAGGAGGAGGAGGTAGATATCATCGAGGTGGTTATAGACCTGTCTGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AATAGAAGGCACTCTAGGAGTCCTAGACGAGGTCGTTCACGTTCCAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101278 AATAGAAGGCACTCTAGGAGTCCTAGACGAGGTCGTTCACGTTCCAGGAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TCCAAAAAGAAGATCCGTTTCTTCTCAAAGATCCAGAAGCAGATCTCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101328 TCCAAAAAGAAGATCCGTTTCTTCTCAAAGATCCAGAAGCAGATCTCGCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 GGTCATATAGATCTTCTAGGTCTCCAAGATCATCCTCTTCTCGTTCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101378 GGTCATATAGATCTTCTAGGTCTCCAAGATCATCCTCTTCTCGTTCTTCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 TCCCCATATAGCAAATCTCCTGTTTCTAAAAGACGAGGGTCTCAGGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101428 TCCCCATATAGCAAATCTCCTGTTTCTAAAAGACGAGGGTCTCAGGAAAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 ACAAACCAAAAAAGCTGAAGGGGAACCCCAAGAAGAGAGTCCGTTGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101478 ACAAACCAAAAAAGCTGAAGGGGAACCCCAAGAAGAGAGTCCGTTGAAAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 GTAAATCACAGGAGGAACCGAAAGATACATTTGAACATGACCCATCTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101528 GTAAATCACAGGAGGAACCGAAAGATACATTTGAACATGACCCATCTGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 TCTATCGATGAATTTAATAAGTCATCAGCCACATCCGGTGATATTTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101578 TCTATCGATGAATTTAATAAGTCATCAGCCACATCCGGTGATATTTGGCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 TGGCCTTTCAGCTTATGATAATAGTCCTAGATCACCCCATAGTCCTTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101628 TGGCCTTTCAGCTTATGATAATAGTCCTAGATCACCCCATAGTCCTTCAC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 CTATTGCTACACCACCTAGTCAGAGTTCATCTTGCTCTGATGCTCCCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101678 CTATTGCTACACCACCTAGTCAGAGTTCATCTTGCTCTGATGCTCCCATG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 CTCAGTACAGTTCACTCTGCAAAAAATACTCCTTCTCAGCATTCACATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101728 CTCAGTACAGTTCACTCTGCAAAAAATACTCCTTCTCAGCATTCACATTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 CATTCAGCATAGTCCTGAAAGGTCTGGGTCTGGTTCTGTTGGAAATGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101778 CATTCAGCATAGTCCTGAAAGGTCTGGGTCTGGTTCTGTTGGAAATGGAT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 CTAGTCGATACAGTCCTTCTCAGAATAGTCCAATTCATCACATCCCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101828 CTAGTCGATACAGTCCTTCTCAGAATAGTCCAATTCATCACATCCCTTCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 CGAAGAAGTCCTGCAAAGACAATCGCACCACAGAATGCTCCAAGAGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101878 CGAAGAAGTCCTGCAAAGACAATCGCACCACAGAATGCTCCAAGAGATGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 GTCTAGGGGCCGTTCCTCGTTTTATCCTGATGGTGGAGATCAGGAAACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101928 GTCTAGGGGCCGTTCCTCGTTTTATCCTGATGGTGGAGATCAGGAAACTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 CAAAGACTGGGAAGTTCTTAAAAAG         GTTCACAGATGAAGAG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 101978 CAAAGACTGGGAAGTTCTTAAAAAGGTA...CAGGTTCACAGATGAAGAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 TCTAGAGTATTCCTGCTTGATAGGGGTAATACCAGGGATAAAGAGGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103375 TCTAGAGTATTCCTGCTTGATAGGGGTAATACCAGGGATAAAGAGGCTTC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 AAAAGAGAAAGGATCAGAGAAAGGGAGGGCAGAGGGAGAATGGGAAGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103425 AAAAGAGAAAGGATCAGAGAAAGGGAGGGCAGAGGGAGAATGGGAAGATC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 AGGAAGCTCTAGATTACTTCAGTGATAAAGAGTCTGGAAAACAAAAGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103475 AGGAAGCTCTAGATTACTTCAGTGATAAAGAGTCTGGAAAACAAAAGTTT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1183 AATGATTCAGAAGGGGATGACACAGAGGAGACAGAGGATTATAGACAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103525 AATGATTCAGAAGGGGATGACACAGAGGAGACAGAGGATTATAGACAGTT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1233 CAGGAAGTCAGTCCTCGCAGATCAGGGTAAAAGTTTTGCTACTGCATCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103575 CAGGAAGTCAGTCCTCGCAGATCAGGGTAAAAGTTTTGCTACTGCATCTC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1283 ACCGGAATACTGAGGAGGAAGGACTCAAGTACAAGTCCAAAGTTTCACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103625 ACCGGAATACTGAGGAGGAAGGACTCAAGTACAAGTCCAAAGTTTCACTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1333 AAAGGCAATAGAGAAAGTGATGGATTTAGAGAAGAAAAAAATTATAAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103675 AAAGGCAATAGAGAAAGTGATGGATTTAGAGAAGAAAAAAATTATAAACT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1383 TAAAGAGACTGGATATGTAGTGGAAAGGCCTAGCACTACAAAAGATAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103725 TAAAGAGACTGGATATGTAGTGGAAAGGCCTAGCACTACAAAAGATAAGC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1433 ACAAAGAAGAAGACAAAAATTCTGAAAGAATAACAGTAAAGAAAGAAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103775 ACAAAGAAGAAGACAAAAATTCTGAAAGAATAACAGTAAAGAAAGAAACT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1483 CAGTCACCTGAGCAGGTAAAGTCTGAAAAGCTCAAAGACCTCTTTGATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103825 CAGTCACCTGAGCAGGTAAAGTCTGAAAAGCTCAAAGACCTCTTTGATTA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1533 CAGTCCCCCTCTACACAAGAATCTGGATGCACGAGAAAAGTCTACCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103875 CAGTCCCCCTCTACACAAGAATCTGGATGCACGAGAAAAGTCTACCTTCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1583 GAGAGGAAAGCCCACTTAGGATCAAAATGATAGCGAGTGATTCTCACCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103925 GAGAGGAAAGCCCACTTAGGATCAAAATGATAGCGAGTGATTCTCACCGT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1633 CCTGAAGTCAAACTCAAAATGGCACCTGTTCCTCTTGATGATTCTAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103975 CCTGAAGTCAAACTCAAAATGGCACCTGTTCCTCTTGATGATTCTAACAG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1683          ACCTGCTTCCTTGACTAAAGACAGGCTGCTTGCTAGTACAC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104025 GTA...CAGACCTGCTTCCTTGACTAAAGACAGGCTGCTTGCTAGTACAC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1724 TTGTCCATTCTGTCAAGAAGGAGCAAGAATTCCGATCCATCTTTGACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104207 TTGTCCATTCTGTCAAGAAGGAGCAAGAATTCCGATCCATCTTTGACCAC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1774 ATTAAGTTGCCACAGGCCAGCAAAAGCACTTCAGAGTCATTTATTCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104257 ATTAAGTTGCCACAGGCCAGCAAAAGCACTTCAGAGTCATTTATTCAACA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1824 CATTGTGTCCTTGGTTCATCATGTTAAAG         AGCAATACTTCA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 104307 CATTGTGTCCTTGGTTCATCATGTTAAAGGTA...CAGAGCAATACTTCA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1865 AGTCAGCTGCAATGACCCTAAACGAGCGGTTCACTTCGTATCAGAAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106692 AGTCAGCTGCAATGACCCTAAACGAGCGGTTCACTTCGTATCAGAAAGCC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1915 ACTGAAGAACATAGTACTCGGCAAAAGAGCCCTGAAATACACAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 106742 ACTGAAGAACATAGTACTCGGCAAAAGAGCCCTGAAATACACAGGTA...

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1959    GAGAATTGACATCTCACCAAGTACCCTGAGGAAGCATACCCGTTTAG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107785 AAGGAGAATTGACATCTCACCAAGTACCCTGAGGAAGCATACCCGTTTAG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2006 CAGGGGAAGAGAGAGTTTTTAAAGAAGAAAATCAAAAG         GGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 107835 CAGGGGAAGAGAGAGTTTTTAAAGAAGAAAATCAAAAGGTA...TAGGGA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2047 GATAAAAAATTAAGGTGTGACTCTGCTGACCTTCGGCATGACATTGATCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110258 GATAAAAAATTAAGGTGTGACTCTGCTGACCTTCGGCATGACATTGATCG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2097 CCGTAGAAAAGAAAGAAGTAAAGAACGGGGAGATTCCAAGGGCTCCAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110308 CCGTAGAAAAGAAAGAAGTAAAGAACGGGGAGATTCCAAGGGCTCCAGGG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2147 AATCCAGTGGATCAAGAAAGCAGGAAAAAACTCCAAAAGATTACAAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110358 AATCCAGTGGATCAAGAAAGCAGGAAAAAACTCCAAAAGATTACAAGGAA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2197 TACAAATCTTACAAAGATGACAG         TAAACATAAAAGAGAGCA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 110408 TACAAATCTTACAAAGATGACAGGTA...CAGTAAACATAAAAGAGAGCA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2238 AGATCATTCTCGATCTTCATCCTCTTCAGCATCACCTTCTTCTCCCAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111546 AGATCATTCTCGATCTTCATCCTCTTCAGCATCACCTTCTTCTCCCAGTT

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2288 CTCGAGAAGAAAAGGAGAGTAAGAAGGAAAGAGAAGAAGAATTTAAAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111596 CTCGAGAAGAAAAGGAGAGTAAGAAGGAAAGAGAAGAAGAATTTAAAACT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2338 CACCATGAAATGAAAGAATACTCAGGCTTTGCAGGAGTTAGCCGACCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111646 CACCATGAAATGAAAGAATACTCAGGCTTTGCAGGAGTTAGCCGACCACG

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2388 AGGAACCTTT         TTTCGAATTAGAGGCAGAGGAAGAGCCAGAG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 111696 AGGAACCTTTGTA...CAGTTTCGAATTAGAGGCAGAGGAAGAGCCAGAG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2429 GAGTTTTTGCTGGGACAAATACTGGTCCAAACAACTCAAATACTACTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112723 GAGTTTTTGCTGGGACAAATACTGGTCCAAACAACTCAAATACTACTTTT

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2479 CAAAAGAGACCGAAGGAAGAGGAATGGGATCCAGAATATACCCCAAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112773 CAAAAGAGACCGAAGGAAGAGGAATGGGATCCAGAATATACCCCAAAGAG

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2529 CAAGAAGTACTTCTTG         CATGACGACAGAGATGATGGTGTGG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 112823 CAAGAAGTACTTCTTGGTG...TAGCATGACGACAGAGATGATGGTGTGG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2570 ATTATTGGGCCAAAAGAGGAAGAGGTCGTGGTACTTTTCAACGTGGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118415 ATTATTGGGCCAAAAGAGGAAGAGGTCGTGGTACTTTTCAACGTGGCAGA

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2620 GGGCGCTTTAACTTCAAAAAATCAGGTAGCAGTCCTAAATGGACTCATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118465 GGGCGCTTTAACTTCAAAAAATCAGGTAGCAGTCCTAAATGGACTCATGA

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2670 CAAATACCAAGGGGATGGGATTGTTGAAGATGAAGAAGAGACCATGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118515 CAAATACCAAGGGGATGGGATTGTTGAAGATGAAGAAGAGACCATGGAAA

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :
   2720 ATAATGAAGAAAAGAAGGACAGACGCAAGGAAGAAAAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
 118565 ATAATGAAGAAAAGAAGGACAGACGCAAGGAAGAAAAGGTA