seq1 = pF1KA0138.tfa, 2859 bp
seq2 = pF1KA0138/gi568815579r_5487246.tfa (gi568815579r:5487246_5722715), 235470 bp

>pF1KA0138 2859
>gi568815579r:5487246_5722715 (Chr19)

(complement)

1-186  (100001-100186)   100% ->
187-274  (101320-101407)   100% ->
275-339  (106230-106294)   100% ->
340-543  (106381-106584)   100% ->
544-606  (109189-109251)   100% ->
607-634  (110149-110176)   100% ->
635-1145  (111086-111596)   100% ->
1146-1195  (112028-112077)   100% ->
1196-1296  (112621-112721)   100% ->
1297-1446  (117780-117929)   100% ->
1447-1559  (118021-118133)   100% ->
1560-1690  (122456-122586)   100% ->
1691-1782  (123832-123923)   100% ->
1783-1919  (127219-127355)   100% ->
1920-2207  (128538-128825)   100% ->
2208-2348  (129829-129969)   100% ->
2349-2394  (130923-130968)   100% ->
2395-2525  (132308-132438)   100% ->
2526-2638  (134736-134848)   100% ->
2639-2705  (134949-135015)   100% ->
2706-2859  (135317-135470)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGAGACTCTGCCCGGGTCGGGCGACTCGGGCCCTGGCACGGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGAGACTCTGCCCGGGTCGGGCGACTCGGGCCCTGGCACGGCTTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCTCGGCCCGGGCGTTGCGGAGACTGGGACGAGGCGGCTCAGCGAGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TCTCGGCCCGGGCGTTGCGGAGACTGGGACGAGGCGGCTCAGCGAGCTGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGGTGATCGATCTGCGGGCGGAGCTGAAGAAGCGGAACCTGGACACGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGGTGATCGATCTGCGGGCGGAGCTGAAGAAGCGGAACCTGGACACGGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGCAACAAGAGCGTCCTGATGGAGCGGCTCAAGAAG         GCGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 100151 GGCAACAAGAGCGTCCTGATGGAGCGGCTCAAGAAGGTG...TAGGCGGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TAAAGAAGAGGGGCAAGATCCTGATGAAATTGGCATCGAGTTAGAAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101325 TAAAGAAGAGGGGCAAGATCCTGATGAAATTGGCATCGAGTTAGAAGCCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CCAGCAAGAAGTCAGCCAAGAGATGTGTTAAAG         GACTGAAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 101375 CCAGCAAGAAGTCAGCCAAGAGATGTGTTAAAGGTA...TAGGACTGAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ATGGAGGAGGAAGGCACAGAAGATAATGGCCTGGAAGACGATTCCAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106238 ATGGAGGAGGAAGGCACAGAAGATAATGGCCTGGAAGACGATTCCAGAGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CGGGCAG         GAGGACATGGAAGCAAGTCTGGAGAACCTGCAGA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106288 CGGGCAGGTA...CAGGAGGACATGGAAGCAAGTCTGGAGAACCTGCAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ATATGGGCATGATGGACATGAGTGTGCTAGACGAAACTGAAGTGGCGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106415 ATATGGGCATGATGGACATGAGTGTGCTAGACGAAACTGAAGTGGCGAAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AGCAGTGCTCCAGATTTTGGGGAGGATGGCACGGACGGCCTTCTCGATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106465 AGCAGTGCTCCAGATTTTGGGGAGGATGGCACGGACGGCCTTCTCGATTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CTTTTGTGATAGTAAAGAATACGTGGCTGCACAGCTGAGACAGCTCCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106515 CTTTTGTGATAGTAAAGAATACGTGGCTGCACAGCTGAGACAGCTCCCGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CTCAGCCCCCAGAGCATGCT         GTGGATGGGGAAGGATTTAAG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 106565 CTCAGCCCCCAGAGCATGCTGTA...CAGGTGGATGGGGAAGGATTTAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 AACACTTTGGAAACTTCATCGTTGAACTTCAAAGTAACTCCG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 109210 AACACTTTGGAAACTTCATCGTTGAACTTCAAAGTAACTCCGGTA...TA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    607  GACATTGAAGAATCCCTTTTGGAGCCAG         AAAATGAGAAAA
        >||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 110148 GGACATTGAAGAATCCCTTTTGGAGCCAGGTA...TAGAAAATGAGAAAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 TACTCGACATTTTGGGGGAAACTTGTAAATCTGAGCCAGTAAAAGAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111098 TACTCGACATTTTGGGGGAAACTTGTAAATCTGAGCCAGTAAAAGAAGAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 AGTTCCGAGCTGGAGCAGCCATTTGCACAGGACACAAGTAGCGTGGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111148 AGTTCCGAGCTGGAGCAGCCATTTGCACAGGACACAAGTAGCGTGGGGCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 AGACAGAAAGCTTGCGGAGGAAGAGGACCTATTTGACAGCGCCCATCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111198 AGACAGAAAGCTTGCGGAGGAAGAGGACCTATTTGACAGCGCCCATCCGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 AAGAGGGTGATTTAGATTTGGCCAGCGAGTCAACAGCACACGCTCAGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111248 AAGAGGGTGATTTAGATTTGGCCAGCGAGTCAACAGCACACGCTCAGTCG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 AGCAAGGCAGACAGCCTGTTAGCGGTAGTGAAAAGGGAGCCCGCGGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111298 AGCAAGGCAGACAGCCTGTTAGCGGTAGTGAAAAGGGAGCCCGCGGAGCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 GCCAGGCGATGGCGAGAGGACGGACTGTGAGCCTGTAGGGCTAGAGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111348 GCCAGGCGATGGCGAGAGGACGGACTGTGAGCCTGTAGGGCTAGAGCCGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 CAGTTGAGCAGAGTAGTGCGGCCTCCGAGCTCGCGGAGGCCTCTAGCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111398 CAGTTGAGCAGAGTAGTGCGGCCTCCGAGCTCGCGGAGGCCTCTAGCGAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 GAGCTCGCAGAAGCACCCACGGAAGCCCCAAGCCCAGAAGCCAGAGATAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111448 GAGCTCGCAGAAGCACCCACGGAAGCCCCAAGCCCAGAAGCCAGAGATAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 CAAAGAAGACGGGAGGAAGTTTGATTTTGACGCTTGTAATGAAGTCCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111498 CAAAGAAGACGGGAGGAAGTTTGATTTTGACGCTTGTAATGAAGTCCCTC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 CGGCTCCTAAAGAGTCCTCAACCAGTGAGGGCGCTGATCAGAAAATGAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 111548 CGGCTCCTAAAGAGTCCTCAACCAGTGAGGGCGCTGATCAGAAAATGAGG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1146         CTCTTTTAAGGAAGAAAAAGATATAAAGCCAATCATTAAAGA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111598 TT...TAGCTCTTTTAAGGAAGAAAAAGATATAAAGCCAATCATTAAAGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 TGAAAAAG         GTCGGGTCGGCAGCGGTTCTGGTCGGAACCTGT
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 112070 TGAAAAAGGTA...CAGGTCGGGTCGGCAGCGGTTCTGGTCGGAACCTGT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 GGGTCAGCGGGCTGTCCTCCACAACACGCGCTACGGATCTCAAGAACCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112654 GGGTCAGCGGGCTGTCCTCCACAACACGCGCTACGGATCTCAAGAACCTT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 TTCAGCAAGTATGGGAAG         GTTGTCGGGGCCAAAGTGGTAAC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 112704 TTCAGCAAGTATGGGAAGGTA...AAGGTTGTCGGGGCCAAAGTGGTAAC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 GAACGCCCGCAGCCCGGGGGCTCGATGCTATGGATTCGTCACCATGTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117803 GAACGCCCGCAGCCCGGGGGCTCGATGCTATGGATTCGTCACCATGTCGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 CATCTGACGAGGCGACCAAGTGCATCAGCCATCTCCACAGAACTGAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117853 CATCTGACGAGGCGACCAAGTGCATCAGCCATCTCCACAGAACTGAGCTG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 CATGGACGAATGATCTCCGTAGAGAAG         GCCAAAAATGAGCC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 117903 CATGGACGAATGATCTCCGTAGAGAAGGTG...TAGGCCAAAAATGAGCC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 TGCTGGGAAAAAGCTTTCCGACAGAAAAGAGTGCGAAGTGAAGAAGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118035 TGCTGGGAAAAAGCTTTCCGACAGAAAAGAGTGCGAAGTGAAGAAGGAAA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 AATTATCGAGTGTCGACAGACATCATTCTGTGGAGATCAAAATTGAAAA 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 118085 AATTATCGAGTGTCGACAGACATCATTCTGTGGAGATCAAAATTGAAAAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1560         AACTGTAATTAAGAAGGAAGAGAAGATTGAGAAGAAGGAGGA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118135 TA...TAGAACTGTAATTAAGAAGGAAGAGAAGATTGAGAAGAAGGAGGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 AAAAAAGCCTGAAGACATTAAGAAGGAAGAAAAAGACCAGGATGAGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122498 AAAAAAGCCTGAAGACATTAAGAAGGAAGAAAAAGACCAGGATGAGCTGA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1652 AACCCGGACCTACAAATCGGTCTAGAGTCACCAAATCAG         GA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 122548 AACCCGGACCTACAAATCGGTCTAGAGTCACCAAATCAGGTG...AAGGA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 AGCAGAGGAATGGAGCGGACGGTCGTGATGGATAAATCGAAAGGAGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123834 AGCAGAGGAATGGAGCGGACGGTCGTGATGGATAAATCGAAAGGAGAGCC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1743 CGTCATTAGCGTGAAAACCACAAGCAGGTCCAAAGAGAGA         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 123884 CGTCATTAGCGTGAAAACCACAAGCAGGTCCAAAGAGAGAGTG...CAGA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1784 GCTCCAAGAGTCAGGATCGCAAGTCAGAAAGCAAAGAAAAGAGAGACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127220 GCTCCAAGAGTCAGGATCGCAAGTCAGAAAGCAAAGAAAAGAGAGACATC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1834 TTGTCGTTTGATAAAATCAAAGAACAAAGGGAGAGAGAGCGCCAGAGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127270 TTGTCGTTTGATAAAATCAAAGAACAAAGGGAGAGAGAGCGCCAGAGGCA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1884 GCGGGAACGGGAGATCCGCGAAACGGAGAGGCGGCG         GGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 127320 GCGGGAACGGGAGATCCGCGAAACGGAGAGGCGGCGGTG...CAGGGAGC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1925 GCGAGCAGCGGGAGCGGGAGCAACGCCTCGAGGCCTTCCATGAGCGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128543 GCGAGCAGCGGGAGCGGGAGCAACGCCTCGAGGCCTTCCATGAGCGGAAG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1975 GAGAAGGCCCGGCTACAGCGGGAACGCCTGCAGCTCGAGTGCCAGCGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128593 GAGAAGGCCCGGCTACAGCGGGAACGCCTGCAGCTCGAGTGCCAGCGCCA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2025 GCGGCTGGAGCGGGAGCGCATGGAGCGGGAGCGGCTGGAGCGCGAGCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128643 GCGGCTGGAGCGGGAGCGCATGGAGCGGGAGCGGCTGGAGCGCGAGCGCA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2075 TGCGCGTGGAGCGTGAGCGCAGGAAGGAGCAGGAGCGCATCCACCGCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128693 TGCGCGTGGAGCGTGAGCGCAGGAAGGAGCAGGAGCGCATCCACCGCGAG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2125 CGCGAGGAGCTGCGGCGCCAGCAGGAGCAGCTGCGTTACGAGCAGGAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128743 CGCGAGGAGCTGCGGCGCCAGCAGGAGCAGCTGCGTTACGAGCAGGAGCG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2175 GCGGCCCGGGCGGAGGCCCTACGACCTGGACCG         ACGAGATG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 128793 GCGGCCCGGGCGGAGGCCCTACGACCTGGACCGGTG...CAGACGAGATG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2216 ATGCCTATTGGCCAGAAGGAAAGCGTGTGGCAATGGAGGACCGATATCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129837 ATGCCTATTGGCCAGAAGGAAAGCGTGTGGCAATGGAGGACCGATATCGT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2266 GCAGACTTTCCCCGGCCAGACCACCGCTTTCACGACTTCGATCATCGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129887 GCAGACTTTCCCCGGCCAGACCACCGCTTTCACGACTTCGATCATCGAGA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2316 CCGGGGCCAGTACCAGGACCACGCCATCGACAG         GCGGGAGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 129937 CCGGGGCCAGTACCAGGACCACGCCATCGACAGGTC...CAGGCGGGAGG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2357 GTTCGAGGCCAATGATGGGAGACCACCGGGATGGGCAG         CAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 130931 GTTCGAGGCCAATGATGGGAGACCACCGGGATGGGCAGGTG...CAGCAC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2398 TATGGAGATGACCGCCATGGCCACGGAGGACCCCCAGAGCGCCACGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132311 TATGGAGATGACCGCCATGGCCACGGAGGACCCCCAGAGCGCCACGGCCG

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2448 GGACTCCCGTGATGGCTGGGGGGGCTACGGCTCCGACAAGAGGCTGAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132361 GGACTCCCGTGATGGCTGGGGGGGCTACGGCTCCGACAAGAGGCTGAGTG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2498 AAGGCCGGGGGCTGCCCCCTCCCCCCAG         GGGTGGCCGTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 132411 AAGGCCGGGGGCTGCCCCCTCCCCCCAGGTT...AAGGGGTGGCCGTGAC

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2539 TGGGGAGAGCACAACCAGCGGCTAGAGGAGCACCAGGCACGCGCCTGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134749 TGGGGAGAGCACAACCAGCGGCTAGAGGAGCACCAGGCACGCGCCTGGCA

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2589 GGGTGCCATGGACGCAGGCGCGGCTAGCCGGGAGCACGCCAGGTGGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134799 GGGTGCCATGGACGCAGGCGCGGCTAGCCGGGAGCACGCCAGGTGGCAAG

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2639          GTGGCGAGAGGGGCCTGTCTGGGCCCTCGGGGCCGGGGCAC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134849 GTA...TAGGTGGCGAGAGGGGCCTGTCTGGGCCCTCGGGGCCGGGGCAC

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2680 ATGGCAAGCCGCGGTGGAGTGGCGGG         GCGAGGCGGCTTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 134990 ATGGCAAGCCGCGGTGGAGTGGCGGGGTA...TAGGCGAGGCGGCTTTGC

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2721 ACAAGGTGGACATTCCCAGGGCCACGTGGTGCCAGGTGGCGGACTGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135332 ACAAGGTGGACATTCCCAGGGCCACGTGGTGCCAGGTGGCGGACTGGAAG

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2771 GTGGCGGAGTGGCCAGCCAGGACCGGGGCAGCAGAGTCCCTCACCCACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135382 GTGGCGGAGTGGCCAGCCAGGACCGGGGCAGCAGAGTCCCTCACCCACAC

   3000     .    :    .    :    .    :    .
   2821 CCTCATCCCCCCCCGTACCCCCACTTCACCCGCCGCTAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135432 CCTCATCCCCCCCCGTACCCCCACTTCACCCGCCGCTAC