seq1 = pF1KA0128.tfa, 1281 bp seq2 = pF1KA0128/gi568815575r_119529318.tfa (gi568815575r:119529318_119775669), 246352 bp >pF1KA0128 1281 >gi568815575r:119529318_119775669 (ChrX) (complement) 1-30 (82565-82594) 100% -> 31-145 (100002-100116) 100% -> 146-341 (111993-112188) 100% -> 342-528 (122630-122816) 100% -> 529-690 (125572-125733) 100% -> 691-787 (134882-134978) 100% -> 788-956 (138475-138643) 100% -> 957-1089 (142178-142310) 100% -> 1090-1281 (146162-146352) 99% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGGCAGCGACCGATATAGCTCGCCAGGTG GGTGAAGGTTG ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||| 82565 ATGGCAGCGACCGATATAGCTCGCCAGGTGGTA...TAGGGTGAAGGTTG 50 . : . : . : . : . : 42 CCGAACTGTCCCCCTGGCTGGACATGTGGGGTTTGACAGCTTGCCTGACC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100013 CCGAACTGTCCCCCTGGCTGGACATGTGGGGTTTGACAGCTTGCCTGACC 100 . : . : . : . : . : 92 AGCTGGTGAATAAGTCCGTCAGCCAGGGCTTCTGCTTCAACATCCTGTGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100063 AGCTGGTGAATAAGTCCGTCAGCCAGGGCTTCTGCTTCAACATCCTGTGC 150 . : . : . : . : . : 142 GTGG GAGAGACAGGTTTGGGCAAGTCCACCCTCATGGACAC ||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100113 GTGGGTG...CAGGAGAGACAGGTTTGGGCAAGTCCACCCTCATGGACAC 200 . : . : . : . : . : 183 CCTGTTCAACACCAAATTCGAAGGGGAGCCAGCCACCCACACACAGCCGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 112030 CCTGTTCAACACCAAATTCGAAGGGGAGCCAGCCACCCACACACAGCCGG 250 . : . : . : . : . : 233 GTGTCCAGCTCCAGTCTAATACCTATGACCTCCAAGAGAGCAACGTGAGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 112080 GTGTCCAGCTCCAGTCTAATACCTATGACCTCCAAGAGAGCAACGTGAGG 300 . : . : . : . : . : 283 CTAAAGCTCACGATCGTTAGCACAGTTGGCTTTGGGGACCAGATCAACAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 112130 CTAAAGCTCACGATCGTTAGCACAGTTGGCTTTGGGGACCAGATCAACAA 350 . : . : . : . : . : 333 AGAGGACAG CTACAAGCCTATCGTGGAATTCATCGATGCAC |||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||| 112180 AGAGGACAGGTA...TAGCTACAAGCCTATCGTGGAATTCATCGATGCAC 400 . : . : . : . : . : 374 AATTCGAGGCCTACCTGCAGGAAGAGCTAAAGATCCGAAGAGTGCTACAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 122662 AATTCGAGGCCTACCTGCAGGAAGAGCTAAAGATCCGAAGAGTGCTACAC 450 . : . : . : . : . : 424 ACCTACCATGACTCCCGAATCCATGTCTGCTTGTATTTCATTGCCCCCAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 122712 ACCTACCATGACTCCCGAATCCATGTCTGCTTGTATTTCATTGCCCCCAC 500 . : . : . : . : . : 474 GGGTCATTCCCTGAAGTCTCTGGACCTAGTGACTATGAAGAAGCTGGACA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 122762 GGGTCATTCCCTGAAGTCTCTGGACCTAGTGACTATGAAGAAGCTGGACA 550 . : . : . : . : . : 524 GTAAG GTGAACATCATCCCCATCATTGCCAAAGCAGATGCC |||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 122812 GTAAGGTA...TAGGTGAACATCATCCCCATCATTGCCAAAGCAGATGCC 600 . : . : . : . : . : 565 ATTTCGAAGAGTGAGCTAACAAAGTTCAAAATCAAAATCACCAGCGAGCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 125608 ATTTCGAAGAGTGAGCTAACAAAGTTCAAAATCAAAATCACCAGCGAGCT 650 . : . : . : . : . : 615 TGTCAGCAACGGAGTCCAGATCTATCAGTTTCCTACAGATGATGAGTCGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 125658 TGTCAGCAACGGAGTCCAGATCTATCAGTTTCCTACAGATGATGAGTCGG 700 . : . : . : . : . : 665 TGGCAGAGATCAATGGAACCATGAAC GCCCACCTGCCGTTT ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||| 125708 TGGCAGAGATCAATGGAACCATGAACGTG...CAGGCCCACCTGCCGTTT 750 . : . : . : . : . : 706 GCTGTCATTGGCAGCACAGAAGAACTGAAGATAGGCAACAAGATGATGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 134897 GCTGTCATTGGCAGCACAGAAGAACTGAAGATAGGCAACAAGATGATGAG 800 . : . : . : . : . : 756 GGCGCGGCAGTATCCTTGGGGCACTGTGCAGG TTGAAAACG ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||| 134947 GGCGCGGCAGTATCCTTGGGGCACTGTGCAGGGTG...CAGTTGAAAACG 850 . : . : . : . : . : 797 AGGCCCACTGCGACTTTGTGAAGCTGCGGGAGATGCTGATTCGGGTCAAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 138484 AGGCCCACTGCGACTTTGTGAAGCTGCGGGAGATGCTGATTCGGGTCAAC 900 . : . : . : . : . : 847 ATGGAGGATCTGCGGGAGCAGACCCACACCCGGCACTATGAGCTGTATCG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 138534 ATGGAGGATCTGCGGGAGCAGACCCACACCCGGCACTATGAGCTGTATCG 950 . : . : . : . : . : 897 CCGCTGTAAGCTGGAGGAGATGGGCTTCAAGGACACCGACCCTGACAGCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 138584 CCGCTGTAAGCTGGAGGAGATGGGCTTCAAGGACACCGACCCTGACAGCA 1000 . : . : . : . : . : 947 AACCCTTCAG TTTACAGGAGACATATGAGGCCAAAAGGAAC ||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||| 138634 AACCCTTCAGGTA...CAGTTTACAGGAGACATATGAGGCCAAAAGGAAC 1050 . : . : . : . : . : 988 GAGTTCCTAGGGGAACTCCAGAAAAAAGAAGAGGAGATGAGACAGATGTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 142209 GAGTTCCTAGGGGAACTCCAGAAAAAAGAAGAGGAGATGAGACAGATGTT 1100 . : . : . : . : . : 1038 CGTCCAGCGAGTCAAAGAGAAAGAAGCGGAGCTCAAAGAGGCAGAGAAAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 142259 CGTCCAGCGAGTCAAAGAGAAAGAAGCGGAGCTCAAAGAGGCAGAGAAAG 1150 . : . : . : . : . : 1088 AG CTGCACGAGAAGTTTGACCGTCTGAAGAAACTGCACCAG ||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 142309 AGGTA...CAGCTGCACGAGAAGTTTGACCGTCTGAAGAAACTGCACCAG 1200 . : . : . : . : . : 1129 GACGAGAAGAAGAAACTGGAGGATAAGAAGAAATCCCTGGATGATGAAGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 146201 GACGAGAAGAAGAAACTGGAGGATAAGAAGAAATCCCTGGATGATGAAGT 1250 . : . : . : . : . : 1179 GAATGCTTTCAAGCAAAGAAAGACGGCGGCTGAGCTGCTCCAGTCCCAGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 146251 GAATGCTTTCAAGCAAAGAAAGACGGCGGCTGAGCTGCTCCAGTCCCAGG 1300 . : . : . : . : . : 1229 GCTCCCAGGCTGGAGGCTCACAGACTCTGAAGAGAGACAAAGAGAAGAAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 146301 GCTCCCAGGCTGGAGGCTCACAGACTCTGAAGAGAGACAAAGAGAAGAAA 1350 1279 AAT ||- 146351 AA