seq1 = pF1KA0121.tfa, 870 bp seq2 = pF1KA0121/gi568815595r_11458559.tfa (gi568815595r:11458559_11803034), 344476 bp >pF1KA0121 870 >gi568815595r:11458559_11803034 (Chr3) (complement) 1-64 (100001-100064) 100% -> 65-254 (201013-201202) 99% -> 255-477 (238016-238238) 100% -> 478-601 (243580-243703) 100% -> 602-870 (244208-244476) 100% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGGAGACGCCATTGGATGTTTTGTCCAGGGCAGCATCTCTGGTGCATGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100001 ATGGAGACGCCATTGGATGTTTTGTCCAGGGCAGCATCTCTGGTGCATGC 50 . : . : . : . : . : 51 TGATGACGAAAAAC GCGAAGCTGCTCTCAGGGGAGAACCCA ||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||| 100051 TGATGACGAAAAACGTA...TAGGCGAAGCTGCTCTCAGGGGAGAACCCA 100 . : . : . : . : . : 92 GAATGCAGACCCTGCCGGTGGCCTCTGCCCTCAGCAGTCACCGCACCGGC |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 201040 GAATACAGACCCTGCCGGTGGCCTCTGCCCTCAGCAGTCACCGCACCGGC 150 . : . : . : . : . : 142 CCTCCCCCAATCAGCCCCAGCAAGAGGAAGTTCAGCATGGAGCCAGGTGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 201090 CCTCCCCCAATCAGCCCCAGCAAGAGGAAGTTCAGCATGGAGCCAGGTGA 200 . : . : . : . : . : 192 CGAGGACCTAGACTGTGACAACGACCACGTCTCCAAAATGAGTCGCATCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 201140 CGAGGACCTAGACTGTGACAACGACCACGTCTCCAAAATGAGTCGCATCT 250 . : . : . : . : . : 242 TCAACCCCCATCT GAACAAGACTGCCAATGGAGACTGCCGC |||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||| 201190 TCAACCCCCATCTGTG...CAGGAACAAGACTGCCAATGGAGACTGCCGC 300 . : . : . : . : . : 283 AGAGACCCCCGGGAGCGGAGCCGCAGCCCCATCGAGCGCGCTGTGGCCCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 238044 AGAGACCCCCGGGAGCGGAGCCGCAGCCCCATCGAGCGCGCTGTGGCCCC 350 . : . : . : . : . : 333 CACCATGAGCCTGCACGGCAGCCACCTGTACACCTCCCTCCCCAGCCTTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 238094 CACCATGAGCCTGCACGGCAGCCACCTGTACACCTCCCTCCCCAGCCTTG 400 . : . : . : . : . : 383 GCCTGGAGCAGCCCCTCGCACTGACCAAGAACAGCCTGGACGCCAGCAGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 238144 GCCTGGAGCAGCCCCTCGCACTGACCAAGAACAGCCTGGACGCCAGCAGG 450 . : . : . : . : . : 433 CCAGCCGGCCTCTCGCCCACACTGACCCCGGGGGAGCGGCAGCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.. 238194 CCAGCCGGCCTCTCGCCCACACTGACCCCGGGGGAGCGGCAGCAGGTG.. 500 . : . : . : . : . : 478 AACCGGCCCTCCGTGATCACCTGTGCCTCGGCTGGCGCCCGCAACT .>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 238244 .CAGAACCGGCCCTCCGTGATCACCTGTGCCTCGGCTGGCGCCCGCAACT 550 . : . : . : . : . : 524 GCAACCTCTCGCACTGCCCCATCGCGCACAGCGGCTGTGCCGCGCCCGGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 243626 GCAACCTCTCGCACTGCCCCATCGCGCACAGCGGCTGTGCCGCGCCCGGG 600 . : . : . : . : . : 574 CCTGCCAGCTACCGGAGGCCACCGAGCG CTGCCACCACCTG ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||| 243676 CCTGCCAGCTACCGGAGGCCACCGAGCGGTG...CAGCTGCCACCACCTG 650 . : . : . : . : . : 615 TGACCCCGTGGTGGAGGAGCATTTCCGCAGGAGCCTGGGCAAGAATTACA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 244221 TGACCCCGTGGTGGAGGAGCATTTCCGCAGGAGCCTGGGCAAGAATTACA 700 . : . : . : . : . : 665 AGGAGCCCGAGCCGGCACCCAACTCCGTGTCCATCACGGGCTCCGTGGAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 244271 AGGAGCCCGAGCCGGCACCCAACTCCGTGTCCATCACGGGCTCCGTGGAC 750 . : . : . : . : . : 715 GACCACTTTGCCAAAGCTCTGGGTGACACGTGGCTCCAGATCAAAGCGGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 244321 GACCACTTTGCCAAAGCTCTGGGTGACACGTGGCTCCAGATCAAAGCGGC 800 . : . : . : . : . : 765 CAAGGACGGAGCATCCAGCAGCCCTGAGTCCGCCTCTCGCAGGGGCCAGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 244371 CAAGGACGGAGCATCCAGCAGCCCTGAGTCCGCCTCTCGCAGGGGCCAGC 850 . : . : . : . : . : 815 CCGCCAGCCCCTCTGCCCACATGGTCAGCCACAGTCACTCCCCCTCTGTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 244421 CCGCCAGCCCCTCTGCCCACATGGTCAGCCACAGTCACTCCCCCTCTGTG 900 . 865 GTCTCC |||||| 244471 GTCTCC