seq1 = pF1KA0038.tfa, 684 bp
seq2 = pF1KA0038/gi568815591r_27358169.tfa (gi568815591r:27358169_27558849), 200681 bp

>pF1KA0038 684
>gi568815591r:27358169_27558849 (Chr7)

(complement)

1-684  (100001-100683)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGACTTCGACACCTACGACGATCGGGCCTACAGCAGCTTCGGCGG
        |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
 100001 ATGGCGGACTTCGACACCTACGACGATCAGGCCTACAGCAGCTTCGGCAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGGCAGAGGGTCCCGCGGCAGTGCTGGTGGCCATGGTTCCCGTAGCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGGCAGAGGGTCCCGCGGCAGTGCTGGTGGCCATGGTTCCCGTAGCCAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGGAGTTGCCCACAGAGCCCCCCTACACAGCATACGTAGGAAATCTACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGGAGTTGCCCACAGAGCCCCCCTACACAGCATACGTAGGAAATCTACCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTCAATACGGTTCAGGGCGACATAGATGCTATCTTTAAGGATCTCAGCAT
        ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTCAATACGGTTCGGGGCGACATAGATGCTATCTTTAAGGATCTCAGCAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AAGGAGTGTACGGCTAGTCAGAGACAAAGACACAGATAAATTTAAAGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AAGGAGTGTACGGCTAGTCAGAGACAAAGACACAGATAAATTTAAAGGAT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCTGCTATGTAGAATTCGATGAAGTGGATTCCCTTAAGGAAGCCTTGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCTGCTATGTAGAATTCGATGAAGTGGATTCCCTTAAGGAAGCCTTGACA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TACGATGGTGCACTGTTGGGCGATCGGTCACTTCGTGTGGACATTGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TACGATGGTGCACTGTTGGGCGATCGGTCACTTCGTGTGGACATTGCAGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AGGCAGAAAACAAGATAAAGGTGGCTTTGGATTCAGAAAAGGTGGACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 AGGCAGAAAACAAGATAAAGGTGGCTTTGGATTCAGAAAAGGTGGACCAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ATGACAGAGGCTTCAGGGATGACTTCTTAGGGGGCAGGGGAGGTAGTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ATGACAGAGGCTTCAGGGATGACTTCTTAGGGGGCAGGGGAGGTAGTCGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CCAGGCGACCGGCGAACAGGCCCCCCCATGGGCAGCCGCTTCAGAGATGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
 100451 CCAGGCGACCGGCGAACAGGCCCCCCCATGGGCAGCCGCTTCGGAGATGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CCCTCCCCTCCGTGGATCCAACATGGATTTCAGAGAACCCACAGAAGAGG
        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CCCTCCCCTCGGTGGATCCAACATGGATTTCAGAGAACCCACAGAAGAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AAAGAGCACAGAGACCACGACTCCAGCTTAAACCTCGAACAGTCGCGACG
        |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 AAAGCGCACAGAGACCACGACTCCAGCTTAAACCTCGAACAGTCGCGACG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CCCCTCAATCAAGTAGCCAATCCCAACTCTGCTATCTTCGGGGGTGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CCCCTCAATCAAGTAGCCAATCCCAACTCTGCTATCTTCGGGGGTGCCAG

    650     .    :    .    :    .    :
    651 GCCTAGAGAGGAAGTCGTTCAAAAGGAGCAAGAA
        ||||||||||||||| |||||||||||||||-||
 100651 GCCTAGAGAGGAAGTTGTTCAAAAGGAGCAA AA