seq1 = pF1KA0010.tfa, 3249 bp
seq2 = pF1KA0010/gi568815591f_157039273.tfa (gi568815591f:157039273_157367752), 328480 bp

>pF1KA0010 3249
>gi568815591f:157039273_157367752 (Chr7)

1-66  (100001-100066)   100% ->
67-120  (124538-124591)   100% ->
121-195  (129776-129850)   100% ->
196-342  (131032-131178)   100% ->
343-458  (135647-135762)   100% ->
459-616  (139418-139575)   100% ->
617-770  (142246-142399)   100% ->
771-991  (142836-143056)   100% ->
992-1143  (144606-144757)   100% ->
1144-1331  (147562-147749)   100% ->
1332-1418  (162449-162535)   100% ->
1419-1576  (168126-168283)   99% ->
1577-1809  (168431-168663)   100% ->
1810-1914  (177595-177699)   100% ->
1915-2002  (181417-181504)   100% ->
2003-2100  (183982-184079)   100% ->
2101-2233  (186135-186267)   100% ->
2234-2481  (191808-192055)   99% ->
2482-2694  (209096-209308)   100% ->
2695-2883  (214682-214870)   100% ->
2884-2950  (214972-215038)   100% ->
2951-3081  (217642-217772)   100% ->
3082-3249  (228313-228480)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTCAGCTTCGAAGGCGACTTCAAGACGCGGCCCAAGGTGTCCCTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTTCAGCTTCGAAGGCGACTTCAAGACGCGGCCCAAGGTGTCCCTTGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGGCGCGAGCAGGAAG         GAGGAAAAGGCTTCTCTTTTACATC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 100051 CGGCGCGAGCAGGAAGGTG...TAGGAGGAAAAGGCTTCTCTTTTACATC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GTACTCAGGAAGAAAGAAGAAAGAGAGAG         GAAGAAAGGCGA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 124563 GTACTCAGGAAGAAAGAAGAAAGAGAGAGGTA...TAGGAAGAAAGGCGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 AGGTTGAAAAATGCAATAATTATCCAGTCATTTATTCGAGGCTATAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129788 AGGTTGAAAAATGCAATAATTATCCAGTCATTTATTCGAGGCTATAGAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CAGAAAACAGCAA         TATTCCATCCAAAGAAGTGCATTTGATC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 129838 CAGAAAACAGCAAGTA...CAGTATTCCATCCAAAGAAGTGCATTTGATC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 GCTGTGCTACCTTGTCACAGTCCGGGGGCGCTTTTCCCATTGCTAATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131060 GCTGTGCTACCTTGTCACAGTCCGGGGGCGCTTTTCCCATTGCTAATGGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 CCCAACCTTACCCTTTTGGTAAGGCAGCTTCTGTTTTTTTACAAACAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131110 CCCAACCTTACCCTTTTGGTAAGGCAGCTTCTGTTTTTTTACAAACAAAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TGAAGACTCAAAACGTTTG         ATATGGCTGTATCAGAACTTAA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 131160 TGAAGACTCAAAACGTTTGGTG...CAGATATGGCTGTATCAGAACTTAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 TTAAACACAGCTCTCTGTTTGTCAAGCAGTTGGATGGATCTGAGAGACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135669 TTAAACACAGCTCTCTGTTTGTCAAGCAGTTGGATGGATCTGAGAGACTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 ACATGCTTATTTCAGATAAAAAGATTGATGAGCCTCTGTTGCAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 135719 ACATGCTTATTTCAGATAAAAAGATTGATGAGCCTCTGTTGCAGGTA...

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    459    GTTGCTGCAAAACTGTAATGATGACAGTTTGAATGTTGCACTTCCAA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139415 CAGGTTGCTGCAAAACTGTAATGATGACAGTTTGAATGTTGCACTTCCAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 TGAGAATGCTTGAAGTATTTTCGTCTGAGAATACTTACTTGCCTGTTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139465 TGAGAATGCTTGAAGTATTTTCGTCTGAGAATACTTACTTGCCTGTTTTA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 CAAGATGCTAGCTATGTGGTGTCAGTGATTGAACAAATTTTGCACTACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139515 CAAGATGCTAGCTATGTGGTGTCAGTGATTGAACAAATTTTGCACTACAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GATTCACAATG         GGTATTATAGGTCTCTATATTTGTTGATTA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 139565 GATTCACAATGGTA...TAGGGTATTATAGGTCTCTATATTTGTTGATTA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 ACAGCAAGCTTCCATCAAGTATTGAATATTCTGATTTATCTCGAGTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142276 ACAGCAAGCTTCCATCAAGTATTGAATATTCTGATTTATCTCGAGTTCCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 ATAGCAAAAATTTTGCTAGAGAATGTTCTAAAACCATTGCACTTTACTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142326 ATAGCAAAAATTTTGCTAGAGAATGTTCTAAAACCATTGCACTTTACTTA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 CAACTCCTGTCCGGAAGGTGCGAG         GCAACAAGTTTTTACAG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 142376 CAACTCCTGTCCGGAAGGTGCGAGGTG...CAGGCAACAAGTTTTTACAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 CCTTCACAGAGGAGTTTCTGGCAGCACCTTTTACAGATCAGATTTTTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142853 CCTTCACAGAGGAGTTTCTGGCAGCACCTTTTACAGATCAGATTTTTCAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 TTCATCATTCCGGCGCTTGCAGATGCGCAGACCGTTTTCCCTTACGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142903 TTCATCATTCCGGCGCTTGCAGATGCGCAGACCGTTTTCCCTTACGAGCC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 CTTTCTGAATGCACTGTTGTTAATAGAGAGTAGATGTTCAAGAAAGAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142953 CTTTCTGAATGCACTGTTGTTAATAGAGAGTAGATGTTCAAGAAAGAGTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 GTGGAGCACCCTGGCTTTTCTATTTCGTTTTAACTGTTGGCGAAAATTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143003 GTGGAGCACCCTGGCTTTTCTATTTCGTTTTAACTGTTGGCGAAAATTAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 TTGG         GGGCCCTCTCTGAGGAAGGGCTGCTGGTGTATTTGCG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143053 TTGGGTA...AAGGGGCCCTCTCTGAGGAAGGGCTGCTGGTGTATTTGCG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 GGTGCTGCAGACCTTCCTCTCTCAGTTACCAGTCTCTCCTGCCAGCGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144643 GGTGCTGCAGACCTTCCTCTCTCAGTTACCAGTCTCTCCTGCCAGCGCGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 GCTGTCACGACTCAGCCAGTGACTCTGAGGAGGAGAGTGAAGAAGCCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144693 GCTGTCACGACTCAGCCAGTGACTCTGAGGAGGAGAGTGAAGAAGCCGAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 AAGCCCTCAAGCCCG         GAGGATGGCAGACTGTCAGTATCATA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 144743 AAGCCCTCAAGCCCGGTA...TAGGAGGATGGCAGACTGTCAGTATCATA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 CATAACAGAGGAATGCCTGAAGAAGCTGGACACAAAGCAGCAGACCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147588 CATAACAGAGGAATGCCTGAAGAAGCTGGACACAAAGCAGCAGACCAACA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 CCCTGCTCAACCTGGTGTGGAGGGACTCTGCGAGCGAGGAGGTCTTCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147638 CCCTGCTCAACCTGGTGTGGAGGGACTCTGCGAGCGAGGAGGTCTTCACC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 ACCATGGCCTCCGTCTGCCACACGCTGATGGTGCAGCACCGCATGATGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147688 ACCATGGCCTCCGTCTGCCACACGCTGATGGTGCAGCACCGCATGATGGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 ACCCAAAGTCAG         GCTTCTCTACAGTTTAGCCTTTAATGCCA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 147738 ACCCAAAGTCAGGCA...TAGGCTTCTCTACAGTTTAGCCTTTAATGCCA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 GGTTTCTGAGACATCTTTGGTTTCTAATATCTTCCATGTCAACACGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162478 GGTTTCTGAGACATCTTTGGTTTCTAATATCTTCCATGTCAACACGGATG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 ATCACAGG         GTCTATGGTACCGTTGCTTCAGGTGATATCCAG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 162528 ATCACAGGGTA...AAGGTCTATGGTACCGTTGCTTCAGGTGATATCCAG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 GGGTTCTCCTATGTCTTTTGAAGATTCTAGTCGAATCATCCCACTCTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168159 GGGTTCTCCTATGTCTTTTGAAGATTCTAGTCGAATCATCCCACTCTTTT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 ACCTTTTTAGCTCCTTGTTTAGTCATTCACTAATTTCCATACATGATAAC
        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168209 ATCTTTTTAGCTCCTTGTTTAGTCATTCACTAATTTCCATACATGATAAC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 GAATTCTTCGGTGATCCCATAGAAG         TTGTAGGTCAAAGACA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 168259 GAATTCTTCGGTGATCCCATAGAAGGTA...TAGTTGTAGGTCAAAGACA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 ATCATCAATGATGCCTTTTACTTTAGAAGAGCTGATAATGTTGTCTCGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168447 ATCATCAATGATGCCTTTTACTTTAGAAGAGCTGATAATGTTGTCTCGAT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 GCCTTCGAGATGCATGCCTGGGGATCATCAAGTTGGCTTATCCAGAAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168497 GCCTTCGAGATGCATGCCTGGGGATCATCAAGTTGGCTTATCCAGAAACC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 AAGCCAGAAGTTCGAGAAGAATATATTACAGCATTTCAGAGTATTGGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168547 AAGCCAGAAGTTCGAGAAGAATATATTACAGCATTTCAGAGTATTGGAGT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1743 TACTACTAGCTCTGAAATGCAACAATGCATACAGATGGAACAGAAAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168597 TACTACTAGCTCTGAAATGCAACAATGCATACAGATGGAACAGAAAAGAT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1793 GGATTCAGTTATTTAAG         GTTATCACCAATCTAGTGAAAATG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 168647 GGATTCAGTTATTTAAGGTA...CAGGTTATCACCAATCTAGTGAAAATG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1834 TTGAAGTCCAGAGACACGAGGAGAAATTTTTGTCCTCCAAACCACTGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 177619 TTGAAGTCCAGAGACACGAGGAGAAATTTTTGTCCTCCAAACCACTGGCT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1884 GTCAGAACAAGAAGATATTAAAGCAGATAAG         GTCACTCAGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 177669 GTCAGAACAAGAAGATATTAAAGCAGATAAGGTG...CAGGTCACTCAGC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1925 TCTATGTGCCAGCATCCAGACATGTGTGGAGGTTCCGGCGGATGGGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 181427 TCTATGTGCCAGCATCCAGACATGTGTGGAGGTTCCGGCGGATGGGGAGG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1975 ATAGGCCCGCTGCAGTCCACCCTGGACG         TGGGTTTGGAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 181477 ATAGGCCCGCTGCAGTCCACCCTGGACGGTG...TAGTGGGTTTGGAGTC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2016 CCCGCCGCTGTCTGTGTCTGAGGAAAGACAGCTTGCTGTCCTGACAGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183995 CCCGCCGCTGTCTGTGTCTGAGGAAAGACAGCTTGCTGTCCTGACAGAGT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2066 TGCCTTTTGTGGTTCCATTTGAGGAACGAGTAAAG         ATCTTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 184045 TGCCTTTTGTGGTTCCATTTGAGGAACGAGTAAAGGTA...TAGATCTTT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2107 CAGAGGTTGATTTATGCAGATAAGCAAGAAGTTCAAGGAGATGGTCCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 186141 CAGAGGTTGATTTATGCAGATAAGCAAGAAGTTCAAGGAGATGGTCCATT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2157 TCTGGATGGAATTAATGTCACAATAAGAAGAAATTACATTTATGAAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 186191 TCTGGATGGAATTAATGTCACAATAAGAAGAAATTACATTTATGAAGATG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2207 CTTATGACAAACTTTCTCCAGAAAATG         AGCCTGATTTGAAA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 186241 CTTATGACAAACTTTCTCCAGAAAATGGTA...CAGAGCCTGATTTGAAA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2248 AAGCGGATCCGTGTGCACTTGCTCAATGCCCATGGCCTGGATGAAGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191822 AAGCGGATCCGTGTGCACTTGCTCAATGCCCATGGCCTGGATGAAGCTGG

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2298 CATTGATGGTGGTGGTATTTTCAGAGAGTTTTTAAATGAACTACTGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191872 CATTGATGGTGGTGGTATTTTCAGAGAGTTTTTAAATGAACTACTGAAGT

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2348 CAGGATTTAACCCCAACCAGGGGTTCTTTAAGACTACTAATGAAGGGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191922 CAGGATTTAACCCCAACCAGGGGTTCTTTAAGACTACTAATGAAGGGCTT

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2398 CTGTACCCCAACCCGGCTGCTCAGATGCTTGTGGGAGATTCTTTTGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191972 CTGTACCCCAACCCGGCTGCTCAGATGCTTGTGGGAGATTCTTTTGCCAG

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2448 ACATTACTACTTCCTAGCCAGAATGCTTGGAAAG         GCTCTCT
        ||||||||||||||||| ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 192022 ACATTACTACTTCCTAGGCAGAATGCTTGGAAAGGTA...AAGGCTCTCT

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2489 ATGAGAACATGCTGGTGGAGCTGCCCTTTGCAGGCTTCTTTCTTTCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 209103 ATGAGAACATGCTGGTGGAGCTGCCCTTTGCAGGCTTCTTTCTTTCCAAG

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2539 TTGCTTGGAACCAGTGCCGACGTGGACATTCACCACCTCGCCTCCCTAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 209153 TTGCTTGGAACCAGTGCCGACGTGGACATTCACCACCTCGCCTCCCTAGA

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2589 CCCTGAGGTGTATAAGAATTTGCTCTTTCTGAAGAGCTACGAAGACGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 209203 CCCTGAGGTGTATAAGAATTTGCTCTTTCTGAAGAGCTACGAAGACGATG

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2639 TGGAGGAGCTTGGGCTGAACTTCACTGTGGTGAACAATGACCTGGGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 209253 TGGAGGAGCTTGGGCTGAACTTCACTGTGGTGAACAATGACCTGGGAGAG

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2689 GCGCAG         GTAGTTGAACTAAAATTCGGTGGGAAAGACATCCC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 209303 GCGCAGGTG...CAGGTAGTTGAACTAAAATTCGGTGGGAAAGACATCCC

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2730 TGTCACCAGCGCCAACCGGATTGCGTACATCCACTTGGTGGCAGACTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 214717 TGTCACCAGCGCCAACCGGATTGCGTACATCCACTTGGTGGCAGACTACA

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2780 GGCTGAACAGGCAGATCCGCCAGCACTGCCTGGCTTTCCGCCAGGGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 214767 GGCTGAACAGGCAGATCCGCCAGCACTGCCTGGCTTTCCGCCAGGGCCTT

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2830 GCCAATGTCGTCAGCCTCGAGTGGCTCCGAATGTTTGATCAGCAAGAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 214817 GCCAATGTCGTCAGCCTCGAGTGGCTCCGAATGTTTGATCAGCAAGAAAT

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2880 TCAG         GTATTAATTTCTGGTGCACAAGTTCCCATAAGCCTAG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 214867 TCAGGTA...TAGGTATTAATTTCTGGTGCACAAGTTCCCATAAGCCTAG

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2921 AGGACCTAAAATCCTTTACAAACTATTCAG         GAGGCTATTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 215009 AGGACCTAAAATCCTTTACAAACTATTCAGGTA...TAGGAGGCTATTCT

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2962 GCAGACCATCCTGTTATTAAGGTCTTCTGGAGAGTTGTGGAAGGGTTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 217653 GCAGACCATCCTGTTATTAAGGTCTTCTGGAGAGTTGTGGAAGGGTTCAC

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3012 TGATGAAGAAAAGCGCAAACTGCTGAAGTTTGTAACAAGCTGCTCTCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 217703 TGATGAAGAAAAGCGCAAACTGCTGAAGTTTGTAACAAGCTGCTCTCGAC

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3062 CCCCTCTCTTGGGGTTTAAG         GAGTTGTATCCCGCATTTTGT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 217753 CCCCTCTCTTGGGGTTTAAGGTA...CAGGAGTTGTATCCCGCATTTTGT

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3103 ATTCACAACGGAGGCTCCGACCTTGAGCGGCTCCCCACAGCCAGCACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 228334 ATTCACAACGGAGGCTCCGACCTTGAGCGGCTCCCCACAGCCAGCACCTG

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3153 CATGAACCTGCTGAAGCTCCCCGAGTTCTATGACGAGACACTTTTGCGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 228384 CATGAACCTGCTGAAGCTCCCCGAGTTCTATGACGAGACACTTTTGCGAA

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   3203 GTAAACTTCTCTATGCGATTGAATGTGCCGCTGGCTTTGAGCTGAGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 228434 GTAAACTTCTCTATGCGATTGAATGTGCCGCTGGCTTTGAGCTGAGC