seq1 = pF1KA0008.tfa, 2538 bp
seq2 = pF1KA0008/gi568815584r_55048354.tfa (gi568815584r:55048354_55289179), 240826 bp

>pF1KA0008 2538
>gi568815584r:55048354_55289179 (Chr14)

(complement)

1-238  (100001-100238)   100% ->
239-432  (105427-105620)   100% ->
433-495  (106748-106810)   100% ->
496-580  (107883-107967)   100% ->
581-703  (108402-108524)   100% ->
704-774  (109481-109551)   100% ->
775-1049  (111844-112118)   99% ->
1050-1174  (113162-113286)   100% ->
1175-1301  (113708-113834)   100% ->
1302-1387  (118393-118478)   100% ->
1388-1548  (119621-119781)   99% ->
1549-1653  (126105-126209)   100% ->
1654-1873  (130439-130658)   100% ->
1874-2063  (134374-134563)   100% ->
2064-2121  (136533-136590)   98% ->
2122-2368  (137239-137485)   100% ->
2369-2418  (138332-138381)   100% ->
2419-2538  (140707-140826)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCTTCATCACATTTTGCCAGTCGACACAGGAAGGATATAAGTACTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCTTCATCACATTTTGCCAGTCGACACAGGAAGGATATAAGTACTGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AATGATTAGAACTAAAATTGCTCATAGGAAATCACTGTCTCAGAAAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AATGATTAGAACTAAAATTGCTCATAGGAAATCACTGTCTCAGAAAGAAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ATAGACATAAGGAATACGAACGAAATAGACACTTTGGTTTGAAAGATGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ATAGACATAAGGAATACGAACGAAATAGACACTTTGGTTTGAAAGATGTA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AACATTCCAACCTTGGAAGGTAGAATTCTTGTTGAATTAGATGAGACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AACATTCCAACCTTGGAAGGTAGAATTCTTGTTGAATTAGATGAGACATC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TCAAGGGCTTGTTCCAGAAAAGACCAATGTTAAGCCAA         GGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 100201 TCAAGGGCTTGTTCCAGAAAAGACCAATGTTAAGCCAAGTA...TAGGGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CAATGAAAACTATTCTAGGTGATCAACGAAAACAGATGCTCCAAAAATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105430 CAATGAAAACTATTCTAGGTGATCAACGAAAACAGATGCTCCAAAAATAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AAAGAAGAAAAGCAACTTCAAAAATTGAAAGAGCAGAGAGAGAAAGCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105480 AAAGAAGAAAAGCAACTTCAAAAATTGAAAGAGCAGAGAGAGAAAGCTAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 ACGAGGAATATTTAAAGTGGGTCGTTATAGACCTGATATGCCTTGTTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105530 ACGAGGAATATTTAAAGTGGGTCGTTATAGACCTGATATGCCTTGTTTTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TTTTATCAAACCAGAATGCTGTGAAAGCTGAGCCAAAAAAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 105580 TTTTATCAAACCAGAATGCTGTGAAAGCTGAGCCAAAAAAGGTA...AAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GCTATTCCATCTTCTGTACGGATTACAAGGTCAAAGGCCAAAGACCAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106748 GCTATTCCATCTTCTGTACGGATTACAAGGTCAAAGGCCAAAGACCAAAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GGAGCAGACTAAG         ATTGATAACGAGAGTGATGTTCGAGCAA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 106798 GGAGCAGACTAAGGTA...TAGATTGATAACGAGAGTGATGTTCGAGCAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TCCGACCTGGTCCAAGACAAACTTCTGAAAAGAAAGTGTCAGACAAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107911 TCCGACCTGGTCCAAGACAAACTTCTGAAAAGAAAGTGTCAGACAAAGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 AAAAAAG         TTGTGCAGCCTGTAATGCCCACGTCGTTGAGAAT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107961 AAAAAAGGTA...CAGTTGTGCAGCCTGTAATGCCCACGTCGTTGAGAAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GACTCGATCAGCTACTCAAGCAGCAAAGCAGGTTCCCAGAACAGTCTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108436 GACTCGATCAGCTACTCAAGCAGCAAAGCAGGTTCCCAGAACAGTCTCAT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CTACCACAGCAAGAAAGCCAGTCACAAGAGCTGCTAATG         AA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 108486 CTACCACAGCAAGAAAGCCAGTCACAAGAGCTGCTAATGGTG...TAGAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 AACGAACCAGAAGGAAAGGTGCCAAGTAAAGGAAGACCTGCCAAAAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109483 AACGAACCAGAAGGAAAGGTGCCAAGTAAAGGAAGACCTGCCAAAAATGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 AGAAACAAAACCCGACAAG         GGTATTTCTTGTAAAGTCGATA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 109533 AGAAACAAAACCCGACAAGGTA...TAGGGTATTTCTTGTAAAGTCGATA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 GTGAAGAAAATACTTTGAATTCACAAACTAATGCAACAAGTGGAATGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111866 GTGAAGAAAATACTTTGAATTCACAAACTAATGCAACAAGTGGAATGAAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 CCAGATGGAGTCTTATCAAAAATGGAAAACTTACCTGAGATAAATACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111916 CCAGATGGAGTCTTATCAAAAATGGAAAACTTACCTGAGATAAATACTGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 AAAAATAAAAGGGAAGAATTCCTTCGCACCTAAGGATTTTATGTTTCAGC
        |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
 111966 AAAAATAAAAGGGAAGAATTCCTTTGCACCTAAGGATTTTATGTTTCAGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 CACTGGATGGTCTGAAGACCTATCAAGTAACACCTATGACTCCCAGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112016 CACTGGATGGTCTGAAGACCTATCAAGTAACACCTATGACTCCCAGAAGT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 GCCAATGCTTTTTTGACACCCAGTTACACCTGGACTCCTTTAAAAACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112066 GCCAATGCTTTTTTGACACCCAGTTACACCTGGACTCCTTTAAAAACAGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 AGT         TGATGAGTCTCAAGCAACAAAAGAAATTTTGGCACAAA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112116 AGTGTA...TAGTGATGAGTCTCAAGCAACAAAAGAAATTTTGGCACAAA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 AATGTAAAACTTACTCTACCAAGACAATACAGCAAGATTCAAATAAATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113200 AATGTAAAACTTACTCTACCAAGACAATACAGCAAGATTCAAATAAATTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 CCATGTCCTTTGGGTCCTCTAACTGTTTGGCATGAAG         AACA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 113250 CCATGTCCTTTGGGTCCTCTAACTGTTTGGCATGAAGGTA...TAGAACA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 TGTTTTAAATAAAAATGAAGCTACTACTAAAAATTTAAATGGCCTTCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113712 TGTTTTAAATAAAAATGAAGCTACTACTAAAAATTTAAATGGCCTTCCAA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 TAAAAGAAGTCCCATCACTTGAAAGAAATGAAGGTCGAATTGCTCAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113762 TAAAAGAAGTCCCATCACTTGAAAGAAATGAAGGTCGAATTGCTCAGCCC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 CACCATGGTGTGCCATATTTCAG         AAATATCCTCCAGTCAGA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 113812 CACCATGGTGTGCCATATTTCAGGTA...TAGAAATATCCTCCAGTCAGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 AACTGAGAAATTAACTTCACATTGCTTCGAGTGGGACAGGAAACTTGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118411 AACTGAGAAATTAACTTCACATTGCTTCGAGTGGGACAGGAAACTTGAAT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 TGGACATTCCAGATGATG         CTAAAGATCTTATTCGCACAGCA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 118461 TGGACATTCCAGATGATGGTG...CAGCTAAAGATCTTATTCGCACAGCA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 GTTGGTCAAACAAGACTCCTTATGAAGGAAAGGTTCAAACAGTTTGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
 119644 GTTGGTCAAACAAGACTCCTTATGAAGGAAAGGTTTAAACAGTTTGAAGG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 ACTGGTTGATGATTGTGAATATAAACGAGGTATAAAGGAGACTACCTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119694 ACTGGTTGATGATTGTGAATATAAACGAGGTATAAAGGAGACTACCTGTA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 CAGATCTGGATGGATTTTGGGATATGGTTAGTTTTCAG         ATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 119744 CAGATCTGGATGGATTTTGGGATATGGTTAGTTTTCAGGTA...CAGATA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 GAAGATGTAATCCACAAATTCAACAATCTGATCAAACTTGAGGAATCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126108 GAAGATGTAATCCACAAATTCAACAATCTGATCAAACTTGAGGAATCTGG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 GTGGCAAGTCAATAATAATATGAATCATAATATGAACAAAAATGTCTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126158 GTGGCAAGTCAATAATAATATGAATCATAATATGAACAAAAATGTCTTTA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1652 GG         AAAAAAGTTGTCTCAGGTATAGCAAGTAAACCAAAACAG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126208 GGGTA...CAGAAAAAAGTTGTCTCAGGTATAGCAAGTAAACCAAAACAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 GATGATGCTGGAAGAATTGCAGCGAGAAATCGCCTAGCTGCCATAAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130478 GATGATGCTGGAAGAATTGCAGCGAGAAATCGCCTAGCTGCCATAAAAAA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1743 TGCAATGAGAGAGAGAATTAGGCAGGAAGAATGTGCTGAAACAGCAGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130528 TGCAATGAGAGAGAGAATTAGGCAGGAAGAATGTGCTGAAACAGCAGTTT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1793 CTGTGATACCAAAGGAAGTTGATAAAATAGTGTTCGATGCTGGATTTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130578 CTGTGATACCAAAGGAAGTTGATAAAATAGTGTTCGATGCTGGATTTTTC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1843 AGAGTTGAAAGTCCTGTTAAATTATTCTCAG         GACTTTCTGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 130628 AGAGTTGAAAGTCCTGTTAAATTATTCTCAGGTT...TAGGACTTTCTGT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1884 CTCTTCTGAAGGCCCTTCTCAAAGACTTGGAACACCTAAGTCTGTCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134384 CTCTTCTGAAGGCCCTTCTCAAAGACTTGGAACACCTAAGTCTGTCAACA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1934 AAGCTGTATCTCAGAGTAGAAATGAGATGGGCATTCCACAACAAACTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134434 AAGCTGTATCTCAGAGTAGAAATGAGATGGGCATTCCACAACAAACTACA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1984 TCACCAGAAAATGCCGGTCCTCAGAATACGAAAAGTGAACATGTGAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134484 TCACCAGAAAATGCCGGTCCTCAGAATACGAAAAGTGAACATGTGAAGAA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2034 GACTTTGTTTTTGAGTATTCCTGAAAGCAG         GAGCAGCATAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 134534 GACTTTGTTTTTGAGTATTCCTGAAAGCAGGTA...TAGGAGCAGCATAG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2075 AAGATGCTCAGTGTCCTGGATTACCAGATTTAATTGAAGAAAACCAT   
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||>>>
 136544 AAGATGCTCAGTGTCCTGGATTACCAGATTTAATTGAAGAAAATCATGTA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2122       GTTGTAAATAAGACAGACTTGAAGGTGGATTGTTTATCCAGTGA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136594 ...CAGGTTGTAAATAAGACAGACTTGAAGGTGGATTGTTTATCCAGTGA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2166 GAGAATGAGTTTGCCTCTTCTTGCTGGTGGAGTAGCAGATGATATTAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137283 GAGAATGAGTTTGCCTCTTCTTGCTGGTGGAGTAGCAGATGATATTAATA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2216 CTAACAAAAAAGAAGGAATTTCAGATGTTGTGGAAGGAATGGAACTGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137333 CTAACAAAAAAGAAGGAATTTCAGATGTTGTGGAAGGAATGGAACTGAAT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2266 TCTTCAATTACATCACAGGATGTTTTGATGAGTAGCCCTGAAAAAAATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137383 TCTTCAATTACATCACAGGATGTTTTGATGAGTAGCCCTGAAAAAAATAC

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2316 AGCTTCACAAAATAGCATCTTAGAAGAAGGGGAAACTAAAATTTCTCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137433 AGCTTCACAAAATAGCATCTTAGAAGAAGGGGAAACTAAAATTTCTCAGT

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2366 CAG         AACTATTTGATAATAAAAGTCTCACTACTGAATGCCAC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137483 CAGGTG...CAGAACTATTTGATAATAAAAGTCTCACTACTGAATGCCAC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2407 CTTCTTGATTCA         CCAGGTCTAAACTGCAGTAATCCATTTAC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 138370 CTTCTTGATTCAGTA...CAGCCAGGTCTAAACTGCAGTAATCCATTTAC

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2448 TCAGCTGGAGAGGAGACATCAAGAACATGCCAGACACATTTCTTTTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140736 TCAGCTGGAGAGGAGACATCAAGAACATGCCAGACACATTTCTTTTGGTG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :
   2498 GTAACCTGATTACTTTTTCACCTCTACAACCAGGAGAATTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140786 GTAACCTGATTACTTTTTCACCTCTACAACCAGGAGAATTT