# 0 Query: pF1KE1591, 462 aa
# 1 CCDS11366.1 RARA gene_id:5914|Hs108|chr17 (462 aa)
# 2 CCDS42317.1 RARA gene_id:5914|Hs108|chr17 (457 aa)
# 3 CCDS2642.1 RARB gene_id:5915|Hs108|chr3 (448 aa)
# 4 CCDS8850.1 RARG gene_id:5916|Hs108|chr12 (454 aa)
# 5 CCDS41790.1 RARG gene_id:5916|Hs108|chr12 (443 aa)
//
exp sw-scr id% from to
1 2e-135 3167 100.0 1 462
2 5.1e-117 2754 91.4 10 457
3 1.6e-93 2253 82.1 53 445
4 7.5e-91 2176 72.3 1 453
5 2.2e-89 2143 74.7 12 442
//
0 ( 1) MASNSSSCPTPGG-GHLNGYPVPPYAFFFPPMLGGLSPPGA--LTTL------QHQLPVS
1 ( 1) MASNSSSCPTPGG-GHLNGYPVPPYAFFFPPMLGGLSPPGA--LTTL------QHQLPVS
2 ( 10) ........PTPNP-FLVVDFYNQNRACLLPE--KGLPAPGP--YST-------PLRTPLW
3 ( -) ............................................................
4 ( 1) MATNKERLFAAGALGPGSGYPGAGFPFAFPGALRG-SPPFE--MLSPSFRGLGQPDLPKE
5 ( 12) .............................PRRLYGAAGPGAGLLRRA------TGGSCFA
//
0 ( 52) G---YSTPSPAT---IETQSSSSEEIVPSPPSPPPLPRIYKPCFVCQDKSSGYHYGVSAC
1 ( 52) G---YSTPSPAT---IETQSSSSEEIVPSPPSPPPLPRIYKPCFVCQDKSSGYHYGVSAC
2 ( 50) N---GSNHS------IETQSSSSEEIVPSPPSPPPLPRIYKPCFVCQDKSSGYHYGVSAC
3 ( 53) ...........S---IETQSTSSEELVPSPPSPLPPPRVYKPCFVCQDKSSGYHYGVSAC
4 ( 58) M---ASL----S---VETQSTSSEEMVPSSPSPPPPPRVYKPCFVCNDKSSGYHYGVSSC
5 ( 37) GLESFAWPQPASLQSVETQSTSSEEMVPSSPSPPPPPRVYKPCFVCNDKSSGYHYGVSSC
//
0 ( 106) EGCKGFFRRSIQKNMVYTCHRDKNCIINKVTRNRCQYCRLQKCFEVGMSKESVRNDRNKK
1 ( 106) EGCKGFFRRSIQKNMVYTCHRDKNCIINKVTRNRCQYCRLQKCFEVGMSKESVRNDRNKK
2 ( 101) EGCKGFFRRSIQKNMVYTCHRDKNCIINKVTRNRCQYCRLQKCFEVGMSKESVRNDRNKK
3 ( 99) EGCKGFFRRSIQKNMIYTCHRDKNCVINKVTRNRCQYCRLQKCFEVGMSKESVRNDRNKK
4 ( 108) EGCKGFFRRSIQKNMVYTCHRDKNCIINKVTRNRCQYCRLQKCFEVGMSKEAVRNDRNKK
5 ( 97) EGCKGFFRRSIQKNMVYTCHRDKNCIINKVTRNRCQYCRLQKCFEVGMSKEAVRNDRNKK
//
0 ( 166) KKEVPKPECSESYTLTPEVGELIEKVRKAHQETFPALCQLGKYTTNNSSEQRVSLDIDLW
1 ( 166) KKEVPKPECSESYTLTPEVGELIEKVRKAHQETFPALCQLGKYTTNNSSEQRVSLDIDLW
2 ( 161) KKEVPKPECSESYTLTPEVGELIEKVRKAHQETFPALCQLGKYTTNNSSEQRVSLDIDLW
3 ( 159) KKETSKQECTESYEMTAELDDLTEKIRKAHQETFPSLCQLGKYTTNSSADHRVRLDLGLW
4 ( 168) KKEVKEEGSPDSYELSPQLEELITKVSKAHQETFPSLCQLGKYTTNSSADHRVQLDLGLW
5 ( 157) KKEVKEEGSPDSYELSPQLEELITKVSKAHQETFPSLCQLGKYTTNSSADHRVQLDLGLW
//
0 ( 226) DKFSELSTKCIIKTVEFAKQLPGFTTLTIADQITLLKAACLDILILRICTRYTPEQDTMT
1 ( 226) DKFSELSTKCIIKTVEFAKQLPGFTTLTIADQITLLKAACLDILILRICTRYTPEQDTMT
2 ( 221) DKFSELSTKCIIKTVEFAKQLPGFTTLTIADQITLLKAACLDILILRICTRYTPEQDTMT
3 ( 219) DKFSELATKCIIKIVEFAKRLPGFTGLTIADQITLLKAACLDILILRICTRYTPEQDTMT
4 ( 228) DKFSELATKCIIKIVEFAKRLPGFTGLSIADQITLLKAACLDILMLRICTRYTPEQDTMT
5 ( 217) DKFSELATKCIIKIVEFAKRLPGFTGLSIADQITLLKAACLDILMLRICTRYTPEQDTMT
//
0 ( 286) FSDGLTLNRTQMHNAGFGPLTDLVFAFANQLLPLEMDDAETGLLSAICLICGDRQDLEQP
1 ( 286) FSDGLTLNRTQMHNAGFGPLTDLVFAFANQLLPLEMDDAETGLLSAICLICGDRQDLEQP
2 ( 281) FSDGLTLNRTQMHNAGFGPLTDLVFAFANQLLPLEMDDAETGLLSAICLICGDRQDLEQP
3 ( 279) FSDGLTLNRTQMHNAGFGPLTDLVFTFANQLLPLEMDDTETGLLSAICLICGDRQDLEEP
4 ( 288) FSDGLTLNRTQMHNAGFGPLTDLVFAFAGQLLPLEMDDTETGLLSAICLICGDRMDLEEP
5 ( 277) FSDGLTLNRTQMHNAGFGPLTDLVFAFAGQLLPLEMDDTETGLLSAICLICGDRMDLEEP
//
0 ( 346) DRVDMLQEPLLEALKVYVRKRRPSRPHMFPKMLMKITDLRSISAKGAERVITLKMEIPGS
1 ( 346) DRVDMLQEPLLEALKVYVRKRRPSRPHMFPKMLMKITDLRSISAKGAERVITLKMEIPGS
2 ( 341) DRVDMLQEPLLEALKVYVRKRRPSRPHMFPKMLMKITDLRSISAKGAERVITLKMEIPGS
3 ( 339) TKVDKLQEPLLEALKIYIRKRRPSKPHMFPKILMKITDLRSISAKGAERVITLKMEIPGS
4 ( 348) EKVDKLQEPLLEALRLYARRRRPSQPYMFPRMLMKITDLRGISTKGAERAITLKMEIPGP
5 ( 337) EKVDKLQEPLLEALRLYARRRRPSQPYMFPRMLMKITDLRGISTKGAERAITLKMEIPGP
//
0 ( 406) MPPLIQEMLENSEGLDTLSGQPGG-----------GGRDGGGLAPPPGSCSPSLSPSSNR
1 ( 406) MPPLIQEMLENSEGLDTLSGQPGG-----------GGRDGGGLAPPPGSCSPSLSPSSNR
2 ( 401) MPPLIQEMLENSEGLDTLSGQPGG-----------GGRDGGGLAPPPGSCSPSLSPSSNR
3 ( 399) MPPLIQEMLENSEGHEPLT--PSS-----------SGNTA--------EHSPSISPSSVE
4 ( 408) MPPLIREMLENPEMFEDDSSQPGPHPNASSEDEVPGGQGKGGLKSP..............
5 ( 397) MPPLIREMLENPEMFEDDSSQPGPHPNASSEDEVPGGQGKGGLKSP..............
//
0 ( 455) SSPATHSP
1 ( 455) SSPATHSP
2 ( 450) SSPATHSP
3 ( 438) NSGVSQSP
4 ( -) ........
5 ( -) ........
//
