# 0 Query: pF1KE1548, 261 aa
# 1 CCDS43451.1 DQB1 gene_id:3119|Hs108|chr6 (261 aa)
# 2 CCDS59006.1 DQB1 gene_id:3119|Hs108|chr6 (269 aa)
# 3 CCDS78128.1 DQB2 gene_id:3120|Hs108|chr6 (264 aa)
# 4 CCDS56419.1 DQB2 gene_id:3120|Hs108|chr6 (227 aa)
# 5 CCDS4751.1 DRB5 gene_id:3127|Hs108|chr6 (266 aa)
//
exp sw-scr id% from to
1 1.8e-107 1606 91.6 1 261
2 4.7e-106 1586 91.5 1 258
3 3.9e-92 1389 82.2 2 253
4 1.2e-76 1169 80.1 2 216
5 9e-72 1101 64.7 4 255
//
* *** *
0 ( 1) MSWKKALRIPGGLRVATVTLMLAMLSTPVAEGRDSPEDFVYQFKGMCYFTNGTERVRLVT
1 ( 1) MSWKKALRIPGDLRVATVTLMLAMLSSLLAEGRDSPEDFVFQFKGMCYFTNGTERVRLVT
2 ( 1) MSWKKALRIPGDLRVATVTLMLAMLSSLLAEGRDSPEDFVFQFKGMCYFTNGTERVRLVT
3 ( 2) .....ALQIPGGFWAAAVTVMLVMLSTPVAEARDFPKDFLVQFKGMCYFTNGTERVRGVA
4 ( 2) .....ALQIPGGFWAAAVTVMLVMLSTPVAEARDFPKDFLVQFKGMCYFTNGTERVRGVA
5 ( 4) ......LKLPGGSYMAKLTVTLMVLSSPLALAGDTRPRFLQQDKYECHFFNGTERVRFLH
//
* * * * ****
0 ( 61) RYIYNREEYARFDSDVGVYRAVTPLGPPAAEYWNSQKEVLERTRAELDTVCRHNYQLELR
1 ( 61) RYIYNREEYARFDSDVGVYRAVTPQGRPDAEYWNSQKEVLEGTRAELDTVCRHNYEVAFR
2 ( 61) RYIYNREEYARFDSDVGVYRAVTPQGRPDAEYWNSQKEVLEGTRAELDTVCRHNYEVAFR
3 ( 57) RYIYNREEYGRFDSDVGEFQAVTELGR-SIEDWNNYKDFLEQERAAVDKVCRHNYEAELR
4 ( 57) RYIYNREEYGRFDSDVGEFQAVTELGR-SIEDWNNYKDFLEQERAAVDKVCRHNYEAELR
5 ( 58) RDIYNQEEDLRFDSDVGEYRAVTELGRPDAEYWNSQKDFLEDRRAAVDTYCRHNYGVGES
//
** * *
0 ( 121) TTLQRRVEPTVTISPSRTEALNHHNLLVCSVTDFYPAQIKVRWFRNDQEETTGVVSTPLI
1 ( 121) GILQRRVEPTVTISPSRTEALNHHNLLVCSVTDFYPGQIKVRWFRNDQEETAGVVSTPLI
2 ( 121) GILQRRVEPTVTISPSRTEALNHHNLLVCSVTDFYPGQIKVRWFRNDQEETAGVVSTPLI
3 ( 116) TTLQRQVEPTVTISPSRTEALNHHNLLVCSVTDFYPAQIKVRWFRNDQEETAGVVSTSLI
4 ( 116) TTLQRQVEPTVTISPSRTEALNHHNLLVCSVTDFYPAQIKVRWFRNDQEETAGVVSTSLI
5 ( 118) FTVQRRVEPKVTVYPARTQTLQHHNLLVCSVNGFYPGSIEVRWFRNSQEEKAGVVSTGLI
//
* * *
0 ( 181) RNGDWTFQILVMLEMTPQRGDVYTCHVEHPSLQNPIIVEWRAQSESAQSKMLSGIGGFVL
1 ( 181) RNGDWTFQILVMLEMTPQRGDVYTCHVEHPSLQSPITVEWRAQSESAQSKMLSGVGGFVL
2 ( 181) RNGDWTFQILVMLEMTPQRGDVYTCHVEHPSLQSPITVEWRAQSESAQSKMLSGVGGFVL
3 ( 176) RNGDWTFQILVMLEITPQRGDIYTCQVEHPSLQSPITVEWRAQSESAQSKMLSGIGGFVL
4 ( 176) RNGDWTFQILVMLEITPQRGDIYTCQVEHPSLQSPITVEWR...................
5 ( 178) QNGDWTFQTLVMLETVPRSGEVYTCQVEHPSVTSPLTVEWRAQSESAQSKMLSGVGGFVL
//
**
0 ( 241) GLIFLGLGLIIHHRSQKGLLH
1 ( 241) GLIFLGLGLIIRQRSQKGLLH
2 ( 241) GLIFLGLGLIIRQRSQKG...
3 ( 236) GLIFLGLGLIIRHRGQKG...
4 ( -) .....................
5 ( 238) GLLFLGAGLFIYFKNQKG...
//