Multiple alignment for pF1KE1343
Check alignment(s).
#  0    Query: pF1KE1343, 261 aa
#  1    CCDS4761.1 DMA gene_id:3108|Hs108|chr6    (261 aa)
#  2    CCDS4753.1 DQA2 gene_id:3118|Hs108|chr6    (255 aa)
#  3    CCDS4763.1 DOA gene_id:3111|Hs108|chr6    (250 aa)
#  4    CCDS4752.1 DQA1 gene_id:3117|Hs108|chr6    (255 aa)
#  5    CCDS4764.1 DPA1 gene_id:3113|Hs108|chr6    (260 aa)

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        exp       sw-scr    id%      from      to
   1    2.5e-113    1844  100.0         1     261
   2    4.6e-18      371   30.7         7     240
   3    1.5e-17      363   32.2        38     240
   4    2.4e-17      360   32.0        44     240
   5    1.4e-16      348   29.6        35     245

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   0  (    1)    MGHEQNQGAALLQMLPLLWLLPHSWAVPEAPTPMWPDDL-QNHTFLHTV-YCQDGSPSVG
   1  (    1)    MGHEQNQGAALLQMLPLLWLLPHSWAVPEAPTPMWPDDL-QNHTFLHTV-YCQDGSPSVG
   2  (    7)    ...................LLLGALALTAVMSPCGGEDIVADHVASYGVNFYQSHGPSGQ
   3  (   38)    ..................................................FYQSYGASGQ
   4  (   44)    ........................................................PSGQ
   5  (   35)    .........................................DHVSTYAA-FVQTHRPTGE

//
                                                                             
   0  (   59)    LSEAYDEDQLFFFDFSQNTRVPRLPEFADWA--Q--EQGDAPAILFDKEFCEWMIQQIGP
   1  (   59)    LSEAYDEDQLFFFDFSQNTRVPRLPEFADWA--Q--EQGDAPAILFDKEFCEWMIQQIGP
   2  (   48)    YTHEFDGDEEFYVDLETKETVWQLPMFSKFI--SFDPQSALRNMAVGKHTLEFMMRQ---
   3  (   48)    FTHEFDEEQLFSVDLKKSEAVWRLPEFGDFA--RFDPQGGLAGIAAIKAHLDILVERSNR
   4  (   48)    YTHEFDGDEQFYVDLERKETAWRWPEFSKFGGFD--PQGALRNMAVAKHNLNIMIKRYN-
   5  (   53)    FMFEFDEDEMFYVDLDKKETVWHLEEFGQAFSFE--AQGGLANIAILNNNLNTLIQR---

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   0  (  115)    KLDGKIPVSRGFPIAEVFTLKPLEFGKPNTLVCFVSNLFPPMLTVNW--QHHSVPV-EGF
   1  (  115)    KLDGKIPVSRGFPIAEVFTLKPLEFGKPNTLVCFVSNLFPPMLTVNW--QHHSVPV-EGF
   2  (  103)    --SNSTAATNEVPEVTVFSKFPVTLGQPNTLICLVDNIFPPVVNITWLSNGHSV-T-EGV
   3  (  106)    SRAINVP-----PRVTVLPKSRVELGQPNILICIVDNIFPPVINITW--LRNGQTVTEGV
   4  (  105)    ----STAATNEVPEVTVFSKSPVTLGQPNTLICLVDNIFPPVVNITW--LSNGQSVTEGV
   5  (  108)    --SNHTQATNDPPEVTVFPKEPVELGQPNTLICHIDKFFPPVLNVTW--LCNGELVTEGV

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   0  (  172)    GPT-FVSAVDGLSFQAFSYLNFTPEPSDIFSCIVTHEIDRYTAIAYW---VPRNALP-SD
   1  (  172)    GPT-FVSAVDGLSFQAFSYLNFTPEPSDIFSCIVTHEIDRYTAIAYW---VPRNALP-SD
   2  (  159)    SETSFLSKSDH-SFFKISYLTFLPSADEIYDCKVEHWGLDEPLLKHW---EPEIPAPMSE
   3  (  159)    AQTSFYSQPDHL-FRKFHYLPFVPSAEDVYDCQVEHWGLDAPLLRHWELQVP--IPP-PD
   4  (  159)    SETSFLSKSDH-SFFKISYLTFLPSADEIYDCKVEHWGLDQPLLKHW---EPEIPAPMSE
   5  (  164)    AES-LFLPRTDYSFHKFHYLTFVPSAEDFYDCRVEHWGLDQPLLKHW---EAQEPIQMPE

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   0  (  227)    LLENVLCGVAFGLGVLGIIVGIVLIIYFRKPCSGD
   1  (  227)    LLENVLCGVAFGLGVLGIIVGIVLIIYFRKPCSGD
   2  (  215)    LTETLVCALGLSVGLMGIVVGTVFII.........
   3  (  215)    AMETLVCALGLAIGLVGFLVGTVLII.........
   4  (  215)    LTETVVCALGLSVGLMGIVVGTVFII.........
   5  (  220)    TTETVLCALGLVLGLVGIIVGTVLII.........

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