Multiple alignment for pF1KB9705
Check alignment(s).
#  0    Query: pF1KB9705, 335 aa
#  1    CCDS2264.2 HOXD13 gene_id:3239|Hs108|chr2    (343 aa)
#  2    CCDS5412.1 HOXA13 gene_id:3209|Hs108|chr7    (388 aa)
#  3    CCDS8865.1 HOXC13 gene_id:3229|Hs108|chr12    (330 aa)
#  4    CCDS11536.1 HOXB13 gene_id:10481|Hs108|chr17    (284 aa)

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        exp       sw-scr    id%      from      to
   1    1.9e-68     2236  100.0         9     343
   2    1.6e-25      931   50.1        53     387
   3    9.7e-22      898   48.3        29     323
   4    5.1e-17      749   47.8        57     283

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   0  (    1)    MDGLRADGGG--------AGGAPASSSSSSVAAAAASGQCRGFLS--APVFAGTHSGRAA
   1  (    9)    MDGLRADGGG--------AGGAPASSSSSSVAAAAASGQCRGFLS--APVFAGTHSGRAA
   2  (   53)    .....AGGGGFPHPAAAAAGGNFSVAAAAAAAAAAAANQCRNLMAHPAPLAPGAASAYSS
   3  (   29)    .......GGG--------GGGGGGGTGG-------AGGGCSG--A--SPGKAPSMDGLGS
   4  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (   51)    AAAAAAAAAAAAASGFAYPGTSERTGSSSSSSSSAVVAARPEAPPAKECPAPTPAAAAAA
   1  (   59)    AAAAAAAAAAAAASGFAYPGTSERTGSSSSSSSSAVVAARPEAPPAKECPAPTPAAAAAA
   2  (  108)    APGEAPPSAAAAAAAAAAAAAAAAAASSSGGPGPAGPAG---AEAAKQC---SPCSAAAQ
   3  (   63)    SCPASHCRDLLPHPVLGRPPAP--LGAPQGAVYTDIPA--PEA--ARQC-APPPA-----
   4  (   57)    ..........................................AEPPKQCH-PCPGVPQGT

//
                                                                             
   0  (  111)    PP--SAPA-LGYGYHFGNGYYSC-RMSHGVGLQQNALKSSPH----A-SLGGFPVEKYMD
   1  (  119)    PP--SAPA-LGYGYHFGNGYYSC-RMSHGVGLQQNALKSSPH----A-SLGGFPVEKYMD
   2  (  162)    SS--SGPAALPYGY-FGSGYYPCARM----GPHPNAIKSCAQPASAA-AAAAF-ADKYMD
   3  (  111)    PPTSSSAT-LGYGYPFGGSYYGC-RLSHNVNLQQK-----PC----A-Y---HPGDKYPE
   4  (   74)    SP---AP--VPYGY-FGGGYYSC-RVS------RSSLKPCAQ----AATLAAYPAE----

//
                                                                             
   0  (  162)    VSGLASSSVPANEVPARAKEVSFY-QGYTS-PYQH---VPGYIDM--VSTFG-S-G--EP
   1  (  170)    VSGLASSSVPANEVPARAKEVSFY-QGYTS-PYQH---VPGYIDM--VSTFG-S-G--EP
   2  (  213)    TAGPA-----AEEFSSRAKEFAFYHQGYAAGPYHHHQPMPGYLDMPVVPGLG-GPG--ES
   3  (  156)    PSG----ALPGDDLSSRAKEFAFY-PSFAS-SYQA---MPGYLDV--SVVPGIS-GHPEP
   4  (  113)    ------TPTAGEEYPSRPTEFAFY-PGYPG-TYQP---MASYLDVSVVQTLG-APG--EP

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   0  (  211)    RHEAY-ISMEGYQSWTLANGWNSQVYCTKDQPQGSHFWKSSFPGDVALNQPDMCVYRRGR
   1  (  219)    RHEAY-ISMEGYQSWTLANGWNSQVYCTKDQPQGSHFWKSSFPGDVALNQPDMCVYRRGR
   2  (  265)    RHEPLGLPMESYQPWALPNGWNGQMYCPKEQAQPPHLWKSTLP-DVVSHPSDASSYRRGR
   3  (  204)    RHDAL-IPVEGYQHWALSNGWDSQVYCSKEQSQSAHLWKSPFP-DVVPLQPEVSSYRRGR
   4  (  159)    RHDSL-LPVDSYQSWALAGGWNSQMCCQGEQNPPGPFWKAAFADSSGQHPPDACAFRRGR

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   1  (  338)    LKDTVS
   2  (  384)    LKTT..
   3  (  322)    SK....
   4  (  278)    VKNSAT

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