# 0 Query: pF1KB7282, 705 aa
# 1 CCDS9108.1 RFX4 gene_id:5992|Hs108|chr12 (641 aa)
# 2 CCDS9106.1 RFX4 gene_id:5992|Hs108|chr12 (735 aa)
# 3 CCDS55880.1 RFX4 gene_id:5992|Hs108|chr12 (744 aa)
# 4 CCDS5113.1 RFX6 gene_id:222546|Hs108|chr6 (928 aa)
//
exp sw-scr id% from to
1 8.9e-128 3839 91.4 1 641
2 9.9e-128 4694 95.9 1 735
3 1e-127 4601 95.9 22 744
4 4e-19 1261 36.8 85 763
//
************************************************************
0 ( 1) MHCGLLEEPDMDSTESWIERCLNESENKRYSSHTSLGNVSNDENEEKENNRA---SKPHS
1 ( -) ............................................................
2 ( 1) MHCGLLEEPDMDSTESWIERCLNESENKRYSSHTSLGNVSNDENEEKENNRA---SKPHS
3 ( 22) ............STESWIERCLNESENKRYSSHTSLGNVSNDENEEKENNRA---SKPHS
4 ( 85) ........................SEEEDADNHDSKTKAADQYLSQKKTITQIVKDKKKQ
//
***************************************** * * ********** **
0 ( 58) TPATLQWLEENYEIAEGVCIPRSALYMHYLDFCEKNDTQPVNAASFG--KIIRQQFPQLT
1 ( 1) ........................................MNWAAFGGSEFFIPEGIQID
2 ( 58) TPATLQWLEENYEIAEGVCIPRSALYMHYLDFCEKNDTQPVNAASFG--KIIRQQFPQLT
3 ( 67) TPATLQWLEENYEIAEGVCIPRSALYMHYLDFCEKNDTQPVNAASFG--KIIRQQFPQLT
4 ( 121) TQLTLQWLEENYIVCEGVCLPRCILYAHYLDFCRKEKLEPACAATFG--KTIRQKFPLLT
//
* **** *****
0 ( 116) TRRLGTRGQSK-YHYYGIAVKESSQYYDVMYSKKGAAWVSETGKKEVSKQTVAYSPRSKL
1 ( 21) SRCPLSRNITEWYHYYGIAVKESSQYYDVMYSKKGAAWVSETGKKEVSKQTVAYSPRSKL
2 ( 116) TRRLGTRGQSK-YHYYGIAVKESSQYYDVMYSKKGAAWVSETGKKEVSKQTVAYSPRSKL
3 ( 125) TRRLGTRGQSK-YHYYGIAVKESSQYYDVMYSKKGAAWVSETGKKEVSKQTVAYSPRSKL
4 ( 179) TRRLGTRGHSK-YHYYGIGIKESSAYYHSVYSGKGLTRFSGSKLKNEGGFTRKYSLSSKT
//
*********************
0 ( 175) GTLLPEFPNVKDLNLPASLPEEKVSTFIMMYRTHCQRIL---------------------
1 ( 81) GTLLPEFPNVKDLNLPASLPEEKVSTFIMMYRTHCQRILDTVIRANFDEVQSFLLHFWQG
2 ( 175) GTLLPEFPNVKDLNLPASLPEEKVSTFIMMYRTHCQRILDTVIRANFDEVQSFLLHFWQG
3 ( 184) GTLLPEFPNVKDLNLPASLPEEKVSTFIMMYRTHCQRILDTVIRANFDEVQSFLLHFWQG
4 ( 238) GTLLPEFPSAQHLVYQGCISKDKVDTLIMMYKTHCQCIL---------------------
//
*********
0 ( 214) ---------GSS------------------------------TVVNIVGVCDSILYKAIS
1 ( 141) MPPHMLPVLGSS------------------------------TVVNIVGVCDSILYKAIS
2 ( 235) MPPHMLPVLGSS------------------------------TVVNIVGVCDSILYKAIS
3 ( 244) MPPHMLPVLGSS------------------------------TVVNIVGVCDSILYKAIS
4 ( 277) ---------DNAINGNFEEIQHFLLHFWQGMPDHLLPLLENPVIIDIFCVCDSILYKVLT
//
0 ( 235) GVLMPTVLQALPDSLTQVIRKFAKQLDEWLKVALHDLPENLRNIKFELSRRFSQILRRQT
1 ( 171) GVLMPTVLQALPDSLTQVIRKFAKQLDEWLKVALHDLPENLRNIKFELSRRFSQILRRQT
2 ( 265) GVLMPTVLQALPDSLTQVIRKFAKQLDEWLKVALHDLPENLRNIKFELSRRFSQILRRQT
3 ( 274) GVLMPTVLQALPDSLTQVIRKFAKQLDEWLKVALHDLPENLRNIKFELSRRFSQILRRQT
4 ( 328) DVLIPATMQEMPESLLADIRNFAKNWEQWVVSSLENLPEALTDKKIPIVRRFVSSLKRQT
//
0 ( 295) SLNHLCQASRTVIHSADITFQMLEDWRNVDLNSITKQTLYTMEDSRDEHRKLITQ-----
1 ( 231) SLNHLCQASRTVIHSADITFQMLEDWRNVDLNSITKQTLYTMEDSRDEHRKLITQ-----
2 ( 325) SLNHLCQASRTVIHSADITFQMLEDWRNVDLNSITKQTLYTMEDSRDEHRKLITQ-----
3 ( 334) SLNHLCQASRTVIHSADITFQMLEDWRNVDLNSITKQTLYTMEDSRDEHRKLITQ-----
4 ( 388) SFLHLAQIARPALFDQHVVNSMVSDIERVDLNSIGSQALLTISGSTDTESGIYTEHDSIT
//
0 ( 350) LYQEFDHLLEEQSPIESYIEWLDTMVDRCVVKVAAKRQGSLKKVAQQFLLMWSCFGTRVI
1 ( 286) LYQEFDHLLEEQSPIESYIEWLDTMVDRCVVKVAAKRQGSLKKVAQQFLLMWSCFGTRVI
2 ( 380) LYQEFDHLLEEQSPIESYIEWLDTMVDRCVVKVAAKRQGSLKKVAQQFLLMWSCFGTRVI
3 ( 389) LYQEFDHLLEEQSPIESYIEWLDTMVDRCVVKVAAKRQGSLKKVAQQFLLMWSCFGTRVI
4 ( 448) VFQELKDLLKKNATVEAFIEWLDTVVEQRVIKTSKQNGRSLKKRAQDFLLKWSFFGARVM
//
0 ( 410) RDMTLHSAPSFGSFHLIHLMFDDYVLYLLESLHCQERANELM----RAMKG-EGSTAEVR
1 ( 346) RDMTLHSAPSFGSFHLIHLMFDDYVLYLLESLHCQERANELM----RAMKG-EGSTAEVR
2 ( 440) RDMTLHSAPSFGSFHLIHLMFDDYVLYLLESLHCQERANELM----RAMKG-EGSTAEVR
3 ( 449) RDMTLHSAPSFGSFHLIHLMFDDYVLYLLESLHCQERANELM----RAMKG-EGSTAEVR
4 ( 508) HNLTLNNASSFGSFHLIRMLLDEYILLAMETQFNNDKEQELQNLLDKYMKNSDASKAAFT
//
0 ( 465) EEIILTEAAAPTPSPVPSFSPAKSATSVE---VPPPSS------PVSN--PSPEYTGLST
1 ( 401) EEIILTEAAAPTPSPVPSFSPAKSATSVE---VPPPSS------PVSN--PSPEYTGLST
2 ( 495) EEIILTEAAAPTPSPVPSFSPAKSATSVE---VPPPSS------PVSN--PSPEYTGLST
3 ( 504) EEIILTEAAAPTPSPVPSFSPAKSATSVE---VPPPSS------PVSN--PSPEYTGLST
4 ( 568) ASPSSCFLANRNKGSMVSSDAVKNESHVETTYLPLPSSQPGGLGPALHQFPAGNTDNMPL
//
0 ( 514) TGAMQSYTWS---LTYTVTTAAGSPAENSQQLPCM-RNTHV------PSSSVTHRIPVYP
1 ( 450) TGAMQSYTWS---LTYTVTTAAGSPAENSQQLPCM-RNTHV------PSSSVTHRIPVYP
2 ( 544) TGAMQSYTWS---LTYTVTTAAGSPAENSQQLPCM-RNTHV------PSSSVTHRIPVYP
3 ( 553) TGAMQSYTWS---LTYTVTTAAGSPAENSQQLPCM-RNTHV------PSSSVTHRIPVYP
4 ( 628) TGQMELSQIAGHLMTPPISPAMASRGSVINQGPMAGRPPSVGPVLSAPSHCSTYPEPIYP
//
0 ( 564) H--REEHG-YTGSYNYGSYGNQHPHPMQSQYPA-LPHDTAIS---GPLHYAPYHRSSAQY
1 ( 500) H--REEHG-YTGSYNYGSYGNQHPHPMQSQYPA-LPHDTAIS---GPLHYAPYHRSSAQY
2 ( 594) H--REEHG-YTGSYNYGSYGNQHPHPMQSQYPA-LPHDTAIS---GPLHYAPYHRSSAQY
3 ( 603) H--REEHG-YTGSYNYGSYGNQHPHPMQSQYPA-LPHDTAIS---GPLHYAPYHRSSAQY
4 ( 688) TLPQANHDFYSTSSNYQTVFRAQPHSTSGLYPHHTEHGRCMAWTEQQLSRDFFSGSCAGS
//
0 ( 617) PFNS-PTSRMEPCLMSSTPRLHPTPVTPRWPEVPSANTCYTSPSVHSARYGNSSDMYTPL
1 ( 553) PFNS-PTSRMEPCLMSSTPRLHPTPVTPRWPEVPSANTCYTSPSVHSARYGNSSDMYTPL
2 ( 647) PFNS-PTSRMEPCLMSSTPRLHPTPVTPRWPEVPSANTCYTSPSVHSARYGNSSDMYTPL
3 ( 656) PFNS-PTSRMEPCLMSSTPRLHPTPVTPRWPEVPSANTCYTSPSVHSARYGNSSDMYTPL
4 ( 748) PYNSRPPSSYGPSLQA............................................
//
0 ( 676) TTRRNSEYEHMQHFPGFAYINGEASTGWAK
1 ( 612) TTRRNSEYEHMQHFPGFAYINGEASTGWAK
2 ( 706) TTRRNSEYEHMQHFPGFAYINGEASTGWAK
3 ( 715) TTRRNSEYEHMQHFPGFAYINGEASTGWAK
4 ( -) ..............................
//
