# 0 Query: pF1KB5593, 1863 aa
# 1 CCDS11453.1 BRCA1 gene_id:672|Hs108|chr17 (1863 aa)
# 2 CCDS11459.2 BRCA1 gene_id:672|Hs108|chr17 (1816 aa)
# 3 CCDS11456.2 BRCA1 gene_id:672|Hs108|chr17 (1884 aa)
# 4 CCDS11454.2 BRCA1 gene_id:672|Hs108|chr17 (759 aa)
# 5 CCDS11455.2 BRCA1 gene_id:672|Hs108|chr17 (699 aa)
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exp sw-scr id% from to
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2 0 11906 100.0 1 1816
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1 ( 1) MDLSALRVEEVQNVINAMQKILECPICLELIKEPVSTKCDHIFCKFCMLKLLNQKKGPSQ
2 ( 1) ...............................................MLKLLNQKKGPSQ
3 ( 1) MDLSALRVEEVQNVINAMQKILECPICLELIKEPVSTKCDHIFCKFCMLKLLNQKKGPSQ
4 ( -) ............................................................
5 ( -) ............................................................
//
0 ( 61) CPLCKNDITKRSLQESTRFSQLVEELLKIICAFQLDTGLEYANSYNFAKKENNSPEHLKD
1 ( 61) CPLCKNDITKRSLQESTRFSQLVEELLKIICAFQLDTGLEYANSYNFAKKENNSPEHLKD
2 ( 14) CPLCKNDITKRSLQESTRFSQLVEELLKIICAFQLDTGLEYANSYNFAKKENNSPEHLKD
3 ( 61) CPLCKNDITKRSLQESTRFSQLVEELLKIICAFQLDTGLEYANSYNFAKKENNSPEHLKD
4 ( -) ............................................................
5 ( -) ............................................................
//
0 ( 121) EVSIIQSMGYRNRAKRLLQSEPENPSLQETSLSVQLSNLGTVRTLRTKQRIQPQKTSVYI
1 ( 121) EVSIIQSMGYRNRAKRLLQSEPENPSLQETSLSVQLSNLGTVRTLRTKQRIQPQKTSVYI
2 ( 74) EVSIIQSMGYRNRAKRLLQSEPENPSLQETSLSVQLSNLGTVRTLRTKQRIQPQKTSVYI
3 ( 121) EVSIIQSMGYRNRAKRLLQSEPENPSLQETSLSVQLSNLGTVRTLRTKQRIQPQKTSVYI
4 ( -) ............................................................
5 ( -) ............................................................
//
0 ( 181) ELGSDSSEDTVNKATYCSVGDQELLQITPQGTRDEISLDSAKKAACEFSETDVTNTEHHQ
1 ( 181) ELGSDSSEDTVNKATYCSVGDQELLQITPQGTRDEISLDSAKKAACEFSETDVTNTEHHQ
2 ( 134) ELGSDSSEDTVNKATYCSVGDQELLQITPQGTRDEISLDSAKKAACEFSETDVTNTEHHQ
3 ( 181) ELGSDSSEDTVNKATYCSVGDQELLQITPQGTRDEISLDSAKKAACEFSETDVTNTEHHQ
4 ( -) ............................................................
5 ( -) ............................................................
//
0 ( 241) PSNNDLNTTEKRAAERHPEKYQGSSVSNLHVEPCGTNTHASSLQHENSSLLLTKDRMNVE
1 ( 241) PSNNDLNTTEKRAAERHPEKYQGSSVSNLHVEPCGTNTHASSLQHENSSLLLTKDRMNVE
2 ( 194) PSNNDLNTTEKRAAERHPEKYQGSSVSNLHVEPCGTNTHASSLQHENSSLLLTKDRMNVE
3 ( 241) PSNNDLNTTEKRAAERHPEKYQGSSVSNLHVEPCGTNTHASSLQHENSSLLLTKDRMNVE
4 ( -) ............................................................
5 ( -) ............................................................
//
0 ( 301) KAEFCNKSKQPGLARSQHNRWAGSKETCNDRRTPSTEKKVDLNADPLCERKEWNKQKLPC
1 ( 301) KAEFCNKSKQPGLARSQHNRWAGSKETCNDRRTPSTEKKVDLNADPLCERKEWNKQKLPC
2 ( 254) KAEFCNKSKQPGLARSQHNRWAGSKETCNDRRTPSTEKKVDLNADPLCERKEWNKQKLPC
3 ( 301) KAEFCNKSKQPGLARSQHNRWAGSKETCNDRRTPSTEKKVDLNADPLCERKEWNKQKLPC
4 ( -) ............................................................
5 ( -) ............................................................
//
0 ( 361) SENPRDTEDVPWITLNSSIQKVNEWFSRSDELLGSDDSHDGESESNAKVADVLDVLNEVD
1 ( 361) SENPRDTEDVPWITLNSSIQKVNEWFSRSDELLGSDDSHDGESESNAKVADVLDVLNEVD
2 ( 314) SENPRDTEDVPWITLNSSIQKVNEWFSRSDELLGSDDSHDGESESNAKVADVLDVLNEVD
3 ( 361) SENPRDTEDVPWITLNSSIQKVNEWFSRSDELLGSDDSHDGESESNAKVADVLDVLNEVD
4 ( -) ............................................................
5 ( -) ............................................................
//
0 ( 421) EYSGSSEKIDLLASDPHEALICKSERVHSKSVESNIEDKIFGKTYRKKASLPNLSHVTEN
1 ( 421) EYSGSSEKIDLLASDPHEALICKSERVHSKSVESNIEDKIFGKTYRKKASLPNLSHVTEN
2 ( 374) EYSGSSEKIDLLASDPHEALICKSERVHSKSVESNIEDKIFGKTYRKKASLPNLSHVTEN
3 ( 421) EYSGSSEKIDLLASDPHEALICKSERVHSKSVESNIEDKIFGKTYRKKASLPNLSHVTEN
4 ( -) ............................................................
5 ( -) ............................................................
//
0 ( 481) LIIGAFVTEPQIIQERPLTNKLKRKRRPTSGLHPEDFIKKADLAVQKTPEMINQGTNQTE
1 ( 481) LIIGAFVTEPQIIQERPLTNKLKRKRRPTSGLHPEDFIKKADLAVQKTPEMINQGTNQTE
2 ( 434) LIIGAFVTEPQIIQERPLTNKLKRKRRPTSGLHPEDFIKKADLAVQKTPEMINQGTNQTE
3 ( 481) LIIGAFVTEPQIIQERPLTNKLKRKRRPTSGLHPEDFIKKADLAVQKTPEMINQGTNQTE
4 ( -) ............................................................
5 ( -) ............................................................
//
0 ( 541) QNGQVMNITNSGHENKTKGDSIQNEKNPNPIESLEKESAFKTKAEPISSSISNMELELNI
1 ( 541) QNGQVMNITNSGHENKTKGDSIQNEKNPNPIESLEKESAFKTKAEPISSSISNMELELNI
2 ( 494) QNGQVMNITNSGHENKTKGDSIQNEKNPNPIESLEKESAFKTKAEPISSSISNMELELNI
3 ( 541) QNGQVMNITNSGHENKTKGDSIQNEKNPNPIESLEKESAFKTKAEPISSSISNMELELNI
4 ( -) ............................................................
5 ( -) ............................................................
//
0 ( 601) HNSKAPKKNRLRRKSSTRHIHALELVVSRNLSPPNCTELQIDSCSSSEEIKKKKYNQMPV
1 ( 601) HNSKAPKKNRLRRKSSTRHIHALELVVSRNLSPPNCTELQIDSCSSSEEIKKKKYNQMPV
2 ( 554) HNSKAPKKNRLRRKSSTRHIHALELVVSRNLSPPNCTELQIDSCSSSEEIKKKKYNQMPV
3 ( 601) HNSKAPKKNRLRRKSSTRHIHALELVVSRNLSPPNCTELQIDSCSSSEEIKKKKYNQMPV
4 ( -) ............................................................
5 ( -) ............................................................
//
0 ( 661) RHSRNLQLMEGKEPATGAKKSNKPNEQTSKRHDSDTFPELKLTNAPGSFTKCSNTSELKE
1 ( 661) RHSRNLQLMEGKEPATGAKKSNKPNEQTSKRHDSDTFPELKLTNAPGSFTKCSNTSELKE
2 ( 614) RHSRNLQLMEGKEPATGAKKSNKPNEQTSKRHDSDTFPELKLTNAPGSFTKCSNTSELKE
3 ( 661) RHSRNLQLMEGKEPATGAKKSNKPNEQTSKRHDSDTFPELKLTNAPGSFTKCSNTSELKE
4 ( -) ............................................................
5 ( -) ............................................................
//
0 ( 721) FVNPSLPREEKEEKLETVKVSNNAEDPKDLMLSGERVLQTERSVESSSISLVPGTDYGTQ
1 ( 721) FVNPSLPREEKEEKLETVKVSNNAEDPKDLMLSGERVLQTERSVESSSISLVPGTDYGTQ
2 ( 674) FVNPSLPREEKEEKLETVKVSNNAEDPKDLMLSGERVLQTERSVESSSISLVPGTDYGTQ
3 ( 721) FVNPSLPREEKEEKLETVKVSNNAEDPKDLMLSGERVLQTERSVESSSISLVPGTDYGTQ
4 ( -) ............................................................
5 ( -) ............................................................
//
0 ( 781) ESISLLEVSTLGKAKTEPNKCVSQCAAFENPKGLIHGCSKDNRNDTEGFKYPLGHEVNHS
1 ( 781) ESISLLEVSTLGKAKTEPNKCVSQCAAFENPKGLIHGCSKDNRNDTEGFKYPLGHEVNHS
2 ( 734) ESISLLEVSTLGKAKTEPNKCVSQCAAFENPKGLIHGCSKDNRNDTEGFKYPLGHEVNHS
3 ( 781) ESISLLEVSTLGKAKTEPNKCVSQCAAFENPKGLIHGCSKDNRNDTEGFKYPLGHEVNHS
4 ( -) ............................................................
5 ( -) ............................................................
//
0 ( 841) RETSIEMEESELDAQYLQNTFKVSKRQSFAPFSNPGNAEEECATFSAHSGSLKKQSPKVT
1 ( 841) RETSIEMEESELDAQYLQNTFKVSKRQSFAPFSNPGNAEEECATFSAHSGSLKKQSPKVT
2 ( 794) RETSIEMEESELDAQYLQNTFKVSKRQSFAPFSNPGNAEEECATFSAHSGSLKKQSPKVT
3 ( 841) RETSIEMEESELDAQYLQNTFKVSKRQSFAPFSNPGNAEEECATFSAHSGSLKKQSPKVT
4 ( -) ............................................................
5 ( -) ............................................................
//
0 ( 901) FECEQKEENQGKNESNIKPVQTVNITAGFPVVGQKDKPVDNAKCSIKGGSRFCLSSQFRG
1 ( 901) FECEQKEENQGKNESNIKPVQTVNITAGFPVVGQKDKPVDNAKCSIKGGSRFCLSSQFRG
2 ( 854) FECEQKEENQGKNESNIKPVQTVNITAGFPVVGQKDKPVDNAKCSIKGGSRFCLSSQFRG
3 ( 901) FECEQKEENQGKNESNIKPVQTVNITAGFPVVGQKDKPVDNAKCSIKGGSRFCLSSQFRG
4 ( -) ............................................................
5 ( -) ............................................................
//
0 ( 961) NETGLITPNKHGLLQNPYRIPPLFPIKSFVKTKCKKNLLEENFEEHSMSPEREMGNENIP
1 ( 961) NETGLITPNKHGLLQNPYRIPPLFPIKSFVKTKCKKNLLEENFEEHSMSPEREMGNENIP
2 ( 914) NETGLITPNKHGLLQNPYRIPPLFPIKSFVKTKCKKNLLEENFEEHSMSPEREMGNENIP
3 ( 961) NETGLITPNKHGLLQNPYRIPPLFPIKSFVKTKCKKNLLEENFEEHSMSPEREMGNENIP
4 ( -) ............................................................
5 ( -) ............................................................
//
0 ( 1021) STVSTISRNNIRENVFKEASSSNINEVGSSTNEVGSSINEIGSSDENIQAELGRNRGPKL
1 ( 1021) STVSTISRNNIRENVFKEASSSNINEVGSSTNEVGSSINEIGSSDENIQAELGRNRGPKL
2 ( 974) STVSTISRNNIRENVFKEASSSNINEVGSSTNEVGSSINEIGSSDENIQAELGRNRGPKL
3 ( 1021) STVSTISRNNIRENVFKEASSSNINEVGSSTNEVGSSINEIGSSDENIQAELGRNRGPKL
4 ( -) ............................................................
5 ( -) ............................................................
//
0 ( 1081) NAMLRLGVLQPEVYKQSLPGSNCKHPEIKKQEYEEVVQTVNTDFSPYLISDNLEQPMGSS
1 ( 1081) NAMLRLGVLQPEVYKQSLPGSNCKHPEIKKQEYEEVVQTVNTDFSPYLISDNLEQPMGSS
2 ( 1034) NAMLRLGVLQPEVYKQSLPGSNCKHPEIKKQEYEEVVQTVNTDFSPYLISDNLEQPMGSS
3 ( 1081) NAMLRLGVLQPEVYKQSLPGSNCKHPEIKKQEYEEVVQTVNTDFSPYLISDNLEQPMGSS
4 ( 6) ...........................LRVEEVQNVINAMQKILECPICLELIKEPVSTK
5 ( 6) ...........................LRVEEVQNVINAMQKILECPICLELIKEPVSTK
//
0 ( 1141) HASQVCSETPDDLLDDGEIKEDTSFAENDI-KES---SAVFSKSVQKGELSRSPSPF---
1 ( 1141) HASQVCSETPDDLLDDGEIKEDTSFAENDI-KES---SAVFSKSVQKGELSRSPSPF---
2 ( 1094) HASQVCSETPDDLLDDGEIKEDTSFAENDI-KES---SAVFSKSVQKGELSRSPSPF---
3 ( 1141) HASQVCSETPDDLLDDGEIKEDTSFAENDI-KES---SAVFSKSVQKGELSRSPSPF---
4 ( 39) CDHIFCKFCMLKLLNQKKGPSQCPLCKNDITKRSLQESTRFSQLVE--ELLKIICAFQLD
5 ( 39) CDHIFCKFCMLKLLNQKKGPSQCPLCKNDITKRSLQESTRFSQLVE--ELLKIICAFQLD
//
0 ( 1194) THTHLAQGYRRGAKKLESSEENLSSEDEELPCFQHLLFGK--VNNIPSQSTRHSTVATEC
1 ( 1194) THTHLAQGYRRGAKKLESSEENLSSEDEELPCFQHLLFGK--VNNIPSQSTRHSTVATEC
2 ( 1147) THTHLAQGYRRGAKKLESSEENLSSEDEELPCFQHLLFGK--VNNIPSQSTRHSTVATEC
3 ( 1194) THTHLAQGYRRGAKKLESSEENLSSEDEELPCFQHLLFGK--VNNIPSQSTRHSTVATEC
4 ( 97) TGLEYANSYNF-AKKENNSPEHLKDEVSIIQSMGYRNRAKRLLQSEPENPSLQETSLSVQ
5 ( 97) TGLEYANSYNF-AKKENNSPEHLKDEVSIIQSMGYRNRAKRLLQSEPENPSLQETSLSVQ
//
0 ( 1252) LSKNTEENLLSLKNSLNDCSNQVILAKASQEHHLSEETKCSASLFSSQCSELEDLTANTN
1 ( 1252) LSKNTEENLLSLKNSLNDCSNQVILAKASQEHHLSEETKCSASLFSSQCSELEDLTANTN
2 ( 1205) LSKNTEENLLSLKNSLNDCSNQVILAKASQEHHLSEETKCSASLFSSQCSELEDLTANTN
3 ( 1252) LSKNTEENLLSLKNSLNDCSNQVILAKASQEHHLSEETKCSASLFSSQCSELEDLTANTN
4 ( 156) LSNLGTVRTLRTKQRIQPQKTSVYIELGSDS---SEDTVNKATYCSVGDQELLQITPQ-G
5 ( 156) LSNLGTVRTLRTKQRIQPQKTSVYIELGSDS---SEDTVNKATYCSVGDQELLQITPQ-G
//
0 ( 1312) TQDPFLIGSSKQMRHQSESQGVGLSDKELVSDDEERGTGLEENNQEEQSMDSNLGEAASG
1 ( 1312) TQDPFLIGSSKQMRHQSESQGVGLSDKELVSDDEERGTGLEENNQEEQSMDSNLGEAASG
2 ( 1265) TQDPFLIGSSKQMRHQSESQGVGLSDKELVSDDEERGTGLEENNQEEQSMDSNLGEAASG
3 ( 1312) TQDPFLIGSSKQMRHQSESQGVGLSDKELVSDDEERGTGLEENNQEEQSMDSNLGEAASG
4 ( 212) TRDEISLDSAKKAACEFSETDVTNTEHHQPSNNDLNTT---EKRAAERHPEKYQGEAASG
5 ( 212) TRDEISLDSAKKAACEFSETDVTNTEHHQPSNNDLNTT---EKRAAERHPEKYQGEAASG
//
0 ( 1372) CESETSVSEDCSGLSSQSDILTTQQRDTMQHNLIKLQQEMAELEAVLEQHGSQPSNSYPS
1 ( 1372) CESETSVSEDCSGLSSQSDILTTQQRDTMQHNLIKLQQEMAELEAVLEQHGSQPSNSYPS
2 ( 1325) CESETSVSEDCSGLSSQSDILTTQQRDTMQHNLIKLQQEMAELEAVLEQHGSQPSNSYPS
3 ( 1372) CESETSVSEDCSGLSSQSDILTTQQRDTMQHNLIKLQQEMAELEAVLEQHGSQPSNSYPS
4 ( 269) CESETSVSEDCSGLSSQSDILTTQQRDTMQHNLIKLQQEMAELEAVLEQHGSQPSNSYPS
5 ( 269) CESETSVSEDCSGLSSQSDILTTQQRDTMQHNLIKLQQEMAELEAVLEQHGSQPSNSYPS
//
0 ( 1432) IISDSSALEDLRNPEQSTSEK---------------------AVLTSQKSSEYPISQNPE
1 ( 1432) IISDSSALEDLRNPEQSTSEK---------------------AVLTSQKSSEYPISQNPE
2 ( 1385) IISDSSALEDLRNPEQSTSEK---------------------AVLTSQKSSEYPISQNPE
3 ( 1432) IISDSSALEDLRNPEQSTSEKDSHIHGQRNNSMFSKRPREHISVLTSQKSSEYPISQNPE
4 ( 329) IISDSSALEDLRNPEQSTSEK----------------------VLTSQKSSEYPISQNPE
5 ( 329) IISDSSALEDLRNPEQSTSEK----------------------VLTSQKSSEYPISQNPE
//
0 ( 1471) GLSADKFEVSADSSTSKNKEPGVERSSPSKCPSLDDRWYMHSCSGSLQNRNYPSQEELIK
1 ( 1471) GLSADKFEVSADSSTSKNKEPGVERSSPSKCPSLDDRWYMHSCSGSLQNRNYPSQEELIK
2 ( 1424) GLSADKFEVSADSSTSKNKEPGVERSSPSKCPSLDDRWYMHSCSGSLQNRNYPSQEELIK
3 ( 1492) GLSADKFEVSADSSTSKNKEPGVERSSPSKCPSLDDRWYMHSCSGSLQNRNYPSQEELIK
4 ( 367) GLSADKFEVSADSSTSKNKEPGVERSSPSKCPSLDDRWYMHSCSGSLQNRNYPSQEELIK
5 ( 367) GLSADKFEVSADSSTSKNKEPGVERSSPSKCPSLDDRWYMHSCSGSLQNRNYPSQEELIK
//
0 ( 1531) VVDVEEQQLEESGPHDLTETSYLPRQDLEGTPYLESGISLFSDDPESDPSEDRAPESARV
1 ( 1531) VVDVEEQQLEESGPHDLTETSYLPRQDLEGTPYLESGISLFSDDPESDPSEDRAPESARV
2 ( 1484) VVDVEEQQLEESGPHDLTETSYLPRQDLEGTPYLESGISLFSDDPESDPSEDRAPESARV
3 ( 1552) VVDVEEQQLEESGPHDLTETSYLPRQDLEGTPYLESGISLFSDDPESDPSEDRAPESARV
4 ( 427) VVDVEEQQLEESGPHDLTETSYLPRQDLEGTPYLESGISLFSDDPESDPSEDRAPESARV
5 ( 427) VVDVEEQQLEESGPHDLTETSYLPRQDLEGTPYLESGISLFSDDPESDPSEDRAPESARV
//
0 ( 1591) GNIPSSTSALKVPQLKVAESAQSPAAAHTTDTAGYNAMEESVSREKPELTASTERVNKRM
1 ( 1591) GNIPSSTSALKVPQLKVAESAQSPAAAHTTDTAGYNAMEESVSREKPELTASTERVNKRM
2 ( 1544) GNIPSSTSALKVPQLKVAESAQSPAAAHTTDTAGYNAMEESVSREKPELTASTERVNKRM
3 ( 1612) GNIPSSTSALKVPQLKVAESAQSPAAAHTTDTAGYNAMEESVSREKPELTASTERVNKRM
4 ( 487) GNIPSSTSALKVPQLKVAESAQSPAAAHTTDTAGYNAMEESVSREKPELTASTERVNKRM
5 ( 487) GNIPSSTSALKVPQLKVAESAQSPAAAHTTDTAGYNAMEESVSREKPELTASTERVNKRM
//
0 ( 1651) SMVVSGLTPEEFMLVYKFARKHHITLTNLITEETTHVVMKTDAEFVCERTLKYFLGIAGG
1 ( 1651) SMVVSGLTPEEFMLVYKFARKHHITLTNLITEETTHVVMKTDAEFVCERTLKYFLGIAGG
2 ( 1604) SMVVSGLTPEEFMLVYKFARKHHITLTNLITEETTHVVMKTDAEFVCERTLKYFLGIAGG
3 ( 1672) SMVVSGLTPEEFMLVYKFARKHHITLTNLITEETTHVVMKTDAEFVCERTLKYFLGIAGG
4 ( 547) SMVVSGLTPEEFMLVYKFARKHHITLTNLITEETTHVVMKTDAEFVCERTLKYFLGIAGG
5 ( 547) SMVVSGLTPEEFMLVYKFARKHHITLTNLITEETTHVVMKTDAEFVCERTLKYFLGIAGG
//
0 ( 1711) KWVVSYFWVTQSIKERKMLNEHDFEVRGDVVNGRNHQGPKRARESQDRKIFRGLEICCYG
1 ( 1711) KWVVSYFWVTQSIKERKMLNEHDFEVRGDVVNGRNHQGPKRARESQDRKIFRGLEICCYG
2 ( 1664) KWVVSYFWVTQSIKERKMLNEHDFEVRGDVVNGRNHQGPKRARESQDRKIFRGLEICCYG
3 ( 1732) KWVVSYFWVTQSIKERKMLNEHDFEVRGDVVNGRNHQGPKRARESQDRKIFRGLEICCYG
4 ( 607) KWVVSYFWVTQSIKERKMLNEHDFEVRGDVVNGRNHQGPKRARESQDRKIFRGLEICCYG
5 ( 607) KWVVSYFWVTQSIKERKMLNEHDFEVRGDVVNGRNHQGPKRARESQDRKIFRGLEICCYG
//
0 ( 1771) PFTNMPTDQLEWMVQLCGASVVKELSSFTLGTGVHPIVVVQPDAWTEDNGFHAIGQMCEA
1 ( 1771) PFTNMPTDQLEWMVQLCGASVVKELSSFTLGTGVHPIVVVQPDAWTEDNGFHAIGQMCEA
2 ( 1724) PFTNMPTDQLEWMVQLCGASVVKELSSFTLGTGVHPIVVVQPDAWTEDNGFHAIGQMCEA
3 ( 1792) PFTNMPTDQLEWMVQLCGASVVKELSSFTLGTGVHPIVVVQPDAWTEDNGFHAIGQMCEA
4 ( 667) PFTNMPTDQLEWMVQLCGASVVKELSSFTLGTGVHPIVVVQPDAWTEDNGFHAIGQMCEA
5 ( 667) PFTNMPT.....................................................
//
0 ( 1831) PVVTREWVLDSVALYQCQELDTYLIPQIPHSHY
1 ( 1831) PVVTREWVLDSVALYQCQELDTYLIPQIPHSHY
2 ( 1784) PVVTREWVLDSVALYQCQELDTYLIPQIPHSHY
3 ( 1852) PVVTREWVLDSVALYQCQELDTYLIPQIPHSHY
4 ( 727) PVVTREWVLDSVALYQCQELDTYLIPQIPHSHY
5 ( -) .................................
//