Multiple alignment for pF1KB5593
Check alignment(s).
#  0    Query: pF1KB5593, 1863 aa
#  1    CCDS11453.1 BRCA1 gene_id:672|Hs108|chr17    (1863 aa)
#  2    CCDS11459.2 BRCA1 gene_id:672|Hs108|chr17    (1816 aa)
#  3    CCDS11456.2 BRCA1 gene_id:672|Hs108|chr17    (1884 aa)
#  4    CCDS11454.2 BRCA1 gene_id:672|Hs108|chr17    (759 aa)
#  5    CCDS11455.2 BRCA1 gene_id:672|Hs108|chr17    (699 aa)

//
        exp       sw-scr    id%      from      to
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   5    2.1e-110    2733   68.5         6     673

//
                                                                             
   0  (    1)    MDLSALRVEEVQNVINAMQKILECPICLELIKEPVSTKCDHIFCKFCMLKLLNQKKGPSQ
   1  (    1)    MDLSALRVEEVQNVINAMQKILECPICLELIKEPVSTKCDHIFCKFCMLKLLNQKKGPSQ
   2  (    1)    ...............................................MLKLLNQKKGPSQ
   3  (    1)    MDLSALRVEEVQNVINAMQKILECPICLELIKEPVSTKCDHIFCKFCMLKLLNQKKGPSQ
   4  (    -)    ............................................................
   5  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
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   1  (   61)    CPLCKNDITKRSLQESTRFSQLVEELLKIICAFQLDTGLEYANSYNFAKKENNSPEHLKD
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   3  (   61)    CPLCKNDITKRSLQESTRFSQLVEELLKIICAFQLDTGLEYANSYNFAKKENNSPEHLKD
   4  (    -)    ............................................................
   5  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
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   3  (  121)    EVSIIQSMGYRNRAKRLLQSEPENPSLQETSLSVQLSNLGTVRTLRTKQRIQPQKTSVYI
   4  (    -)    ............................................................
   5  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
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   3  (  181)    ELGSDSSEDTVNKATYCSVGDQELLQITPQGTRDEISLDSAKKAACEFSETDVTNTEHHQ
   4  (    -)    ............................................................
   5  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
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   2  (  194)    PSNNDLNTTEKRAAERHPEKYQGSSVSNLHVEPCGTNTHASSLQHENSSLLLTKDRMNVE
   3  (  241)    PSNNDLNTTEKRAAERHPEKYQGSSVSNLHVEPCGTNTHASSLQHENSSLLLTKDRMNVE
   4  (    -)    ............................................................
   5  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (  301)    KAEFCNKSKQPGLARSQHNRWAGSKETCNDRRTPSTEKKVDLNADPLCERKEWNKQKLPC
   1  (  301)    KAEFCNKSKQPGLARSQHNRWAGSKETCNDRRTPSTEKKVDLNADPLCERKEWNKQKLPC
   2  (  254)    KAEFCNKSKQPGLARSQHNRWAGSKETCNDRRTPSTEKKVDLNADPLCERKEWNKQKLPC
   3  (  301)    KAEFCNKSKQPGLARSQHNRWAGSKETCNDRRTPSTEKKVDLNADPLCERKEWNKQKLPC
   4  (    -)    ............................................................
   5  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (  361)    SENPRDTEDVPWITLNSSIQKVNEWFSRSDELLGSDDSHDGESESNAKVADVLDVLNEVD
   1  (  361)    SENPRDTEDVPWITLNSSIQKVNEWFSRSDELLGSDDSHDGESESNAKVADVLDVLNEVD
   2  (  314)    SENPRDTEDVPWITLNSSIQKVNEWFSRSDELLGSDDSHDGESESNAKVADVLDVLNEVD
   3  (  361)    SENPRDTEDVPWITLNSSIQKVNEWFSRSDELLGSDDSHDGESESNAKVADVLDVLNEVD
   4  (    -)    ............................................................
   5  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (  421)    EYSGSSEKIDLLASDPHEALICKSERVHSKSVESNIEDKIFGKTYRKKASLPNLSHVTEN
   1  (  421)    EYSGSSEKIDLLASDPHEALICKSERVHSKSVESNIEDKIFGKTYRKKASLPNLSHVTEN
   2  (  374)    EYSGSSEKIDLLASDPHEALICKSERVHSKSVESNIEDKIFGKTYRKKASLPNLSHVTEN
   3  (  421)    EYSGSSEKIDLLASDPHEALICKSERVHSKSVESNIEDKIFGKTYRKKASLPNLSHVTEN
   4  (    -)    ............................................................
   5  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (  481)    LIIGAFVTEPQIIQERPLTNKLKRKRRPTSGLHPEDFIKKADLAVQKTPEMINQGTNQTE
   1  (  481)    LIIGAFVTEPQIIQERPLTNKLKRKRRPTSGLHPEDFIKKADLAVQKTPEMINQGTNQTE
   2  (  434)    LIIGAFVTEPQIIQERPLTNKLKRKRRPTSGLHPEDFIKKADLAVQKTPEMINQGTNQTE
   3  (  481)    LIIGAFVTEPQIIQERPLTNKLKRKRRPTSGLHPEDFIKKADLAVQKTPEMINQGTNQTE
   4  (    -)    ............................................................
   5  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (  541)    QNGQVMNITNSGHENKTKGDSIQNEKNPNPIESLEKESAFKTKAEPISSSISNMELELNI
   1  (  541)    QNGQVMNITNSGHENKTKGDSIQNEKNPNPIESLEKESAFKTKAEPISSSISNMELELNI
   2  (  494)    QNGQVMNITNSGHENKTKGDSIQNEKNPNPIESLEKESAFKTKAEPISSSISNMELELNI
   3  (  541)    QNGQVMNITNSGHENKTKGDSIQNEKNPNPIESLEKESAFKTKAEPISSSISNMELELNI
   4  (    -)    ............................................................
   5  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (  601)    HNSKAPKKNRLRRKSSTRHIHALELVVSRNLSPPNCTELQIDSCSSSEEIKKKKYNQMPV
   1  (  601)    HNSKAPKKNRLRRKSSTRHIHALELVVSRNLSPPNCTELQIDSCSSSEEIKKKKYNQMPV
   2  (  554)    HNSKAPKKNRLRRKSSTRHIHALELVVSRNLSPPNCTELQIDSCSSSEEIKKKKYNQMPV
   3  (  601)    HNSKAPKKNRLRRKSSTRHIHALELVVSRNLSPPNCTELQIDSCSSSEEIKKKKYNQMPV
   4  (    -)    ............................................................
   5  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
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   1  (  661)    RHSRNLQLMEGKEPATGAKKSNKPNEQTSKRHDSDTFPELKLTNAPGSFTKCSNTSELKE
   2  (  614)    RHSRNLQLMEGKEPATGAKKSNKPNEQTSKRHDSDTFPELKLTNAPGSFTKCSNTSELKE
   3  (  661)    RHSRNLQLMEGKEPATGAKKSNKPNEQTSKRHDSDTFPELKLTNAPGSFTKCSNTSELKE
   4  (    -)    ............................................................
   5  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
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   2  (  674)    FVNPSLPREEKEEKLETVKVSNNAEDPKDLMLSGERVLQTERSVESSSISLVPGTDYGTQ
   3  (  721)    FVNPSLPREEKEEKLETVKVSNNAEDPKDLMLSGERVLQTERSVESSSISLVPGTDYGTQ
   4  (    -)    ............................................................
   5  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (  781)    ESISLLEVSTLGKAKTEPNKCVSQCAAFENPKGLIHGCSKDNRNDTEGFKYPLGHEVNHS
   1  (  781)    ESISLLEVSTLGKAKTEPNKCVSQCAAFENPKGLIHGCSKDNRNDTEGFKYPLGHEVNHS
   2  (  734)    ESISLLEVSTLGKAKTEPNKCVSQCAAFENPKGLIHGCSKDNRNDTEGFKYPLGHEVNHS
   3  (  781)    ESISLLEVSTLGKAKTEPNKCVSQCAAFENPKGLIHGCSKDNRNDTEGFKYPLGHEVNHS
   4  (    -)    ............................................................
   5  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (  841)    RETSIEMEESELDAQYLQNTFKVSKRQSFAPFSNPGNAEEECATFSAHSGSLKKQSPKVT
   1  (  841)    RETSIEMEESELDAQYLQNTFKVSKRQSFAPFSNPGNAEEECATFSAHSGSLKKQSPKVT
   2  (  794)    RETSIEMEESELDAQYLQNTFKVSKRQSFAPFSNPGNAEEECATFSAHSGSLKKQSPKVT
   3  (  841)    RETSIEMEESELDAQYLQNTFKVSKRQSFAPFSNPGNAEEECATFSAHSGSLKKQSPKVT
   4  (    -)    ............................................................
   5  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (  901)    FECEQKEENQGKNESNIKPVQTVNITAGFPVVGQKDKPVDNAKCSIKGGSRFCLSSQFRG
   1  (  901)    FECEQKEENQGKNESNIKPVQTVNITAGFPVVGQKDKPVDNAKCSIKGGSRFCLSSQFRG
   2  (  854)    FECEQKEENQGKNESNIKPVQTVNITAGFPVVGQKDKPVDNAKCSIKGGSRFCLSSQFRG
   3  (  901)    FECEQKEENQGKNESNIKPVQTVNITAGFPVVGQKDKPVDNAKCSIKGGSRFCLSSQFRG
   4  (    -)    ............................................................
   5  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (  961)    NETGLITPNKHGLLQNPYRIPPLFPIKSFVKTKCKKNLLEENFEEHSMSPEREMGNENIP
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   2  (  914)    NETGLITPNKHGLLQNPYRIPPLFPIKSFVKTKCKKNLLEENFEEHSMSPEREMGNENIP
   3  (  961)    NETGLITPNKHGLLQNPYRIPPLFPIKSFVKTKCKKNLLEENFEEHSMSPEREMGNENIP
   4  (    -)    ............................................................
   5  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  ( 1021)    STVSTISRNNIRENVFKEASSSNINEVGSSTNEVGSSINEIGSSDENIQAELGRNRGPKL
   1  ( 1021)    STVSTISRNNIRENVFKEASSSNINEVGSSTNEVGSSINEIGSSDENIQAELGRNRGPKL
   2  (  974)    STVSTISRNNIRENVFKEASSSNINEVGSSTNEVGSSINEIGSSDENIQAELGRNRGPKL
   3  ( 1021)    STVSTISRNNIRENVFKEASSSNINEVGSSTNEVGSSINEIGSSDENIQAELGRNRGPKL
   4  (    -)    ............................................................
   5  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  ( 1081)    NAMLRLGVLQPEVYKQSLPGSNCKHPEIKKQEYEEVVQTVNTDFSPYLISDNLEQPMGSS
   1  ( 1081)    NAMLRLGVLQPEVYKQSLPGSNCKHPEIKKQEYEEVVQTVNTDFSPYLISDNLEQPMGSS
   2  ( 1034)    NAMLRLGVLQPEVYKQSLPGSNCKHPEIKKQEYEEVVQTVNTDFSPYLISDNLEQPMGSS
   3  ( 1081)    NAMLRLGVLQPEVYKQSLPGSNCKHPEIKKQEYEEVVQTVNTDFSPYLISDNLEQPMGSS
   4  (    6)    ...........................LRVEEVQNVINAMQKILECPICLELIKEPVSTK
   5  (    6)    ...........................LRVEEVQNVINAMQKILECPICLELIKEPVSTK

//
                                                                             
   0  ( 1141)    HASQVCSETPDDLLDDGEIKEDTSFAENDI-KES---SAVFSKSVQKGELSRSPSPF---
   1  ( 1141)    HASQVCSETPDDLLDDGEIKEDTSFAENDI-KES---SAVFSKSVQKGELSRSPSPF---
   2  ( 1094)    HASQVCSETPDDLLDDGEIKEDTSFAENDI-KES---SAVFSKSVQKGELSRSPSPF---
   3  ( 1141)    HASQVCSETPDDLLDDGEIKEDTSFAENDI-KES---SAVFSKSVQKGELSRSPSPF---
   4  (   39)    CDHIFCKFCMLKLLNQKKGPSQCPLCKNDITKRSLQESTRFSQLVE--ELLKIICAFQLD
   5  (   39)    CDHIFCKFCMLKLLNQKKGPSQCPLCKNDITKRSLQESTRFSQLVE--ELLKIICAFQLD

//
                                                                             
   0  ( 1194)    THTHLAQGYRRGAKKLESSEENLSSEDEELPCFQHLLFGK--VNNIPSQSTRHSTVATEC
   1  ( 1194)    THTHLAQGYRRGAKKLESSEENLSSEDEELPCFQHLLFGK--VNNIPSQSTRHSTVATEC
   2  ( 1147)    THTHLAQGYRRGAKKLESSEENLSSEDEELPCFQHLLFGK--VNNIPSQSTRHSTVATEC
   3  ( 1194)    THTHLAQGYRRGAKKLESSEENLSSEDEELPCFQHLLFGK--VNNIPSQSTRHSTVATEC
   4  (   97)    TGLEYANSYNF-AKKENNSPEHLKDEVSIIQSMGYRNRAKRLLQSEPENPSLQETSLSVQ
   5  (   97)    TGLEYANSYNF-AKKENNSPEHLKDEVSIIQSMGYRNRAKRLLQSEPENPSLQETSLSVQ

//
                                                                             
   0  ( 1252)    LSKNTEENLLSLKNSLNDCSNQVILAKASQEHHLSEETKCSASLFSSQCSELEDLTANTN
   1  ( 1252)    LSKNTEENLLSLKNSLNDCSNQVILAKASQEHHLSEETKCSASLFSSQCSELEDLTANTN
   2  ( 1205)    LSKNTEENLLSLKNSLNDCSNQVILAKASQEHHLSEETKCSASLFSSQCSELEDLTANTN
   3  ( 1252)    LSKNTEENLLSLKNSLNDCSNQVILAKASQEHHLSEETKCSASLFSSQCSELEDLTANTN
   4  (  156)    LSNLGTVRTLRTKQRIQPQKTSVYIELGSDS---SEDTVNKATYCSVGDQELLQITPQ-G
   5  (  156)    LSNLGTVRTLRTKQRIQPQKTSVYIELGSDS---SEDTVNKATYCSVGDQELLQITPQ-G

//
                                                                             
   0  ( 1312)    TQDPFLIGSSKQMRHQSESQGVGLSDKELVSDDEERGTGLEENNQEEQSMDSNLGEAASG
   1  ( 1312)    TQDPFLIGSSKQMRHQSESQGVGLSDKELVSDDEERGTGLEENNQEEQSMDSNLGEAASG
   2  ( 1265)    TQDPFLIGSSKQMRHQSESQGVGLSDKELVSDDEERGTGLEENNQEEQSMDSNLGEAASG
   3  ( 1312)    TQDPFLIGSSKQMRHQSESQGVGLSDKELVSDDEERGTGLEENNQEEQSMDSNLGEAASG
   4  (  212)    TRDEISLDSAKKAACEFSETDVTNTEHHQPSNNDLNTT---EKRAAERHPEKYQGEAASG
   5  (  212)    TRDEISLDSAKKAACEFSETDVTNTEHHQPSNNDLNTT---EKRAAERHPEKYQGEAASG

//
                                                                             
   0  ( 1372)    CESETSVSEDCSGLSSQSDILTTQQRDTMQHNLIKLQQEMAELEAVLEQHGSQPSNSYPS
   1  ( 1372)    CESETSVSEDCSGLSSQSDILTTQQRDTMQHNLIKLQQEMAELEAVLEQHGSQPSNSYPS
   2  ( 1325)    CESETSVSEDCSGLSSQSDILTTQQRDTMQHNLIKLQQEMAELEAVLEQHGSQPSNSYPS
   3  ( 1372)    CESETSVSEDCSGLSSQSDILTTQQRDTMQHNLIKLQQEMAELEAVLEQHGSQPSNSYPS
   4  (  269)    CESETSVSEDCSGLSSQSDILTTQQRDTMQHNLIKLQQEMAELEAVLEQHGSQPSNSYPS
   5  (  269)    CESETSVSEDCSGLSSQSDILTTQQRDTMQHNLIKLQQEMAELEAVLEQHGSQPSNSYPS

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   5  (  667)    PFTNMPT.....................................................

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   5  (    -)    .................................

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