# 0 Query: pF1KB1311, 1384 aa
# 1 CCDS11436.1 CNTNAP1 gene_id:8506|Hs108|chr17 (1384 aa)
# 2 CCDS5889.1 CNTNAP2 gene_id:26047|Hs108|chr7 (1331 aa)
# 3 CCDS46401.1 CNTNAP5 gene_id:129684|Hs108|chr2 (1306 aa)
# 4 CCDS73915.1 CNTNAP4 gene_id:85445|Hs108|chr16 (1308 aa)
# 5 CCDS75836.1 CNTNAP3B gene_id:728577|Hs108|chr9 (1288 aa)
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4 ( 24) .................EAGNS----YDCDDPLVSALPQASFSSSSELSSSHGPGFARLN
5 ( 31) ............................CDSPLASALPRSSFSSSSELSSSHGPGFSRLN
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1 ( 57) ---GISGWSPRIGDPNPWLQIDLMKKHRIRAVATQGSFNSWDWVTRYMLLYGDRVDSWTP
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4 ( 123) YRQEDSIWGFSGNANADSVVYYRLQPSIKARFLRFIPLEWNPKGRIGMRIEVFGCAYRSE
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5 ( 243) FFLNSGNAKLPSTIAPVTLTLGSLLDDQHWHSVLIELLDTQVNFTVDKHTHHFQAKGDSS
//
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4 ( 303) LMNLDYEISFGG-IPAPGKSVSFPHRNFHGCLENLYYNGVDIIDLAKQQKPQIIAMGNVS
5 ( 303) NLDLNFEISFGGILSPGRSRAFTRK-SFHGCLENLYYNGVDVTELAKKHKPQILMMGNVS
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2 ( 366) FSCVEPYTVPVFF-NAT-SYLEVPGRLNQDLFSVSFQFRTWNPNGLLVFSHFADNLGNVE
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4 ( 362) FSCSQPQSMPVTF-LSSRSYLALPDFSGEEEVSATFQFRTWNKAGLLLFSELQLISGGIL
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2 ( 424) IDLTESKVGVHINITQTKMSQIDISSGSGLNDGQWHEVRFLAKENFAILTIDGDEASAVR
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2 ( 484) TNSPLQVKTGEKYFFGGFLNQMNN-SSHSVLQPSFQGCMQLIQVDDQLVNLYEVAQRKPG
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4 ( 479) LLGPEQIYSGGTYYFGGCPDKSFGSKCKSP-LGGFQGCMRLISISGKVVDLISVQQGSLG
5 ( 479) VA--VLIDSGDTYYFGGCLGNSSGSGCKSP-LGGFQGCLRLITIGDKAVDPILVQQGALG
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2 ( 543) SFANVSIDMCAIIDRCVPNHCEHGGKCSQTWDSFKCTCDETGYSGATCHNSIYEPSCEAY
3 ( 535) NFSDLHIDLCSIKDRCLPNYCEHGGSCSQSWTTFYCNCSDTSYTGATCHNSIYEQSCEVY
4 ( 538) NFSDLQIDSCGISDRCLPNYCEHGGECSQSWSTFHCNCTNTGYRGATCHNSIYEQSCEAY
5 ( 536) SFRDLQIDSCGITDRCLPSYCEHGGECSQSWDTFSCDCLGTGYTGETCHSSLYEQSCEAH
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3 ( 595) RHQGNTAGFFYIDSDGSGPLGPLQVYCNITEDKIWTSVQHNNTELTRVRGANPEKPYAMA
4 ( 598) KHRGNTSGFYYIDSDGSGPLEPFLLYCNMTET-AWTIIQHNGSDLTRVRNTNPENPYAGF
5 ( 596) KHRGNPSGLYYIDADGSGPLGPFLVYCNMTADSAWTVVRHGGPDAVTLRGAPSGHP-LSA
//
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1 ( 649) IQY-WNASWEEVSALANASQHCEQWIEFSCYNSRLLNTAGGYPYSFWIGRNEEQHFYWGG
2 ( 663) LVY--SASMDQISAITDSAEYCEQYVSYFCKMSRLLNTPDGSPYTWWVGKANEKHYYWGG
3 ( 655) LDY--GGSMEQLEAVIDGSEHCEQEVAYHCRRSRLLNTPDGTPFTWWIGRSNERHPYWGG
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//
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4 ( 715) SSPDLQKCTCGLEGNCIDSQYYCNCDADRNEWTNDTGLLAYKEHLPVTKIVITDTGRLHS
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2 ( 840) MG------KEDFIKLELKSATEVSFSFDVGNGPVEIVVRSPT-PLNDDQWHRVTAERNVK
3 ( 832) LGI------KDFIRLEISSPSEITFAIDVGNGPVELVVQSPSL-LNDNQWHYVRAERNLK
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1 ( 886) QARLRVDHRPWVLRPMPLQTYIWMEYDQPLYVGSAELKRRPFVGCLRAMRLNGVTLNLEG
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3 ( 885) ETSLQVDNLPRSTRETSEEGHFRLQLNSQLFVGGTSSRQKGFLGCIRSLHLNGQKMDLEE
4 ( 887) EASLQVDQLTPKTQPAPADGHVLLQLNSQLFVGGTATRQRGFLGCIRSLQLNGMTLDLEE
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3 ( 945) RAKVTSGVRPGCPGHCSSYGSICHNGGKCVEKHNGYLCDCTNSPYEGPFCKKEVSAVFEA
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1 ( 1006) GTWMRYNLQSALRSAAREFSHMLSRPVPGYEPGYIPGYDTPGYVPGYHGPGYRLPDYPRP
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4 ( 1007) GSSVIYNFQE---------NYLLSK-------------NSSSHAASFHGD----------
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1 ( 1066) GRPVPGYRGPVYNVTGEEVSFSFSTSSAPAVLLYVSSFVRDYMAVLIKDDGTLQLRYQLG
2 ( 1040) QNSHP-------DLAQEEIRFSFSTTKAPCILLYISSFTTDFLAVLVKPTGSLQIRYNLG
3 ( 1036) SK--------------ENIALSFVTTQAPSLLLFINSSSQDFVVVLLCKNGSLQVRYHLN
4 ( 1035) -----------MKLSREMIKFSFRTTRTPSLLLFVSSFYKEYLSVIIAKNGSLQIRYKLN
5 ( 1033) -RDV--------TLTREMITLSFRTTRTPSLLLYVSSFYEEYLSVILANNGSLQIRYKLD
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1 ( 1126) T--S--P-YVYQLTTRPVTDGQPHSINITRVYRNLFIQVDYFPLTEQKFSLLVDSQLDSP
2 ( 1093) G--TREP-YNIDVDHRNMANGQPHSVNITRHEKTIFLKLDHYPSVSYHLPSSSDTLFNSP
3 ( 1082) K--E--ETHVFTIDADNFANRRMHHLKINREGRELTIQMDQQLRLSYNFSPEVEFRV--I
4 ( 1084) KYQE--P-DVVNFDFKNMADGQLHHIMINREEGVVFIEID--DNRRRQVHLSSGTEFSAV
5 ( 1084) RHQN--P-DAFTFDFKNMADGQLHQVKINREEAVVMVEVNQS--AKKQVILSSGTEFNAV
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1 ( 1181) KALYLGRVMETGVIDPEIQRYNTPGFSGCLSGVRFNNVAPLKT--HFR--TPRP----MT
2 ( 1150) KSLFLGKVIETGKIDQEIHKYNTPGFTGCLSRVQFNQIAPLKA--ALR----------QT
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1 ( 1233) AELAEALR-VQGELSESNCGAM-P----RLVSEVPPELDPW-----Y-----LP------
2 ( 1198) NASAH-VH-IQGELVESNCGAS-P----LTLSPMSSATDPW-----H-----LDHLDSAS
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1 ( 1271) PDFPYYHDEGWV--------AILLGFLVA---FLLLGLVGMLVLFYLQNHRYKGSYHTNE
2 ( 1241) ADFPYNPGQGQAIRNGVNRNSAIIGGVIA---VVIFTILCTLVFLIRYMFRHKGTYHTNE
3 ( 1229) LTNAVRSDSAVI--------GGVIA-VVI---FIIFCIIGIMTRFLYQ---HKQSHRTSQ
4 ( 1228) DREPLANAIKSD--------SAVIGGLIAVVIFILLCITAIAVRIYQQKRLYKRS.....
5 ( 1232) EGEPLVNADRRD--------SAVIGGVIAVEIFILLCITAIAIRIYQQRKLRK----ENE
//
0 ( 1320) PKAAHEYHPGSKPPLPTSGPAQVPTPTAAPNQAPASAPAPAPTPAPAPGPRDQNLPQILE
1 ( 1320) PKAAHEYHPGSKPPLPTSGPAQVPTPTAAPNQAPASAPAPAPTPAPAPGPRDQNLPQILE
2 ( 1298) AKGA........................................................
3 ( 1274) MKE-KEY.....................................................
4 ( -) ............................................................
5 ( 1280) SKVSKK......................................................
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2 ( -) .....
3 ( -) .....
4 ( -) .....
5 ( -) .....
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