# 0 Query: pF1KB0020, 1783 aa
# 1 CCDS5229.1 AKAP12 gene_id:9590|Hs108|chr6 (1782 aa)
# 2 CCDS5230.1 AKAP12 gene_id:9590|Hs108|chr6 (1684 aa)
//
exp sw-scr id% from to
1 0 11297 99.7 1 1782
2 0 10617 99.5 5 1684
//
0 ( 1) MGAGSSTEQRSPEQPPEGSSTPAEPEPSGGGPSAEAAPDTTADPAIAASDPATKLLQKNG
1 ( 1) MGAGSSTEQRSPEQPPEGSSTPAEPEPSGGGPSAEAAPDTTADPAIAASDPATKLLQKNG
2 ( -) ............................................................
//
*
0 ( 61) QLSTINGVAEQDELSLQEGDLNGQKGALNGQGALNSQEEEEVIVTEVGQRDSEDVSERDS
1 ( 61) QLSTINGVAEQDELSLQEGDLNGQKGALNGQGALNSQEEEEVIVTEVGQRDSEDVSKRDS
2 ( 5) ..........................................ITITVGQRDSEDVSKRDS
//
0 ( 121) DKEMATKSAVVHDITDDGQEETPEIIEQIPSSESNLEELTQPTESQANDIGFKKVFKFVG
1 ( 121) DKEMATKSAVVHDITDDGQEETPEIIEQIPSSESNLEELTQPTESQANDIGFKKVFKFVG
2 ( 23) DKEMATKSAVVHDITDDGQEETPEIIEQIPSSESNLEELTQPTESQANDIGFKKVFKFVG
//
*
0 ( 181) FKFTVKKDKTEKPDTVQLLTVKKDEGEGAAGAGDHQDPSLGAGEAASKESEPKQSTEKPE
1 ( 181) FKFTVKKDKTEKPDTVQLLTVKKDEGEGAAGAGDHKDPSLGAGEAASKESEPKQSTEKPE
2 ( 83) FKFTVKKDKTEKPDTVQLLTVKKDEGEGAAGAGDHKDPSLGAGEAASKESEPKQSTEKPE
//
0 ( 241) ETLKREQSHAEISPPAESGQAVEECKEEGEEKQEKEPSKSAESPTSPVTSETGSTFKKFF
1 ( 241) ETLKREQSHAEISPPAESGQAVEECKEEGEEKQEKEPSKSAESPTSPVTSETGSTFKKFF
2 ( 143) ETLKREQSHAEISPPAESGQAVEECKEEGEEKQEKEPSKSAESPTSPVTSETGSTFKKFF
//
0 ( 301) TQGWAGWRKKTSFRKPKEDEVEASEKKKEQEPEKVDTEEDGKAEVASEKLTASEQAHPQE
1 ( 301) TQGWAGWRKKTSFRKPKEDEVEASEKKKEQEPEKVDTEEDGKAEVASEKLTASEQAHPQE
2 ( 203) TQGWAGWRKKTSFRKPKEDEVEASEKKKEQEPEKVDTEEDGKAEVASEKLTASEQAHPQE
//
0 ( 361) PAESAHEPRLSAEYEKVELPSEEQVSGSQGPSEEKPAPLATEVFDEKIEVHQEEVVAEVH
1 ( 361) PAESAHEPRLSAEYEKVELPSEEQVSGSQGPSEEKPAPLATEVFDEKIEVHQEEVVAEVH
2 ( 263) PAESAHEPRLSAEYEKVELPSEEQVSGSQGPSEEKPAPLATEVFDEKIEVHQEEVVAEVH
//
*
0 ( 421) VSIVEERTEEQKTEVEETAGSVPAEELVEMDAEPQEAEPAKELVKLKETCVSGEDPTQGA
1 ( 421) VSTVEERTEEQKTEVEETAGSVPAEELVEMDAEPQEAEPAKELVKLKETCVSGEDPTQGA
2 ( 323) VSTVEERTEEQKTEVEETAGSVPAEELVEMDAEPQEAEPAKELVKLKETCVSGEDPTQGA
//
0 ( 481) DLSPDEKVLSKPPEGVVSEVEMLSSQERMKVQGSPLKKLFTSTGLKKLSGKKQKGKRGGG
1 ( 481) DLSPDEKVLSKPPEGVVSEVEMLSSQERMKVQGSPLKKLFTSTGLKKLSGKKQKGKRGGG
2 ( 383) DLSPDEKVLSKPPEGVVSEVEMLSSQERMKVQGSPLKKLFTSTGLKKLSGKKQKGKRGGG
//
0 ( 541) DEESGEHTQVPADSPDSQEEQKGESSASSPEEPEEITCLEKGLAEVQQDGEAEEGATSDG
1 ( 541) DEESGEHTQVPADSPDSQEEQKGESSASSPEEPEEITCLEKGLAEVQQDGEAEEGATSDG
2 ( 443) DEESGEHTQVPADSPDSQEEQKGESSASSPEEPEEITCLEKGLAEVQQDGEAEEGATSDG
//
0 ( 601) EKKREGVTPWASFKKMVTPKKRVRRPSESDKEDELDKVKSATLSSTESTASEMQEEMKGS
1 ( 601) EKKREGVTPWASFKKMVTPKKRVRRPSESDKEDELDKVKSATLSSTESTASEMQEEMKGS
2 ( 503) EKKREGVTPWASFKKMVTPKKRVRRPSESDKEDELDKVKSATLSSTESTASEMQEEMKGS
//
0 ( 661) VEEPKPEEPKRKVDTSVSWEALICVGSSKKRARRGSSSDEEGGPKAMGGDHQKADEAGKD
1 ( 661) VEEPKPEEPKRKVDTSVSWEALICVGSSKKRARRGSSSDEEGGPKAMGGDHQKADEAGKD
2 ( 563) VEEPKPEEPKRKVDTSVSWEALICVGSSKKRARRGSSSDEEGGPKAMGGDHQKADEAGKD
//
0 ( 721) KETGTDGILAGSQEHDPGQGSSSPEQAGSPTEGEGVSTWESFKRLVTPRKKSKSKLEEKS
1 ( 721) KETGTDGILAGSQEHDPGQGSSSPEQAGSPTEGEGVSTWESFKRLVTPRKKSKSKLEEKS
2 ( 623) KETGTDGILAGSQEHDPGQGSSSPEQAGSPTEGEGVSTWESFKRLVTPRKKSKSKLEEKS
//
0 ( 781) EDSIAGSGVEHSTPDTEPGKEESWVSIKKFIPGRRKKRPDGKQEQAPVEDAGPTGANEDD
1 ( 781) EDSIAGSGVEHSTPDTEPGKEESWVSIKKFIPGRRKKRPDGKQEQAPVEDAGPTGANEDD
2 ( 683) EDSIAGSGVEHSTPDTEPGKEESWVSIKKFIPGRRKKRPDGKQEQAPVEDAGPTGANEDD
//
0 ( 841) SDVPAVVPLSEYDAVEREKMEAQQAQKSAEQPEQKAATEVSKELSESQVHMMAAAVADGT
1 ( 841) SDVPAVVPLSEYDAVEREKMEAQQAQKSAEQPEQKAATEVSKELSESQVHMMAAAVADGT
2 ( 743) SDVPAVVPLSEYDAVEREKMEAQQAQKSAEQPEQKAATEVSKELSESQVHMMAAAVADGT
//
0 ( 901) RAATIIEERSPSWISASVTEPLEQVEAEAALLTEEVLEREVIAEEEPPTVTEPLPENREA
1 ( 901) RAATIIEERSPSWISASVTEPLEQVEAEAALLTEEVLEREVIAEEEPPTVTEPLPENREA
2 ( 803) RAATIIEERSPSWISASVTEPLEQVEAEAALLTEEVLEREVIAEEEPPTVTEPLPENREA
//
0 ( 961) RGDTVVSEAELTPEAVTAAETAGPLGAEEGTEASAAEETTEMVSAVSQLTDSPDTTEEAT
1 ( 961) RGDTVVSEAELTPEAVTAAETAGPLGAEEGTEASAAEETTEMVSAVSQLTDSPDTTEEAT
2 ( 863) RGDTVVSEAELTPEAVTAAETAGPLGAEEGTEASAAEETTEMVSAVSQLTDSPDTTEEAT
//
0 ( 1021) PVQEVEGGVPDIEEQERRTQEVLQAVAEKVKEESQLPGTGGPEDVLQPVQRAEAERPEEQ
1 ( 1021) PVQEVEGGVPDIEEQERRTQEVLQAVAEKVKEESQLPGTGGPEDVLQPVQRAEAERPEEQ
2 ( 923) PVQEVEGGVPDIEEQERRTQEVLQAVAEKVKEESQLPGTGGPEDVLQPVQRAEAERPEEQ
//
0 ( 1081) AEASGLKKETDVVLKVDAQEAKTEPFTQGKVVGQTTPESFEKAPQVTESIESSELVTTCQ
1 ( 1081) AEASGLKKETDVVLKVDAQEAKTEPFTQGKVVGQTTPESFEKAPQVTESIESSELVTTCQ
2 ( 983) AEASGLKKETDVVLKVDAQEAKTEPFTQGKVVGQTTPESFEKAPQVTESIESSELVTTCQ
//
0 ( 1141) AETLAGVKSQEMVMEQAIPPDSVETPTDSETDGSTPVADFDAPGTTQKDEIVEIHEENEV
1 ( 1141) AETLAGVKSQEMVMEQAIPPDSVETPTDSETDGSTPVADFDAPGTTQKDEIVEIHEENEV
2 ( 1043) AETLAGVKSQEMVMEQAIPPDSVETPTDSETDGSTPVADFDAPGTTQKDEIVEIHEENEV
//
0 ( 1201) ASGTQSGGTEAEAVPAQKERPPAPSSFVFQEETKEQSKMEDTLEHTDKEVSVETVSILSK
1 ( 1201) ASGTQSGGTEAEAVPAQKERPPAPSSFVFQEETKEQSKMEDTLEHTDKEVSVETVSILSK
2 ( 1103) ASGTQSGGTEAEAVPAQKERPPAPSSFVFQEETKEQSKMEDTLEHTDKEVSVETVSILSK
//
0 ( 1261) TEGTQEADQYADEKTKDVPFFEGLEGSIDTGITVSREKVTEVALKGEGTEEAECKKDDAL
1 ( 1261) TEGTQEADQYADEKTKDVPFFEGLEGSIDTGITVSREKVTEVALKGEGTEEAECKKDDAL
2 ( 1163) TEGTQEADQYADEKTKDVPFFEGLEGSIDTGITVSREKVTEVALKGEGTEEAECKKDDAL
//
0 ( 1321) ELQSHAKSPPSPVEREMVVQVEREKTEAEPTHVNEEKLEHETAVTVSEEVSKQLLQTVNV
1 ( 1321) ELQSHAKSPPSPVEREMVVQVEREKTEAEPTHVNEEKLEHETAVTVSEEVSKQLLQTVNV
2 ( 1223) ELQSHAKSPPSPVEREMVVQVEREKTEAEPTHVNEEKLEHETAVTVSEEVSKQLLQTVNV
//
0 ( 1381) PIIDGAKEVSSLEGSPPPCLGQEEAVCTKIQVQSSEASFTLTAAAEEEKVLGETANILET
1 ( 1381) PIIDGAKEVSSLEGSPPPCLGQEEAVCTKIQVQSSEASFTLTAAAEEEKVLGETANILET
2 ( 1283) PIIDGAKEVSSLEGSPPPCLGQEEAVCTKIQVQSSEASFTLTAAAEEEKVLGETANILET
//
0 ( 1441) GETLEPAGAHLVLEEKSSEKNEDFAAHPGEDAVPTGPDCQAKSTPVIVSATTKKGLSSDL
1 ( 1441) GETLEPAGAHLVLEEKSSEKNEDFAAHPGEDAVPTGPDCQAKSTPVIVSATTKKGLSSDL
2 ( 1343) GETLEPAGAHLVLEEKSSEKNEDFAAHPGEDAVPTGPDCQAKSTPVIVSATTKKGLSSDL
//
*
0 ( 1501) EGEKTTSLKWKSDEVDEQVACQEVKVSVAIEEDLEPENGILELETKSSKLVQNIIQTAVD
1 ( 1501) EGEKTTSLKWKSDEVDEQVACQEVKVSVAIE-DLEPENGILELETKSSKLVQNIIQTAVD
2 ( 1403) EGEKTTSLKWKSDEVDEQVACQEVKVSVAIE-DLEPENGILELETKSSKLVQNIIQTAVD
//
*
0 ( 1561) QFVRTEETATEMLTSELQTQAHVIKADSQDAGQETEKEGEDPQASAQDETPITSAKEESE
1 ( 1560) QFVRTEETATEMLTSELQTQAHVIKADSQDAGQETEKEGEEPQASAQDETPITSAKEESE
2 ( 1462) QFVRTEETATEMLTSELQTQAHVIKADSQDAGQETEKEGEEPQASAQDETPITSAKEESE
//
0 ( 1621) STAVGQAHSDISKDMSEASEKTMTVEVEGSTVNDQQLEEVVLPSEEEGGGAGTKSVPEDD
1 ( 1620) STAVGQAHSDISKDMSEASEKTMTVEVEGSTVNDQQLEEVVLPSEEEGGGAGTKSVPEDD
2 ( 1522) STAVGQAHSDISKDMSEASEKTMTVEVEGSTVNDQQLEEVVLPSEEEGGGAGTKSVPEDD
//
0 ( 1681) GHALLAERIEKSLVEPKEDEKGDDVDDPENQNSALADTDASGGLTKESPDTNGPKQKEKE
1 ( 1680) GHALLAERIEKSLVEPKEDEKGDDVDDPENQNSALADTDASGGLTKESPDTNGPKQKEKE
2 ( 1582) GHALLAERIEKSLVEPKEDEKGDDVDDPENQNSALADTDASGGLTKESPDTNGPKQKEKE
//
0 ( 1741) DAQEVELQEGKVHSESDKAITPQAQEELQKQERESAKSELTES
1 ( 1740) DAQEVELQEGKVHSESDKAITPQAQEELQKQERESAKSELTES
2 ( 1642) DAQEVELQEGKVHSESDKAITPQAQEELQKQERESAKSELTES
//
