Multiple alignment for pF1KA1016
Check alignment(s).
#  0    Query: pF1KA1016, 728 aa
#  1    CCDS31972.1 LRCH1 gene_id:23143|Hs108|chr13    (728 aa)
#  2    CCDS53866.1 LRCH1 gene_id:23143|Hs108|chr13    (696 aa)
#  3    CCDS53865.1 LRCH1 gene_id:23143|Hs108|chr13    (763 aa)
#  4    CCDS3330.1 LRCH3 gene_id:84859|Hs108|chr3    (712 aa)
#  5    CCDS59175.1 LRCH2 gene_id:57631|Hs108|chrX    (748 aa)

//
        exp       sw-scr    id%      from      to
   1    2.6e-191    4851   99.9         1     728
   2    6.4e-174    4422   99.0         1     671
   3    1.9e-143    4756   95.3         1     760
   4    3.1e-44     1456   43.3        22     710
   5    3.7e-40     1872   48.3        29     737

//
                                                                             
   0  (    1)    MATPGSEPQPFVPALSVATLHPLHHPHHHHHHHQHHGGTGAPGGAGGGGGGSG-G-----
   1  (    1)    MATPGSEPQPFVPALSVATLHPLHHPHHHHHHHQHHGGTGAPGGAGGGGGGSG-G-----
   2  (    1)    MATPGSEPQPFVPALSVATLHPLHHPHHHHHHHQHHGGTGAPGGAGGGGGGSG-G-----
   3  (    1)    MATPGSEPQPFVPALSVATLHPLHHPHHHHHHHQHHGGTGAPGGAGGGGGGSG-G-----
   4  (   22)    .....................................GGNLPGVHCGPSSGAGPG-----
   5  (   29)    ....................................GGGG--GGAGGGGGGGG-GTLVVP

//
                                                                             
   0  (   55)    ------FNLP--LNRG----------------LERALEEAANSGGLNLSARKLKEFPRTA
   1  (   55)    ------FNLP--LNRG----------------LERALEEAANSGGLNLSARKLKEFPRTA
   2  (   55)    ------FNLP--LNRG----------------LERALEEAANSGGLNLSARKLKEFPRTA
   3  (   55)    ------FNLP--LNRG----------------LERALEEAANSGGLNLSARKLKEFPRTA
   4  (   40)    ------FG-PGSWSRS----------------LDRALEEAAVTGVLSLSGRKLREFPRGA
   5  (   50)    IPVPTLFGQP--FPNGPPWNPGSLQPQHTVRSLDRALEEAGSSGILSLSGRKLRDFP---

//
                                                                             
   0  (   91)    APGHDLSDTVQADLSKNRLVEVPMELCHFVSLEILNLYHNCIRVIPEAIVNLQMLTYLNL
   1  (   91)    APGHDLSDTVQADLSKNRLVEVPMELCHFVSLEILNLYHNCIRVIPEAIVNLQMLTYLNL
   2  (   91)    APGHDLSDTVQADLSKNRLVEVPMELCHFVSLEILNLYHNCIRVIPEAIVNLQMLTYLNL
   3  (   91)    APGHDLSDTVQADLSKNRLVEVPMELCHFVSLEILNLYHNCIRVIPEAIVNLQMLTYLNL
   4  (   77)    A-NHDLTDTTRADLSRNRLSEIPIEACHFVSLENLNLYQNCIRYIPEAILNLQALTFLNI
   5  (  105)    GSGYDLTDTTQADLSRNRFTEIPSDVWLFAPLETLNLYHNCIKTIPEAIKNLQMLTYLNI

//
                                                                             
   0  (  151)    SRNQLSALPACLCGLPLKVLIASNNKLGSLPEEIGQLKQLMELDVSCNEITALPQQIGQL
   1  (  151)    SRNQLSALPACLCGLPLKVLIASNNKLGSLPEEIGQLKQLMELDVSCNEITALPQQIGQL
   2  (  151)    SRNQLSALPACLCGLPLKVLIASNNKLGSLPEEIGQLKQLMELDVSCNEITALPQQIGQL
   3  (  151)    SRNQLSALPACLCGLPLKVLIASNNKLGSLPEEIGQLKQLMELDVSCNEITALPQQIGQL
   4  (  136)    SRNQLSTLPVHLCNLPLKVLIASNNKLVSLPEEIGHLRHLMELDVSCNEIQTIPSQIGNL
   5  (  165)    SRNLLSTLPKYLFDLPLKVLVVSNNKLVSIPEEIGKLKDLMELDISCNEIQVLPQQMGKL

//
                                        *                                    
   0  (  211)    KSLRELNVRRNYLKVLPQELVDLPLVKFDFSCNKVLVIPICFREMKQLQVLLLENNPLQS
   1  (  211)    KSLRELNVRRNYLKVLPQELVDLSLVKFDFSCNKVLVIPICFREMKQLQVLLLENNPLQS
   2  (  211)    KSLRELNVRRNYLKVLPQELVDLSLVKFDFSCNKVLVIPICFREMKQLQVLLLENNPLQS
   3  (  211)    KSLRELNVRRNYLKVLPQELVDLSLVKFDFSCNKVLVIPICFREMKQLQVLLLENNPLQS
   4  (  196)    EALRDLNVRRNHLVHLPEELAELPLIRLDFSCNKITTIPVCYRNLRHLQTITLDNNPLQS
   5  (  225)    HSLRELNIRRNNLHVLPDELGDLPLVKLDFSCNKVTEIPVCYRKLHHLQVIILDNNPLQV

//
                                                                             
   0  (  271)    PPAQICTKGKVHIFKYLSIQAC--QIKTADSLYLHTMERP----HLHQHVEDGKKD----
   1  (  271)    PPAQICTKGKVHIFKYLSIQAC--QIKTADSLYLHTMERP----HLHQHVEDGKKD----
   2  (  271)    PPAQICTKGKVHIFKYLSIQAC--QIKTADSLYLHTMERP----HLHQHVEDGKKD----
   3  (  271)    PPAQICTKGKVHIFKYLSIQAC--QIKTADSLYLHTMERP----HLHQHVEDGKKD----
   4  (  256)    PPAQICIKGKVHIFKYLNIQAC--KI--APDLPDYD-RRPLGFGSCHEELYSSRPY----
   5  (  285)    PPAQICLKGKVHIFKYLNIQACCRMDKKPDSLDLPSLSKR----MPSQPLTDSMEDFYPN

//
                                                                             
   0  (  321)    ----S--DSGVGS-DNGDKRLSATEPSDEDTVSLNVPMSNIMEEEQIIKEDSCH--RLSP
   1  (  321)    ----S--DSGVGS-DNGDKRLSATEPSDEDTVSLNVPMSNIMEEEQIIKEDSCH--RLSP
   2  (  321)    ----S--DSGVGS-DNGDKRLSATEPSDEDTVSLNVPMSNIMEEEQIIKEDSCH--RLSP
   3  (  321)    ----S--DSGVGS-DNGDKRLSATEPSDEDTVSLNVPMSNIMEEEQIIKEDSCH--RLSP
   4  (  307)    ----GALDSGFNSVDSGDKRWSGNEPTDEFS-DLPLRVAEITKEQRLRRESQYQENRGSL
   5  (  341)    KNHGP--DSGIGS-DNGEKRLSTTEPSDDDTVSLHSQVSE-SNREQTSRNDSHI--IGSK

//
                                                                             
   0  (  372)    VKGEFHQEFQPEPSLLGDSTNSGEE----RDQFTDRADGLHSEFMNY-------------
   1  (  372)    VKGEFHQEFQPEPSLLGDSTNSGEE----RDQFTDRADGLHSEFMNY-------------
   2  (  372)    VKGEFHQEFQPEPSLLGDSTNSGEE----RDQFTDRADGLHSEFMNY-------------
   3  (  372)    VKGEFHQEFQPEPSLLGDSTNSGEE----RDQFTDRADGLHSEFMNY-------------
   4  (  362)    VVTNGGVEHDLDQIDYIDSCTAEEEEAEVRQPKGPDPDSLSSQFMAYIEQRRISHEGSPV
   5  (  395)    TDSQKDQEVY-------DFVDPNTE----DVAVPEQGNAHIGSFVSF-------------

//
                                                                             
   0  (  415)    KARA----EDCEELLRI--EEDV----HWQTEGIIS--SSKDQ----DMDI-----AMIE
   1  (  415)    KARA----EDCEELLRI--EEDV----HWQTEGIIS--SSKDQ----DMDI-----AMIE
   2  (  415)    KARA----EDCEELLRI--EEDV----HWQTEGIIS--SSKDQ----DMDI-----AMIE
   3  (  415)    KARA----EDCEELLRI--EEDV----HWQTEGIIS--SSKDQ----DMDI-----AMIE
   4  (  422)    KPVAIREFQKTEDMRRYLHQNRV----PAEPSSLLSLSASHNQLSHTDLELHQRREQLVE
   5  (  431)    FKGK----EKCSEKSRK--NEELGDEKRLEKEQLLA----EEE----DDDL-----KEVT

//
                                                                             
   0  (  454)    QLRE-AVDL--LQ-DPN-----GLSTDIT----------ER-SV----LN--LYPMGSAE
   1  (  454)    QLRE-AVDL--LQ-DPN-----GLSTDIT----------ER-SV----LN--LYPMGSAE
   2  (  454)    QLRE-AVDL--LQ-DPN-----GLSTDIT----------ER-SV----LN--LYPMGSAE
   3  (  454)    QLRE-AVDL--LQ-DPN-----GLSTDIT----------ER-SV----LN--LYPMGSAE
   4  (  478)    RTRR-EAQLAALQYEEE-----KIRTKQI----------QRDAV----LD--FVKQKASQ
   5  (  472)    DLRKIAAQL--LQ-QEQKNRILNHSTSVMRNKPKQTVECEK-SVSADEVNSPLSPL-TWQ

//
                                                                             
   0  (  488)    ALELQDSALNG-----------QIQLETSPVCEVQSDLT------LQSNG---------S
   1  (  488)    ALELQDSALNG-----------QIQLETSPVCEVQSDLT------LQSNG---------S
   2  (  488)    ALELQDSALNG-----------QIQLETSPVCEVQSDLT------LQSNG---------S
   3  (  488)    ALELQDSALNG-----------QIQLETSPVCEVQSDLT------LQSNG---------S
   4  (  516)    SPQKQHPLLDGVDGECPFPSRRSQHTDDSALCMSLSGLNQVGCAATLPHS---------S
   5  (  527)    PLENQKDQIDE-----------QPWPESHPIIW-QSEER------RRSKQIRKEYFKYKS

//
                                                                             
   0  (  522)    QYSP--NEIREN----SPAVSPTTN-STA---PFGL------KPRS--------------
   1  (  522)    QYSP--NEIREN----SPAVSPTTN-STA---PFGL------KPRS--------------
   2  (  522)    QYSP--NEIREN----SPAVSPTTN-STA---PFGL------KPRS--------------
   3  (  522)    QYSP--NEIREN----SPAVSPTTN-STA---PFGL------KPRSDPALILPPISFNTL
   4  (  567)    AFTPLKSDDRPNALLSSPATETVHH-SPAYSFPAAIQRNQPQRPES--------------
   5  (  569)    MRKS--SSGNEN----DEEYDRTDGFSHS---PFGL------KPRS--------------

//
                                                                             
   0  (  552)    ---------------------VFLR---------------PQRN-LESIDPQFTIRRKME
   1  (  552)    ---------------------VFLR---------------PQRN-LESIDPQFTIRRKME
   2  (  552)    ---------------------VFLR---------------PQRN-LESIDPQFTIRRKME
   3  (  566)    TQAQTWDSSSYSVPSEGDSDNVFLR---------------PQRN-LESIDPQFTIRRKME
   4  (  612)    ---------------------FLFRAGVRAETNKGHASPLPPSA-APTTDSTDSITGQNS
   5  (  600)    ---------------------AFSR---------------SSRQEYGAADPGFTMRRKME

//
                                                                             
   0  (  575)    QMREEK-ELVEQLRESIEMRLKVSLHEDLGAALMDGVVLCHLVNHIRPRSVASIHVPSPA
   1  (  575)    QMREEK-ELVEQLRESIEMRLKVSLHEDLGAALMDGVVLCHLVNHIRPRSVASIHVPSPA
   2  (  575)    QMREEK-ELVEQLRESIEMRLKVSLHEDLGAALMDGVVLCHLVNHIRPRSVASIHVPSPA
   3  (  610)    QMREEK-ELVEQLRESIEMRLKVSLHEDLGAALMDGVVLCHLVNHIRPRSVASIHVPSPA
   4  (  650)    RQREEELELIDQLRKHIEYRLKVSLPCDLGAALTDGVVLCHLANHVRPRSVPSIHVPSPA
   5  (  624)    HLREER-EQIRQLRNNLESRLKVILPDDIGAALMDGVVLCHLANHIRPRSVASIHVPSPA

//
                                                                             
   0  (  634)    VPKLSMAKCRRNVENFLEACRKLGVPEADLCSPCDILQL-DFRHIRKTVDTLLALGEKAP
   1  (  634)    VPKLSMAKCRRNVENFLEACRKLGVPEADLCSPCDILQL-DFRHIRKTVDTLLALGEKAP
   2  (  634)    VPKLSMAKCRRNVENFLEACRKLGVPEEKLCLPHHILE......................
   3  (  669)    VPKLSMAKCRRNVENFLEACRKLGVPEADLCSPCDILQL-DFRHIRKTVDTLLALGEKAP
   4  (  710)    V...........................................................
   5  (  683)    VPKLSMAKCRRNVENFLDACKKLGVSQERLCLPHHILEERGLVKVGVTVQALLEL.....

//
                                                     
   0  (  693)    PPTSALRSRDLIGFCLVHILFIVLVYITYHWNALSA
   1  (  693)    PPTSALRSRDLIGFCLVHILFIVLVYITYHWNALSA
   2  (    -)    ....................................
   3  (  728)    PPTSALRSRDLIGFCLVHILFIVLVYITYHWNA...
   4  (    -)    ....................................
   5  (    -)    ....................................

//
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com