Multiple alignment for pF1KA0291
Check alignment(s).
#  0    Query: pF1KA0291, 1011 aa
#  1    CCDS5570.1 CLIP2 gene_id:7461|Hs108|chr7    (1011 aa)
#  2    CCDS5569.1 CLIP2 gene_id:7461|Hs108|chr7    (1046 aa)
#  3    CCDS9233.1 CLIP1 gene_id:6249|Hs108|chr12    (1392 aa)
#  4    CCDS58285.1 CLIP1 gene_id:6249|Hs108|chr12    (1438 aa)
#  5    CCDS9232.1 CLIP1 gene_id:6249|Hs108|chr12    (1427 aa)

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        exp       sw-scr    id%      from      to
   1    1.8e-185    6446   99.9         1    1011
   2    9.8e-100    6346   96.5         4    1046
   3    2.7e-54     2578   43.7         3    1037
   4    1.8e-40     2426   42.8         3    1018
   5    3e-40       2448   43.3         3    1007

//
                                                                             
   0  (    1)    MQKPSGLKPPGRGGKHSSPMGRTSTGSASSSAAVAASSKEGSPLHKQSSGPSSSPAAAAA
   1  (    1)    MQKPSGLKPPGRGGKHSSPMGRTSTGSASSSAAVAASSKEGSPLHKQSSGPSSSPAAAAA
   2  (    4)    ...PSGLKPPGRGGKHSSPMGRTSTGSASSSAAVAASSKEGSPLHKQSSGPSSSPAAAAA
   3  (    3)    MLKPSGLKAPTKILKPGSTALKTPT------AVVAPVEKTISS-EKASSTPSS-------
   4  (    3)    MLKPSGLKAPTKILKPGSTALKTPT------AVVAPVEKTISS-EKASSTPSS-------
   5  (    3)    MLKPSGLKAPTKILKPGSTALKTPT------AVVAPVEKTISS-EKASSTPSS-------

//
                                                                             
   0  (   61)    PEKPGPKAAEVGDDFLGDFVVGERVWVNGVKPGVVQYLGETQFAPGQWAGVVLDDPVGKN
   1  (   61)    PEKPGPKAAEVGDDFLGDFVVGERVWVNGVKPGVVQYLGETQFAPGQWAGVVLDDPVGKN
   2  (   61)    PEKPGPKAAEVGDDFLGDFVVGERVWVNGVKPGVVQYLGETQFAPGQWAGVVLDDPVGKN
   3  (   49)    ---------ETQEEFVDDFRVGERVWVNGNKPGFIQFLGETQFAPGQWAGIVLDEPIGKN
   4  (   49)    ---------ETQEEFVDDFRVGERVWVNGNKPGFIQFLGETQFAPGQWAGIVLDEPIGKN
   5  (   49)    ---------ETQEEFVDDFRVGERVWVNGNKPGFIQFLGETQFAPGQWAGIVLDEPIGKN

//
                                                                             
   0  (  121)    DGAVGGVRYFECPALQGIFTRPSKLTRQPTAEGSGSDAHSVESLTAQN---LSLHSGTAT
   1  (  121)    DGAVGGVRYFECPALQGIFTRPSKLTRQPTAEGSGSDAHSVESLTAQN---LSLHSGTAT
   2  (  121)    DGAVGGVRYFECPALQGIFTRPSKLTRQPTAEGSGSDAHSVESLTAQN---LSLHSGTAT
   3  (  100)    DGSVAGVRYFQCEPLKGIFTRPSKLTRKVQAEDEANGLQTTPASRATSPLCTSTASMVSS
   4  (  100)    DGSVAGVRYFQCEPLKGIFTRPSKLTRKVQAEDEANGLQTTPASRATSPLCTSTASMVSS
   5  (  100)    DGSVAGVRYFQCEPLKGIFTRPSKLTRKVQAEDEANGLQTTPASRATSPLCTSTASMVSS

//
                                                                             
   0  (  178)    PPLTSRVIPLRESV-----------LNSSVKTGNESGSNLSDSGSVKRGEKDLRLGDRVL
   1  (  178)    PPLTSRVIPLRESV-----------LNSSVKTGNESGSNLSDSGSVKRGEKDLRLGDRVL
   2  (  178)    PPLTSRVIPLRESV-----------LNSSVKTGNESGSNLSDSGSVKRGEKDLRLGDRVL
   3  (  160)    SPSTPSNIPQKPSQPAAKEPSATPPISNLTKTASESISNLSEAGSIKKGERELKIGDRVL
   4  (  160)    SPSTPSNIPQKPSQPAAKEPSATPPISNLTKTASESISNLSEAGSIKKGERELKIGDRVL
   5  (  160)    SPSTPSNIPQKPSQPAAKEPSATPPISNLTKTASESISNLSEAGSIKKGERELKIGDRVL

//
                                                                             
   0  (  227)    VGGTKTGVVRYVGETDFAKGEWCGVELDEPLGKNDGAVAGTRYFQCPPKFGLFAPIHKVI
   1  (  227)    VGGTKTGVVRYVGETDFAKGEWCGVELDEPLGKNDGAVAGTRYFQCPPKFGLFAPIHKVI
   2  (  227)    VGGTKTGVVRYVGETDFAKGEWCGVELDEPLGKNDGAVAGTRYFQCPPKFGLFAPIHKVI
   3  (  220)    VGGTKAGVVRFLGETDFAKGEWCGVELDEPLGKNDGAVAGTRYFQCQPKYGLFAPVHKVT
   4  (  220)    VGGTKAGVVRFLGETDFAKGEWCGVELDEPLGKNDGAVAGTRYFQCQPKYGLFAPVHKVT
   5  (  220)    VGGTKAGVVRFLGETDFAKGEWCGVELDEPLGKNDGAVAGTRYFQCQPKYGLFAPVHKVT

//
                                                                             
   0  (  287)    RIGFPSTSPAKAKKT--KR-MAMGVSALTHSPSSSSISSVSSVASSVGGRPSRSGLLTET
   1  (  287)    RIGFPSTSPAKAKKT--KR-MAMGVSALTHSPSSSSISSVSSVASSVGGRPSRSGLLTET
   2  (  287)    RIGFPSTSPAKAKKT--KR-MAMGVSALTHSPSSSSISSVSSVASSVGGRPSRSGLLTET
   3  (  280)    KIGFPSTTPAKAKANAVRRVMATTSASLKRSPSASSLSSMSSVASSVSSRPSRTGLLTET
   4  (  280)    KIGFPSTTPAKAKANAVRRVMATTSASLKRSPSASSLSSMSSVASSVSSRPSRTGLLTET
   5  (  280)    KIGFPSTTPAKAKANAVRRVMATTSASLKRSPSASSLSSMSSVASSVSSRPSRTGLLTET

//
                                                                             
   0  (  344)    SSRYARKISGTTALQEALKEKQQHIEQLLAERDLERAEVAKATSHICEVEKEIALLKAQH
   1  (  344)    SSRYARKISGTTALQEALKEKQQHIEQLLAERDLERAEVAKATSHICEVEKEIALLKAQH
   2  (  344)    SSRYARKISGTTALQEALKEKQQHIEQLLAERDLERAEVAKATSHICEVEKEIALLKAQH
   3  (  340)    SSRYARKISGTTALQEALKEKQQHIEQLLAERDLERAEVAKATSHVGEIEQELALARDGH
   4  (  340)    SSRYARKISGTTALQEALKEKQQHIEQLLAERDLERAEVAKATSHVGEIEQELALARDGH
   5  (  340)    SSRYARKISGTTALQEALKEKQQHIEQLLAERDLERAEVAKATSHVGEIEQELALARDGH

//
                                                                             
   0  (  404)    EQYVAEAEEKLQRARLLVESVRKEKVDLSNQLEEERRKVEDLQFRVEEESITKGDLE---
   1  (  404)    EQYVAEAEEKLQRARLLVESVRKEKVDLSNQLEEERRKVEDLQFRVEEESITKGDLE---
   2  (  404)    EQYVAEAEEKLQRARLLVESVRKEKVDLSNQLEEERRKVEDLQFRVEEESITKGDLETQT
   3  (  400)    DQHVLELEAKMDQLRTMVEAADREKVELLNQLEEEKRKVEDLQFRVEEESITKGDLE---
   4  (  400)    DQHVLELEAKMDQLRTMVEAADREKVELLNQLEEEKRKVEDLQFRVEEESITKGDLEQKS
   5  (  400)    DQHVLELEAKMDQLRTMVEAADREKVELLNQLEEEKRKVEDLQFRVEEESITKGDLETQT

//
                                                                             
   0  (  461)    -------------------------------------------LTTVAEKSRVLQLEEEL
   1  (  461)    -------------------------------------------LTTVAEKSRVLQLEEEL
   2  (  464)    QLEHARIGELEQSLLLEKAQAERLLRELADNR-----------LTTVAEKSRVLQLEEEL
   3  (  457)    -------------------------------------------VATVSEKSRIMELEKDL
   4  (  460)    QISEDPENTQTKLEHARIKELEQSLLFEKTKADKLQRELEDTRVATVSEKSRIMELEKDL
   5  (  460)    KLEHARIKELEQSLLFEKTKADKLQRELEDTR-----------VATVSEKSRIMELEKDL

//
                                                                             
   0  (  478)    TLRRGEIEELQQCLLHSGPPPPDHPDAA-----EILRLRERLLSASKEHQRESGVLRDKY
   1  (  478)    TLRRGEIEELQQCLLHSGPPPPDHPDAA-----EILRLRERLLSASKEHQRESGVLRDKY
   2  (  513)    TLRRGEIEELQQCLLHSGPPPPDHPDAA-----EILRLRERLLSASKEHQRESGVLRDKY
   3  (  474)    ALRVQEVAELRR-RLESNKPAGD-VDMSLSLLQEISSLQEKLEVTRTDHQREITSLKEHF
   4  (  520)    ALRVQEVAELRR-RLESNKPAGD-VDMSLSLLQEISSLQEKLEVTRTDHQREITSLKEHF
   5  (  509)    ALRVQEVAELRR-RLESNKPAGD-VDMSLSLLQEISSLQEKLEVTRTDHQREITSLKEHF

//
                                                                             
   0  (  533)    EKALKAYQAEVDKLRAANEKYAQEVAGLKDKVQQATSENMGLMDNWKSKLDSLASDHQKS
   1  (  533)    EKALKAYQAEVDKLRAANEKYAQEVAGLKDKVQQATSENMGLMDNWKSKLDSLASDHQKS
   2  (  568)    EKALKAYQAEVDKLRAANEKYAQEVAGLKDKVQQATSENMGLMDNWKSKLDSLASDHQKS
   3  (  532)    GAREETHQKEIKALYTATEKLSKENESLKSKLEHANKENSDVIALWKSKLETAIASHQQA
   4  (  578)    GAREETHQKEIKALYTATEKLSKENESLKSKLEHANKENSDVIALWKSKLETAIASHQQA
   5  (  567)    GAREETHQKEIKALYTATEKLSKENESLKSKLEHANKENSDVIALWKSKLETAIASHQQA

//
                                                                             
   0  (  593)    LEDLKATLNSGPGAQQKEIGELKAVMEGIKMEHQLELGNLQAKHDLETAMHVKEKEALRE
   1  (  593)    LEDLKATLNSGPGAQQKEIGELKAVMEGIKMEHQLELGNLQAKHDLETAMHVKEKEALRE
   2  (  628)    LEDLKATLNSGPGAQQKEIGELKAVMEGIKMEHQLELGNLQAKHDLETAMHVKEKEALRE
   3  (  592)    MEELKVSFSKGLGTETAEFAELKTQIEKMRLDYQHEIENLQNQQDSERAAHAKEMEALRA
   4  (  638)    MEELKVSFSKGLGTETAEFAELKTQIEKMRLDYQHEIENLQNQQDSERAAHAKEMEALRA
   5  (  627)    MEELKVSFSKGLGTETAEFAELKTQIEKMRLDYQHEIENLQNQQDSERAAHAKEMEALRA

//
                                                                             
   0  (  653)    KLQEAQEELAGLQRHWRAQLEVQASQHRLELQEAQDQRRDAELRVHELEKLDVEYRGQAQ
   1  (  653)    KLQEAQEELAGLQRHWRAQLEVQASQHRLELQEAQDQRRDAELRVHELEKLDVEYRGQAQ
   2  (  688)    KLQEAQEELAGLQRHWRAQLEVQASQHRLELQEAQDQRRDAELRVHELEKLDVEYRGQAQ
   3  (  652)    KLMKVIKEKENSLEAIRSKLDKAEDQHLVEMEDTLNKLQEAEIKVKELEVLQAKCNEQTK
   4  (  698)    KLMKVIKEKENSLEAIRSKLDKAEDQHLVEMEDTLNKLQEAEIKVKELEVLQAKCNEQTK
   5  (  687)    KLMKVIKEKENSLEAIRSKLDKAEDQHLVEMEDTLNKLQEAEIKVKELEVLQAKCNEQTK

//
                                                                             
   0  (  713)    AIEFLKEQISLAEKKMLDYERLQRAEAQGKQEVESLREKLLVAENRLQAVE----ALCS-
   1  (  713)    AIEFLKEQISLAEKKMLDYERLQRAEAQGKQEVESLREKLLVAENRLQAVE----ALCS-
   2  (  748)    AIEFLKEQISLAEKKMLDYERLQRAEAQGKQEVESLREKLLVAENRLQAVE----ALCS-
   3  (  712)    VIDNFTSQLKATEEKLLDLDALRKASSEGKSEMKKLRQQLEAAEKQIKHLEIEKNAESSK
   4  (  758)    VIDNFTSQLKATEEKLLDLDALRKASSEGKSEMKKLRQQLEAAEKQIKHLEIEKNAESSK
   5  (  747)    VIDNFTSQLKATEEKLLDLDALRKASSEGKSEMKKLRQQLEAAEKQIKHLEIEKNAESSK

//
                                                                             
   0  (  768)    -------------------------SQHTHMIESN---------DISEETIRTKETVEGL
   1  (  768)    -------------------------SQHTHMIESN---------DISEETIRTKETVEGL
   2  (  803)    -------------------------SQHTHMIESN---------DISEETIRTKETVEGL
   3  (  772)    ASSITRELQGRELKLTNLQENLSEVSQVKETLEKELQILKEKFAEASEEAVSVQRSMQET
   4  (  818)    ASSITRELQGRELKLTNLQENLSEVSQVKETLEKELQILKEKFAEASEEAVSVQRSMQET
   5  (  807)    ASSITRELQGRELKLTNLQENLSEVSQVKETLEKELQILKEKFAEASEEAVSVQRSMQET

//
                                                                             
   0  (  794)    QDKLNKRDKEVTALTSQTEMLRAQVSALESKCKSGEKKVDALLKEKRRLEAELETVSRKT
   1  (  794)    QDKLNKRDKEVTALTSQTEMLRAQVSALESKCKSGEKKVDALLKEKRRLEAELETVSRKT
   2  (  829)    QDKLNKRDKEVTALTSQTEMLRAQVSALESKCKSGEKKVDALLKEKRRLEAELETVSRKT
   3  (  832)    VNKLHQKEEQFNMLSSDLEKLRENLADMEAKFREKDEREEQLIKAKEKLENDIAEIMKMS
   4  (  878)    VNKLHQKEEQFNMLSSDLEKLRENLADMEAKFREKDEREEQLIKAKEKLENDIAEIMKMS
   5  (  867)    VNKLHQKEEQFNMLSSDLEKLRENLADMEAKFREKDEREEQLIKAKEKLENDIAEIMKMS

//
                                                                             
   0  (  854)    HDASGQLVLISQELLRKERSLNELRVLLLEANRHSPGPERDLSREVHKAEWRIKE--QKL
   1  (  854)    HDASGQLVLISQELLRKERSLNELRVLLLEANRHSPGPERDLSREVHKAEWRIKE--QKL
   2  (  889)    HDASGQLVLISQELLRKERSLNELRVLLLEANRHSPGPERDLSREVHKAEWRIKE--QKL
   3  (  892)    GDNSSQLTKMNDELRLKERDVEELQLKLTKANENASFLQKSIEDMTVKAEQSQQEAAKKH
   4  (  938)    GDNSSQLTKMNDELRLKERDVEELQLKLTKANENASFLQKSIEDMTVKAEQSQQEAAKKH
   5  (  927)    GDNSSQLTKMNDELRLKERDVEELQLKLTKANENASFLQKSIEDMTVKAEQSQQEAAKKH

//
                                                     *                       
   0  (  912)    KDDIRGLREKLTGLDKEKSLSDQR------RYSLIDPSSAP---ELLR-LQHQLMSTEDA
   1  (  912)    KDDIRGLREKLTGLDKEKSLSDQR------RYSLIDRSSAP---ELLR-LQHQLMSTEDA
   2  (  947)    KDDIRGLREKLTGLDKEKSLSDQR------RYSLIDRSSAP---ELLR-LQHQLMSTEDA
   3  (  952)    EEEKKELERKLSDLEKKMETSHNQCQELKARYERATSETKTKHEEILQNLQKTLLDTEDK
   4  (  998)    EEEKKELERKLSDLEKKMETS.......................................
   5  (  987)    EEEKKELERKLSDLEKKMETS.......................................

//
                                                                   
   0  (  962)    LRDALDQAQQVEKLMEAMRSCPDKAQTIGNSGSANGIHQQDKAQKQEDKH
   1  (  962)    LRDALDQAQQVEKLMEAMRSCPDKAQTIGNSGSANGIHQQDKAQKQEDKH
   2  (  997)    LRDALDQAQQVEKLMEAMRSCPDKAQTIGNSGSANGIHQQDKAQKQEDKH
   3  ( 1012)    LKGAREENSGLLQELEELRKQADKAK........................
   4  (    -)    ..................................................
   5  (    -)    ..................................................

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