# 0 Query: pF1KSDB0234, 1203 aa
# 1 CCDS9443.1 PCDH9 gene_id:5101|Hs108|chr13 (1203 aa)
# 2 CCDS81770.1 PCDH9 gene_id:5101|Hs108|chr13 (1195 aa)
# 3 CCDS9444.1 PCDH9 gene_id:5101|Hs108|chr13 (1237 aa)
# 4 CCDS81769.1 PCDH9 gene_id:5101|Hs108|chr13 (1032 aa)
# 5 CCDS76066.1 PCDH11Y gene_id:83259|Hs108|chrY (1340 aa)
//
exp sw-scr id% from to
1 0 7902 100.0 1 1203
2 0 7589 97.0 1 1195
3 0 7812 97.2 1 1235
4 0 6543 100.0 1 1012
5 0 4356 58.0 36 1151
//
0 ( 1) MDLRDFYLLAALIACLRLDSAIAQELIYTIREELPENVPIGNIPKDLNISHINAATGTSA
1 ( 1) MDLRDFYLLAALIACLRLDSAIAQELIYTIREELPENVPIGNIPKDLNISHINAATGTSA
2 ( 1) MDLRDFYLLAALIACLRLDSAIAQELIYTIREELPENVPIGNIPKDLNISHINAATGTSA
3 ( 1) MDLRDFYLLAALIACLRLDSAIAQELIYTIREELPENVPIGNIPKDLNISHINAATGTSA
4 ( 1) MDLRDFYLLAALIACLRLDSAIAQELIYTIREELPENVPIGNIPKDLNISHINAATGTSA
5 ( 36) ..LSGTYIFAVLLVCVVFHSG-AQEKNYTIREEIPENVLIGNLLKDLNLSLIPNKSLTT-
//
0 ( 61) SLVYRLVSKAGDAPLVKVSSSTGEIFTTSNRIDREKLCAGASYAEENECFFELEVVILPN
1 ( 61) SLVYRLVSKAGDAPLVKVSSSTGEIFTTSNRIDREKLCAGASYAEENECFFELEVVILPN
2 ( 61) SLVYRLVSKAGDAPLVKVSSSTGEIFTTSNRIDREKLCAGASYAEENECFFELEVVILPN
3 ( 61) SLVYRLVSKAGDAPLVKVSSSTGEIFTTSNRIDREKLCAGASYAEENECFFELEVVILPN
4 ( 61) SLVYRLVSKAGDAPLVKVSSSTGEIFTTSNRIDREKLCAGASYAEENECFFELEVVILPN
5 ( 92) TMQFKLVYKTGDVPLIRIEEDTGEIFTTGARIDREKLCAGIPRDEH--CFYEVEVAILPD
//
0 ( 121) DFFRLIKIKIIVKDTNDNAPMFPSPVINISIPENTLINSRFPIPSATDPDTGFNGVQHYE
1 ( 121) DFFRLIKIKIIVKDTNDNAPMFPSPVINISIPENTLINSRFPIPSATDPDTGFNGVQHYE
2 ( 121) DFFRLIKIKIIVKDTNDNAPMFPSPVINISIPENTLINSRFPIPSATDPDTGFNGVQHYE
3 ( 121) DFFRLIKIKIIVKDTNDNAPMFPSPVINISIPENTLINSRFPIPSATDPDTGFNGVQHYE
4 ( 121) DFFRLIKIKIIVKDTNDNAPMFPSPVINISIPENTLINSRFPIPSATDPDTGFNGVQHYE
5 ( 150) EIFRLVKIRFLIEDINDNAPLFPATVINISIPENSAINSKYTLPAAVDPDVGINGVQNYE
//
0 ( 181) LLNGQSVFGLDIVETPEGEKWPQLIVQQNLDREQKDTYVMKIKVEDGGTPQKSSTAILQV
1 ( 181) LLNGQSVFGLDIVETPEGEKWPQLIVQQNLDREQKDTYVMKIKVEDGGTPQKSSTAILQV
2 ( 181) LLNGQSVFGLDIVETPEGEKWPQLIVQQNLDREQKDTYVMKIKVEDGGTPQKSSTAILQV
3 ( 181) LLNGQSVFGLDIVETPEGEKWPQLIVQQNLDREQKDTYVMKIKVEDGGTPQKSSTAILQV
4 ( 181) LLNGQSVFGLDIVETPEGEKWPQLIVQQNLDREQKDTYVMKIKVEDGGTPQKSSTAILQV
5 ( 210) LIKSQNIFGLDVIETPEGDKMPQLIVQKELDREEKDTYVMKVKVEDGGFPQRSSTAILQV
//
0 ( 241) TVSDVNDNRPVFKEGQVEVHIPENAPVGTSVIQLHATDADIGSNAEIRYIFGAQVAPATK
1 ( 241) TVSDVNDNRPVFKEGQVEVHIPENAPVGTSVIQLHATDADIGSNAEIRYIFGAQVAPATK
2 ( 241) TVSDVNDNRPVFKEGQVEVHIPENAPVGTSVIQLHATDADIGSNAEIRYIFGAQVAPATK
3 ( 241) TVSDVNDNRPVFKEGQVEVHIPENAPVGTSVIQLHATDADIGSNAEIRYIFGAQVAPATK
4 ( 241) TVSDVNDNRPVFKEGQVEVHIPENAPVGTSVIQLHATDADIGSNAEIRYIFGAQVAPATK
5 ( 270) SVTDTNDNHPVFKETEIEVSIPENAPVGTSVTQLHATDADIGENAKIHFSFSNLVSNIAR
//
0 ( 301) RLFALNNTTGLITVQRSLDREETAIHKVTVLASDGSSTPARATVTINVTDVNDNPPNIDL
1 ( 301) RLFALNNTTGLITVQRSLDREETAIHKVTVLASDGSSTPARATVTINVTDVNDNPPNIDL
2 ( 301) RLFALNNTTGLITVQRSLDREETAIHKVTVLASDGSSTPARATVTINVTDVNDNPPNIDL
3 ( 301) RLFALNNTTGLITVQRSLDREETAIHKVTVLASDGSSTPARATVTINVTDVNDNPPNIDL
4 ( 301) RLFALNNTTGLITVQRSLDREETAIHKVTVLASDGSSTPARATVTINVTDVNDNPPNIDL
5 ( 330) RLFHLNATTGLITIKEPLDREETPNHKLLVLASDGGLMPARAMVLVNVTDVNDNVPSIDI
//
0 ( 361) RYIISPINGTVYLSEKDPVNTKIALITVSDKDTDVNGKVICFIEREVPFHLKAVYDNQYL
1 ( 361) RYIISPINGTVYLSEKDPVNTKIALITVSDKDTDVNGKVICFIEREVPFHLKAVYDNQYL
2 ( 361) RYIISPINGTVYLSEKDPVNTKIALITVSDKDTDVNGKVICFIEREVPFHLKAVYDNQYL
3 ( 361) RYIISPINGTVYLSEKDPVNTKIALITVSDKDTDVNGKVICFIEREVPFHLKAVYDNQYL
4 ( 361) RYIISPINGTVYLSEKDPVNTKIALITVSDKDTDVNGKVICFIEREVPFHLKAVYDNQYL
5 ( 390) RYIVNPVNDTVVLSENIPLNTKIALITVTDKDADHNGRVTCFTDHEIPFRLRPVFSNQFL
//
0 ( 421) LETSSLLDYEGTKEFSFKIVASDSGKPSLNQTALVRVKLEDENDNPPIFNQPVIELSVSE
1 ( 421) LETSSLLDYEGTKEFSFKIVASDSGKPSLNQTALVRVKLEDENDNPPIFNQPVIELSVSE
2 ( 421) LETSSLLDYEGTKEFSFKIVASDSGKPSLNQTALVRVKLEDENDNPPIFNQPVIELSVSE
3 ( 421) LETSSLLDYEGTKEFSFKIVASDSGKPSLNQTALVRVKLEDENDNPPIFNQPVIELSVSE
4 ( 421) LETSSLLDYEGTKEFSFKIVASDSGKPSLNQTALVRVKLEDENDNPPIFNQPVIELSVSE
5 ( 450) LENAAYLDYESTKEYAIKLLAADAGKPPLNQSAMLFIKVKDENDNAPVFTQSFVTVSIPE
//
0 ( 481) NNRRGLYLTTISATDEDSGKNADIVYQLGPNAS-FFDLDRKTGVLTASRVFDREEQERFI
1 ( 481) NNRRGLYLTTISATDEDSGKNADIVYQLGPNAS-FFDLDRKTGVLTASRVFDREEQERFI
2 ( 481) NNRRGLYLTTISATDEDSGKNADIVYQLGPNAS-FFDLDRKTGVLTASRVFDREEQERFI
3 ( 481) NNRRGLYLTTISATDEDSGKNADIVYQLGPNAS-FFDLDRKTGVLTASRVFDREEQERFI
4 ( 481) NNRRGLYLTTISATDEDSGKNADIVYQLGPNAS-FFDLDRKTGVLTASRVFDREEQERFI
5 ( 510) NNSPGIQLMKVSATDADSGPNAEINYLLGPDAPPEFSLDRRTGMLTVVKKLDREKEDKYL
//
0 ( 540) FTVTARDNGTPPLQSQAAVIVTVLDENDNSPKFTHNHFQFFVSENLPKYSTVGVITVTDA
1 ( 540) FTVTARDNGTPPLQSQAAVIVTVLDENDNSPKFTHNHFQFFVSENLPKYSTVGVITVTDA
2 ( 540) FTVTARDNGTPPLQSQAAVIVTVLDENDNSPKFTHNHFQFFVSENLPKYSTVGVITVTDA
3 ( 540) FTVTARDNGTPPLQSQAAVIVTVLDENDNSPKFTHNHFQFFVSENLPKYSTVGVITVTDA
4 ( 540) FTVTARDNGTPPLQSQAAVIVTVLDENDNSPKFTHNHFQFFVSENLPKYSTVGVITVTDA
5 ( 570) FTILAKDNGVPPLTSNVTVFVSIIDQNDNSPVFTHNEYKFYVPENLPRHGTVGLITVTDP
//
0 ( 600) DAGENKAVTLSILNDNDNFVLDPYSGVIKSNVSFDREQQSSYTFDVKATDGGQPPRSSTA
1 ( 600) DAGENKAVTLSILNDNDNFVLDPYSGVIKSNVSFDREQQSSYTFDVKATDGGQPPRSSTA
2 ( 600) DAGENKAVTLSILNDNDNFVLDPYSGVIKSNVSFDREQQSSYTFDVKATDGGQPPRSSTA
3 ( 600) DAGENKAVTLSILNDNDNFVLDPYSGVIKSNVSFDREQQSSYTFDVKATDGGQPPRSSTA
4 ( 600) DAGENKAVTLSILNDNDNFVLDPYSGVIKSNVSFDREQQSSYTFDVKATDGGQPPRSSTA
5 ( 630) DYGDNSAVTLSILDENDDFTIDSQTGVIRPNISFDREKQESYTFYVKAEDGGRVSRSSSA
//
0 ( 660) KVTINVMDVNDNSPVVISPPSNTSFKLVPLSAIPGSVVAEVFAVDVDTGMNAELKYTIVS
1 ( 660) KVTINVMDVNDNSPVVISPPSNTSFKLVPLSAIPGSVVAEVFAVDVDTGMNAELKYTIVS
2 ( 660) KVTINVMDVNDNSPVVISPPSNTSFKLVPLSAIPGSVVAEVFAVDVDTGMNAELKYTIVS
3 ( 660) KVTINVMDVNDNSPVVISPPSNTSFKLVPLSAIPGSVVAEVFAVDVDTGMNAELKYTIVS
4 ( 660) KVTINVMDVNDNSPVVISPPSNTSFKLVPLSAIPGSVVAEVFAVDVDTGMNAELKYTIVS
5 ( 690) KVTINVVDVNDNKPVFIVPPYNYSYELVLPSTNPGTVVFQVIAVDNDTGMNAEVRYSIVG
//
0 ( 720) GNNKGLFRIDPVTGNITLEEKPAPTDVGLHRLVVNISDLGYPKSLHTLVLVFLYVNDTAG
1 ( 720) GNNKGLFRIDPVTGNITLEEKPAPTDVGLHRLVVNISDLGYPKSLHTLVLVFLYVNDTAG
2 ( 720) GNNKGLFRIDPVTGNITLEEKPAPTDVGLHRLVVNISDLGYPKSLHTLVLVFLYVNDTAG
3 ( 720) GNNKGLFRIDPVTGNITLEEKPAPTDVGLHRLVVNISDLGYPKSLHTLVLVFLYVNDTAG
4 ( 720) GNNKGLFRIDPVTGNITLEEKPAPTDVGLHRLVVNISDLGYPKSLHTLVLVFLYVNDTAG
5 ( 750) GNTRDLFAIDQETGNITLMEKCDVTDLGLHRVLVKANDLGQPDSLFSVVIVNLFVNESVT
//
0 ( 780) NASYIYDLIRRTMETPLDRN--IGDSSQPYQNEDYLTIMIAIIAGAMVVIVVIFVTVLVR
1 ( 780) NASYIYDLIRRTMETPLDRN--IGDSSQPYQNEDYLTIMIAIIAGAMVVIVVIFVTVLVR
2 ( 780) NASYIYDLIRRTMETPLDRN--IGDSSQPYQNEDYLTIMIAIIAGAMVVIVVIFVTVLVR
3 ( 780) NASYIYDLIRRTMETPLDRN--IGDSSQPYQNEDYLTIMIAIIAGAMVVIVVIFVTVLVR
4 ( 780) NASYIYDLIRRTMETPLDRN--IGDSSQPYQNEDYLTIMIAIIAGAMVVIVVIFVTVLVR
5 ( 810) NATLINELVRKSIEAPVTPNTEIADVSSP--TSDYVKILVAAVAGTITVVVVIFITAVVR
//
0 ( 838) CRHASRFKAAQRSKQGAEWMSPNQENKQN---KKKKRKKRKSPKSSLLNFVTIEESKPDD
1 ( 838) CRHASRFKAAQRSKQGAEWMSPNQENKQN---KKKKRKKRKSPKSSLLNFVTIEESKPDD
2 ( 838) CRHASRFKAAQRSKQGAEWMSPNQENKQN---KKKKRKKRKSPKSSLLNFVTIEESKPDD
3 ( 838) CRHASRFKAAQRSKQGAEWMSPNQENKQN---KKKKRKKRKSPKSSLLNFVTIEESKPDD
4 ( 838) CRHASRFKAAQRSKQGAEWMSPNQENKQN---KKKKRKKRKSPKSSLLNFVTIEESKPDD
5 ( 868) CRQAPHLKAAQKNMQNSEWATPNPENRQMIMMKKKKKKKKHSPKNLLLNVVTIEETKADD
//
0 ( 895) AVHEPINGTISLPAELEEQSIGRFDWGPAPPTTFKPNSPDLAKHYKSASPQPAFHLKPDT
1 ( 895) AVHEPINGTISLPAELEEQSIGRFDWGPAPPTTFKPNSPDLAKHYKSASPQPAFHLKPDT
2 ( 895) AVHEPINGTISLPAELEEQSIGRFDWGPAPPTTFKPNSPDLAKHYKSASPQPAFHLKPDT
3 ( 895) AVHEPINGTISLPAELEEQSIGRFDWGPAPPTTFKPNSPDLAKHYKSASPQPAFHLKPDT
4 ( 895) AVHEPINGTISLPAELEEQSIGRFDWGPAPPTTFKPNSPDLAKHYKSASPQPAFHLKPDT
5 ( 928) VDSDGNRVTLDLPIDLEEQTMGKYNW-VTTPTTFKPDSPDLARHYKSASPQPAFQIQPET
//
0 ( 955) PVSVKKHHVIQELPLDNTFVGGCDTLSKRSSTSSDHFSASECSSQ-GGFKTKGPLHTRQ-
1 ( 955) PVSVKKHHVIQELPLDNTFVGGCDTLSKRSSTSSDHFSASECSSQ-GGFKTKGPLHTRQ-
2 ( 955) PVSVKKHHVIQELPLDNTFVGGCDTLSKRSSTSSDHFSASECSSQ-GGFKTKGPLHTRQC
3 ( 955) PVSVKKHHVIQELPLDNTFVGGCDTLSKRSSTSSDHFSASECSSQ-GGFKTKGPLHTRQC
4 ( 955) PVSVKKHHVIQELPLDNTFVGGCDTLSKRSSTSSDHFSASECSSQ-GGFKTKGPLHTRQ.
5 ( 987) PLNLK-HHIIQELPLDNTFVA-CDSISNCSSSSSDPYSVSDCGYPVTTFEVPVSVHTRP-
//
0 ( 1013) ---------------------------------SQRRVTFHLPDGSQESCSDSGLGDHEP
1 ( 1013) ---------------------------------SQRRVTFHLPDGSQESCSDSGLGDHEP
2 ( 1014) ---------------------------------NSHSKSDNIPVTPQKCPSSTGFHIQE-
3 ( 1014) NSHSKSDNIPVTPQKCPSSTGFHIQENEESHYESQRRVTFHLPDGSQESCSDSGLGDHEP
4 ( -) ............................................................
5 ( 1044) ---------------------------------SQRRVTFHLPEGSQESSSDGGLGDHD-
//
0 ( 1040) VGSGTLISHPLPLVQPQDEFYDQASPDKRTEADGNSDPNSDGPLGPRG-------LAEAT
1 ( 1040) VGSGTLISHPLPLVQPQDEFYDQASPDKRTEADGNSDPNSDGPLGPRG-------LAEAT
2 ( 1040) ----NEESH----YEPQDEFYDQASPDKRTEADGNSDPNSDGPLGPRG-------LAEAT
3 ( 1074) VGSGTLISHPLPLVQPQDEFYDQASPDKRTEADGNSDPNSDGPLGPRG-------LAEAT
4 ( -) ............................................................
5 ( 1070) AGSLTSTSHGLPLGYPQEEYFDRATPSNRTEGDGNSDPESTFIPGLKKEITVQPTVEEAS
//
0 ( 1093) EMCTQECLVLGHSDNCWMPPGLGPYQHPKSPLSTFAPQKEWVKKDKLVNGHTLTRAWKED
1 ( 1093) EMCTQECLVLGHSDNCWMPPGLGPYQHPKSPLSTFAPQKEWVKKDKLVNGHTLTRAWKED
2 ( 1085) EMCTQECLVLGHSDNCWMPPGLGPYQHPKSPLSTFAPQKEWVKKDKLVNGHTLTRAWKED
3 ( 1127) EMCTQECLVLGHSDNCWMPPGLGPYQHPKSPLSTFAPQKEWVKKDKLVNGHTLTRAWKED
4 ( -) ............................................................
5 ( 1130) DNCTQECLIYGHSDACWMPASL......................................
//
0 ( 1153) SNRNQFNDRKQYGSNEGHFNNGSHMTDIPLANLKSYKQAGGATESPKEHQL
1 ( 1153) SNRNQFNDRKQYGSNEGHFNNGSHMTDIPLANLKSYKQAGGATESPKEHQL
2 ( 1145) SNRNQFNDRKQYGSNEGHFNNGSHMTDIPLANLKSYKQAGGATESPKEHQL
3 ( 1187) SNRNQFNDRKQYGSNEGHFNNGSHMTDIPLANLKSYKQAGGATESPKEH..
4 ( -) ...................................................
5 ( -) ...................................................
//
