Multiple alignment for pF1KE3637
Check alignment(s).
#  0    Query: pF1KE3637, 518 aa
#  1    CCDS1004.1 RORC gene_id:6097|Hs108|chr1    (518 aa)
#  2    CCDS30856.1 RORC gene_id:6097|Hs108|chr1    (497 aa)
#  3    CCDS45271.1 RORA gene_id:6095|Hs108|chr15    (468 aa)
#  4    CCDS10177.1 RORA gene_id:6095|Hs108|chr15    (523 aa)
#  5    CCDS10178.1 RORA gene_id:6095|Hs108|chr15    (548 aa)

//
        exp       sw-scr    id%      from      to
   1    6.9e-156    3535  100.0         1     518
   2    6.6e-149    3382   99.8         3     497
   3    9.1e-38     1531   49.3         5     461
   4    9.9e-38     1578   49.5        43     516
   5    1e-37       1530   49.6        91     541

//
                                                                             
   0  (    1)    MDRAPQRQHR---ASRELLAAKKTHTSQIEVIPCKICGDKSSGIHYGVITCEGCKGFFRR
   1  (    1)    MDRAPQRQHR---ASRELLAAKKTHTSQIEVIPCKICGDKSSGIHYGVITCEGCKGFFRR
   2  (    3)    ..........................TQIEVIPCKICGDKSSGIHYGVITCEGCKGFFRR
   3  (    5)    .................VIAAMK---AQIEIIPCKICGDKSSGIHYGVITCEGCKGFFRR
   4  (   43)    ...APVRRQSYSSTSRGISVTKKTHTSQIEIIPCKICGDKSSGIHYGVITCEGCKGFFRR
   5  (   91)    ..........................AQIEIIPCKICGDKSSGIHYGVITCEGCKGFFRR

//
                                                                             
   0  (   58)    SQRCNAAYSCTRQQNCPIDRTSRNRCQHCRLQKCLALGMSRDAVKFGRMSKKQRDSLHAE
   1  (   58)    SQRCNAAYSCTRQQNCPIDRTSRNRCQHCRLQKCLALGMSRDAVKFGRMSKKQRDSLHAE
   2  (   37)    SQRCNAAYSCTRQQNCPIDRTSRNRCQHCRLQKCLALGMSRDAVKFGRMSKKQRDSLHAE
   3  (   45)    SQQSNATYSCPRQKNCLIDRTSRNRCQHCRLQKCLAVGMSRDAVKFGRMSKKQRDSLYAE
   4  (  100)    SQQSNATYSCPRQKNCLIDRTSRNRCQHCRLQKCLAVGMSRDAVKFGRMSKKQRDSLYAE
   5  (  125)    SQQSNATYSCPRQKNCLIDRTSRNRCQHCRLQKCLAVGMSRDAVKFGRMSKKQRDSLYAE

//
                                                                             
   0  (  118)    VQKQLQQRQQQQQEPVVKTPPAGAQGADTLTYTLGLPDGQLPLGSSPDLPEASACPPGLL
   1  (  118)    VQKQLQQRQQQQQEPVVKTPPAGAQGADTLTYTLGLPDGQLPLGSSPDLPEASACPPGLL
   2  (   97)    VQKQLQQRQQQQQEPVVKTPPAGAQGADTLTYTLGLPDGQLPLGSSPDLPEASACPPGLL
   3  (  105)    VQKHRMQQQQRDHQ-------------------------QQPGEAEPLTPTYNISANGLT
   4  (  160)    VQKHRMQQQQRDHQ-------------------------QQPGEAEPLTPTYNISANGLT
   5  (  185)    VQKHRMQQQQRDHQ-------------------------QQPGEAEPLTPTYNISANGLT

//
                                                                             
   0  (  178)    KASGSGPSYSNNLAKAGLNGASCHLEYSPERGKAEGRESFYSTGSQLTPDRCGLRFEEHR
   1  (  178)    KASGSGPSYSNNLAKAGLNGASCHLEYSPERGKAEGRESFYSTGSQLTPDRCGLRFEEHR
   2  (  157)    KASGSGPSYSNNLAKAGLNGASCHLEYSPERGKAEGRESFYSTGSQLTPDRCGLRFEEHR
   3  (  140)    ELHDDLSNY--------IDG------HTPEGSKADSAVSSFYLDIQPSPDQSGLDINGIK
   4  (  195)    ELHDDLSNY--------IDG------HTPEGSKADSAVSSFYLDIQPSPDQSGLDINGIK
   5  (  220)    ELHDDLSNY--------IDG------HTPEGSKADSAVSSFYLDIQPSPDQSGLDINGIK

//
                                                                             
   0  (  238)    HPGLGELGQGPDSYGSPSFRSTPEAPYASLTEIEHLVQSVCKSYRETCQLRLEDLLRQRS
   1  (  238)    HPGLGELGQGPDSYGSPSFRSTPEAPYASLTEIEHLVQSVCKSYRETCQLRLEDLLRQRS
   2  (  217)    HPGLGELGQGPDSYGSPSFRSTPEAPYASLTEIEHLVQSVCKSYRETCQLRLEDLLRQRS
   3  (  186)    PEPICDYTPASGFFPYCSFTNGETSPTVSMAELEHLAQNISKSHLETCQYLREELQQITW
   4  (  241)    PEPICDYTPASGFFPYCSFTNGETSPTVSMAELEHLAQNISKSHLETCQYLREELQQITW
   5  (  266)    PEPICDYTPASGFFPYCSFTNGETSPTVSMAELEHLAQNISKSHLETCQYLREELQQITW

//
                                                                             
   0  (  298)    NIFSREEVTGYQRKSMWEMWERCAHHLTEAIQYVVEFAKRLSGFMELCQNDQIVLLKAGA
   1  (  298)    NIFSREEVTGYQRKSMWEMWERCAHHLTEAIQYVVEFAKRLSGFMELCQNDQIVLLKAGA
   2  (  277)    NIFSREEVTGYQRKSMWEMWERCAHHLTEAIQYVVEFAKRLSGFMELCQNDQIVLLKAGA
   3  (  246)    QTFLQEEIENYQNKQREVMWQLCAIKITEAIQYVVEFAKRIDGFMELCQNDQIVLLKAGS
   4  (  301)    QTFLQEEIENYQNKQREVMWQLCAIKITEAIQYVVEFAKRIDGFMELCQNDQIVLLKAGS
   5  (  326)    QTFLQEEIENYQNKQREVMWQLCAIKITEAIQYVVEFAKRIDGFMELCQNDQIVLLKAGS

//
                                                                             
   0  (  358)    MEVVLVRMCRAYNADNRTVFFEGKYGGMELFRALGCSELISSIFDFSHSLSALHFSEDEI
   1  (  358)    MEVVLVRMCRAYNADNRTVFFEGKYGGMELFRALGCSELISSIFDFSHSLSALHFSEDEI
   2  (  337)    MEVVLVRMCRAYNADNRTVFFEGKYGGMELFRALGCSELISSIFDFSHSLSALHFSEDEI
   3  (  306)    LEVVFIRMCRAFDSQNNTVYFDGKYASPDVFKSLGCEDFISFVFEFGKSLCSMHLTEDEI
   4  (  361)    LEVVFIRMCRAFDSQNNTVYFDGKYASPDVFKSLGCEDFISFVFEFGKSLCSMHLTEDEI
   5  (  386)    LEVVFIRMCRAFDSQNNTVYFDGKYASPDVFKSLGCEDFISFVFEFGKSLCSMHLTEDEI

//
                                                                             
   0  (  418)    ALYTALVLINAHRPGLQEKRKVEQLQYNLELAFHHHLCKTHRQS-ILAKLPPK-GKLRSL
   1  (  418)    ALYTALVLINAHRPGLQEKRKVEQLQYNLELAFHHHLCKTHRQS-ILAKLPPK-GKLRSL
   2  (  397)    ALYTALVLINAHRPGLQEKRKVEQLQYNLELAFHHHLCKTHRQS-ILAKLPPK-GKLRSL
   3  (  366)    ALFSAFVLMSADRSWLQEKVKIEKLQQKIQLALQHVLQKNHREDGILTKLICKVSTLRAL
   4  (  421)    ALFSAFVLMSADRSWLQEKVKIEKLQQKIQLALQHVLQKNHREDGILTKLICKVSTLRAL
   5  (  446)    ALFSAFVLMSADRSWLQEKVKIEKLQQKIQLALQHVLQKNHREDGILTKLICKVSTLRAL

//
                                                            
   0  (  476)    CSQHVERLQIFQHLHPIVVQAAFPPLYKELFSTETESPVGLSK
   1  (  476)    CSQHVERLQIFQHLHPIVVQAAFPPLYKELFSTETESPVGLSK
   2  (  455)    CSQHVERLQIFQHLHPIVVQAAFPPLYKELFSTETESPVGLSK
   3  (  426)    CGRHTEKLMAFKAIYPDIVRLHFPPLYKELFTSEFE.......
   4  (  481)    CGRHTEKLMAFKAIYPDIVRLHFPPLYKELFTSEFE.......
   5  (  506)    CGRHTEKLMAFKAIYPDIVRLHFPPLYKELFTSEFE.......

//
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com