# 0 Query: pF1KE3393, 1188 aa
# 1 CCDS9733.1 ARID4A gene_id:5926|Hs108|chr14 (1188 aa)
# 2 CCDS45114.1 ARID4A gene_id:5926|Hs108|chr14 (1203 aa)
# 3 CCDS9732.1 ARID4A gene_id:5926|Hs108|chr14 (1257 aa)
# 4 CCDS31061.1 ARID4B gene_id:51742|Hs108|chr1 (1312 aa)
# 5 CCDS31060.1 ARID4B gene_id:51742|Hs108|chr1 (1226 aa)
//
exp sw-scr id% from to
1 0 7675 100.0 1 1188
2 0 7629 98.7 1 1203
3 0 7282 94.3 1 1220
4 3.2e-77 2681 43.7 1 1179
5 3.9e-60 2380 40.0 1 1205
//
0 ( 1) MKAADEPAYLTVGTDVSAKYRGAFCEAKIKTVKRLVKVKVLLKQDNTTQLVQDDQVKGPL
1 ( 1) MKAADEPAYLTVGTDVSAKYRGAFCEAKIKTVKRLVKVKVLLKQDNTTQLVQDDQVKGPL
2 ( 1) MKAADEPAYLTVGTDVSAKYRGAFCEAKIKTVKRLVKVKVLLKQDNTTQLVQDDQVKGPL
3 ( 1) MKAADEPAYLTVGTDVSAKYRGAFCEAKIKTVKRLVKVKVLLKQDNTTQLVQDDQVKGPL
4 ( 1) MKALDEPPYLTVGTDVSAKYRGAFCEAKIKTAKRLVKVKVTFRHDSSTVEVQDDHIKGPL
5 ( 1) MKALDEPPYLTVGTDVSAKYRGAFCEAKIKTAKRLVKVKVTFRHDSSTVEVQDDHIKGPL
//
0 ( 61) RVGAIVETRTSDGSFQEAIISKLTDASWYTVVFDDGDERTLRRTSLCLKGERHFAESETL
1 ( 61) RVGAIVETRTSDGSFQEAIISKLTDASWYTVVFDDGDERTLRRTSLCLKGERHFAESETL
2 ( 61) RVGAIVETRTSDGSFQEAIISKLTDASWYTVVFDDGDERTLRRTSLCLKGERHFAESETL
3 ( 61) RVGAIVETRTSDGSFQEAIISKLTDASWYTVVFDDGDERTLRRTSLCLKGERHFAESETL
4 ( 61) KVGAIVEVKNLDGAYQEAVINKLTDASWYTVVFDDGDEKTLRRSSLCLKGERHFAESETL
5 ( 61) KVGAIVEVKNLDGAYQEAVINKLTDASWYTVVFDDGDEKTLRRSSLCLKGERHFAESETL
//
0 ( 121) DQLPLTNPEHFGTPVIAKKTNRGRRSS-LPVTEDEKEEESSEEEDEDKRRLNDELLGKVV
1 ( 121) DQLPLTNPEHFGTPVIAKKTNRGRRSS-LPVTEDEKEEESSEEEDEDKRRLNDELLGKVV
2 ( 121) DQLPLTNPEHFGTPVIAKKTNRGRRSS-LPVTEDEKEEESSEEEDEDKRRLNDELLGKVV
3 ( 121) DQLPLTNPEHFGTPVIAKKTNRGRRSS-LPVTEDEKEEESSEEEDEDKRRLNDELLGKVV
4 ( 121) DQLPLTNPEHFGTPVIGKKTNRGRRSNHIP---EEESSSSSSDEDEDDRKQIDELLGKVV
5 ( 121) DQLPLTNPEHFGTPVIGKKTNRGRRSNHIP---EEESSSSSSDEDEDDRKQIDELLGKVV
//
0 ( 180) SV--VSATERTE-WYPALVISPSCNDDITVKKDQCLVRSFIDSKFYSIARKDIKEVDILN
1 ( 180) SV--VSATERTE-WYPALVISPSCNDDITVKKDQCLVRSFIDSKFYSIARKDIKEVDILN
2 ( 180) SV--VSATERTE-WYPALVISPSCNDDITVKKDQCLVRSFIDSKFYSIARKDIKEVDILN
3 ( 180) SV--VSATERTE-WYPALVISPSCNDDITVKKDQCLVRSFIDSKFYSIARKDIKEVDILN
4 ( 178) CVDYISLDKKKALWFPALVVCPDCSDEIAVKKDNILVRSFKDGKFTSVPRKDVHEITSDT
5 ( 178) CVDYISLDKKKALWFPALVVCPDCSDEIAVKKDNILVRSFKDGKFTSVPRKDVHEITSDT
//
0 ( 237) LPESELSTKPGLQKASIFLKTRVVPDNWKMDISEILESSSSDDEDGPAEENDEEKEKEAK
1 ( 237) LPESELSTKPGLQKASIFLKTRVVPDNWKMDISEILESSSSDDEDGPAEENDEEKEKEAK
2 ( 237) LPESELSTKPGLQKASIFLKTRVVPDNWKMDISEILESSSSDDEDGPAEENDEEKEKEAK
3 ( 237) LPESELSTKPGLQKASIFLKTRVVPDNWKMDISEILESSSSDDEDGPAEENDEEKEKEAK
4 ( 238) APKPDAVLKQAFEQALEFHKSRTIPANWKTELKE--DSSSSEAEE-EEEEEDDEKEKEDN
5 ( 238) APKPDAVLKQAFEQALEFHKSRTIPANWKTELKE--DSSSSEAEE-EEEEEDDEKEKEDN
//
0 ( 297) KTEEEVPEEELDP--EERDNFLQQLYKFMEDRGTPINKPPVLGYKDLNLFKLFRLVYHQG
1 ( 297) KTEEEVPEEELDP--EERDNFLQQLYKFMEDRGTPINKPPVLGYKDLNLFKLFRLVYHQG
2 ( 297) KTEEEVPEEELDP--EERDNFLQQLYKFMEDRGTPINKPPVLGYKDLNLFKLFRLVYHQG
3 ( 297) KTEEEVPEEELDP--EERDNFLQQLYKFMEDRGTPINKPPVLGYKDLNLFKLFRLVYHQG
4 ( 295) SSEEE---EEIEPFPEERENFLQQLYKFMEDRGTPINKRPVLGYRNLNLFKLFRLVHKLG
5 ( 295) SSEEE---EEIEPFPEERENFLQQLYKFMEDRGTPINKRPVLGYRNLNLFKLFRLVHKLG
//
0 ( 355) GCDNIDSGAVWKQIYMDLGIPILNSAASYNVKTAYRKYLYGFEEYCRSANIQFRTVHHHE
1 ( 355) GCDNIDSGAVWKQIYMDLGIPILNSAASYNVKTAYRKYLYGFEEYCRSANIQFRTVHHHE
2 ( 355) GCDNIDSGAVWKQIYMDLGIPILNSAASYNVKTAYRKYLYGFEEYCRSANIQFRTVHHHE
3 ( 355) GCDNIDSGAVWKQIYMDLGIPILNSAASYNVKTAYRKYLYGFEEYCRSANIQFRTVHHHE
4 ( 352) GFDNIESGAVWKQVYQDLGIPVLNSAAGYNVKCAYKKYLYGFEEYCRSANIEFQMALP-E
5 ( 352) GFDNIESGAVWKQVYQDLGIPVLNSAAGYNVKCAYKKYLYGFEEYCRSANIEFQ-MALPE
//
0 ( 415) PKVKEEKKDLEESMEEALKLDQEMPLTEVKSEPEENIDSNSESERE-EIE----LKSPRG
1 ( 415) PKVKEEKKDLEESMEEALKLDQEMPLTEVKSEPEENIDSNSESERE-EIE----LKSPRG
2 ( 415) PKVKEEKKDLEESMEEALKLDQEMPLTEVKSEPEENIDSNSESERE-EIE----LKSPRG
3 ( 415) PKVKEEKKDLEESMEEALKLDQEMPLTEVKSEPEENIDSNSESERE-EIE----LKSPRG
4 ( 411) KVVNKQCKECENVKEIKVKEENETEIKEIKMEEERNIIPREEKPIEDEIERKENIKPSLG
5 ( 411) KVVNKQCKECENVKEIKVKEENETEIKEIKMEEERNI-----------------------
//
0 ( 470) RRRIARDVNSIKKEIEEEKTEDKLKDNDTEN-KDVDDDYETAEKKENELLLGRKNTPKQK
1 ( 470) RRRIARDVNSIKKEIEEEKTEDKLKDNDTEN-KDVDDDYETAEKKENELLLGRKNTPKQK
2 ( 470) RRRIARDVNSIKKEIEEEKTEDKLKDNDTEN-KDVDDDYETAEKKENELLLGRKNTPKQK
3 ( 470) RRRIARDVNSIKKEIEEEKTEDKLKDNDTEN-KDVDDDYETAEKKENELLLGRKNTPKQK
4 ( 471) SKKNL--LESIPTHSDQEKEVNIKKPEDNENLDDKDDDTTRVDESLNIKVEAEEEKAKSG
5 ( 448) ---IPREEKPIEDEIERK---ENIKPSLGSK-KNLLESIPT-------------HSDQEK
//
0 ( 529) EKKIKKQEDSDKDSDEEEEKSQEREETESKCDSEGEEDEEDMEPCLTGTKVKVKYGRGKT
1 ( 529) EKKIKKQEDSDKDSDEEEEKSQEREETESKCDSEGEEDEEDMEPCLTGTKVKVKYGRGKT
2 ( 529) EKKIKKQEDSDKDSDEEEEKSQEREETESKCDSEGEEDEEDMEPCLTGTKVKVKYGRGKT
3 ( 529) EKKIKKQEDSDKDSDEEEEKSQEREETESKCDSEGEEDEEDMEPCLTGTKVKVKYGRGKT
4 ( 529) DET-NKEEDEDDEEAEEEEEEEEEEEDEDDDDNNEEEEFECYPP---GMKVQVRYGRGKN
5 ( 488) EVNIKKPEDNENLDDKDDDTTRVDESLNIKVEAEEE---------------KAKSG----
//
0 ( 589) QKIYEASIKSTEIDDGEVLYLVHYYGWNVRYDEWVKADRIIWPLDKGGPKKKQKKKAKNK
1 ( 589) QKIYEASIKSTEIDDGEVLYLVHYYGWNVRYDEWVKADRIIWPLDKGGPKKKQKKKAKNK
2 ( 589) QKIYEASIKSTEIDDGEVLYLVHYYGWNVRYDEWVKADRIIWPLDKGGPKKKQKKKAKNK
3 ( 589) QKIYEASIKSTEIDDGEVLYLVHYYGWNVRYDEWVKADRIIWPLDKGGPKKKQKKKAKNK
4 ( 585) QKMYEASIKDSDVEGGEVLYLVHYCGWNVRYDEWIKADKIVRPADKNVPKIKHRKKIKNK
5 ( 529) ------------------------------YDEWIKADKIVRPADKNVPKIKHRKKIKNK
//
0 ( 649) EDSEKD--EKRDEERQKSKR-GRPPLKSTLSSNM--PYGL-------SKTA---------
1 ( 649) EDSEKD--EKRDEERQKSKR-GRPPLKSTLSSNM--PYGL-------SKTA---------
2 ( 649) EDSEKD--EKRDEERQKSKR-GRPPLKSTLSSNM--PYGL-------SKTA---------
3 ( 649) EDSEKD--EKRDEERQKSKR-GRPPLKSTLSSNM--PYGL-------SKTA---------
4 ( 645) LDKEKDKDEKYSPKNCKLRRLSKPPFQTNPSPEMVSKLDL-------TDAK---------
5 ( 559) LDKEKDKDEKYSPKNCKLRRLSKPPFQTNPSPEM--VSKLDLTDAKNSDTAHIKSIEITS
//
0 ( 688) --NSEGK----------------SDSCSSDSETED---ALEKNLINEELSLKDELEKNEN
1 ( 688) --NSEGK----------------SDSCSSDSETED---ALEKNLINEELSLKDELEKNEN
2 ( 688) --NSEGK----------------SDSCSSDSETED---ALEKNLINEELSLKDELEKNEN
3 ( 688) --NSEGK----------------SDSCSSDSETED---ALEKNLINEELSLKDELEKNEN
4 ( 689) --NSDTAHIKSIEITSILNGLQASESSAEDSEQEDERGAQDMDNNGKEESKIDHLTNNRN
5 ( 617) ILNGLQA----------------SESSAEDSEQEDERGAQDMDNNGKEESKIDHLTNNRN
//
0 ( 727) -------LNDDKLDEENPK-----ISAHILKENDRTQMQPLETLKLEVGENEQIVQIFGN
1 ( 727) -------LNDDKLDEENPK-----ISAHILKENDRTQMQPLETLKLEVGENEQIVQIFGN
2 ( 727) -------LNDDKLDEENPK-----ISAHILKENDRTQMQPLETLKLEVGENEQIVQIFGN
3 ( 727) -------LNDDKLDEENPK-----ISAHILKENDRTQMQPLETLKLEVGENEQIVQIFGN
4 ( 747) DLISKEEQNSSSLLEENKVHADLVISKPVSKSPERLR-KDIEVLSEDTDYEEDEVT----
5 ( 661) DLISKEEQNSSSLLEENKVHADLVISKPVSKSPERLR-KDIEVLSEDTDYEEDEVT----
//
0 ( 775) KMEKTEEVKKEA-EKSPKGKGRRSKTKDLSLE-IIKISSFGQNEAGSEPHIEAHSLELSS
1 ( 775) KMEKTEEVKKEA-EKSPKGKGRRSKTKDLSLE-IIKISSFGQNEAGSEPHIEAHSLELSS
2 ( 775) KMEKTEEVKKEA-EKSPKGKGRRSKTKDLSLE-IIKISSFGQNEAGSEPHIEAHSLELSS
3 ( 775) KMEKTEEVKKEA-EKSPKGKGRRSKTKDLSLE-IIKISSFGQNEAGSEPHIEAHSLELSS
4 ( 802) --KKRKDVKKDTTDKSSKPQIKRGKRRYCNTEECLKTGSPGKKEE------KAKNKESLC
5 ( 716) --KKRKDVKKDTTDKSSKPQIKRGKRRYCNTEECLKTGSPGKKEE------KAKNKESLC
//
0 ( 833) LDNKNFSSATEDEIDQCVKEKKLKRKILGQSSPEKKIRIENGMEMTNTVSQERTSDCIGS
1 ( 833) LDNKNFSSATEDEIDQCVKEKKLKRKILGQSSPEKKIRIENGMEMTNTVSQERTSDCIGS
2 ( 833) LDNKNFSSATEDEIDQCVKEKKLKRKILGQSSPEKKIRIENGMEMTNTVSQERTSDCIGS
3 ( 833) LDNKNFSSATEDEIDQCVKEKKLKRKILGQSSPEKKIRIENGMEMTNTVSQERTSDCIGS
4 ( 854) MENSSNSSSDEDEEETKAKMTPTK-KYNGLEEKRKSLRTTGFYSGFSEVAEKRIKLLNNS
5 ( 768) MENSSNSSSDEDEEETKAKMTPTK-KYNGLEEKRKSLRTTGFYSGFSEVAEKRIKLLNNS
//
0 ( 893) EGMKNLNFEQHFERENEGMPSLIAESNQCIQQLTSERFDSPAEETVNIPLKED---EDAM
1 ( 893) EGMKNLNFEQHFERENEGMPSLIAESNQCIQQLTSERFDSPAEETVNIPLKED---EDAM
2 ( 893) EGMKNLNFEQHFERENEGMPSLIAESNQCIQQLTSERFDSPAEETVNIPLKED---EDAM
3 ( 893) EGMKNLNFEQHFERENEGMPSLIAESNQCIQQLTSERFDSPAEETVNIPLKED---EDAM
4 ( 913) D--ERLQNSRAKDRKDVWSSIQGQWPKKTLKELFSDS-DTEAAASPPHPAPEEGVAEESL
5 ( 827) D--ERLQNSRAKDRKDVWSSIQGQWPKKTLKELFSDS-DTEAAASPPHPAPEEGVAEESL
//
0 ( 950) PLIGPETLVCHEVDLD-----DLDEK---DKT-SIEDVAVE--SSESNSLVSIPPALP--
1 ( 950) PLIGPETLVCHEVDLD-----DLDEK---DKT-SIEDVAVE--SSESNSLVSIPPALP--
2 ( 950) PLIGPETLVCHEVDLD-----DLDEK---DKT-SIEDVAVE--SSESNSLVSIPPALP--
3 ( 950) PLIGPETLVCHEVDLD-----DLDEK---DKT-SIEDVAVE--SSESNSLVSIPPALP--
4 ( 970) QTVAEEESCSPSVELEKPPPVNVDSKPIEEKTVEVNDRKAEFPSSGSNSVLNTPPTTPES
5 ( 884) QTVAEEESCSPSVELEKPPPVNVDSKPIEEKTVEVNDRKAEFPSSGSNSVLNTPPTTPES
//
0 ( 997) PVV---------QHNFSVASPLTLSQDESRSVKSESDITIEVDSIAEESQEGLCERESA-
1 ( 997) PVV---------QHNFSVASPLTLSQDESRSVKSESDITIEVDSIAEESQEGLCERESA-
2 ( 997) PVV---------QHNFSVASPLTLSQDESRSVKSESDITIEVDSIAEESQEGLCERESA-
3 ( 997) PVV---------QHNFSVASPLTLSQDESRSVKSESDITIEVDSIAEESQEGLCERESA-
4 ( 1030) PSSVTVTEGSRQQSSVTVSEPLAPNQEEVRSIKSETDSTIEVDSVAGELQDLQSEGNSSP
5 ( 944) PSSVTVTEGSRQQSSVTVSEPLAPNQEEVRSIKSETDSTIEVDSVAGELQDLQSEGNSSP
//
0 ( 1047) NGFETNVASGTCSIIVQER-ESREKGQKRPSDGNSG-LMAKKQKRT--------------
1 ( 1047) NGFETNVASGTCSIIVQER-ESREKGQKRPSDGNSG-LMAKKQKRT--------------
2 ( 1047) NGFETNVASGTCSIIVQER-ESREKGQKRPSDGNSG-LMAKKQKRT--------------
3 ( 1047) NGFETNVASGTCSIIVQER-ESREKGQKRPSDGNSG-LMAKKQKRT--------------
4 ( 1090) AGFDASVSSSSSNQPEPEHPEKACTGQKRVKDAQGGGSSSKKQKRS--------------
5 ( 1004) AGFDASVSSSSSNQPEPEHPEKACTGQKRVKDAQGGGSSSKKQKRSHKATVVNNKKKGKG
//
0 ( 1091) -----------------------------------PKRTSAAAKNEKNGT----------
1 ( 1091) -----------------------------------PKRTSAAAKNEKNGT----------
2 ( 1091) -----------------------------------PKRTSAAAKNEKNGTGQSSDSEDLP
3 ( 1091) -----------------------------------PKRTSAAAKNEKNGTGQSSDSEDLP
4 ( 1136) -----------------------------------HKATVVNNKKKGKGT----------
5 ( 1064) TNSSDSEELSAGESITKSQPVKSVSTGMKSHSTKSPARTQSPGKCGKNGDKDPDLKEPSN
//
0 ( 1106) -----------------------------------------------------------D
1 ( 1106) -----------------------------------------------------------D
2 ( 1116) VLDNS------------------------------------------------------N
3 ( 1116) VLDNSSKCTPVKHLNVSKPQKLARSPARISPHIKDGEKDKHREKHPNSSPRTYKWSFQLN
4 ( 1151) -----------------------------------------------------------N
5 ( 1124) RLPKVYKWSFQM-----------------------------------------------S
//
0 ( 1107) ELDN--MNSTERISFLQEKLQEIRKYYMSLKSEVATIDRRRKRLKKKDREVSHAGASMSS
1 ( 1107) ELDN--MNSTERISFLQEKLQEIRKYYMSLKSEVATIDRRRKRLKKKDREVSHAGASMSS
2 ( 1122) ELDN--MNSTERISFLQEKLQEIRKYYMSLKSEVATIDRRRKRLKKKDREVSHAGASMSS
3 ( 1176) ELDN--MNSTERISFLQEKLQEIRKYYMSLKSEVATIDRRRKRLKKK.............
4 ( 1152) SSDSEELSAGESIT----KSQPVKSVSTGMKS............................
5 ( 1137) DLEN--MTSAERITILQEKLQEIRKHYLSLKSEVASIDRRRKRLKKKERE--------SA
//
0 ( 1165) ASSDTGMSPSSSSPPQNVLAVECR
1 ( 1165) ASSDTGMSPSSSSPPQNVLAVECR
2 ( 1180) ASSDTGMSPSSSSPPQNVLAVECR
3 ( -) ........................
4 ( -) ........................
5 ( 1187) ATSSSSSSPSSSSITAAVM.....
//