# 0 Query: pF1KE2429, 658 aa
# 1 CCDS575.1 CPT2 gene_id:1376|Hs108|chr1 (658 aa)
# 2 CCDS81326.1 CPT2 gene_id:1376|Hs108|chr1 (635 aa)
# 3 CCDS6919.1 CRAT gene_id:1384|Hs108|chr9 (626 aa)
# 4 CCDS7233.1 CHAT gene_id:1103|Hs108|chr10 (630 aa)
# 5 CCDS44389.1 CHAT gene_id:1103|Hs108|chr10 (666 aa)
//
exp sw-scr id% from to
1 0 4405 100.0 1 658
2 5.3e-208 4195 96.5 1 635
3 7.1e-39 938 30.9 31 614
4 1.2e-32 855 29.7 10 602
5 1.2e-32 857 29.4 20 638
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2 ( 1) MVPRLLLRAWPRGPAVGPGAPSRPLSAGSGPGQYLQRSIVPTMHYQDSLPRLPIPKLEDT
3 ( 31) ............................................HQDALPRLPVPPLQQS
4 ( 10) .............................................ESGLPKLPVPPLQQT
5 ( 20) .............PA--PGLTKTPILEKV-PRKMAAKT--PSSE-ESGLPKLPVPPLQQT
//
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3 ( 47) LDHYLKALQPIVSEEEWAHTKQLVDEF--QASGGVGERLQK---GLERRARKTENWLSEW
4 ( 25) LATYLQCMRHLVSEEQFRKSQAIVQQFGAP--GGLGETLQQKL--LERQEKTA-NWVSEY
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//
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4 ( 80) WLNDM-YLNNRLALPVNSSPAVIFARQHFPGTDDQL-----------RFAASLISGVL--
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3 ( 149) --------------FKVMI--DNETLPVEYLGGK-----PLCMNQYYQILSSCRVPGPKQ
4 ( 126) -------------SYKALLDSHSIPTDCA-KGQ--LSGQPLCMKQYYGLFSSYRLPGHTQ
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3 ( 188) DTVSNFSKTKKPP---THITVVHNYQFFELDVYHSDGTPLTADQIFVQLEKIWNSSLQTN
4 ( 170) DTL--VAQNSSIMPEPEHVIVACCNQFFVLDVV-INFRRLSEGDLFTQLRKIVKMASNED
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//
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4 ( 227) ERLPPIGLLTSDGRSEWAEARTVLVKDST-NRDSLDMIERCICLVCLDAPGGVE-LSD-T
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//
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3 ( 300) YRSHVAGQMLHG-----GGSRLNSGNRWFDKTLQFIVAEDGSCGLVYEHAAAEGPPIVTL
4 ( 284) HRAL---QLLHGGGYSKNGA-----NRWYDKSLQFVVGRDGTCGVVCEHSPFDGIVLVQC
5 ( 320) HRAL---QLLHGGGYSKNGA-----NRWYDKSLQFVVGRDGTCGVVCEHSPFDGIVLVQC
//
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3 ( 355) LDYVIEYTKKPELVRSPLVPLPMP-----KKLRFNITPEIKSDIEKAKQNLSIMIQDLDI
4 ( 336) TEHLLKHVTQSSRKLIRAD--SVSELPAPRRLRWKCSPEIQGHLASSAEKLQRIVKNLDF
5 ( 372) TEHLLKHVTQSSRKLIRAD--SVSELPAPRRLRWKCSPEIQGHLASSAEKLQRIVKNLDF
//
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3 ( 410) TVMVFHHFGKDFPKSEKLSPDAFIQMALQLAYYRIYGQACATYESASLRMFHLGRTDTIR
4 ( 394) IVYKFDNYGKTFIKKQKCSPDAFIQVALQLAFYRLHRRLVPTYESASIRRFQEGRVDNIR
5 ( 430) IVYKFDNYGKTFIKKQKCSPDAFIQVALQLAFYRLHRRLVPTYESASIRRFQEGRVDNIR
//
0 ( 504) PASVYTKRCSEAFVREPSRHSAG----ELQQ--MMVECSKYHGQLTKEAAMGQGFDRHLF
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2 ( 504) PASVYTKRCSEAFVREPSRHSAG-----------------------------QGFDRHLF
3 ( 470) SASMD----SLTFVKAMDDSSVT----EHQKVELLRKAVQAHRGYTDRAIRGEAFDRHLL
4 ( 454) SATPE----ALAFVRAVTDHKAAVPASEKLL--LLKDAIRAQTAYTVMAITGMAIDNHLL
5 ( 490) SATPE----ALAFVRAVTDHKAAVPASEKLL--LLKDAIRAQTAYTVMAITGMAIDNHLL
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3 ( 522) GLKLQAIEDLVSMPDIFMDTSYAIAMHFHLSTSQVPAKTDCVMFFGPVVPDGYGVCYNPM
4 ( 508) ALRELARAMCKELPEMFMDETYLMSNRFVLSTSQVPTTTEMFCCYGPVVPNGYGACYNPQ
5 ( 544) ALRELARAMCKELPEMFMDETYLMSNRFVLSTSQVPTTTEMFCCYGPVVPNGYGACYNPQ
//
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1 ( 618) DNWIGCNVSSYPG---RNAREFLQCVEKALEDMFDALEGKSIKS
2 ( 595) DNWIGCNVSSYPG---RNAREFLQCVEKALEDMFDALEGKSIKS
3 ( 582) EAHINFSLSAYNSCAETNAARLAHYLEKALLDM...........
4 ( 568) PETILFCISSFHSCKETSSSKFAKAVEESLIDMRD.........
5 ( 604) PETILFCISSFHSCKETSSSKFAKAVEESLIDMRD.........
//