# 0 Query: pF1KE2346, 2804 aa
# 1 CCDS3920.1 NIPBL gene_id:25836|Hs108|chr5 (2804 aa)
# 2 CCDS47198.1 NIPBL gene_id:25836|Hs108|chr5 (2697 aa)
//
exp sw-scr id% from to
1 0 18293 100.0 1 2804
2 0 17529 99.8 1 2693
//
0 ( 1) MNGDMPHVPITTLAGIASLTDLLNQLPLPSPLPATTTKSLLFNARIAEEVNCLLACRDDN
1 ( 1) MNGDMPHVPITTLAGIASLTDLLNQLPLPSPLPATTTKSLLFNARIAEEVNCLLACRDDN
2 ( 1) MNGDMPHVPITTLAGIASLTDLLNQLPLPSPLPATTTKSLLFNARIAEEVNCLLACRDDN
//
0 ( 61) LVSQLVHSLNQVSTDHIELKDNLGSDDPEGDIPVLLQAVLARSPNVFREKSMQNRYVQSG
1 ( 61) LVSQLVHSLNQVSTDHIELKDNLGSDDPEGDIPVLLQAVLARSPNVFREKSMQNRYVQSG
2 ( 61) LVSQLVHSLNQVSTDHIELKDNLGSDDPEGDIPVLLQAVLARSPNVFREKSMQNRYVQSG
//
0 ( 121) MMMSQYKLSQNSMHSSPASSNYQQTTISHSPSSRFVPPQTSSGNRFMPQQNSPVPSPYAP
1 ( 121) MMMSQYKLSQNSMHSSPASSNYQQTTISHSPSSRFVPPQTSSGNRFMPQQNSPVPSPYAP
2 ( 121) MMMSQYKLSQNSMHSSPASSNYQQTTISHSPSSRFVPPQTSSGNRFMPQQNSPVPSPYAP
//
0 ( 181) QSPAGYMPYSHPSSYTTHPQMQQASVSSPIVAGGLRNIHDNKVSGPLSGNSANHHADNPR
1 ( 181) QSPAGYMPYSHPSSYTTHPQMQQASVSSPIVAGGLRNIHDNKVSGPLSGNSANHHADNPR
2 ( 181) QSPAGYMPYSHPSSYTTHPQMQQASVSSPIVAGGLRNIHDNKVSGPLSGNSANHHADNPR
//
0 ( 241) HGSSEDYLHMVHRLSSDDGDSSTMRNAASFPLRSPQPVCSPAGSEGTPKGSRPPLILQSQ
1 ( 241) HGSSEDYLHMVHRLSSDDGDSSTMRNAASFPLRSPQPVCSPAGSEGTPKGSRPPLILQSQ
2 ( 241) HGSSEDYLHMVHRLSSDDGDSSTMRNAASFPLRSPQPVCSPAGSEGTPKGSRPPLILQSQ
//
0 ( 301) SLPCSSPRDVPPDILLDSPERKQKKQKKMKLGKDEKEQSEKAAMYDIISSPSKDSTKLTL
1 ( 301) SLPCSSPRDVPPDILLDSPERKQKKQKKMKLGKDEKEQSEKAAMYDIISSPSKDSTKLTL
2 ( 301) SLPCSSPRDVPPDILLDSPERKQKKQKKMKLGKDEKEQSEKAAMYDIISSPSKDSTKLTL
//
0 ( 361) RLSRVRSSDMDQQEDMISGVENSNVSENDIPFNVQYPGQTSKTPITPQDINRPLNAAQCL
1 ( 361) RLSRVRSSDMDQQEDMISGVENSNVSENDIPFNVQYPGQTSKTPITPQDINRPLNAAQCL
2 ( 361) RLSRVRSSDMDQQEDMISGVENSNVSENDIPFNVQYPGQTSKTPITPQDINRPLNAAQCL
//
0 ( 421) SQQEQTAFLPANQVPVLQQNTSVAAKQPQTSVVQNQQQISQQGPIYDEVELDALAEIERI
1 ( 421) SQQEQTAFLPANQVPVLQQNTSVAAKQPQTSVVQNQQQISQQGPIYDEVELDALAEIERI
2 ( 421) SQQEQTAFLPANQVPVLQQNTSVAAKQPQTSVVQNQQQISQQGPIYDEVELDALAEIERI
//
0 ( 481) ERESAIERERFSKEVQDKDKPLKKRKQDSYPQEAGGATGGNRPASQETGSTGNGSRPALM
1 ( 481) ERESAIERERFSKEVQDKDKPLKKRKQDSYPQEAGGATGGNRPASQETGSTGNGSRPALM
2 ( 481) ERESAIERERFSKEVQDKDKPLKKRKQDSYPQEAGGATGGNRPASQETGSTGNGSRPALM
//
0 ( 541) VSIDLHQAGRVDSQASITQDSDSIKKPEEIKQCNDAPVSVLQEDIVGSLKSTPENHPETP
1 ( 541) VSIDLHQAGRVDSQASITQDSDSIKKPEEIKQCNDAPVSVLQEDIVGSLKSTPENHPETP
2 ( 541) VSIDLHQAGRVDSQASITQDSDSIKKPEEIKQCNDAPVSVLQEDIVGSLKSTPENHPETP
//
0 ( 601) KKKSDPELSKSEMKQSESRLAESKPNENRLVETKSSENKLETKVETQTEELKQNESRTTE
1 ( 601) KKKSDPELSKSEMKQSESRLAESKPNENRLVETKSSENKLETKVETQTEELKQNESRTTE
2 ( 601) KKKSDPELSKSEMKQSESRLAESKPNENRLVETKSSENKLETKVETQTEELKQNESRTTE
//
0 ( 661) CKQNESTIVEPKQNENRLSDTKPNDNKQNNGRSETTKSRPETPKQKGESRPETPKQKSDG
1 ( 661) CKQNESTIVEPKQNENRLSDTKPNDNKQNNGRSETTKSRPETPKQKGESRPETPKQKSDG
2 ( 661) CKQNESTIVEPKQNENRLSDTKPNDNKQNNGRSETTKSRPETPKQKGESRPETPKQKSDG
//
0 ( 721) HPETPKQKGDGRPETPKQKGESRPETPKQKNEGRPETPKHRHDNRRDSGKPSTEKKPEVS
1 ( 721) HPETPKQKGDGRPETPKQKGESRPETPKQKNEGRPETPKHRHDNRRDSGKPSTEKKPEVS
2 ( 721) HPETPKQKGDGRPETPKQKGESRPETPKQKNEGRPETPKHRHDNRRDSGKPSTEKKPEVS
//
0 ( 781) KHKQDTKSDSPRLKSERAEALKQRPDGRSVSESLRRDHDNKQKSDDRGESERHRGDQSRV
1 ( 781) KHKQDTKSDSPRLKSERAEALKQRPDGRSVSESLRRDHDNKQKSDDRGESERHRGDQSRV
2 ( 781) KHKQDTKSDSPRLKSERAEALKQRPDGRSVSESLRRDHDNKQKSDDRGESERHRGDQSRV
//
0 ( 841) RRPETLRSSSRNEHGIKSDSSKTDKLERKHRHESGDSRERPSSGEQKSRPDSPRVKQGDS
1 ( 841) RRPETLRSSSRNEHGIKSDSSKTDKLERKHRHESGDSRERPSSGEQKSRPDSPRVKQGDS
2 ( 841) RRPETLRSSSRNEHGIKSDSSKTDKLERKHRHESGDSRERPSSGEQKSRPDSPRVKQGDS
//
0 ( 901) NKSRSDKLGFKSPTSKDDKRTEGNKSKVDTNKAHPDNKAEFPSYLLGGRSGALKNFVIPK
1 ( 901) NKSRSDKLGFKSPTSKDDKRTEGNKSKVDTNKAHPDNKAEFPSYLLGGRSGALKNFVIPK
2 ( 901) NKSRSDKLGFKSPTSKDDKRTEGNKSKVDTNKAHPDNKAEFPSYLLGGRSGALKNFVIPK
//
0 ( 961) IKRDKDGNVTQETKKMEMKGEPKDKVEKIGLVEDLNKGAKPVVVLQKLSLDDVQKLIKDR
1 ( 961) IKRDKDGNVTQETKKMEMKGEPKDKVEKIGLVEDLNKGAKPVVVLQKLSLDDVQKLIKDR
2 ( 961) IKRDKDGNVTQETKKMEMKGEPKDKVEKIGLVEDLNKGAKPVVVLQKLSLDDVQKLIKDR
//
0 ( 1021) EDKSRSSLKPIKNKPSKSNKGSIDQSVLKELPPELLAEIESTMPLCERVKMNKRKRSTVN
1 ( 1021) EDKSRSSLKPIKNKPSKSNKGSIDQSVLKELPPELLAEIESTMPLCERVKMNKRKRSTVN
2 ( 1021) EDKSRSSLKPIKNKPSKSNKGSIDQSVLKELPPELLAEIESTMPLCERVKMNKRKRSTVN
//
0 ( 1081) EKPKYAEISSDEDNDSDEAFESSRKRHKKDDDKAWEYEERDRRSSGDHRRSGHSHEGRRS
1 ( 1081) EKPKYAEISSDEDNDSDEAFESSRKRHKKDDDKAWEYEERDRRSSGDHRRSGHSHEGRRS
2 ( 1081) EKPKYAEISSDEDNDSDEAFESSRKRHKKDDDKAWEYEERDRRSSGDHRRSGHSHEGRRS
//
0 ( 1141) SGGGRYRNRSPSDSDMEDYSPPPSLSEVARKMKKKEKQKKRKAYEPKLTPEEMMDSSTFK
1 ( 1141) SGGGRYRNRSPSDSDMEDYSPPPSLSEVARKMKKKEKQKKRKAYEPKLTPEEMMDSSTFK
2 ( 1141) SGGGRYRNRSPSDSDMEDYSPPPSLSEVARKMKKKEKQKKRKAYEPKLTPEEMMDSSTFK
//
0 ( 1201) RFTASIENILDNLEDMDFTAFGDDDEIPQELLLGKHQLNELGSESAKIKAMGIMDKLSTD
1 ( 1201) RFTASIENILDNLEDMDFTAFGDDDEIPQELLLGKHQLNELGSESAKIKAMGIMDKLSTD
2 ( 1201) RFTASIENILDNLEDMDFTAFGDDDEIPQELLLGKHQLNELGSESAKIKAMGIMDKLSTD
//
0 ( 1261) KTVKVLNILEKNIQDGSKLSTLLNHNNDTEEEERLWRDLIMERVTKSADACLTTINIMTS
1 ( 1261) KTVKVLNILEKNIQDGSKLSTLLNHNNDTEEEERLWRDLIMERVTKSADACLTTINIMTS
2 ( 1261) KTVKVLNILEKNIQDGSKLSTLLNHNNDTEEEERLWRDLIMERVTKSADACLTTINIMTS
//
0 ( 1321) PNMPKAVYIEDVIERVIQYTKFHLQNTLYPQYDPVYRLDPHGGGLLSSKAKRAKCSTHKQ
1 ( 1321) PNMPKAVYIEDVIERVIQYTKFHLQNTLYPQYDPVYRLDPHGGGLLSSKAKRAKCSTHKQ
2 ( 1321) PNMPKAVYIEDVIERVIQYTKFHLQNTLYPQYDPVYRLDPHGGGLLSSKAKRAKCSTHKQ
//
0 ( 1381) RVIVMLYNKVCDIVSSLSELLEIQLLTDTTILQVSSMGITPFFVENVSELQLCAIKLVTA
1 ( 1381) RVIVMLYNKVCDIVSSLSELLEIQLLTDTTILQVSSMGITPFFVENVSELQLCAIKLVTA
2 ( 1381) RVIVMLYNKVCDIVSSLSELLEIQLLTDTTILQVSSMGITPFFVENVSELQLCAIKLVTA
//
0 ( 1441) VFSRYEKHRQLILEEIFTSLARLPTSKRSLRNFRLNSSDMDGEPMYIQMVTALVLQLIQC
1 ( 1441) VFSRYEKHRQLILEEIFTSLARLPTSKRSLRNFRLNSSDMDGEPMYIQMVTALVLQLIQC
2 ( 1441) VFSRYEKHRQLILEEIFTSLARLPTSKRSLRNFRLNSSDMDGEPMYIQMVTALVLQLIQC
//
0 ( 1501) VVHLPSSEKDSNAEEDSNKKIDQDVVITNSYETAMRTAQNFLSIFLKKCGSKQGEEDYRP
1 ( 1501) VVHLPSSEKDSNAEEDSNKKIDQDVVITNSYETAMRTAQNFLSIFLKKCGSKQGEEDYRP
2 ( 1501) VVHLPSSEKDSNAEEDSNKKIDQDVVITNSYETAMRTAQNFLSIFLKKCGSKQGEEDYRP
//
0 ( 1561) LFENFVQDLLSTVNKPEWPAAELLLSLLGRLLVHQFSNKSTEMALRVASLDYLGTVAARL
1 ( 1561) LFENFVQDLLSTVNKPEWPAAELLLSLLGRLLVHQFSNKSTEMALRVASLDYLGTVAARL
2 ( 1561) LFENFVQDLLSTVNKPEWPAAELLLSLLGRLLVHQFSNKSTEMALRVASLDYLGTVAARL
//
0 ( 1621) RKDAVTSKMDQGSIERILKQVSGGEDEIQQLQKALLDYLDENTETDPSLVFSRKFYIAQW
1 ( 1621) RKDAVTSKMDQGSIERILKQVSGGEDEIQQLQKALLDYLDENTETDPSLVFSRKFYIAQW
2 ( 1621) RKDAVTSKMDQGSIERILKQVSGGEDEIQQLQKALLDYLDENTETDPSLVFSRKFYIAQW
//
0 ( 1681) FRDTTLETEKAMKSQKDEESSEGTHHAKEIETTGQIMHRAENRKKFLRSIIKTTPSQFST
1 ( 1681) FRDTTLETEKAMKSQKDEESSEGTHHAKEIETTGQIMHRAENRKKFLRSIIKTTPSQFST
2 ( 1681) FRDTTLETEKAMKSQKDEESSEGTHHAKEIETTGQIMHRAENRKKFLRSIIKTTPSQFST
//
0 ( 1741) LKMNSDTVDYDDACLIVRYLASMRPFAQSFDIYLTQILRVLGENAIAVRTKAMKCLSEVV
1 ( 1741) LKMNSDTVDYDDACLIVRYLASMRPFAQSFDIYLTQILRVLGENAIAVRTKAMKCLSEVV
2 ( 1741) LKMNSDTVDYDDACLIVRYLASMRPFAQSFDIYLTQILRVLGENAIAVRTKAMKCLSEVV
//
0 ( 1801) AVDPSILARLDMQRGVHGRLMDNSTSVREAAVELLGRFVLCRPQLAEQYYDMLIERILDT
1 ( 1801) AVDPSILARLDMQRGVHGRLMDNSTSVREAAVELLGRFVLCRPQLAEQYYDMLIERILDT
2 ( 1801) AVDPSILARLDMQRGVHGRLMDNSTSVREAAVELLGRFVLCRPQLAEQYYDMLIERILDT
//
0 ( 1861) GISVRKRVIKILRDICIEQPTFPKITEMCVKMIRRVNDEEGIKKLVNETFQKLWFTPTPH
1 ( 1861) GISVRKRVIKILRDICIEQPTFPKITEMCVKMIRRVNDEEGIKKLVNETFQKLWFTPTPH
2 ( 1861) GISVRKRVIKILRDICIEQPTFPKITEMCVKMIRRVNDEEGIKKLVNETFQKLWFTPTPH
//
0 ( 1921) NDKEAMTRKILNITDVVAACRDTGYDWFEQLLQNLLKSEEDSSYKPVKKACTQLVDNLVE
1 ( 1921) NDKEAMTRKILNITDVVAACRDTGYDWFEQLLQNLLKSEEDSSYKPVKKACTQLVDNLVE
2 ( 1921) NDKEAMTRKILNITDVVAACRDTGYDWFEQLLQNLLKSEEDSSYKPVKKACTQLVDNLVE
//
0 ( 1981) HILKYEESLADSDNKGVNSGRLVACITTLFLFSKIRPQLMVKHAMTMQPYLTTKCSTQND
1 ( 1981) HILKYEESLADSDNKGVNSGRLVACITTLFLFSKIRPQLMVKHAMTMQPYLTTKCSTQND
2 ( 1981) HILKYEESLADSDNKGVNSGRLVACITTLFLFSKIRPQLMVKHAMTMQPYLTTKCSTQND
//
0 ( 2041) FMVICNVAKILELVVPLMEHPSETFLATIEEDLMKLIIKYGMTVVQHCVSCLGAVVNKVT
1 ( 2041) FMVICNVAKILELVVPLMEHPSETFLATIEEDLMKLIIKYGMTVVQHCVSCLGAVVNKVT
2 ( 2041) FMVICNVAKILELVVPLMEHPSETFLATIEEDLMKLIIKYGMTVVQHCVSCLGAVVNKVT
//
0 ( 2101) QNFKFVWACFNRYYGAISKLKSQHQEDPNNTSLLTNKPALLRSLFTVGALCRHFDFDLED
1 ( 2101) QNFKFVWACFNRYYGAISKLKSQHQEDPNNTSLLTNKPALLRSLFTVGALCRHFDFDLED
2 ( 2101) QNFKFVWACFNRYYGAISKLKSQHQEDPNNTSLLTNKPALLRSLFTVGALCRHFDFDLED
//
0 ( 2161) FKGNSKVNIKDKVLELLMYFTKHSDEEVQTKAIIGLGFAFIQHPSLMFEQEVKNLYNNIL
1 ( 2161) FKGNSKVNIKDKVLELLMYFTKHSDEEVQTKAIIGLGFAFIQHPSLMFEQEVKNLYNNIL
2 ( 2161) FKGNSKVNIKDKVLELLMYFTKHSDEEVQTKAIIGLGFAFIQHPSLMFEQEVKNLYNNIL
//
0 ( 2221) SDKNSSVNLKIQVLKNLQTYLQEEDTRMQQADRDWKKVAKQEDLKEMGDVSSGMSSSIMQ
1 ( 2221) SDKNSSVNLKIQVLKNLQTYLQEEDTRMQQADRDWKKVAKQEDLKEMGDVSSGMSSSIMQ
2 ( 2221) SDKNSSVNLKIQVLKNLQTYLQEEDTRMQQADRDWKKVAKQEDLKEMGDVSSGMSSSIMQ
//
0 ( 2281) LYLKQVLEAFFHTQSSVRHFALNVIALTLNQGLIHPVQCVPYLIAMGTDPEPAMRNKADQ
1 ( 2281) LYLKQVLEAFFHTQSSVRHFALNVIALTLNQGLIHPVQCVPYLIAMGTDPEPAMRNKADQ
2 ( 2281) LYLKQVLEAFFHTQSSVRHFALNVIALTLNQGLIHPVQCVPYLIAMGTDPEPAMRNKADQ
//
0 ( 2341) QLVEIDKKYAGFIHMKAVAGMKMSYQVQQAINTCLKDPVRGFRQDESSSALCSHLYSMIR
1 ( 2341) QLVEIDKKYAGFIHMKAVAGMKMSYQVQQAINTCLKDPVRGFRQDESSSALCSHLYSMIR
2 ( 2341) QLVEIDKKYAGFIHMKAVAGMKMSYQVQQAINTCLKDPVRGFRQDESSSALCSHLYSMIR
//
0 ( 2401) GNRQHRRAFLISLLNLFDDTAKTDVTMLLYIADNLACFPYQTQEEPLFIMHHIDITLSVS
1 ( 2401) GNRQHRRAFLISLLNLFDDTAKTDVTMLLYIADNLACFPYQTQEEPLFIMHHIDITLSVS
2 ( 2401) GNRQHRRAFLISLLNLFDDTAKTDVTMLLYIADNLACFPYQTQEEPLFIMHHIDITLSVS
//
0 ( 2461) GSNLLQSFKESMVKDKRKERKSSPSKENESSDSEEEVSRPRKSRKRVDSDSDSDSEDDIN
1 ( 2461) GSNLLQSFKESMVKDKRKERKSSPSKENESSDSEEEVSRPRKSRKRVDSDSDSDSEDDIN
2 ( 2461) GSNLLQSFKESMVKDKRKERKSSPSKENESSDSEEEVSRPRKSRKRVDSDSDSDSEDDIN
//
0 ( 2521) SVMKCLPENSAPLIEFANVSQGILLLLMLKQHLKNLCGFSDSKIQKYSPSESAKVYDKAI
1 ( 2521) SVMKCLPENSAPLIEFANVSQGILLLLMLKQHLKNLCGFSDSKIQKYSPSESAKVYDKAI
2 ( 2521) SVMKCLPENSAPLIEFANVSQGILLLLMLKQHLKNLCGFSDSKIQKYSPSESAKVYDKAI
//
0 ( 2581) NRKTGVHFHPKQTLDFLRSDMANSKITEEVKRSIVKQYLDFKLLMEHLDPDEEEEEGEVS
1 ( 2581) NRKTGVHFHPKQTLDFLRSDMANSKITEEVKRSIVKQYLDFKLLMEHLDPDEEEEEGEVS
2 ( 2581) NRKTGVHFHPKQTLDFLRSDMANSKITEEVKRSIVKQYLDFKLLMEHLDPDEEEEEGEVS
//
0 ( 2641) ASTNARNKAITSLLGGGSPKNNTAAETEDDESDGEDRGGGTSG-SLRRSKRNSDSTELAA
1 ( 2641) ASTNARNKAITSLLGGGSPKNNTAAETEDDESDGEDRGGGTSG-SLRRSKRNSDSTELAA
2 ( 2641) ASTNARNKAITSLLGGGSPKNNTAAETEDDESDGEDRGGGTSGVRRRRSQRIS.......
//
0 ( 2700) QMNESVDVMDVIAICCPKYKDRPQIARVVQKTSSGFSVQWMAGSYSGSWTEAKRRDGRKL
1 ( 2700) QMNESVDVMDVIAICCPKYKDRPQIARVVQKTSSGFSVQWMAGSYSGSWTEAKRRDGRKL
2 ( -) ............................................................
//
0 ( 2760) VPWVDTIKESDIIYKKIALTSANKLTNKVVQTLRSLYAAKDGTSS
1 ( 2760) VPWVDTIKESDIIYKKIALTSANKLTNKVVQTLRSLYAAKDGTSS
2 ( -) .............................................
//
