Multiple alignment for pF1KB8923
Check alignment(s).
#  0    Query: pF1KB8923, 270 aa
#  1    CCDS5406.1 HOXA5 gene_id:3202|Hs108|chr7    (270 aa)
#  2    CCDS11530.1 HOXB5 gene_id:3215|Hs108|chr17    (269 aa)
#  3    CCDS8873.1 HOXC4 gene_id:3221|Hs108|chr12    (264 aa)
#  4    CCDS11529.1 HOXB4 gene_id:3214|Hs108|chr17    (251 aa)
#  5    CCDS8872.1 HOXC5 gene_id:3222|Hs108|chr12    (222 aa)

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        exp       sw-scr    id%      from      to
   1    2.1e-60     1854  100.0         1     270
   2    1.4e-32     1066   62.3         1     269
   3    1.2e-13      529   49.2        54     231
   4    1.4e-13      536   44.3        23     234
   5    1.6e-13      625   45.9         1     218

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   0  (    1)    MSSYFVNSFCGRYPNGPDYQLHNYGDHSSVSEQFRDSASMHSGRYGYGYNGMDLSVGRSG
   1  (    1)    MSSYFVNSFCGRYPNGPDYQLHNYGDHSSVSEQFRDSASMHSGRYGYGYNGMDLSVGRSG
   2  (    1)    MSSYFVNSFSGRYPNGPDYQLLNYGSGSSLSGSYRDPAAMHTGSYGYNYNGMDLSVNRSS
   3  (    -)    ............................................................
   4  (   23)    ................................................YSQSDYLPSDHS
   5  (    1)    MSSYVANSFYKQSPNIPAYNMQTCGNYGSASE-------VQASRYCYG--GLDLSITFPP

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   0  (   61)    --SGHFGS-GERARS-YAASAS----AAPAEPRYSQPATSTHSPQPDPLP--------CS
   1  (   61)    --SGHFGS-GERARS-YAASAS----AAPAEPRYSQPATSTHSPQPDPLP--------CS
   2  (   61)    ASSSHFGAVGESSRA-FPAPAQ--------EPRFRQAASSCSLSSPESLP--------CT
   3  (   54)    ...........................................PPPPPRPSYPERQYSCT
   4  (   35)    --PGYYAG-GQRRESSFQPEAGFGRRAACTVQRYA--ACRDPGPPPPPPP--------PP
   5  (   52)    --PAPSNS--LHGVD-MAANPR----AHPDRPACSAAAAPGHAPGRD-------------

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   0  (  105)    AVAP-SPGSDSHHGGKNSLSNSSGASADAGSTHISSREGVGTASGAEEDAPA---SSEQA
   1  (  105)    AVAP-SPGSDSHHGGKNSLSNSSGASADAGSTHISSREGVGTASGAEEDAPA---SSEQA
   2  (  104)    -------NGDSH-GAKPSASSPSDQATSASSSANFTEIDEASASSEPEEAASQLSSPSLA
   3  (   71)    SLQ--GPGNSRGHG-----PAQAGHHHPEKSQSLCEPAPLSGASASPSPAPP---ACSQP
   4  (   82)    PPPP-PPG----------LSPRAPAPPPAGALLPEP----GQRCEAVSSSPP---PPPCA
   5  (   90)    EAAPLNPGMYSQKAARPAL------------------EERAKSSGEIKEEQA---QTGQP

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   0  (  161)    SAQSEP----SPAPPA--Q-PQIYPWMRKLHIS--HDNIGGPEGKRARTAYTRYQTLELE
   1  (  161)    SAQSEP----SPAPPA--Q-PQIYPWMRKLHIS--HDNIGGPEGKRARTAYTRYQTLELE
   2  (  156)    RAQPEPMATSTAAPEG--QTPQIFPWMRKLHIS--HD-MTGPDGKRARTAYTRYQTLELE
   3  (  121)    -APDHP----SSAASK--Q-PIVYPWMKKIHVSTVNPNYNGGEPKRSRTAYTRQQVLELE
   4  (  124)    QNPLHP----SPSHSACKE-PVVYPWMRKVHVSTVNPNYAGGEPKRSRTAYTRQQVLELE
   5  (  129)    AGLSQP-----PAPP------QIYPWMTKLHMS--HET----DGKRSRTSYTRYQTLELE

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   0  (  212)    KEFHFNRYLTRRRRIEIAHALCLSERQIKIWFQNRRMKWKKDNKL---KSMSMAAAGGAF
   1  (  212)    KEFHFNRYLTRRRRIEIAHALCLSERQIKIWFQNRRMKWKKDNKL---KSMSMAAAGGAF
   2  (  211)    KEFHFNRYLTRRRRIEIAHALCLSERQIKIWFQNRRMKWKKDNKL---KSMSLATAGSAF
   3  (  173)    KEFHYNRYLTRRRRIEIAHSLCLSERQIKIWFQNRRMKWKKDHRLPNTKVRSAPPAGAA.
   4  (  179)    KEFHYNRYLTRRRRVEIAHALCLSERQIKIWFQNRRMKWKKDHKL---PNTKIRSGGAA.
   5  (  172)    KEFHFNRYLTRRRRIEIANNLCLNERQIKIWFQNRRMKWKKDSKM---KS..........

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   0  (  269)    RP
   1  (  269)    RP
   2  (  268)    QP
   3  (    -)    ..
   4  (    -)    ..
   5  (    -)    ..

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