# 0 Query: pF1KB8591, 770 aa
# 1 CCDS1955.1 SEMA4F gene_id:10505|Hs108|chr2 (770 aa)
# 2 CCDS74529.1 SEMA4F gene_id:10505|Hs108|chr2 (737 aa)
# 3 CCDS62942.1 SEMA4F gene_id:10505|Hs108|chr2 (615 aa)
# 4 CCDS2029.1 SEMA4C gene_id:54910|Hs108|chr2 (833 aa)
# 5 CCDS6685.1 SEMA4D gene_id:10507|Hs108|chr9 (862 aa)
//
exp sw-scr id% from to
1 0 5281 99.9 1 770
2 0 4972 95.6 1 737
3 2.8e-191 3909 79.7 1 615
4 5.3e-74 1495 36.2 28 780
5 7.9e-73 1390 36.8 11 628
//
0 ( 1) MPASAARPRPGPGQPTASPFPLLLLAVLSGPVSGRVPRSVPRTSLPISEADSCLTRFAVP
1 ( 1) MPASAARPRPGPGQPTASPFPLLLLAVLSGPVSGRVPRSVPRTSLPISEADSCLTRFAVP
2 ( 1) MPASAARPRPGPGQPTASPFPLLLLAVLSGPVSGRVPRSVPRTSLPISEADSCLTRFAVP
3 ( 1) MPASAARPRPGPGQPTASPFPLLLLAVLSGPVSGRVPRSVPRTSLPISEADSCLTRFAVP
4 ( 28) .......................................VPRKTVSSGELATVVRRFSQT
5 ( 11) .....................LMALAVMFGTAMAFAP--IPRITWEHREVH--LVQFHEP
//
*
0 ( 61) HTYNYSVLLVDPASHTLYVGARDTIFALSLPFSGERPRRIDWMVPEAHRQNCRKKGR-K-
1 ( 61) HTYNYSVLLVDPASHTLYVGARDTIFALSLPFSGERPRRIDWMVPEAHRQNCRKKGK-K-
2 ( 61) HTYNYSVLLVDPASHTLYVGARDTIFALSLPFSGERPRRIDWMVPEAHRQNCRKKGK-K-
3 ( 61) HTYNYSVLLVDPASHTLYVGARDTIFALSLPFSGERPRRIDWMVPEAHRQNCRKKGK-K-
4 ( 49) GIQDFLTLTLTEPTGLLYVGAREALFAFSME-ALELQGAISWEAPVEKKTECIQKGK-NN
5 ( 46) DIYNYSALLLSEDKDTLYIGAREAVFAVNALNISEKQHEVYWKVSEDKKAKCAEKGKSK-
//
0 ( 119) EDECHNFVQILAIANASHLLTCGTFAFDPKCGVIDVSRFQQVE-RLESGRGKCPFEPAQR
1 ( 119) EDECHNFVQILAIANASHLLTCGTFAFDPKCGVIDVSRFQQVE-RLESGRGKCPFEPAQR
2 ( 119) ED---------------------------------VSRFQQVE-RLESGRGKCPFEPAQR
3 ( 119) E-----------------------------------------------------------
4 ( 107) QTECFNFIRFLQPYNASHLYVCGTYAFQPKCTYVNMLTFTLEHGEFEDGKGKCPYDPAKG
5 ( 105) QTECLNYIRVLQPLSATSLYVCGTNAFQPACDHLNLTSFKFLG-KNEDGKGRCPFDPAHS
//
0 ( 178) SAAVMAGGVLYAATVKNYLGTEPIITRAVGRAEDWIRTDTLPSWLNAPAFVAAVALSPAE
1 ( 178) SAAVMAGGVLYAATVKNYLGTEPIITRAVGRAEDWIRTDTLPSWLNAPAFVAAVALSPAE
2 ( 145) SAAVMAGGVLYAATVKNYLGTEPIITRAVGRAEDWIRTDTLPSWLNAPAFVAAVALSPAE
3 ( -) ------------------------------------------------------------
4 ( 167) HAGLLVDGELYSATLNNFLGTEPIILRNMGPHHS-MKTEYLAFWLNEPHFVGS-AYVPES
5 ( 164) YTSVMVDGELYSGTSYNFLGSEPIISRNSSHSP--LRTEYAIPWLNEPSFVFADVIRKSP
//
0 ( 238) WGDEDGDDE-IYFFFTETSRAFDSYERIKVPRVARVCAGDLGGRKTLQQRWTTFLKADLL
1 ( 238) WGDEDGDDE-IYFFFTETSRAFDSYERIKVPRVARVCAGDLGGRKTLQQRWTTFLKADLL
2 ( 205) WGDEDGDDE-IYFFFTETSRAFDSYERIKVPRVARVCAGDLGGRKTLQQRWTTFLKADLL
3 ( 120) --------------------------------------GDLGGRKTLQQRWTTFLKADLL
4 ( 225) VGSFTGDDDKVYFFFRERAVESDCYAEQVVARVARVCKGDMGGARTLQRKWTTFLKARLA
5 ( 222) DSPDGEDDR-VYFFFTEVSVEYEFVFRVLIPRIARVCKGDQGGLRTLQKKWTSFLKARLI
//
0 ( 297) CPGPEHGRASSVLQDVAVLRPELGAGTPIFYGIFSSQWEGATISAVCAFRPQDIRTVLN-
1 ( 297) CPGPEHGRASSVLQDVAVLRPELGAGTPIFYGIFSSQWEGATISAVCAFRPQDIRTVLN-
2 ( 264) CPGPEHGRASSVLQDVAVLRPELGAGTPIFYGIFSSQWEGATISAVCAFRPQDIRTVLN-
3 ( 142) CPGPEHGRASSVLQDVAVLRPELGAGTPIFYGIFSSQWEGATISAVCAFRPQDIRTVLN-
4 ( 285) CSAPNWQLYFNQLQAMHTLQ-DTSWHNTTFFGVFQAQWGDMYLSAICEYQLEEIQRVFE-
5 ( 281) CSRPDSGLVFNVLRDVFVLRSP-GLKVPVFYALFTPQLNNVGLSAVCAYNLSTAEEVFSH
//
0 ( 356) GPFRELKHDCNRGLPVV--DNDVPQPRPGECITNNMKLRH-FGSSLSLPDRVLTFIRDHP
1 ( 356) GPFRELKHDCNRGLPVV--DNDVPQPRPGECITNNMKLRH-FGSSLSLPDRVLTFIRDHP
2 ( 323) GPFRELKHDCNRGLPVV--DNDVPQPRPGECITNNMKLRH-FGSSLSLPDRVLTFIRDHP
3 ( 201) GPFRELKHDCNRGLPVV--DNDVPQPRPGECITNNMKLRH-FGSSLSLPDRVLTFIRDHP
4 ( 343) GPYKEY-HEEAQKWDRY--TDPVPSPRPGSCI-NNWHRRHGYTSSLELPDNILNFVKKHP
5 ( 340) GKYMQSTTVEQSHTKWVRYNGPVPKPRPGACIDSEARAAN-YTSSLNLPDKTLQFVKDHP
//
0 ( 413) LMDRPVFPADGHPLLVTTDTAYLRVVAHRVTSLSGKEYDVLYLGTEDGHLHRAVRIGAQL
1 ( 413) LMDRPVFPADGHPLLVTTDTAYLRVVAHRVTSLSGKEYDVLYLGTEDGHLHRAVRIGAQL
2 ( 380) LMDRPVFPADGHPLLVTTDTAYLRVVAHRVTSLSGKEYDVLYLGTEDGHLHRAVRIGAQL
3 ( 258) LMDRPVFPADGHPLLVTTDTAYLRVVAHRVTSLSGKEYDVLYLGTEDGHLHRAVRIGAQL
4 ( 399) LMEEQVGPRWSRPLLVKKGTNFTHLVADRVTGLDGATYTVLFIGTGDGWLLKAVSLGPWV
5 ( 399) LMDDSVTPIDNRPRLIKKDVNYTQIVVDRTQALDGTVYDVMFVSTDRGALHKAISLEHAV
//
0 ( 473) SVLEDLALFPEPQPVENMKLY----HS--WLLVGSRTEVTQVNTTNCGRLQSCSECILAQ
1 ( 473) SVLEDLALFPEPQPVENMKLY----HS--WLLVGSRTEVTQVNTTNCGRLQSCSECILAQ
2 ( 440) SVLEDLALFPEPQPVENMKLY----HS--WLLVGSRTEVTQVNTTNCGRLQSCSECILAQ
3 ( 318) SVLEDLALFPEPQPVENMKLY----HS--WLLVGSRTEVTQVNTTNCGRLQSCSECILAQ
4 ( 459) HLIEELQLFDQ-EPMRSLVLS----QSKKLLFAGSRSQLVQLPVADCMKYRSCADCVLAR
5 ( 459) HIIEETQLFQDFEPVQTLLLSSKKGNR--FVYAGSNSGVVQAPLAFCGKHGTCEDCVLAR
//
0 ( 527) DPVCAWSFRLDECVA-HAGEH--RG--LVQDIESADVSSLCP-KEPGE--RPVVFEVPVA
1 ( 527) DPVCAWSFRLDECVA-HAGEH--RG--LVQDIESADVSSLCP-KEPGE--RPVVFEVPVA
2 ( 494) DPVCAWSFRLDECVA-HAGEH--RG--LVQDIESADVSSLCP-KEPGE--RPVVFEVPVA
3 ( 372) DPVCAWSFRLDECVA-HAGEH--RG--LVQDIESADVSSLCP-KEPGE--RPVVFEVPVA
4 ( 514) DPYCAWSVNTSRCVA--VGGH--SGSLLIQHVMTSDTSGICN-LRGSKKVRPTPKNITVV
5 ( 517) DPYCAWSPPTATCVALHQTESPSRG--LIQEM-SGD-ASVCPDKSKGS--YRQHFFKHGG
//
0 ( 579) TAAHVVLPCSPSSAWASCVW---------HQPSGVT-ALTP------RRDGLEVVVT-PG
1 ( 579) TAAHVVLPCSPSSAWASCVW---------HQPSGVT-ALTP------RRDGLEVVVT-PG
2 ( 546) TAAHVVLPCSPSSAWASCVW---------HQPSGVT-ALTP------RRDGLEVVVT-PG
3 ( 424) TAAHVVLPCSPSSAWASCVW---------HQPSGVT-ALTP------RRDGLEVVVT-PG
4 ( 569) AGTDLVLPCHLSSNLAHARWTFGGRDLPAEQP-GSF-LYDA------RLQALVVMAAQPR
5 ( 571) TAE---LKCSQKSNLARVFW---------KFQNGVLKAESPKYGLMGRKNLLIFNLS-EG
//
0 ( 622) AMGAYACECQEGGAAHVVAAY--SLVWGSQRDAPSRAHTVGAGLAGFFLGILAASLTLIL
1 ( 622) AMGAYACECQEGGAAHVVAAY--SLVWGSQRDAPSRAHTVGAGLAGFFLGILAASLTLIL
2 ( 589) AMGAYACECQEGGAAHVVAAY--SLVWGSQRDAPSRAHTVGAGLAGFFLGILAASLTLIL
3 ( 467) AMGAYACECQEGGAAHVVAAY--SLVWGSQRDAPSRAHTVGAGLAGFFLGILAASLTLIL
4 ( 621) HAGAYHCFSEEQGARLAAEGYLVAVVAGPSVTLEARAPLENLGLVWLAVVALGAVCLVLL
5 ( 618) DSGVYQCLSEE.................................................
//
0 ( 680) IGRRQQRRRQRELLARD-KVGLDLGAPPSGTTSYSQDPP-SPSPE-DERL--PLAL----
1 ( 680) IGRRQQRRRQRELLARD-KVGLDLGAPPSGTTSYSQDPP-SPSPE-DERL--PLAL----
2 ( 647) IGRRQQRRRQRELLARD-KVGLDLGAPPSGTTSYSQDPP-SPSPE-DERL--PLAL----
3 ( 525) IGRRQQRRRQRELLARD-KVGLDLGAPPSGTTSYSQDPP-SPSPE-DERL--PLAL----
4 ( 681) LLVLSLRRRLREELEKGAKATERTLVYPLELPKEPTSPPFRPCPEPDEKLWDPVGYYYSD
5 ( -) ............................................................
//
0 ( 731) ---------AKRGSGFGGFSPPFLL--DPCPSPAHIRLTGAPLATCDETSI
1 ( 731) ---------AKRGSGFGGFSPPFLL--DPCPSPAHIRLTGAPLATCDETSI
2 ( 698) ---------AKRGSGFGGFSPPFLL--DPCPSPAHIRLTGAPLATCDETSI
3 ( 576) ---------AKRGSGFGGFSPPFLL--DPCPSPAHIRLTGAPLATCDETSI
4 ( 741) GSLKIVPGHARCQPGGGPPSPPPGIPGQPLPSPTRLHLGG...........
5 ( -) ...................................................
//