Multiple alignment for pF1KB8501
Check alignment(s).
#  0    Query: pF1KB8501, 936 aa
#  1    CCDS670.1 MSH4 gene_id:4438|Hs108|chr1    (936 aa)
#  2    CCDS58709.1 MSH2 gene_id:4436|Hs108|chr2    (868 aa)
#  3    CCDS1834.1 MSH2 gene_id:4436|Hs108|chr2    (934 aa)
#  4    CCDS34195.1 MSH3 gene_id:4437|Hs108|chr5    (1137 aa)
#  5    CCDS4720.1 MSH5 gene_id:4439|Hs108|chr6    (834 aa)

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        exp       sw-scr    id%      from      to
   1    0           6010   99.9         1     936
   2    9.1e-29      751   27.0        94     780
   3    9.7e-29      751   27.0       160     846
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   5    3e-17        520   24.3       253     823

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   1  (    1)    MLRPEISSTSPSAPAVSPSSGETRSPQGPRYNFGLQETPQSRPSVQVVSASTCPGTSGAA
   2  (    -)    ............................................................
   3  (    -)    ............................................................
   4  (    -)    ............................................................
   5  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (   61)    GDRSSSSSSLPCPAPNSRPAQGSYFGNKRAYAENTVASNFTFGASSSSARDTNYPQTLKT
   1  (   61)    GDRSSSSSSLPCPAPNSRPAQGSYFGNKRAYAENTVASNFTFGASSSSARDTNYPQTLKT
   2  (    -)    ............................................................
   3  (    -)    ............................................................
   4  (    -)    ............................................................
   5  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (  121)    PLSTGNPQRSGYKSWTPQVGYSASSSSAISAHSPSVIVAVVEGRGLARGEIGMASIDLKN
   1  (  121)    PLSTGNPQRSGYKSWTPQVGYSASSSSAISAHSPSVIVAVVEGRGLARGEIGMASIDLKN
   2  (   94)    .................................................QVGVGYVDSIQ
   3  (  160)    .................................................QVGVGYVDSIQ
   4  (  388)    ..................................................IGIVGVQPAT
   5  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
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   1  (  181)    PQIILSQFADNTTYAKVITKLKILSPLEIIM--SNTACAVGNSTKLF----T----LITE
   2  (  105)    RKLGLCEFPDNDQFSNLEALLIQIGPKECVLPGGETAGDMGKLRQII----QRGGILITE
   3  (  171)    RKLGLCEFPDNDQFSNLEALLIQIGPKECVLPGGETAGDMGKLRQII----QRGGILITE
   4  (  398)    GEVVFDSFQDSASRSELETRMSSLQPVELLL--PS---ALSEQTEALIHRAT----SVSV
   5  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (  231)    NFKNVNFTT--IQRKYFNETKGLEYIEQLCIAEFSTV--------LMEVQSKYYCLAAVA
   1  (  231)    NFKNVNFTT--IQRKYFNETKGLEYIEQLCIAEFSTV--------LMEVQSKYYCLAAVA
   2  (  161)    R-KKADFSTKDIYQDLNRLLKG-KKGEQMN----SAV--------LPEMENQV-AVSSLS
   3  (  227)    R-KKADFSTKDIYQDLNRLLKG-KKGEQMN----SAV--------LPEMENQV-AVSSLS
   4  (  449)    QDDRIRVER--MDNIYFEYSHAFQAVTEFYAKDTVDIKGSQIISGIVNLEKPVIC--SLA
   5  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (  281)    ALLKYV-EF-IQNSVYAPKSLKICFQGSEQTAMIDSSSAQNLELLINN-QDYRNNHTLFG
   1  (  281)    ALLKYV-EF-IQNSVYAPKSLKICFQGSEQTAMIDSSSAQNLELLINN-QDYRNNHTLFG
   2  (  206)    AVIKFL-EL-LSDDSNFGQFELTTFDFS-QYMKLDIAAVRALNLFQGSVEDTTGSQSLAA
   3  (  272)    AVIKFL-EL-LSDDSNFGQFELTTFDFS-QYMKLDIAAVRALNLFQGSVEDTTGSQSLAA
   4  (  505)    AIIKYLKEFNLEKMLSKPENFKQ-LSSKMEFMTINGTTLRNLEILQNQ-TDMKTKGSLLW
   5  (  253)    ........................................................SLFG

//
                                            *                                
   0  (  338)    VLNYTKTPGGSRRLRSNILEPLVDIETVNMRLDCVQELLQDEELFFG-LQ-SVISRFLDT
   1  (  338)    VLNYTKTPGGSRRLRSNILEPLVDIETINMRLDCVQELLQDEELFFG-LQ-SVISRFLDT
   2  (  263)    LLNKCKTPQGQRLVNQWIKQPLMDKNRIEERLNLVEAFVEDAELRQT-LQEDLLRRFPDL
   3  (  329)    LLNKCKTPQGQRLVNQWIKQPLMDKNRIEERLNLVEAFVEDAELRQT-LQEDLLRRFPDL
   4  (  563)    VLDHTKTSFGRRKLKKWVTQPLLKLREINARLDAVSEVLHSESSVFGQIE-NHLRKLPDI
   5  (  257)    ILNRCHCKWGEKLLRLWFTRPTHDLGELSSRLDVIQFFLLPQNL--D-MA-QMLHRLLGH

//
                                                                             
   0  (  396)    EQLLSVLVQIPKQDTVNAAESKITNLIY--LKHTLELVDPLKIAMKNCNTPLLRAYYGSL
   1  (  396)    EQLLSVLVQIPKQDTVNAAESKITNLIY--LKHTLELVDPLKIAMKNCNTPLLRAYYGSL
   2  (  322)    NRLAK---KFQRQ----AANLQDCYRLYQGINQLPNVIQALEKHEGKHQKLLLAVFVTPL
   3  (  388)    NRLAK---KFQRQ----AANLQDCYRLYQGINQLPNVIQALEKHEGKHQKLLLAVFVTPL
   4  (  622)    ERGLCSIYH--KKCSTQEFFLIVKTLYH--LKSEFQAIIP--AVNSHIQSDLLRT-----
   5  (  313)    IKNVPLILK-----RMKLSHTKVSDWQV--LYKTVYSALGLRDACRS--LPQSIQLFRDI

//
                                                                             
   0  (  454)    EDKR--FGIILEKIKTVINDDARYMKGCLNMRTQKC---YAVRSNINEFLDIARRT--YT
   1  (  454)    EDKR--FGIILEKIKTVINDDARYMKGCLNMRTQKC---YAVRSNINEFLDIARRT--YT
   2  (  375)    TDLRSDFSKFQEMIETTLD-----MDQVENHEFLVK---PSFDPNLSELREIMNDL--EK
   3  (  441)    TDLRSDFSKFQEMIETTLD-----MDQVENHEFLVK---PSFDPNLSELREIMNDL--EK
   4  (  671)    --------VILE-IPELLSPVEHYLK-ILNEQAAKVGDKTELFKDLSDFPLIKKRKDEIQ
   5  (  364)    A-QE--FSDDLHHIASLIGKVVDF-EGSL---AENR---FTVLPNIDPEIDEKKRR--LM

//
                                                                             
   0  (  507)    EIVDDIAGMISQLGEKYSLPLRTSFSSARG--FFIQMTTDCIALPSDQLPSEFIKISKVK
   1  (  507)    EIVDDIAGMISQLGEKYSLPLRTSFSSARG--FFIQMTTDCIALPSDQLPSEFIKISKVK
   2  (  425)    KMQSTLISAARDLGLDPGKQIKLDSSAQFG--YYFRVT--CKEEKVLRNNKNFSTVDIQK
   3  (  491)    KMQSTLISAARDLGLDPGKQIKLDSSAQFG--YYFRVT--CKEEKVLRNNKNFSTVDIQK
   4  (  721)    GVIDEIRMHLQEIRKILKNP-SAQYVTVSGQEFMIEIKNSAVSC----IPTDWVKVGSTK
   5  (  412)    ----GLPSFLTEVARKELENLDSRIPSCSV--IYIPLIGFLLSIP--RLPS-MVEASDFE

//
                                                                             
   0  (  565)    -NSYSFTSADLIKMNERCQESLR----------EIYHMTYMIVCK-----LLSEIYEHIH
   1  (  565)    -NSYSFTSADLIKMNERCQESLR----------EIYHMTYMIVCK-----LLSEIYEHIH
   2  (  481)    -NGVKFTNSKLTSLNEEYTKNKT----------EYEEAQDAIVKE-----IVNISSGYVE
   3  (  547)    -NGVKFTNSKLTSLNEEYTKNKT----------EYEEAQDAIVKE-----IVNISSGYVE
   4  (  776)    -AVSRFHSPFIVE-NYRHLNQLR----------E----QLVLDCSAEWLDFLEKFSEHYH
   5  (  463)    INGLDFMFLSEEKLHYRSARTKELDALLGDLHCEIRDQETLLMYQ-----LQCQVLARAA

//
                                                                             
   0  (  609)    CLYKLSDTVSMLDMLLSFAHACTLSD--YVRPEFTDT----LA---IKQGWHPILEKISA
   1  (  609)    CLYKLSDTVSMLDMLLSFAHACTLSD--YVRPEFTDT----LA---IKQGWHPILEKISA
   2  (  525)    PMQTLNDVLAQLDAVVSFAHVSNGAPVPYVRPAILEKGQGRII---LKASRHACVEVQDE
   3  (  591)    PMQTLNDVLAQLDAVVSFAHVSNGAPVPYVRPAILEKGQGRII---LKASRHACVEVQDE
   4  (  820)    SLCKAVHHLATVDCIFSLAKVAKQGD--YCRPTVQEERK--IV---IKNGRHPVIDVLLG
   5  (  518)    VLTRVLDLASRLDVLLALASAARDYG--YSRPRYSPQ----VLGVRIQNGRHPLME-LCA

//
                                                                             
   0  (  660)    EKP--IANNTYVT-EGSN-FLIITGPNMSGKSTYLKQIALCQIMAQIGSYVPAEYSSFRI
   1  (  660)    EKP--IANNTYVT-EGSN-FLIITGPNMSGKSTYLKQIALCQIMAQIGSYVPAEYSSFRI
   2  (  582)    IAF--IPNDVYFE-KDKQMFHIITGPNMGGKSTYIRQTGVIVLMAQIGCFVPCESAEVSI
   3  (  648)    IAF--IPNDVYFE-KDKQMFHIITGPNMGGKSTYIRQTGVIVLMAQIGCFVPCESAEVSI
   4  (  873)    EQDQYVPNNTDLS-EDSERVMIITGPNMGGKSSYIKQVALITIMAQIGSYVPAEEATIGI
   5  (  571)    RTF--VPNSTECGGDKGR-VKVITGPNSSGKSIYLKQVGLITFMALVGSFVPAEEAEIGA

//
                                                                             
   0  (  716)    AKQIFTRISTDDDIETNSSTFMKEMKEIAYILHNANDKSLILIDELGRGTNTEEGIGICY
   1  (  716)    AKQIFTRISTDDDIETNSSTFMKEMKEIAYILHNANDKSLILIDELGRGTNTEEGIGICY
   2  (  639)    VDCILARVGAGDSQLKGVSTFMAEMLETASILRSATKDSLIIIDELGRGTSTYDGFGLAW
   3  (  705)    VDCILARVGAGDSQLKGVSTFMAEMLETASILRSATKDSLIIIDELGRGTSTYDGFGLAW
   4  (  932)    VDGIFTRMGAADNIYKGQSTFMEELTDTAEIIRKATSQSLVILDELGRGTSTHDGIAIAY
   5  (  628)    VDAIFTRIHSCESISLGLSTFMIDLNQVAKAVNNATAQSLVLIDEFGKGTNTVDGLALLA

//
                                                                             
   0  (  776)    AVCEYLL-S---LKAFTLFATHFLELCHIDALY--PN-VENMHFEVQHVKNTSR------
   1  (  776)    AVCEYLL-S---LKAFTLFATHFLELCHIDALY--PN-VENMHFEVQHVKNTSR------
   2  (  699)    AISEYIA-TK--IGAFCMFATHFHELTALANQI--PT-VNNLHV------TALT------
   3  (  765)    AISEYIA-TK--IGAFCMFATHFHELTALANQI--PT-VNNLHV------TALT------
   4  (  992)    ATLEYFIRD---VKSLTLFVTHYPPVCELEKNY--SHQVGNYHMGFLVSEDESKLDPGAA
   5  (  688)    AVLRHWL-ARGPTCPHIFVATNFLSLVQLQLLPQGPL-VQYLTME------TCE------

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   0  (  823)    --NKEAILYTYKLSKGLTEEKNYGLKAAEVSSLPPSIVLDAKEITTQITRQILQNQRSTP
   1  (  823)    --NKEAILYTYKLSKGLTEEKNYGLKAAEVSSLPPSIVLDAKEITTQITRQILQNQRSTP
   2  (  741)    --TEETLTMLYQVKKGVCDQ-SFGIHVAELANFPKHVIECAKQ.................
   3  (  807)    --TEETLTMLYQVKKGVCDQ-SFGIHVAELANFPKHVIECAKQ.................
   4  ( 1047)    EQVPDFVTFLYQITRGIAA-RSYGLNVAKLADVPGEILKKAAHKSKEL-...........
   5  (  734)    --DGNDLVFFYQVCEGVAKASHASHTAAQ-AGLPDKLVARGKEVSDLIRSG--KPIKPVK

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   0  (  881)    EMERQRAVYHLATRLVQTARNSQLDPD-SLRIYLSNLKKKYKEDFPRTEQVPEKTEE
   1  (  881)    EMERQRAVYHLATRLVQTARNSQLDPD-SLRIYLSNLKKKYKEDFPRTEQVPEKTEE
   2  (    -)    .........................................................
   3  (    -)    .........................................................
   4  (    -)    .........................................................
   5  (  789)    DLLKKNQMENCQTLVDKFMKLDLEDPNLDLNVFMS......................

//
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