# 0 Query: pF1KB4239, 1208 aa
# 1 CCDS58812.1 CHL1 gene_id:10752|Hs108|chr3 (1208 aa)
# 2 CCDS2556.1 CHL1 gene_id:10752|Hs108|chr3 (1224 aa)
# 3 CCDS74887.1 CHL1 gene_id:10752|Hs108|chr3 (1171 aa)
# 4 CCDS48192.1 L1CAM gene_id:3897|Hs108|chrX (1248 aa)
# 5 CCDS14734.1 L1CAM gene_id:3897|Hs108|chrX (1253 aa)
//
exp sw-scr id% from to
1 0 8165 99.8 1 1208
2 0 8119 98.4 1 1224
3 7.3e-211 7645 94.1 1 1171
4 6.7e-98 2926 39.3 20 1238
5 2.5e-97 2912 39.1 18 1243
//
0 ( 1) MEPLLLGRGLIVYLMFLLLKFSKAIEIPSSVQQVPTIIKQS-KVQVAFPFDEYFQIECEA
1 ( 1) MEPLLLGRGLIVYLMFLLLKFSKAIEIPSSVQQVPTIIKQS-KVQVAFPFDEYFQIECEA
2 ( 1) MEPLLLGRGLIVYLMFLLLKFSKAIEIPSSVQQVPTIIKQS-KVQVAFPFDEYFQIECEA
3 ( 1) MEPLLLGRGLIVYLMFLLLKFSKAIEIPSSVQQVPTIIKQS-KVQVAFPFDEYFQIECEA
4 ( 20) ........................IQIPEELMEPPVITEQSPRRLVVFPTDD-ISLKCEA
5 ( 18) ................LLIQIPEEYE-GHHVMEPPVITEQSPRRLVVFPTDD-ISLKCEA
//
0 ( 60) KGNPEPTFSWTKDGNPFYFTDH---RIIPSNNSGTFRIP--NEGHISHFQGKYRCFASNK
1 ( 60) KGNPEPTFSWTKDGNPFYFTDH---RIIPSNNSGTFRIP--NEGHISHFQGKYRCFASNK
2 ( 60) KGNPEPTFSWTKDGNPFYFTDH---RIIPSNNSGTFRIP--NEGHISHFQGKYRCFASNK
3 ( 60) KGNPEPTFSWTKDGNPFYFTDH---RIIPSNNSGTFRIP--NEGHISHFQGKYRCFASNK
4 ( 55) SGKPEVQFRWTRDGVHFKPKEELGVTVYQSPHSGSFTITGNNSNFAQRFQGIYRCFASNK
5 ( 60) SGKPEVQFRWTRDGVHFKPKEELGVTVYQSPHSGSFTITGNNSNFAQRFQGIYRCFASNK
//
0 ( 115) LGIAMSEEIEFIVPSVPKFPKEKIDPLEVEEGDPIVLPCNPPKGLPPLHIYWMNIELEHI
1 ( 115) LGIAMSEEIEFIVPSVPKFPKEKIDPLEVEEGDPIVLPCNPPKGLPPLHIYWMNIELEHI
2 ( 115) LGIAMSEEIEFIVPSVPKFPKEKIDPLEVEEGDPIVLPCNPPKGLPPLHIYWMNIELEHI
3 ( 115) LGIAMSEEIEFIVPSVPKFPKEKIDPLEVEEGDPIVLPCNPPKGLPPLHIYWMNIELEHI
4 ( 115) LGTAMSHEIRLMAEGAPKWPKETVKPVEVEEGESVVLPCNPPPSAEPLRIYWMNSKILHI
5 ( 120) LGTAMSHEIRLMAEGAPKWPKETVKPVEVEEGESVVLPCNPPPSAEPLRIYWMNSKILHI
//
0 ( 175) EQDERVYMSQKGDLYFANVEEKDSRNDYCCFAAFPRLRTIVQKMPMKLTVNS--------
1 ( 175) EQDERVYMSQKGDLYFANVEEKDSRNDYCCFAAFPRLRTIVQKMPMKLTVNS--------
2 ( 175) EQDERVYMSQKGDLYFANVEEKDSRNDYCCFAAFPRLRTIVQKMPMKLTVNSLKHANDSS
3 ( 175) EQDERVYMSQKGDLYFANVEEKDSRNDYCCFAAFPRLRTIVQKMPMKLTVNSLKHANDSS
4 ( 175) KQDERVTMGQNGNLYFANVLTSDNHSDYICHAHFPGTRTIIQKEPIDLRVKA--------
5 ( 180) KQDERVTMGQNGNLYFANVLTSDNHSDYICHAHFPGTRTIIQKEPIDLRVKA--------
//
0 ( 227) --------SNSIKQRKPKLLLPPTESGSESSITILKGEILLLECFAEGLPTPQVDWNKIG
1 ( 227) --------SNSIKQRKPKLLLPPTESGSESSITILKGEILLLECFAEGLPTPQVDWNKIG
2 ( 235) SSTEIGSKANSIKQRKPKLLLPPTESGSESSITILKGEILLLECFAEGLPTPQVDWNKIG
3 ( 235) SSTEIGSKANSIKQRKPKLLLPPTESGSESSITILKGEILLLECFAEGLPTPQVDWNKIG
4 ( 227) --------TNSMIDRKPRLLFP---TNSSSHLVALQGQPLVLECIAEGFPTPTIKWLRPS
5 ( 232) --------TNSMIDRKPRLLFP---TNSSSHLVALQGQPLVLECIAEGFPTPTIKWLRPS
//
*
0 ( 279) GDLPKGREAKENYGKTLKIENVSYQDKGNYRCTASNFLGTATHDFHVIVEEPPRWTKKPQ
1 ( 279) GDLPKGRETKENYGKTLKIENVSYQDKGNYRCTASNFLGTATHDFHVIVEEPPRWTKKPQ
2 ( 295) GDLPKGRETKENYGKTLKIENVSYQDKGNYRCTASNFLGTATHDFHVIVEEPPRWTKKPQ
3 ( 295) GDLPKGRETKENYGKTLKIENVSYQDKGNYRCTASNFLGTATHDFHVIVEEPPRWTKKPQ
4 ( 276) GPMPADRVTYQNHNKTLQLLKVGEEDDGEYRCLAENSLGSARHAYYVTVEAAPYWLHKPQ
5 ( 281) GPMPADRVTYQNHNKTLQLLKVGEEDDGEYRCLAENSLGSARHAYYVTVEAAPYWLHKPQ
//
0 ( 339) SAVYSTGSNGILLCEAEGEPQPTIKWRVNGSPVDNHPFAGDVVFPR-EISFTNLQPNHTA
1 ( 339) SAVYSTGSNGILLCEAEGEPQPTIKWRVNGSPVDNHPFAGDVVFPR-EISFTNLQPNHTA
2 ( 355) SAVYSTGSNGILLCEAEGEPQPTIKWRVNGSPVDNHPFAGDVVFPR-EISFTNLQPNHTA
3 ( 355) SAVYSTGSNGILLCEAEGEPQPTIKWRVNGSPVDNHPFAGDVVFPR-EISFTNLQPNHTA
4 ( 336) SHLYGPGETARLDCQVQGRPQPEVTWRINGIPVEELAKDQKYRIQRGALILSNVQPSDTM
5 ( 341) SHLYGPGETARLDCQVQGRPQPEVTWRINGIPVEELAKDQKYRIQRGALILSNVQPSDTM
//
0 ( 398) VYQCEASNVHGTILANANIDVVDVRPLIQTKDGENYATVVGYSAFLHCEFFASPEAVVSW
1 ( 398) VYQCEASNVHGTILANANIDVVDVRPLIQTKDGENYATVVGYSAFLHCEFFASPEAVVSW
2 ( 414) VYQCEASNVHGTILANANIDVVDVRPLIQTKDGENYATVVGYSAFLHCEFFASPEAVVSW
3 ( 414) VYQCEASNVHGTILANANIDVVDVRPLIQTKDGENYATVVGYSAFLHCEFFASPEAVVSW
4 ( 396) VTQCEARNRHGLLLANAYIYVVQLPAKILTADNQTYMAVQGSTAYLLCKAFGAPVPSVQW
5 ( 401) VTQCEARNRHGLLLANAYIYVVQLPAKILTADNQTYMAVQGSTAYLLCKAFGAPVPSVQW
//
0 ( 458) QKVEEVKPLEGRRYHIYENGTLQINRTTEEDAGSYSCWVENAIGKTAVTANLDIRNATKL
1 ( 458) QKVEEVKPLEGRRYHIYENGTLQINRTTEEDAGSYSCWVENAIGKTAVTANLDIRNATKL
2 ( 474) QKVEEVKPLEGRRYHIYENGTLQINRTTEEDAGSYSCWVENAIGKTAVTANLDIRNATKL
3 ( 474) QKVEEVKPLEGRRYHIYENGTLQINRTTEEDAGSYSCWVENAIGKTAVTANLDIRNATKL
4 ( 456) LDEDGTTVLQDERFFPYANGTLGIRDLQANDTGRYFCLAANDQNNVTIMANLKVKDATQI
5 ( 461) LDEDGTTVLQDERFFPYANGTLGIRDLQANDTGRYFCLAANDQNNVTIMANLKVKDATQI
//
0 ( 518) RVSPKNPRIPKLHMLELHCESKCDSHLKHSLKLSWSKDGEAFEINGTEDGRIIIDGANLT
1 ( 518) RVSPKNPRIPKLHMLELHCESKCDSHLKHSLKLSWSKDGEAFEINGTEDGRIIIDGANLT
2 ( 534) RVSPKNPRIPKLHMLELHCESKCDSHLKHSLKLSWSKDGEAFEINGTEDGRIIIDGANLT
3 ( 534) RVSPKNPRIPKLHMLELHCESKCDSHLKHSLKLSWSKDGEAFEINGTEDGRIIIDGANLT
4 ( 516) TQGPRSTIEKKGSRVTFTCQASFDPSLQPSI--TWRGDGRDLQELGDSDKYFIEDG-RLV
5 ( 521) TQGPRSTIEKKGSRVTFTCQASFDPSLQPS--ITWRGDGRDLQELGDSDKYFIEDG-RLV
//
0 ( 578) ISNVTLEDQGIYCCSAHTALDSAADITQVTVLDVPDPPENLHLSERQ---NRSVRLTWEA
1 ( 578) ISNVTLEDQGIYCCSAHTALDSAADITQVTVLDVPDPPENLHLSERQ---NRSVRLTWEA
2 ( 594) ISNVTLEDQGIYCCSAHTALDSAADITQVTVLDVPDPPENLHLSERQ---NRSVRLTWEA
3 ( 594) ISNVTLEDQGIYCCSAHTALDSAADITQVTVLDVPDPPENLHLSERQ---NRSVRLTWEA
4 ( 573) IHSLDYSDQGNYSCVASTELDVVESRAQLLVVGSPGPVPRLVLSDLHLLTQSQVRVSWSP
5 ( 578) IHSLDYSDQGNYSCVASTELDVVESRAQLLVVGSPGPVPRLVLSDLHLLTQSQVRVSWSP
//
0 ( 635) GADHNSNISEYIVEFEGNKEEPGRWEELTRVQGKKTTVILPLAPFVRYQFRVIAVNEVGR
1 ( 635) GADHNSNISEYIVEFEGNKEEPGRWEELTRVQGKKTTVILPLAPFVRYQFRVIAVNEVGR
2 ( 651) GADHNSNISEYIVEFEGNKEEPGRWEELTRVQGKKTTVILPLAPFVRYQFRVIAVNEVGR
3 ( 651) GADHNSNISEYIVEFEGNKEEPGRWEELTRVQGKKTTVILPLAPFVRYQFRVIAVNEVGR
4 ( 633) AEDHNAPIEKYDIEFEDKEMAPEKWYSLGKVPGNQTSTTLKLSPYVHYTFRVTAINKYGP
5 ( 638) AEDHNAPIEKYDIEFEDKEMAPEKWYSLGKVPGNQTSTTLKLSPYVHYTFRVTAINKYGP
//
0 ( 695) SQPSQPSDHHETPPAAPDRNPQNIRVQASQPKEMIIKWEPLKSMEQNGPGLEYRVTWKPQ
1 ( 695) SQPSQPSDHHETPPAAPDRNPQNIRVQASQPKEMIIKWEPLKSMEQNGPGLEYRVTWKPQ
2 ( 711) SQPSQPSDHHETPPAAPDRNPQNIRVQASQPKEMIIKWEPLKSMEQNGPGLEYRVTWKPQ
3 ( 711) SQPSQPSDHHETPPAAPDRNPQNIRVQASQPKEMIIKWEPLKSMEQNGPGLEYRVTWKPQ
4 ( 693) GEPSPVSETVVTPEAAPEKNPVDVKGEGNETTNMVITWKPLRWMDWNAPQVQYRVQWRPQ
5 ( 698) GEPSPVSETVVTPEAAPEKNPVDVKGEGNETTNMVITWKPLRWMDWNAPQVQYRVQWRPQ
//
0 ( 755) GAPVEWEEETVTNHTLRVMTPAVYAPYDVKVQAINQLGSGPDPQSVTLYSGEDYPDTAPV
1 ( 755) GAPVEWEEETVTNHTLRVMTPAVYAPYDVKVQAINQLGSGPDPQSVTLYSGEDYPDTAPV
2 ( 771) GAPVEWEEETVTNHTLRVMTPAVYAPYDVKVQAINQLGSGPDPQSVTLYSGEDYPDTAPV
3 ( 771) GAPVEWEEETVTNHTLRVMTPAVYAPYDVKVQAINQLGSGPDPQSVTLYSGEDYPDTAPV
4 ( 753) GTRGPWQEQIVSDPFLVVSNTSTFVPYEIKVQAVNSQGKGPEPQVTIGYSGEDYPQAIPE
5 ( 758) GTRGPWQEQIVSDPFLVVSNTSTFVPYEIKVQAVNSQGKGPEPQVTIGYSGEDYPQAIPE
//
0 ( 815) IHGVDVINSTLVKVTWSTVPKDRVHGRLKGYQINWWKTKSLLD-GRTHPKEVNILRFSGQ
1 ( 815) IHGVDVINSTLVKVTWSTVPKDRVHGRLKGYQINWWKTKSLLD-GRTHPKEVNILRFSGQ
2 ( 831) IHGVDVINSTLVKVTWSTVPKDRVHGRLKGYQINWWKTKSLLD-GRTHPKEVNILRFSGQ
3 ( 831) IHGVDVINSTLVKVTWSTVPKDRVHGRLKGYQINWWKTKSLLD-GRTHPKEVNILRFSGQ
4 ( 813) LEGIEILNSSAVLVKWRPVDLAQVKGHLRGYNVTYWREGSQRKHSKRHIHKDHVV-VPAN
5 ( 818) LEGIEILNSSAVLVKWRPVDLAQVKGHLRGYNVTYWREGSQRKHSKRHIHKDHVV-VPAN
//
0 ( 874) RNSGMVPSLDAFSEFHLTVLAYNSKGAGPESEPYIFQTPEGVPEQPTFLKVIKVDKDTAT
1 ( 874) RNSGMVPSLDAFSEFHLTVLAYNSKGAGPESEPYIFQTPEGVPEQPTFLKVIKVDKDTAT
2 ( 890) RNSGMVPSLDAFSEFHLTVLAYNSKGAGPESEPYIFQTPEGVPEQPTFLKVIKVDKDTAT
3 ( 890) RNSGMVPSLDAFSEFHLTVLAYNSKGAGPESEPYIFQTPEGVPEQPTFLKVIKVDKDTAT
4 ( 872) TTSVILSGLRPYSSYHLEVQAFNGRGSGPASE-FTFSTPEGVPGHPEALHLECQSNTSLL
5 ( 877) TTSVILSGLRPYSSYHLEVQAFNGRGSGPASE-FTFSTPEGVPGHPEALHLECQSNTSLL
//
0 ( 934) LSWGLPKKLNGNLTGYLLQYQIINDTYEIGELNDINITTPSKPSWHLSNLNATTKYKFYL
1 ( 934) LSWGLPKKLNGNLTGYLLQYQIINDTYEIGELNDINITTPSKPSWHLSNLNATTKYKFYL
2 ( 950) LSWGLPKKLNGNLTGYLLQYQIINDTYEIGELNDINITTPSKPSWHLSNLNATTKYKFYL
3 ( 950) LSWGLPKKLNGNLTGYLLQYQIINDTYEIGELNDINITTPSKPSWHLSNLNATTKYKFYL
4 ( 931) LRWQPPLSHNGVLTGYVLSYHPLDEGGK-GQLS-FNLRDPELRTHNLTDLSPHLRYRFQL
5 ( 936) LRWQPPLSHNGVLTGYVLSYHPLDEGGK-GQLS-FNLRDPELRTHNLTDLSPHLRYRFQL
//
*
0 ( 994) RACTSQGCGKPITEESSTLG-EGSKGIGKIS---GVNLTQKTH-PVE---------VFEP
1 ( 994) RACTSQGCGKPITEESSTLG-EGSKGIGKIS---GVNLTQKTH-PIE---------VFEP
2 ( 1010) RACTSQGCGKPITEESSTLG-EGSKGIGKIS---GVNLTQKTH-PIE---------VFEP
3 ( 1010) RACTSQGCGKPITEESSTLG-EG-------------------------------------
4 ( 989) QATTKEGPGEAIVREGGTMALSGISDFGNISATAGENYSVVSWVPKEGQCNFRFHILFKA
5 ( 994) QATTKEGPGEAIVREGGTMALSGISDFGNISATAGENYSVVSWVPKEGQCNFRFHILFKA
//
0 ( 1040) ------GAEHIVRLMTKN------WG---DND---SIFQD-------VIETRGREYAGLY
1 ( 1040) ------GAEHIVRLMTKN------WG---DND---SIFQD-------VIETRGREYAGLY
2 ( 1056) ------GAEHIVRLMTKN------WG---DND---SIFQD-------VIETRGREYAGLY
3 ( 1032) ------------------------------------------------------KYAGLY
4 ( 1049) LGEEKGGASLSPQYVSYNQSSYTQWDLQPDTDYEIHLFKERMFRHQMAVKTNGTGRVRLP
5 ( 1054) LGEEKGGASLSPQYVSYNQSSYTQWDLQPDTDYEIHLFKERMFRHQMAVKTNGTGRVRLP
//
0 ( 1075) D-DISTQGWFIGLMCAIALLTLLLLTVCFVKRNRGGKYSVKEKEDLHPDPEIQSVKDETF
1 ( 1075) D-DISTQGWFIGLMCAIALLTLLLLTVCFVKRNRGGKYSVKEKEDLHPDPEIQSVKDETF
2 ( 1091) D-DISTQGWFIGLMCAIALLTLLLLTVCFVKRNRGGKYSVKEKEDLHPDPEIQSVKDETF
3 ( 1038) D-DISTQGWFIGLMCAIALLTLLLLTVCFVKRNRGGKYSVKEKEDLHPDPEIQSVKDETF
4 ( 1109) PAGFATEGWFIGFVSAIILLLLVLLILCFIKRSKGGKYSVKDKEDTQVDSEARPMKDETF
5 ( 1114) PAGFATEGWFIGFVSAIILLLLVLLILCFIKRSKGGKYSVKDKEDTQVDSEARPMKDETF
//
0 ( 1134) GEYSDSDEKPLKGSLRSLNRDMQPTESADSLVEYGEGDHGLFSEDGSFIGAYAGSKEKGS
1 ( 1134) GEYSDSDEKPLKGSLRSLNRDMQPTESADSLVEYGEGDHGLFSEDGSFIGAYAGSKEKGS
2 ( 1150) GEYSDSDEKPLKGSLRSLNRDMQPTESADSLVEYGEGDHGLFSEDGSFIGAYAGSKEKGS
3 ( 1097) GEYSDSDEKPLKGSLRSLNRDMQPTESADSLVEYGEGDHGLFSEDGSFIGAYAGSKEKGS
4 ( 1169) GEYSDNEEKAFGSSQPSLNGDIKPLGSDDSLADYGGSVDVQFNEDGSFIGQYSGKKEKEA
5 ( 1174) GEYSDNEEKAFGSSQPSLNGDIKPLGSDDSLADYGGSVDVQFNEDGSFIGQYSGKKEKEA
//
0 ( 1194) VESNGSSTATFPLRA
1 ( 1194) VESNGSSTATFPLRA
2 ( 1210) VESNGSSTATFPLRA
3 ( 1157) VESNGSSTATFPLRA
4 ( 1229) AGGNDSSGAT.....
5 ( 1234) AGGNDSSGAT.....
//
