Multiple alignment for pF1KB0496
Check alignment(s).
#  0    Query: pF1KB0496, 1042 aa
#  1    CCDS3967.1 SKIV2L2 gene_id:23517|Hs108|chr5    (1042 aa)
#  2    CCDS4731.1 SKIV2L gene_id:6499|Hs108|chr6    (1246 aa)
#  3    CCDS33833.1 POLQ gene_id:10721|Hs108|chr3    (2590 aa)

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        exp       sw-scr    id%      from      to
   1    0           6856  100.0         1    1042
   2    2.6e-46     1983   36.4       250    1244
   3    3.6e-13      387   27.3       105     520

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   0  (    1)    MADAFGDELFSVFEGDSTTAAGTKKDKEKDKGKWKGPPGSADKAGKRFDGKLQSESTNNG
   1  (    1)    MADAFGDELFSVFEGDSTTAAGTKKDKEKDKGKWKGPPGSADKAGKRFDGKLQSESTNNG
   2  (    -)    ............................................................
   3  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (   61)    KNKRDVDFEGTDEPIFGKKPRIEESITEDLSLADLMPRVKVQSVETVEGCTHEV-ALPAE
   1  (   61)    KNKRDVDFEGTDEPIFGKKPRIEESITEDLSLADLMPRVKVQSVETVEGCTHEV-ALPAE
   2  (  250)    ...................PLARASSLEDLVLKE--ASTAVSTPEAPEPPSQEQWAIPVD
   3  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (  120)    E-----DYLPLKPRVGKAAKEYPFILDAFQREAIQCVDNNQSVLVSAHTSAGKTVCAEYA
   1  (  120)    E-----DYLPLKPRVGKAAKEYPFILDAFQREAIQCVDNNQSVLVSAHTSAGKTVCAEYA
   2  (  289)    ATSPVGDFYRLIP---QPAFQWAFEPDVFQKQAILHLERHDSVFVAAHTSAGKTVVAEYA
   3  (  105)    ....................................VLEGKNLVYSAPTSAGKTLVAELL

//
                                                                             
   0  (  175)    I-ALALREKQRVIFTSPIKALSNQKYREMYEEFQDVGL-MTGDV-TINPT--------AS
   1  (  175)    I-ALALREKQRVIFTSPIKALSNQKYREMYEEFQDVGL-MTGDV-TINPT--------AS
   2  (  346)    I-ALAQKHMTRTIYTSPIKALSNQKFRDFRNTFGDVGL-LTGDV-QLHPE--------AS
   3  (  129)    ILKRVLEMRKKALFILPFVSVAKEKKYYLQSLFQEVGIKVDGYMGSTSPSRHFSSLDIAV

//
                                                                             
   0  (  224)    CLVMTTEILRSMLYRGSEVMREVAWVIFDEIHYMRDSERGVVWEETIIL-----------
   1  (  224)    CLVMTTEILRSMLYRGSEVMREVAWVIFDEIHYMRDSERGVVWEETIIL-----------
   2  (  395)    CLIMTTEILRSMLYSGSDVIRDLEWVIFDEVHYINDVERGVVWEEVLIM-----------
   3  (  189)    CTIERANGLINRLIEENK-MDLLGMVVVDELHMLGDSHRGYLLELLLTKICYITRKSASC

//
                                                                             
   0  (  273)    -------LPDNVHYVFLSATIPNARQFAEWICHLHKQPCHVIYTDYRPTPLQHYIFPAGG
   1  (  273)    -------LPDNVHYVFLSATIPNARQFAEWICHLHKQPCHVIYTDYRPTPLQHYIFPAGG
   2  (  444)    -------LPDHVSIILLSATVPNALEFADWIGRLKRRQIYVISTVTRPVPLEHYLFTGNS
   3  (  248)    QADLASSLSNAVQIVGMSATLPNLELVASWLN------AELYHTDFRPVPLLESV-KVGN

//
                                                                             
   0  (  326)    DG----LHLVVDENGDF-REDNFNTAMQVLRD-AGDLAK---GDQKGRKGGTKGPSNVF-
   1  (  326)    DG----LHLVVDENGDF-REDNFNTAMQVLRD-AGDLAK---GDQKGRKGGTKGPSNVF-
   2  (  497)    SKTQGELFLLLDSRGAF-HTKGYYAAVEAKKERMSKHAQTFGAKQPTHQGGPAQDRGVYL
   3  (  301)    S--------IYDSSMKLVRE--FEPMLQV---------K---GDE----------DHVV-

//
                                                                             
   0  (  376)    KIVKMIMERNFQPVIIFSFSKKDCEAYALQMTKLDFNTDEEKK-MVEE-----VFSNAID
   1  (  376)    KIVKMIMERNFQPVIIFSFSKKDCEAYALQMTKLDFNTDEEKK-MVEE-----VFSNAID
   2  (  556)    SLLASLRTRAQLPVVVFTFSRGRCDEQASGLTSLDLTTSSEKS-EIHL-----FLQRCLA
   3  (  328)    SLCYETICDN-HSVLLFCPSKKWCEKLADIIAREFYNLHHQAEGLVKPSECPPVILEQKE

//
                                                                             
   0  (  430)    CLS--DEDKKLPQ-VEHVLP-LLKRGIGIHHGGLLPILKETIEILFSEGLIKALFATETF
   1  (  430)    CLS--DEDKKLPQ-VEHVLP-LLKRGIGIHHGGLLPILKETIEILFSEGLIKALFATETF
   2  (  610)    RLR--GSDRQLPQ-VLHMSE-LLNRGLGVHHSGILPILKEIVEMLFSRGLVKVLFATETF
   3  (  387)    LLEVMDQLRRLPSGLDSVLQKTVPWGVAFHHAGLTFEERDIIEGAFRQGLIRVLAATSTL

//
                                                                             
   0  (  486)    AMGINMPARTVLFTNARKFDGKDFRWISSGEYIQMSGRAGRRGMDDRGIVILMVDEKMSP
   1  (  486)    AMGINMPARTVLFTNARKFDGKDFRWISSGEYIQMSGRAGRRGMDDRGIVILMVDEKMSP
   2  (  666)    AMGVNMPARTVVFDSMRKHDGSTFRDLLPGEYVQMAGRAGRRGLDPTGTVILLCKGRV-P
   3  (  447)    SSGVNLPARRVIIRTP-IFGGRPLDILT---YKQMVGRAGRKGVDTVGESILICKNSEK-

//
                                                                             
   0  (  546)    TIG--KQLLKGSADPLNSAFHLTYNMVLNLLRVEEINPEYMLEKSFYQFQHYRAIPGVVE
   1  (  546)    TIG--KQLLKGSADPLNSAFHLTYNMVLNLLRVEEINPEYMLEKSFYQFQHYRAIPGVVE
   2  (  725)    EMADLHRMMMGKPSQLQSQFRLTYTMILNLLRVDALRVEDMMKRSFSEFPSRKDSKAHEQ
   3  (  502)    SKG--IALLQGSLKPVRSCLQ.......................................

//
                                                                             
   0  (  604)    KVKNSEEQYNKIVIPNEESVVI----YYKIRQQLAKLGKEIEEYIHKPKYCLPFLQPGRL
   1  (  604)    KVKNSEEQYNKIVIPNEESVVI----YYKIRQQLAKLGKEIEEYIHKPKYCLPFLQPGRL
   2  (  785)    ALAELTKRLGALEEPDMTGQLVDLPEYYSWGEELTETQHMIQRRIMESVNGLKSLSAGRV
   3  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (  660)    VKVKNEGDDFGWGVVVNFSKKSNVKPNSGELDPLYVVEVLLRCSK---ESLKNSATEAAK
   1  (  660)    VKVKNEGDDFGWGVVVNFSKKSNVKPNSGELDPLYVVEVLLRCSK---ESLKNSATEAAK
   2  (  845)    VVVKNQEHHNALGVILQVSSNSTSR----------VFTTLVLCDKPLSQDPQDRGPATAE
   3  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (  717)    PAKPDEK-GEMQVVP------VLVHL----LSAISS--VRLYIPKDLRPVDNRQ------
   1  (  717)    PAKPDEK-GEMQVVP------VLVHL----LSAISS--VRLYIPKDLRPVDNRQ------
   2  (  895)    VPYPDDLVGFKLFLPEGPCDHTVVKLQPGDMAAITTKVLRVNGEKILEDFSKRQQPKFKK
   3  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (  758)    -----SVLKSIQEVQK---RFPDGIPLLDPIDDMGIQDQGLKKVIQKVEAFEHRMYSHPL
   1  (  758)    -----SVLKSIQEVQK---RFPDGIPLLDPIDDMGIQDQGLKKVIQKVEAFEHRMYSHPL
   2  (  955)    DPPLAAVTTAVQELLRLAQAHPAGPPTLDPVNDLQLKDMSVVEGGLRARKLEELIQGAQC
   3  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (  810)    HNDPNLETVYTLCEKKAQIAIDIKSAKRELKKARTVLQMDELKCRKRVLRRLGFATSSDV
   1  (  810)    HNDPNLETVYTLCEKKAQIAIDIKSAKRELKKARTVLQMDELKCRKRVLRRLGFATSSDV
   2  ( 1015)    VHSPRFPAQYLKLRERMQIQKEMERL-RFLLSDQSLLLLPEYHQRVEVLRTLGYVDEAGT
   3  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (  870)    IEMKGRVACEISSADELLLTEMMFNGLFNDLSAEQATALLSCFVFQENSSEMPKLTEQLA
   1  (  870)    IEMKGRVACEISSADELLLTEMMFNGLFNDLSAEQATALLSCFVFQENSSEMPKLTEQLA
   2  ( 1074)    VKLAGRVACAMSS-HELLLTELMFDNALSTLRPEEIAALLSGLVCQSPGDAGDQLPNTLK
   3  (    -)    ............................................................

//
                                                                             
   0  (  930)    GPLRQMQECAKRIAKVSAEAKLEIDEETYLSSFKPHLMDVVYTWATGATFAHICKMTDVF
   1  (  930)    GPLRQMQECAKRIAKVSAEAKLEIDEETYLSSFKPHLMDVVYTWATGATFAHICKMTDVF
   2  ( 1133)    QGIERVRAVAKRIGEVQVACGLNQTVEEFVGELNFGLVEVVYEWARGMPFSELAGLSGTP
   3  (    -)    ............................................................

//
                                                                      
   0  (  990)    EGSIIRCMRRLEELLRQMCQAAKAIGNTELENKFAEGITKIKRDIVFAASLYL
   1  (  990)    EGSIIRCMRRLEELLRQMCQAAKAIGNTELENKFAEGITKIKRDIVFAASLYL
   2  ( 1193)    EGLVVRCIQRLAEMCRSLRGAARLVGEPVLGAKMETAATLLRRDIVFAASLY.
   3  (    -)    .....................................................

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