Multiple alignment for pF1KA1496
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#  0    Query: pF1KA1496, 1028 aa
#  1    CCDS33790.1 CNTN3 gene_id:5067|Hs108|chr3    (1028 aa)
#  2    CCDS43041.1 CNTN4 gene_id:152330|Hs108|chr3    (1026 aa)
#  3    CCDS2557.1 CNTN6 gene_id:27255|Hs108|chr3    (1028 aa)
#  4    CCDS53697.1 CNTN5 gene_id:53942|Hs108|chr11    (1026 aa)
#  5    CCDS53696.1 CNTN5 gene_id:53942|Hs108|chr11    (1100 aa)

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        exp       sw-scr    id%      from      to
   1    0           6839  100.0         1    1028
   2    7e-180      4738   64.9         1    1020
   3    1.3e-164    4348   59.5         1    1018
   4    4.5e-145    3848   54.4         1    1021
   5    1.3e-143    3811   54.9        98    1095

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   1  (    1)    MMFPWKQLILLSFIGCLGGELLLQGPVFIKEPSNSIFPVGSEDKKITLHCEARGNPSPHY
   2  (    1)    MRLPWELLVLQSFILCLADDSTLHGPIFIQEPSPVMFPLDSEEKKVKLNCEVKGNPKPHI
   3  (    1)    MRLLWKLVILLPLINSSAGDGLLSRPIFTQEPHDVIFPLDLSKSEVILNCAANGYPSPHY
   4  (    1)    MASSWKLMLFLSVTMCLS-ESVDYGPVFVQEPDDIIFPTDSDEKKVALNCEVRGNPVPSY
   5  (   98)    ........................GPVFVQEPDDIIFPTDSDEKKVALNCEVRGNPVPSY

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   0  (   61)    RWQLNGSDIDMSMEHRYKLNGGNLVVINPNRNWDTGTYQCFATNSLGTIVSREAKLQFAY
   1  (   61)    RWQLNGSDIDMSMEHRYKLNGGNLVVINPNRNWDTGTYQCFATNSLGTIVSREAKLQFAY
   2  (   61)    RWKLNGTDVDTGMDFRYSVVEGSLLINNPNKTQDAGTYQCTATNSFGTIVSREAKLQFAY
   3  (   61)    RWKQNGTDIDFTMSYHYRLDGGSLAINSPHTDQDIGMYQCLATNLLGTILSRKAKLQFAY
   4  (   60)    RWLRNGTEIDLESDYRYSLIDGTFIISNPSEAKDSGHYQCLATNTVGSILSREATLQFAY
   5  (  134)    RWLRNGTEIDLESDYRYSLIDGTFIISNPSEAKDSGHYQCLATNTVGSILSREATLQFAY

//
                                                                             
   0  (  121)    LENFKTKMRSTVSVREGQGVVLLCGPPPHSGELSYAWIFNEYPSFVEEDSRRFVSQETGH
   1  (  121)    LENFKTKMRSTVSVREGQGVVLLCGPPPHSGELSYAWIFNEYPSFVEEDSRRFVSQETGH
   2  (  121)    LDNFKTRTRSTVSVRRGQGMVLLCGPPPHSGELSYAWIFNEYPSY--QDNRRFVSQETGN
   3  (  121)    IEDFETKTRSTVSVREGQGVVLLCGPPPHFGDLSYAWTFNDNPLYVQEDNRRFVSQETGN
   4  (  120)    LGNFSGRTRSAVSVREGQGVVLMCSPPPHSPEIIYSWVFNEFPSFVAEDSRRFISQETGN
   5  (  194)    LGNFSGRTRSAVSVREGQGVVLMCSPPPHSPEIIYSWVFNEFPSFVAEDSRRFISQETGN

//
                                                                             
   0  (  181)    LYISKVEPSDVGNYTCVVTSMVTNARVLGSPTPLVLRSDGVMGEYEPKIEVQFPETLPAA
   1  (  181)    LYISKVEPSDVGNYTCVVTSMVTNARVLGSPTPLVLRSDGVMGEYEPKIEVQFPETLPAA
   2  (  179)    LYIAKVEKSDVGNYTCVVTNTVTNHKVLGPPTPLILRNDGVMGEYEPKIEVQFPETVPTA
   3  (  181)    LYIAKVEPSDVGNYTCFITNKEAQRSVQGPPTPLVQRTDGVMGEYEPKIEVRFPETIQAA
   4  (  180)    LYISKVQTSDVGSYICLVKNTVTNARVLSPPTPLTLRNDGVMGEYEPKIEVHFPFTVTAA
   5  (  254)    LYISKVQTSDVGSYICLVKNTVTNARVLSPPTPLTLRNDGVMGEYEPKIEVHFPFTVTAA

//
                                                                             
   0  (  241)    KGSTVKLECFALGNPIPQINWRRSDG-LPFSSKIKLRKFSGVLEIPNFQQEDAGSYECIA
   1  (  241)    KGSTVKLECFALGNPIPQINWRRSDG-LPFSSKIKLRKFSGVLEIPNFQQEDAGSYECIA
   2  (  239)    KGATVKLECFALGNPVPTIIWRRADG-KPIARKARRHKSNGILEIPNFQQEDAGLYECVA
   3  (  241)    KDSSVKLECFALGNPVPDISWRRLDG-SPLPGKVKYSKSQAILEIPNFQQEDEGFYECIA
   4  (  240)    KGTTVKMECFALGNPVPTITWMKVNGYIP--SKARLRKSQAVLEIPNVQLDDAGIYECRA
   5  (  314)    KGTTVKMECFALGNPVPTITWMKVNGYIP--SKARLRKSQAVLEIPNVQLDDAGIYECRA

//
                                                                             
   0  (  300)    ENSRGKNVARGRLTYYAKPHWVQLIKDVEIAVEDSLYWECRASGKPKPSYRWLKNGAALV
   1  (  300)    ENSRGKNVARGRLTYYAKPHWVQLIKDVEIAVEDSLYWECRASGKPKPSYRWLKNGAALV
   2  (  298)    ENSRGKNVARGQLTFYAQPNWIQKINDIHVAMEENVFWECKANGRPKPTYKWLKNGEPLL
   3  (  300)    SNLRGRNLAKGQLIFYAPPEWEQKIQNTHLSIYDNLLWECKASGKPNPWYTWLKNGERLN
   4  (  298)    ENSRGKNSFRGQLQVYTYPHWVEKLNDTQLDSGSPLRWECKATGKPRPTYRWLKNGVPLS
   5  (  372)    ENSRGKNSFRGQLQVYTYPHWVEKLNDTQLDSGSPLRWECKATGKPRPTYRWLKNGVPLS

//
                                                                             
   0  (  360)    LEERTQIENGALTISNLSVTDSGMFQCIAENKHGLVYSSAELKVVASAPDFSKNPMKKLV
   1  (  360)    LEERTQIENGALTISNLSVTDSGMFQCIAENKHGLVYSSAELKVVASAPDFSKNPMKKLV
   2  (  358)    TRDRIQIEQGTLNITIVNLSDAGMYQCLAENKHGVIFSNAELSVIAVGPDFSRTLLKRVT
   3  (  360)    PEERIQIENGTLIITMLNVSDSGVYQCAAENKYQIIYANAELRVLASAPDFSKSPVKKKS
   4  (  358)    PQSRVEMVNGVLMIHNVNQSDAGMYQCLAENKYGAIYASAELKILASAPTFALNQLKKTI
   5  (  432)    PQSRVEMVNGVLMIHNVNQSDAGMYQCLAENKYGAIYASAELKILASAPTFALNQLKKTI

//
                                                                             
   0  (  420)    QVQVGSLVSLDCKPRASPRALSSWKKGDVSVQEHERISLLNDGGLKIANVTKADAGTYTC
   1  (  420)    QVQVGSLVSLDCKPRASPRALSSWKKGDVSVQEHERISLLNDGGLKIANVTKADAGTYTC
   2  (  418)    LVKVGGEVVIECKPKASPKPVYTWKKGRDILKENERITISEDGNLRIINVTKSDAGSYTC
   3  (  420)    FVQVGGDIVIGCKPNAFPRAAISWKRGTETLRQSKRIFLLEDGSLKIYNITRSDAGSYTC
   4  (  418)    IVTKDQEVVIECKPQGSPKPTISWKKGDRAVRENKRIAILPDGSLRILNASKSDEGKYVC
   5  (  492)    IVTKDQEVVIECKPQGSPKPTISWKKGDRAVRENKRIAILPDGSLRILNASKSDEGKYVC

//
                                                                             
   0  (  480)    MAENQFGKANGTTHLVVTEPTRITLAPSNMDVSVGESVILPCQVQHDPLLDIIFTWYFNG
   1  (  480)    MAENQFGKANGTTHLVVTEPTRITLAPSNMDVSVGESVILPCQVQHDPLLDIIFTWYFNG
   2  (  478)    IATNHFGTASSTGNLVVKDPTRVMVPPSSMDVTVGESIVLPCQVTHDHSLDIVFTWSFNG
   3  (  480)    IATNQFGTAKNTGSLIVKERTVITVPPSKMDVTVGESIVLPCQVSHDPSIEVVFVWFFNG
   4  (  478)    RGENVFGSAEIIASLSVKEPTRIELTPKRTELTVGESIVLNCKAIHDASLDVTFYWTLKG
   5  (  552)    RGENVFGSAEIIASLSVKEPTRIELTPKRTELTVGESIVLNCKAIHDASLDVTFYWTLKG

//
                                                                             
   0  (  540)    ALADFKKDGSHFEKV-GGS-SSGDLMIRNIQLKHSGKYVCMVQTGVDSVSSAADLIVRGS
   1  (  540)    ALADFKKDGSHFEKV-GGS-SSGDLMIRNIQLKHSGKYVCMVQTGVDSVSSAADLIVRGS
   2  (  538)    HLIDFDRDGDHFERV-GGQDSAGDLMIRNIQLKHAGKYVCMVQTSVDRLSAAADLIVRGP
   3  (  540)    DVIDLKKGVAHFERI-GGE-SVGDLMIRNIQLHHSGKYLCTVQTTLESLSAVADIIVRGP
   4  (  538)    QPIDFEEEGGHFESIRAQA-SSADLMIRNILLMHAGRYGCRVQTTADSVSDEAELLVRGP
   5  (  612)    QPIDFEEEGGHFESIRAQA-SSADLMIRNILLMHAGRYGCRVQTTADSVSDEAELLVRGP

//
                                                                             
   0  (  598)    PGPPENVKVDEITDTTAQLSWKEGKDNHSPVISYSIQARTPFSVGWQTVTTVPEVIDGKT
   1  (  598)    PGPPENVKVDEITDTTAQLSWKEGKDNHSPVISYSIQARTPFSVGWQTVTTVPEVIDGKT
   2  (  597)    PGPPEAVTIDEITDTTAQLSWRPGPDNHSPITMYVIQARTPFSVGWQAVSTVPELIDGKT
   3  (  598)    PGPPEDVQVEDISSTTSQLSWRAGPDNNSPIQIFTIQTRTPFSVGWQAVATVPEILNGKT
   4  (  597)    PGPPGIVIVEEITESTATLSWSPAADNHSPISSYNLQARSPFSLGWQTVKTVPEIITGDM
   5  (  671)    PGPPGIVIVEEITESTATLSWSPAADNHSPISSYNLQARSPFSLGWQTVKTVPEIITGDM

//
                                                                             
   0  (  658)    HTATVVELNPWVEYEFRVVASNKIGGGEPSLPSEKVRTEEAVPEVPPSEVNGGGGSRSEL
   1  (  658)    HTATVVELNPWVEYEFRVVASNKIGGGEPSLPSEKVRTEEAVPEVPPSEVNGGGGSRSEL
   2  (  657)    FTATVVGLNPWVEYEFRTVAANVIGIGEPSRPSEKRRTEEALPEVTPANVSGGGGSKSEL
   3  (  658)    YNATVVGLSPWVEYEFRVVAGNSIGIGEPSEPSELLRTKASVPVVAPVNIHGGGGSRSEL
   4  (  657)    ESAMAVDLNPWVEYEFRVVATNPIGTGDPSTPSRMIRTNEAVPKTAPTNVSGRSGRRHEL
   5  (  731)    ESAMAVDLNPWVEYEFRVVATNPIGTGDPSTPSRMIRTNEAVPKTAPTNVSGRSGRRHEL

//
                                                                             
   0  (  718)    VITWDPVPEELQNGEGFGYVVAFRPLGVTTWIQTVVTSPDTPRYVFRNESIVPYSPYEVK
   1  (  718)    VITWDPVPEELQNGEGFGYVVAFRPLGVTTWIQTVVTSPDTPRYVFRNESIVPYSPYEVK
   2  (  717)    VITWETVPEELQNGRGFGYVVAFRPYGKMIWMLTVLASADASRYVFRNESVHPFSPFEVK
   3  (  718)    VITWESIPEELQNGEGFGYIIMFRPVGSTTWSKEKVSSVESSRFVYRNESIIPLSPFEVK
   4  (  717)    VIAWEPVSEEFQNGEGFGYIVAFRPNGTRGWKEKMVTSSEASKFIYRDESVPPLTPFEVK
   5  (  791)    VIAWEPVSEEFQNGEGFGYIVAFRPNGTRGWKEKMVTSSEASKFIYRDESVPPLTPFEVK

//
                                                                             
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   1  (  778)    VGVYNNKGEGPFSPVTTVFSAEEEPTVAPSQVSANSLSSSEIEVSWNTIPWKLSNGHLLG
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//
                                                                             
   0  (  838)    YEVRYWNGGGKEESSSKMKVAGNETSARLRGLKSNLAYYTAVRAYNSAGAGPFSATVNVT
   1  (  838)    YEVRYWNGGGKEESSSKMKVAGNETSARLRGLKSNLAYYTAVRAYNSAGAGPFSATVNVT
   2  (  836)    YEVKYWRHEDKEENARKIRTVGNQTSTKITNLKGSVLYHLAVKAYNSAGTGPSSATVNVT
   3  (  838)    YEVLYWTDDSKESMIGKIRVSGNVTTKNITGLKANTIYFASVRAYNTAGTGPSSPPVNVT
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   5  (  909)    FEVGYWKDMEQEDTAETVKTRGNESFVILTGLEGNTLYHFTVRAYNGAGYGPPSSEVSAT

//
                                                                             
   0  (  898)    TKKTPPSQPPGNVVWNATDTKVLLNWEQVKAMENESEVTGYKVFYRTSSQNNVQVLNTNK
   1  (  898)    TKKTPPSQPPGNVVWNATDTKVLLNWEQVKAMENESEVTGYKVFYRTSSQNNVQVLNTNK
   2  (  896)    TRKPPPSQPPGNIIWNSSDSKIILNWDQVKALDNESEVKGYKVLYRWNRQSSTSVIETNK
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   5  (  969)    TKKSPPSQAPSNLRWEQQGSQVSLGWEPVIPLANESEVVGYKVFYRQEGHSNSQVIETQK

//
                                                                             
   0  (  958)    TSAELVLPIKEDYIIEVKATTDGGDGTSSEQIRIPRITSMDARGSTSAISNVHPMSSYMP
   1  (  958)    TSAELVLPIKEDYIIEVKATTDGGDGTSSEQIRIPRITSMDARGSTSAISNVHPMSSYMP
   2  (  956)    TSVELSLPFDEDYIIEIKPFSDGGDGSSSEQIRIPKISNAYARGSGASTSNACTLSAIST
   3  (  958)    TSAELLVPFEEDYLIEIRTVSDGGDGSSSEEIRIPKMSSLSSRG----IQFLEPSTHFLS
   4  (  955)    LQAVVPLPDAGVYIIEVRAYSEGGDGTASSQIRVP---SYSGGKITSAQSTLHSLSTSSS
   5  ( 1029)    LQAVVPLPDAGVYIIEVRAYSEGGDGTASSQIRVP---SYSGGKITSAQSTLHSLSTSSS

//
                            
   0  ( 1018)    IVLFLIVYVLW
   1  ( 1018)    IVLFLIVYVLW
   2  ( 1016)    IMISL......
   3  ( 1014)    IVIVI......
   4  ( 1012)    SVTLLLALMI.
   5  ( 1086)    SVTLLLALMI.

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