FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2678, 1484 aa 1>>>pF1KE2678 1484 - 1484 aa - 1484 aa Library: human.CCDS.faa 18921897 residues in 33420 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6141+/-0.00114; mu= 16.3725+/- 0.068 mean_var=82.7390+/-16.221, 0's: 0 Z-trim(103.3): 48 B-trim: 0 in 0/49 Lambda= 0.141000 statistics sampled from 7394 (7440) to 7394 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.572), E-opt: 0.2 (0.223), width: 16 Scan time: 2.530 The best scores are: opt bits E(33420) CCDS8662.1 GRIN2B gene_id:2904|Hs109|chr12 (1484) 10020 2049.2 0 CCDS10539.1 GRIN2A gene_id:2903|Hs109|chr16 (1464) 4699 966.8 0 CCDS45407.1 GRIN2A gene_id:2903|Hs109|chr16 (1281) 4687 964.3 0 CCDS32724.1 GRIN2C gene_id:2905|Hs109|chr17 (1233) 3402 702.9 1.5e-201 CCDS62330.1 GRIN2C gene_id:2905|Hs109|chr17 ( 873) 3272 676.5 1e-193 CCDS12719.1 GRIN2D gene_id:2906|Hs109|chr19 (1336) 2627 545.3 4.7e-154 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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS86 QELDQPAAPVAVTSNASTTKYPQSPTNSKAQKKNRNKLRRQHSYDTFVDLQKEEAALAPR 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1380 pF1KE2 SVSLKDKGRFMDGSPYAHMFEMSAGESTFANNKSSVPTAGHHHHNNPGGGYMLSKSLYPD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS86 SVSLKDKGRFMDGSPYAHMFEMSAGESTFANNKSSVPTAGHHHHNNPGGGYMLSKSLYPD 1330 1340 1350 1360 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1440 pF1KE2 RVTQNPFIPTFGDDQCLLHGSKSYFFRQPTVAGASKARPDFRALVTNKPVVSALHGAVPA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS86 RVTQNPFIPTFGDDQCLLHGSKSYFFRQPTVAGASKARPDFRALVTNKPVVSALHGAVPA 1390 1400 1410 1420 1430 1440 1450 1460 1470 1480 pF1KE2 RFQKDICIGNQSNPCVPNNKNPRAFNGSSNGHVYEKLSSIESDV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS86 RFQKDICIGNQSNPCVPNNKNPRAFNGSSNGHVYEKLSSIESDV 1450 1460 1470 1480 >>CCDS10539.1 GRIN2A gene_id:2903|Hs109|chr16 (1464 aa) initn: 3723 init1: 3338 opt: 4699 Z-score: 5156.7 bits: 966.8 E(33420): 0 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CCDS10 MGRVGYWTLLVLPALLVWRGPAPSAAAEKGPPALNIAVML-GHSHDVTERELRT 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 KDDFHHLSVVP-RVELVA--MNETDPKSIITRICDLMSDRKIQGVVFADDTDQEAIAQIL .. . .: :..:: ::.:::::.::..::::: .:.:.::.:::::::.::.: CCDS10 LWGPEQAAGLPLDVNVVALLMNRTDPKSLITHVCDLMSGARIHGLVFGDDTDQEAVAQML 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 DFISAQTLTPILGIHGGSSMIMADKDESSMFFQFGPSIEQQASVMLNIMEEYDWYIFSIV ::::..:..::::::::.:::::::: .: ::::: ::.:::.:::.::..:::..::.: CCDS10 DFISSHTFVPILGIHGGASMIMADKDPTSTFFQFGASIQQQATVMLKIMQDYDWHVFSLV 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 TTYFPGYQDFVNKIRSTIENSFVGWELEEVLLLDMSLDDGDSKIQNQLKKLQSPIILLYC :: ::::..:.. ...:..::::::....:. :: :.. :.: : ::::..: .::::: CCDS10 TTIFPGYREFISFVKTTVDNSFVGWDMQNVITLDTSFE--DAKTQVQLKKIHSSVILLYC 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 TKEEATYIFEVANSVGLTGYGYTWIVPSLVAGDTDTVPAEFPTGLISVSYDEWDYGLPAR .:.::. :. : :.::::: . :::::::.:.:. .: :::.::::::::.:::.: :: CCDS10 SKDEAVLILSEARSLGLTGYDFFWIVPSLVSGNTELIPKEFPSGLISVSYDDWDYSLEAR 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 VRDGIAIITTAASDMLSEHSFIPEPKSSCYNTHEKRIYQSNMLNRYLINVTFEGRNLSFS :::::.:.:::::.:: . :.::: :.:::. :. . :. ...:::..:..:::. CCDS10 VRDGIGILTTAASSMLEKFSYIPEAKASCYGQMERPEVPMHTLHPFMVNVTWDGKDLSFT 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 EDGYQMHPKLVIILLNKERKWERVGKWKDKSLQMKYYVWPRMCPETE-EQEDDHLSIVTL :.:::.::.::.:.:::.:.::.::::....:.... ::::. .. : .:.::::::: CCDS10 EEGYQVHPRLVVIVLNKDREWEKVGKWENHTLSLRHAVWPRYKSFSDCEPDDNHLSIVTL 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE2 EEAPFVIVESVDPLSGTCMRNTVPCQKRIVTENKTDEEPGY-IKKCCKGFCIDILKKISK :::::::::..:::. ::.::::::.: . .:.:.: :. .::::::::::::::.:. CCDS10 EEAPFVIVEDIDPLTETCVRNTVPCRKFVKINNSTNE--GMNVKKCCKGFCIDILKKLSR 420 430 440 450 460 480 490 500 510 520 530 pF1KE2 SVKFTYDLYLVTNGKHGKKINGTWNGMIGEVVMKRAYMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFI .::::::::::::::::::.:..:::::::::..:: ::::::::::::::::::::::. 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CCDS32 LASPPRQASPDLTASSAQASVLKMLQAARDMVTTAGVS----SSLD--RATRTIENWGGG 880 890 900 910 920 940 950 960 970 980 990 pF1KE2 RRSFTHSDCKS-YNNP-PCEENLFSDYISEVERTFGNLQLKDSNVYQDHYHHHHRPHSIG ::. : : . ..: :: CCDS32 RRAPPPSPCPTPRSGPSPCLPTPDPPPEPSPTGWGPPDGGRAALVRRAPQPPGRPPTPGP 930 940 950 960 970 980 >>CCDS62330.1 GRIN2C gene_id:2905|Hs109|chr17 (873 aa) initn: 3266 init1: 2298 opt: 3272 Z-score: 3591.6 bits: 676.5 E(33420): 1e-193 Smith-Waterman score: 3272; 60.6% identity (83.5% similar) in 781 aa overlap (71-848:67-845) 50 60 70 80 90 100 pF1KE2 LVGTSDEVAIKDAHEKDDFHHLSVVPRVELVAMNETDPKSIITRICDLMSDRKIQGVVFA :..: :.:.:..:.:: :.. ...:.:: CCDS62 SSSGPPQAQFRARLTPQSFLDLPLEIQPLTVGVNTTNPSSLLTQICGLLGAAHVHGIVFE 40 50 60 70 80 90 110 120 130 140 150 160 pF1KE2 DDTDQEAIAQILDFISAQTLTPILGIHGGSSMIMADKDESSMFFQFGPSIEQQASVMLNI :..: ::.::::::::.:: .:::.: :::..... :. .: :.:.: :.::: .:.... 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CCDS62 LNVTWEGRDFSFSPGGYLVQPTMVVIALNRHRLWEMVGRWEHGVLYMKYPVWPRYSASLQ 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 pF1KE2 EQEDD-HLSIVTLEEAPFVIVESVDPLSGTCMRNTVPCQKRIV-TENKTDEEPGYIKKCC :. ::...:::: ::::::: :: .: :. :::::... : .. : : : : :: CCDS62 PVVDSRHLTVATLEERPFVIVESPDPGTGGCVPNTVPCRRQSNHTFSSGDVAP-YTKLCC 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 pF1KE2 KGFCIDILKKISKSVKFTYDLYLVTNGKHGKKINGTWNGMIGEVVMKRAYMAVGSLTINE ::::::::::... :::.:::::::::::::.. :.:::::::: .::: ::.::::::: CCDS62 KGFCIDILKKLARVVKFSYDLYLVTNGKHGKRVRGVWNGMIGEVYYKRADMAIGSLTINE 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 pF1KE2 ERSEVVDFSVPFIETGISVMVSRSNGTVSPSAFLEPFSADVWVMMFVMLLIVSAVAVFVF ::::.:::::::.::::::::.::::::::::::::.: :::::::: : : :..::.: CCDS62 ERSEIVDFSVPFVETGISVMVARSNGTVSPSAFLEPYSPAVWVMMFVMCLTVVAITVFMF 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 pF1KE2 EYFSPVGYNRCLADGREPGGPSFTIGKAIWLLWGLVFNNSVPVQNPKGTTSKIMVSVWAF ::::::.::. :. :.. :::.:::::..::::.::::::::..::.:::::::: :::: CCDS62 EYFSPVSYNQNLTRGKKSGGPAFTIGKSVWLLWALVFNNSVPIENPRGTTSKIMVLVWAF 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 pF1KE2 FAVIFLASYTANLAAFMIQEEYVDQVSGLSDKKFQRPNDFSPPFRFGTVPNGSTERNIRN ::::::::::::::::::::.:.: ::::::::::::.: ::::::::::::::::::. 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CCDS12 QQLQVIFEVLEEYDWTSFVAVTTRAPGHRAFLSYIEVLTDGSLVGWEHRGALTLDPG--A 170 180 190 200 210 220 220 230 240 250 260 pF1KE2 GDSKIQNQLKKLQSPIILLYCTKEEATYIFEVANSVGLTGYGYTWIV--PSLVAGDTDTV :.. .. ::..... : ::.:..::: .:..:. .:::: ::.:.. :.:..: . . CCDS12 GEAVLSAQLRSVSAQIRLLFCAREEAEPVFRAAEEAGLTGSGYVWFMVGPQLAGGGGSGA 230 240 250 260 270 280 270 280 290 300 310 320 pF1KE2 PAE---------FPTGLISVSYDEWDYGLPARVRDGIAIITTAASDMLSEHSFIPEPKSS :.: .:.::..: : : :: :.:... .:. .: ...:.:: . CCDS12 PGEPPLLPGGAPLPAGLFAVRSAGWRDDLARRVAAGVAVVARGAQALLRDYGFLPELGHD 290 300 310 320 330 340 330 340 350 360 370 380 pF1KE2 CYNTHEKRIYQSNMLNRYLINVTFEGRNLSFSEDGYQMHPKLVIILLNKERKWERVGKWK : ..: .... :.::..:.:...:. ::.:::. ..:.::.: :...: :: ::.:. CCDS12 CRA--QNRTHRGESLHRYFMNITWDNRDYSFNEDGFLVNPSLVVISLTRDRTWEVVGSWE 350 360 370 380 390 400 390 400 410 420 430 pF1KE2 DKSLQMKYYVWPRMCPETEEQED-DHLSIVTLEEAPFVIVESVDPLSGTCMRNTVPCQKR ...:..:: .: :. . .: .::...:::: :::::: .::.::::.:..:::... CCDS12 QQTLRLKYPLWSRYGRFLQPVDDTQHLTVATLEERPFVIVEPADPISGTCIRDSVPCRSQ 410 420 430 440 450 460 440 450 460 470 480 490 pF1KE2 IV-TENKTDEEPGYIKKCCKGFCIDILKKISKSVKFTYDLYLVTNGKHGKKINGTWNGMI . :.. . : :.:::::::::::...... :.:::::::::::::::.:.::::: CCDS12 LNRTHSPPPDAPRPEKRCCKGFCIDILKRLAHTIGFSYDLYLVTNGKHGKKIDGVWNGMI 470 480 490 500 510 520 500 510 520 530 540 550 pF1KE2 GEVVMKRAYMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFIETGISVMVSRSNGTVSPSAFLEPFSADV ::: ..:: ::.:::::::::::.:::::::.::::::::.::::::::::::::.: : CCDS12 GEVFYQRADMAIGSLTINEERSEIVDFSVPFVETGISVMVARSNGTVSPSAFLEPYSPAV 530 540 550 560 570 580 560 570 580 590 600 610 pF1KE2 WVMMFVMLLIVSAVAVFVFEYFSPVGYNRCLADGREPGGPSFTIGKAIWLLWGLVFNNSV ::::::: : : ::.::.:::.::::::: :: :..::: .:::::.:::::.::::::: CCDS12 WVMMFVMCLTVVAVTVFIFEYLSPVGYNRSLATGKRPGGSTFTIGKSIWLLWALVFNNSV 590 600 610 620 630 640 620 630 640 650 660 670 pF1KE2 PVQNPKGTTSKIMVSVWAFFAVIFLASYTANLAAFMIQEEYVDQVSGLSDKKFQRPNDFS ::.::.:::::::: :::::::::::::::::::::::::::: ::::::.:::::.. CCDS12 PVENPRGTTSKIMVLVWAFFAVIFLASYTANLAAFMIQEEYVDTVSGLSDRKFQRPQEQY 650 660 670 680 690 700 680 690 700 710 720 730 pF1KE2 PPFRFGTVPNGSTERNIRNNYAEMHAYMGKFNQRGVDDALLSLKTGKLDAFIYDAAVLNY ::..::::::::::.:::.:: .::.:: ..:: :..:: .::.::::::::::::::: CCDS12 PPLKFGTVPNGSTEKNIRSNYPDMHSYMVRYNQPRVEEALTQLKAGKLDAFIYDAAVLNY 710 720 730 740 750 760 740 750 760 770 780 790 pF1KE2 MAGRDEGCKLVTIGSGKVFASTGYGIAIQKDSGWKRQVDLAILQLFGDGEMEELEALWLT :: .::::::::::::::::.::::::..: : ::: .:::.::..:: :.: :: :::. CCDS12 MARKDEGCKLVTIGSGKVFATTGYGIALHKGSRWKRPIDLALLQFLGDDEIEMLERLWLS 770 780 790 800 810 820 800 810 820 830 840 850 pF1KE2 GICHNEKNEVMSSQLDIDNMAGVFYMLGAAMALSLITFICEHLFYWQFRHCFMGVCSGKP :::::.: :::::.::::::::::::: .::.:::..: ::: ::..::: .: . . 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CCDS67 SQGEMME-LDLVSLVLHIPVISI---VRHEFPRESQNPLHLQLSLENSLSSDADVTVSIL 210 220 230 240 250 170 180 190 200 210 220 pF1KE2 EEYDWYIFSIVTTYFP-GYQDFVNKIRSTIENSFVGWELEEVLLLDMSLDDGDSKIQNQL .:: ::.. . ::. . . ...: . .. : .: : .: :: CCDS67 TMNNWYNFSLLLCQEDWNITDFL--LLTQNNSKFHLGSIINITANLPSTQDLLSFLQIQL 260 270 280 290 300 310 230 240 250 260 270 pF1KE2 KKLQ--SPIILLY-CTKEEATYIFEVANSVGLTGYGYTWIVPSLVAGDTDTVPAE----F .... .: .... : : :::.... :. :.. ::...: . CCDS67 ESIKNSTPTVVMFGCDMESIRRIFEITTQFGVMPPELRWVL-----GDSQNVEELRTEGL 320 330 340 350 360 370 280 290 300 310 320 330 pF1KE2 PTGLISVSYDEWDYGLPARVRDGIAIITTA---ASDMLSEHSFIPEPKSSCYNTHEKRIY : :::. . . . :.:.. ... : :. . : ..:: . :.... . CCDS67 PLGLIAHGKTTQSV-FEHYVQDAMELVARAVATATMIQPELALIPSTMN-CMEVETTNLT 380 390 400 410 420 340 350 360 370 380 pF1KE2 QSNMLNRYLINVTFEGRNLSFSEDGYQM---HPKLVIILLNKERK----WERVGKWKDKS ....:.:.: :.::.: . :. : . . .. : :... : :.:.:. . CCDS67 SGQYLSRFLANTTFRGLSGSIRVKGSTIVSSENNFFIWNLQHDPMGKPMWTRLGSWQGGK 430 440 450 460 470 480 390 400 410 420 430 pF1KE2 LQMKYYVWPRMCP--ETEEQEDD--HLSIVTLEEAPFVIVESVD-----PLSGTC---MR . : : .::.. .:. :. . :: .::: : :::... :: : . : : CCDS67 IVMDYGIWPEQAQRHKTHFQHPSKLHLRVVTLIEHPFVFTREVDDEGLCPAGQLCLDPMT 490 500 510 520 530 540 440 450 460 470 480 pF1KE2 NTVPCQKRIVT--ENKTDEEPGYIKKCCKGFCIDILKKISKSVKFTYDLYLVTNGKHGKK : . . ....: : .:::: :.:::.:.::.....: .:::.: .::.: CCDS67 NDSSTLDSLFSSLHSSNDTVPIKFKKCCYGYCIDLLEKIAEDMNFDFDLYIVGDGKYGAW 550 560 570 580 590 600 490 500 510 520 530 540 pF1KE2 INGTWNGMIGEVVMKRAYMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFIETGISVMVSRSNGTVSP-S :: :.:..:... :.::: :..:: ::.:.::. ::. :.....: :. :..: . CCDS67 KNGHWTGLVGDLLRGTAHMAVTSFSINTARSQVIDFTSPFFSTSLGILV-RTRDTAAPIG 610 620 630 640 650 660 550 560 570 580 590 600 pF1KE2 AFLEPFSADVWVMMFVMLLIVSAVAVFVFEYFSPVGYNRCLADGREPGGPSFTIGKAIWL ::. :. .:. .:: : : .:: . ..:. :: : . ::. . :....:. . CCDS67 AFMWPLHWTMWLGIFVALHI-TAVFLTLYEWKSPFGLT---PKGRNRS-KVFSFSSALNI 670 680 690 700 710 720 610 620 630 640 650 660 pF1KE2 LWGLVFNNSVPVQNPKGTTSKIMVSVWAFFAVIFLASYTANLAAFMIQEEYVDQVSGLSD ..:.:. .: .. :: :.......::.: .. :..::::::: :. :. ...::. : CCDS67 CYALLFGRTVAIKPPKCWTGRFLMNLWAIFCMFCLSTYTANLAAVMVGEKIYEELSGIHD 730 740 750 760 770 780 670 680 690 700 710 720 pF1KE2 KKFQRPNDFSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYAEMHAYMGKFNQRGVDDALLSLKTG--KL :...: : :::::: ..:.: .:... ::: :: ..: .. :.. ::. :: CCDS67 PKLHHP---SQGFRFGTVRESSAEDYVRQSFPEMHEYMRRYNVPATPDGVEYLKNDPEKL 790 800 810 820 830 730 740 750 760 770 780 pF1KE2 DAFIYDAAVLNYMAGRDEGCKLVTIGSGKVFASTGYGIAIQKDSGWKRQVDLAILQLFGD ::::.: :.:.: .. : :::.:. :: :: ::::.. .: ... : : . CCDS67 DAFIMDKALLDYEVSIDADCKLLTV--GKPFAIEGYGIGLPPNSPLTANISELISQYKSH 840 850 860 870 880 890 790 800 810 820 830 840 pF1KE2 GEMEELEALWLTGI-CHNEKNEVMSS-QLDIDNMAGVFYMLGAAMALSLITFICEHLFYW : :. :. : . : ... : . :. : ...:.: .: ...::..: : ::. : CCDS67 GFMDMLHDKWYRVVPCGKRSFAVTETLQMGIKHFSGLFVLLCIGFGLSILTTIGEHIVY- 900 910 920 930 940 950 850 860 870 880 890 900 pF1KE2 QFRHCFMGVCSGKPGMVFSI--SRGIYSCIHGVAIEERQSVMNSPTATMNNTHSNILRLL . .. ..: . . . :. .. :. :::.:. ... . . .::. CCDS67 ---RLLLPRIKNKSKLQYWLHTSQRLHRAINTSFIEEKQQHFKTKRV---EKRSNVGPRQ 960 970 980 990 1000 1010 910 920 930 940 950 960 pF1KE2 RTAKNMANLSGVNGSPQSALDFIRRESSVYDISEHRRSFTHSDCKSYNNPPCEENLFSDY :. : .::: : CCDS67 LTVWNTSNLSHDNRRKYIFSDEEGQNQLGIRIHQDIPLPPRRRELPALRTTNGKADSLNV 1020 1030 1040 1050 1060 1070 >>CCDS32861.1 GRIN3B gene_id:116444|Hs109|chr19 (1043 aa) initn: 682 init1: 345 opt: 850 Z-score: 927.6 bits: 183.8 E(33420): 2.4e-45 Smith-Waterman score: 1012; 27.1% identity (58.6% similar) in 885 aa overlap (12-843:7-856) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MKPRAECCSPKFWLVLAVLAVSGSRARSQKSPPSI----GIAVILVGTSDEVAIKDAHEK .:: :: ::.. . : .. .: .. : .: : . .. . :. . CCDS32 MEFVRALWLGLA-LALGPGSAGGHPQPCGVLARLGGSVRLGALLPRAPLARARAR 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 pF1KE2 DDFHHLSVVPRV------ELV--AMNETDPKSIITRICDLMSDRKIQGVVFADDTDQEAI . . ...::. ::: : :: :. .:. . . ... .. : . 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CCDS32 PGLLALG-EVARPPLEAAIHDIVQLVARALGSAAQVQPKRALLPAP-VNCGDLQPAGPES 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 pF1KE2 SN-MLNRYLINVTFEGRNLSFSEDGY-QMHPK--LVIILLNKERK----WERVGKWKDKS . .: :.: :..:.::. : :.: . . . : .. . : ::.:.: . CCDS32 PGRFLARFLANTSFQGRTGPVWVTGSSQVHMSRHFKVWSLRRDPRGAPAWATVGSWRDGQ 340 350 360 370 380 390 390 400 410 420 430 pF1KE2 LQMKYY-VWPRMCPETEEQEDDHLSIVTLEEAPFVIVESVD-----PLSGTCM---RNTV :... . : : : .: .::: : :::.... : : . :. : CCDS32 LDLEPGGASARPPPPQGAQVWPKLRVVTLLEHPFVFARDPDEDGQCPAGQLCLDPGTNDS 400 410 420 430 440 450 440 450 460 470 480 490 pF1KE2 PCQKRIVTENKTDEEPGYIKKCCKGFCIDILKKISKSVKFTYDLYLVTNGKHGKKINGTW . . . : ..::: :.:::.:....... : ..:::: .::.: .: : CCDS32 ATLDALFAALANGSAPRALRKCCYGYCIDLLERLAEDTPFDFELYLVGDGKYGALRDGRW 460 470 480 490 500 510 500 510 520 530 540 550 pF1KE2 NGMIGEVVMKRAYMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFIETGISVMVSRSNGTVSP-SAFLEP .:..:... ::.::: :..:: ::.::::. ::. :....:: :. :.:: .::. : CCDS32 TGLVGDLLAGRAHMAVTSFSINSARSQVVDFTSPFFSTSLGIMV-RARDTASPIGAFMWP 520 530 540 550 560 570 560 570 580 590 600 610 pF1KE2 FSADVWVMMFVMLLIVSAVAVFVFEYFSPVGYNRCLADGREPGGPSFTIGKAIWLLWGLV . ..:. .:. : . .:. . :.:. :: : . ::. . :. ..:. : .... CCDS32 LHWSTWLGVFAALHL-TALFLTVYEWRSPYGLT---PRGRNRS-TVFSYSSALNLCYAIL 580 590 600 610 620 620 630 640 650 660 670 pF1KE2 FNNSVPVQNPKGTTSKIMVSVWAFFAVIFLASYTANLAAFMIQEEYVDQVSGLSDKKFQR : .: ..:: :.......::.: .. :.:::::::: :. .. ...::. : :... CCDS32 FRRTVSSKTPKCPTGRLLMNLWAIFCLLVLSSYTANLAAVMVGDKTFEELSGIHDPKLHH 630 640 650 660 670 680 680 690 700 710 720 pF1KE2 PNDFSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYAEMHAYMGKFNQ----RGVDDALLSLKTGKLDAF : . :::::: ..:.: :.... .:::.: . . ::: :.:. ::.:: CCDS32 P---AQGFRFGTVWESSAEAYIKKSFPDMHAHMRRHSAPTTPRGV--AMLTSDPPKLNAF 690 700 710 720 730 740 730 740 750 760 770 780 pF1KE2 IYDAAVLNYMAGRDEGCKLVTIGSGKVFASTGYGIAIQKDSGWKRQVDLAILQLFGDGEM :.: ..:.: .. : :::.:.: : :: ::::.. ..: ... : . ..: . CCDS32 IMDKSLLDYEVSIDADCKLLTVG--KPFAIEGYGIGLPQNSPLTSNLSEFISRYKSSGFI 750 760 770 780 790 800 790 800 810 820 830 840 pF1KE2 EELEALWLTGI-CHNEKNEVMSS-QLDIDNMAGVFYMLGAAMALSLITFICEHLFYWQFR . :. : . : .. : . :..: ..::.: .: ... .:.. . :: :. CCDS32 DLLHDKWYKMVPCGKRVFAVTETLQMSIYHFAGLFVLLCLGLGSALLSSLGEHAFFRLAL 810 820 830 840 850 860 850 860 870 880 890 900 pF1KE2 HCFMGVCSGKPGMVFSISRGIYSCIHGVAIEERQSVMNSPTATMNNTHSNILRLLRTAKN CCDS32 PRIRKGSRLQYWLHTSQKIHRALNTEPPEGSKEETAEAEPSGPEVEQQQQQQDQPTAPEG 870 880 890 900 910 920 >>CCDS43910.1 GRIN1 gene_id:2902|Hs109|chr9 (885 aa) initn: 694 init1: 202 opt: 815 Z-score: 890.4 bits: 176.7 E(33420): 2.9e-43 Smith-Waterman score: 1173; 28.7% identity (64.5% similar) in 861 aa overlap (14-837:7-833) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MKPRAECCSPKFWLVLAVLAVSGSRARSQKSPPSIGIAVILVGTSDEVAIKDAHEKDDFH :.::.: : : ::. .: ..:...: . : ...: .. . . CCDS43 MSTMRLLTLALL-FSCSVARAACDPKIVNIGAVLSTRKHEQMFREAVNQANKR 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KE2 HLSVVPRVELVAMNETD-PKSI--ITRIC-DLMSDRKIQGVVFADDTDQEAIAQI-LDFI : : ...: : . : :..: .: ::.:.. .: : .. .. ... CCDS43 HGSW--KIQLNATSVTHKPNAIQMALSVCEDLISSQVYAILVSHPPTPNDHFTPTPVSYT 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 SAQTLTPILGIHGGSSMIMADKDESSMFFQFGPSIEQQASVMLNIMEEYDW-YIFSIVTT .. :.::. : :..::. :.. : .:.:: ...:. :.: .:. .:. CCDS43 AGFYRIPVLGLTTRMS-IYSDKSIHLSFLRTVPPYSHQSSVWFEMMRVYSWNHIILLVSD 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 YFPGYQDFVNKIRSTIENSFVGWELEEVLLLDMSLDDGDSKIQNQLKKLQSPIILLYCTK : . ..... .:. . :.:: .: . . . . . :.:.. .:.: .. CCDS43 DHEG-RAAQKRLETLLEERES--KAEKVLQFDPGTKNV-TALLMEAKELEARVIILSASE 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 EEATYIFEVANSVGLTGYGYTWIV-PSLVAGDTDTVPAEFPTGLISVSYDEWDYGLPARV ..:. ....: ...:: ::.:.: ..:.. : :..... . . :.. CCDS43 DDAATVYRAAAMLNMTGSGYVWLVGEREISGNALRYA---PDGILGLQLIN-GKNESAHI 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 pF1KE2 RDGIAIITTAASDMLSEHSFIPEPKSSCYNTHEKRIYQSN-MLNRYLINVTFE----GRN :...... :. ..: .... :.. ::. :.... ...: :.. . :: CCDS43 SDAVGVVAQAVHELLEKENITDPPRGCVGNTN---IWKTGPLFKRVLMSSKYADGVTGR- 290 300 310 320 330 350 360 370 380 390 400 pF1KE2 LSFSEDGYQMHPKLVIILLNKERKWERVGKWKDKSL--QMKYYVWPRMCPETEE----QE . :.::: . . :. : ..:: .:: .. . . . .:: :::. : CCDS43 VEFNEDGDRKFANYSIMNL-QNRKLVQVGIYNGTHVIPNDRKIIWPG--GETEKPRGYQM 340 350 360 370 380 390 410 420 430 440 450 pF1KE2 DDHLSIVTLEEAPFVIVESVDPLS-GTCMR----NTVPCQKRIVTENKTDEEPGY----I . .:.:::... ::: :. . :: ::: . : : :... . .: :: . CCDS43 STRLKIVTIHQEPFVYVKPT--LSDGTCKEEFTVNGDPV-KKVICTGPNDTSPGSPRHTV 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 pF1KE2 KKCCKGFCIDILKKISKSVKFTYDLYLVTNGKHG--KKINGT----WNGMIGEVVMKRAY .:: :::::.: :......:::...::..:: : ...:.. ::::.::.. .: CCDS43 PQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVNNSNKKEWNGMMGELLSGQAD 460 470 480 490 500 510 510 520 530 540 550 560 pF1KE2 MAVGSLTINEERSEVVDFSVPFIETGISVMVSRSNGTVSPSAFLEPFSADVWVMMFVMLL : :. ::::.::.. ..:: :: :....:.. . ..:..::.. .:... . . CCDS43 MIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKEIPRSTLDSFMQPFQSTLWLLVGLSVH 520 530 540 550 560 570 570 580 590 600 610 620 pF1KE2 IVSAVAVFVFEYFSPVGYNRCLADGREPGGPSFTIGKAIWLLWGLVFNNSVPVQNPKGTT .: :: ..... ::: : : ....: ..:...:.:. ::...:... :.. . 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CCDS70 HGSW--KIQLNATSVTHKPNAIQMALSVCEDLISSQVYAILVSHPPTPNDHFTPTPVSYT 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 SAQTLTPILGIHGGSSMIMADKDESSMFFQFGPSIEQQASVMLNIMEEYDW-YIFSIVTT .. :.::. : :..::. :.. : .:.:: ...:. :.: .:. .:. CCDS70 AGFYRIPVLGLTTRMS-IYSDKSIHLSFLRTVPPYSHQSSVWFEMMRVYSWNHIILLVSD 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 YFPGYQDFVNKIRSTIENSFVGWELEEVLLLDMSLDDGDSKIQNQLKKLQSPIILLYCTK : . ..... .:. . :.:: .: . . . . . :.:.. .:.: .. CCDS70 DHEG-RAAQKRLETLLEERES--KAEKVLQFDPGTKNV-TALLMEAKELEARVIILSASE 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 EEATYIFEVANSVGLTGYGYTWIV-PSLVAGDTDTVPAEFPTGLISVSYDEWDYGLPARV ..:. ....: ...:: ::.:.: ..:.. : :..... . . :.. 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CCDS70 STRLKIVTIHQEPFVYVKPT--LSDGTCKEEFTVNGDPV-KKVICTGPNDTSPGSPRHTV 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 pF1KE2 KKCCKGFCIDILKKISKSVKFTYDLYLVTNGKHG--KKINGT----WNGMIGEVVMKRAY .:: :::::.: :......:::...::..:: : ...:.. ::::.::.. .: CCDS70 PQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVNNSNKKEWNGMMGELLSGQAD 460 470 480 490 500 510 510 520 530 540 550 560 pF1KE2 MAVGSLTINEERSEVVDFSVPFIETGISVMVSRSNGTVSPSAFLEPFSADVWVMMFVMLL : :. ::::.::.. ..:: :: :....:.. . ..:..::.. .:... . . CCDS70 MIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKEIPRSTLDSFMQPFQSTLWLLVGLSVH 520 530 540 550 560 570 570 580 590 600 610 620 pF1KE2 IVSAVAVFVFEYFSPVGYNRCLADGREPGGPSFTIGKAIWLLWGLVFNNSVPVQNPKGTT .: :: ..... ::: : : ....: ..:...:.:. ::...:... :.. . 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CCDS70 CDLVT--TGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMEDLDKTWVRYQECDSR 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 850 860 pF1KE2 KNEVMSSQLDIDNMAGVFYML-GAAMALSLITFICEHLFYWQFRHCFMGVCSGKPGMVFS .: . : ..::::::... :. .: .. :: CCDS70 SNA--PATLTFENMAGVFMLVAGGIVAGIFLIFIEIAYKRHKDARRKQMQLAFAAVNVWR 810 820 830 840 850 870 880 890 900 910 920 pF1KE2 ISRGIYSCIHGVAIEERQSVMNSPTATMNNTHSNILRLLRTAKNMANLSGVNGSPQSALD CCDS70 KNLQSTGGGRGALQNQKDTVLPRRAIEREEGQLQLCSRHRES 860 870 880 890 900 1484 residues in 1 query sequences 18921897 residues in 33420 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Jul 16 16:09:52 2019 done: Tue Jul 16 16:09:53 2019 Total Scan time: 2.530 Total Display time: 0.370 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]