Result of FASTA (ccds) for pF1KB7344
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7344, 1049 aa
  1>>>pF1KB7344 1049 - 1049 aa - 1049 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.5653+/-0.00122; mu= 11.9088+/- 0.074
 mean_var=153.6318+/-32.183, 0's: 0 Z-trim(106.6): 191  B-trim: 75 in 1/50
 Lambda= 0.103475
 statistics sampled from 8888 (9085) to 8888 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.616), E-opt: 0.2 (0.279), width:  16
 Scan time:  4.130

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS11896.1 DSG1 gene_id:1828|Hs108|chr18          (1049) 6963 1052.6       0
CCDS11897.1 DSG4 gene_id:147409|Hs108|chr18        (1040) 2018 314.4 8.3e-85
CCDS45845.1 DSG4 gene_id:147409|Hs108|chr18        (1059) 2018 314.4 8.4e-85
CCDS11898.1 DSG3 gene_id:1830|Hs108|chr18          ( 999) 1807 282.8 2.4e-75
CCDS42423.1 DSG2 gene_id:1829|Hs108|chr18          (1118) 1302 207.5 1.3e-52
CCDS32810.1 DSC3 gene_id:1825|Hs108|chr18          ( 896)  852 140.2 1.8e-32
CCDS77172.1 CDH2 gene_id:1000|Hs108|chr18          ( 875)  848 139.6 2.7e-32
CCDS11891.1 CDH2 gene_id:1000|Hs108|chr18          ( 906)  848 139.7 2.8e-32
CCDS11893.1 DSC2 gene_id:1824|Hs108|chr18          ( 847)  839 138.3 6.8e-32
CCDS11892.1 DSC2 gene_id:1824|Hs108|chr18          ( 901)  839 138.3 7.1e-32
CCDS10869.1 CDH1 gene_id:999|Hs108|chr16           ( 882)  824 136.1 3.3e-31
CCDS10868.1 CDH3 gene_id:1001|Hs108|chr16          ( 829)  814 134.6 8.9e-31
CCDS58784.1 CDH4 gene_id:1002|Hs108|chr20          ( 842)  811 134.1 1.2e-30
CCDS13488.1 CDH4 gene_id:1002|Hs108|chr20          ( 916)  811 134.1 1.3e-30
CCDS11895.1 DSC1 gene_id:1823|Hs108|chr18          ( 840)  752 125.3 5.5e-28
CCDS11894.1 DSC1 gene_id:1823|Hs108|chr18          ( 894)  752 125.3 5.7e-28
CCDS10976.1 CDH15 gene_id:1013|Hs108|chr16         ( 814)  746 124.4 9.9e-28
CCDS82004.1 CDH3 gene_id:1001|Hs108|chr16          ( 784)  741 123.6 1.6e-27
CCDS13485.1 CDH26 gene_id:60437|Hs108|chr20        ( 832)  704 118.1 7.8e-26
CCDS58486.1 CDH13 gene_id:1012|Hs108|chr16         ( 713)  690 116.0 2.9e-25
CCDS58485.1 CDH13 gene_id:1012|Hs108|chr16         ( 760)  690 116.0 3.1e-25
CCDS58487.1 CDH13 gene_id:1012|Hs108|chr16         ( 674)  681 114.6 7.1e-25
CCDS3890.1 CDH12 gene_id:1010|Hs108|chr5           ( 794)  593 101.5 7.3e-21
CCDS54835.1 CDH18 gene_id:1016|Hs108|chr5          ( 574)  568 97.7 7.5e-20
CCDS75229.1 CDH18 gene_id:1016|Hs108|chr5          ( 575)  568 97.7 7.6e-20
CCDS3889.1 CDH18 gene_id:1016|Hs108|chr5           ( 790)  568 97.8 9.7e-20
CCDS11977.1 CDH20 gene_id:28316|Hs108|chr18        ( 801)  562 96.9 1.8e-19
CCDS3894.1 CDH6 gene_id:1004|Hs108|chr5            ( 790)  550 95.1 6.2e-19
CCDS81993.1 CDH11 gene_id:1009|Hs108|chr16         ( 693)  543 94.0 1.2e-18
CCDS10803.1 CDH11 gene_id:1009|Hs108|chr16         ( 796)  543 94.1 1.3e-18
CCDS9586.1 CDH24 gene_id:64403|Hs108|chr14         ( 781)  532 92.4   4e-18
CCDS9585.1 CDH24 gene_id:64403|Hs108|chr14         ( 819)  532 92.5 4.1e-18
CCDS3892.1 CDH10 gene_id:1008|Hs108|chr5           ( 788)  531 92.3 4.4e-18
CCDS82005.1 CDH1 gene_id:999|Hs108|chr16           ( 821)  530 92.2 5.1e-18
CCDS82259.1 CDH7 gene_id:1005|Hs108|chr18          ( 630)  527 91.6 5.6e-18
CCDS11993.1 CDH7 gene_id:1005|Hs108|chr18          ( 785)  527 91.7 6.7e-18
CCDS10804.1 CDH5 gene_id:1003|Hs108|chr16          ( 784)  495 86.9 1.8e-16
CCDS10802.1 CDH8 gene_id:1006|Hs108|chr16          ( 799)  492 86.5 2.5e-16
CCDS6260.1 CDH17 gene_id:1015|Hs108|chr8           ( 832)  488 85.9   4e-16
CCDS13395.1 CDH22 gene_id:64405|Hs108|chr20        ( 828)  486 85.6 4.9e-16
CCDS3893.1 CDH9 gene_id:1007|Hs108|chr5            ( 789)  480 84.7 8.7e-16
CCDS59325.1 CDH19 gene_id:28513|Hs108|chr18        ( 490)  449 79.9 1.5e-14
CCDS11994.1 CDH19 gene_id:28513|Hs108|chr18        ( 772)  449 80.0 2.1e-14
CCDS81992.1 CDH11 gene_id:1009|Hs108|chr16         ( 670)  441 78.8 4.3e-14
CCDS56002.1 CDH16 gene_id:1014|Hs108|chr16         ( 807)  370 68.3 7.8e-11


>>CCDS11896.1 DSG1 gene_id:1828|Hs108|chr18               (1049 aa)
 initn: 6963 init1: 6963 opt: 6963  Z-score: 5625.6  bits: 1052.6 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 6963; 100.0% identity (100.0% similar) in 1049 aa overlap (1-1049:1-1049)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MDWSFFRVVAMLFIFLVVVEVNSEFRIQVRDYNTKNGTIKWHSIRRQKREWIKFAAACRE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MDWSFFRVVAMLFIFLVVVEVNSEFRIQVRDYNTKNGTIKWHSIRRQKREWIKFAAACRE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 GEDNSKRNPIAKIHSDCAANQQVTYRISGVGIDQPPYGIFVINQKTGEINITSIVDREVT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GEDNSKRNPIAKIHSDCAANQQVTYRISGVGIDQPPYGIFVINQKTGEINITSIVDREVT
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 PFFIIYCRALNSMGQDLERPLELRVRVLDINDNPPVFSMATFAGQIEENSNANTLVMILN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PFFIIYCRALNSMGQDLERPLELRVRVLDINDNPPVFSMATFAGQIEENSNANTLVMILN
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 ATDADEPNNLNSKIAFKIIRQEPSDSPMFIINRNTGEIRTMNNFLDREQYGQYALAVRGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ATDADEPNNLNSKIAFKIIRQEPSDSPMFIINRNTGEIRTMNNFLDREQYGQYALAVRGS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 DRDGGADGMSAECECNIKILDVNDNIPYMEQSSYTIEIQENTLNSNLLEIRVIDLDEEFS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DRDGGADGMSAECECNIKILDVNDNIPYMEQSSYTIEIQENTLNSNLLEIRVIDLDEEFS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB7 ANWMAVIFFISGNEGNWFEIEMNERTNVGILKVVKPLDYEAMQSLQLSIGVRNKAEFHHS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ANWMAVIFFISGNEGNWFEIEMNERTNVGILKVVKPLDYEAMQSLQLSIGVRNKAEFHHS
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB7 IMSQYKLKASAISVTVLNVIEGPVFRPGSKTYVVTGNMGSNDKVGDFVATDLDTGRPSTT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 IMSQYKLKASAISVTVLNVIEGPVFRPGSKTYVVTGNMGSNDKVGDFVATDLDTGRPSTT
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB7 VRYVMGNNPADLLAVDSRTGKLTLKNKVTKEQYNMLGGKYQGTILSIDDNLQRTCTGTIN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VRYVMGNNPADLLAVDSRTGKLTLKNKVTKEQYNMLGGKYQGTILSIDDNLQRTCTGTIN
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB7 INIQSFGNDDRTNTEPNTKITTNTGRQESTSSTNYDTSTTSTDSSQVYSSEPGNGAKDLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 INIQSFGNDDRTNTEPNTKITTNTGRQESTSSTNYDTSTTSTDSSQVYSSEPGNGAKDLL
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB7 SDNVHFGPAGIGLLIMGFLVLGLVPFLMICCDCGGAPRSAAGFEPVPECSDGAIHSWAVE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SDNVHFGPAGIGLLIMGFLVLGLVPFLMICCDCGGAPRSAAGFEPVPECSDGAIHSWAVE
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB7 GPQPEPRDITTVIPQIPPDNANIIECIDNSGVYTNEYGGREMQDLGGGERMTGFELTEGV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GPQPEPRDITTVIPQIPPDNANIIECIDNSGVYTNEYGGREMQDLGGGERMTGFELTEGV
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB7 KTSGMPEICQEYSGTLRRNSMRECREGGLNMNFMESYFCQKAYAYADEDEGRPSNDCLLI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KTSGMPEICQEYSGTLRRNSMRECREGGLNMNFMESYFCQKAYAYADEDEGRPSNDCLLI
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB7 YDIEGVGSPAGSVGCCSFIGEDLDDSFLDTLGPKFKKLADISLGKESYPDLDPSWPPQST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 YDIEGVGSPAGSVGCCSFIGEDLDDSFLDTLGPKFKKLADISLGKESYPDLDPSWPPQST
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB7 EPVCLPQETEPVVSGHPPISPHFGTTTVISESTYPSGPGVLHPKPILDPLGYGNVTVTES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EPVCLPQETEPVVSGHPPISPHFGTTTVISESTYPSGPGVLHPKPILDPLGYGNVTVTES
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB7 YTTSDTLKPSVHVHDNRPASNVVVTERVVGPISGADLHGMLEMPDLRDGSNVIVTERVIA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 YTTSDTLKPSVHVHDNRPASNVVVTERVVGPISGADLHGMLEMPDLRDGSNVIVTERVIA
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KB7 PSSSLPTSLTIHHPRESSNVVVTERVIQPTSGMIGSLSMHPELANAHNVIVTERVVSGAG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PSSSLPTSLTIHHPRESSNVVVTERVIQPTSGMIGSLSMHPELANAHNVIVTERVVSGAG
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KB7 VTGISGTTGISGGIGSSGLVGTSMGAGSGALSGAGISGGGIGLSSLGGTASIGHMRSSSD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VTGISGTTGISGGIGSSGLVGTSMGAGSGALSGAGISGGGIGLSSLGGTASIGHMRSSSD
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040         
pF1KB7 HHFNQTIGSASPSTARSRITKYSTVQYSK
       :::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 HHFNQTIGSASPSTARSRITKYSTVQYSK
             1030      1040         

>>CCDS11897.1 DSG4 gene_id:147409|Hs108|chr18             (1040 aa)
 initn: 2757 init1: 1799 opt: 2018  Z-score: 1636.0  bits: 314.4 E(32554): 8.3e-85
Smith-Waterman score: 2717; 44.7% identity (68.5% similar) in 1039 aa overlap (1-943:1-1001)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MDWSFFRVVAMLFIFLVVVEVNSEFRIQVRDYNTKNGTIKWHSIRRQKREWIKFAAACRE
       ::: ::: . .:.:..::.:::::: ..:.... .::: ::...::::::::::::::::
CCDS11 MDWLFFRNICLLIILMVVMEVNSEFIVEVKEFDIENGTTKWQTVRRQKREWIKFAAACRE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 GEDNSKRNPIAKIHSDCAANQQVTYRISGVGIDQPPYGIFVINQKTGEINITSIVDREVT
       :::::::::::::.::: .::..::::::::::.::::.:.:: .::::::::.::::.:
CCDS11 GEDNSKRNPIAKIRSDCESNQKITYRISGVGIDRPPYGVFTINPRTGEINITSVVDREIT
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
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       :.:.:::::::: :.::::::::::.:.::::: ::::.......:::::.:::::. : 
CCDS11 PLFLIYCRALNSRGEDLERPLELRVKVMDINDNAPVFSQSVYTASIEENSDANTLVVKLC
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       :::::: :.::::::.::. :::: .::::.:: :::. ::..::::::...: :.::::
CCDS11 ATDADEENHLNSKIAYKIVSQEPSGAPMFILNRYTGEVCTMSSFLDREQHSMYNLVVRGS
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pF1KB7 DRDGGADGMSAECECNIKILDVNDNIPYMEQSSYTIEIQENTLNSNLLEIRVIDLDEEFS
       ::::.:::.:.::.: ::.::::::.: .:..::.  :.:: :.:.:.....:::::: .
CCDS11 DRDGAADGLSSECDCRIKVLDVNDNFPTLEKTSYSASIEENCLSSELIRLQAIDLDEEGT
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        ::.:  ...:::.::::.:. . .:: ::::::: ::::   ..::::::.:.:.::.:
CCDS11 DNWLAQYLILSGNDGNWFDIQTDPQTNEGILKVVKMLDYEQAPNIQLSIGVKNQADFHYS
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       :.: :::..:.. .. : .:::::.. .. .  :..  ...: : . ::.:::.  .: :
CCDS11 PATDVRYIIGHDAGSWLKIDSRTGEIQFSREFDKKSKYIINGIYTAEILAIDDGSGKTAT
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       ::: :.. .. ::   :  :. .          :..:     :                 
CCDS11 GTICIEVPDI-NDYCPNIFPERRTICIDSPSVLISVNEHSYGSPFTFCVVDEPPGIADMW
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pF1KB7 -TSSTN----------------YDTSTTSTDSS----------QVY------------SS
        . :::                :.      ::           :.:            :.
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CCDS11 AAGIYTEDITGDTYGPVTEDQAGVSNVGLGPAGIGMMVLGILLLILAPLLLLLCCCKQRQ
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CCDS11 PEGLGTRFAPVPEGGEGVMQSWRIEGAHPEDRDVSNICA--PMTASNTQDRMDSSEIYTN
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pF1KB7 EY--GGREMQDLGGGERMTGFELTEGVKTSGMPEICQEYSGTLRRNS-----MRECREGG
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CCDS11 TYAAGGTVEGGVSGVELNTGMGTAVGLMAAGAAGA----SGAARKRSSTMGTLRDYADAD
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pF1KB7 LNMNFMESYFCQKAYAYADEDEGRPSNDCLLIYDIEGVGSPAGSVGCCSFIGEDLDDSFL
       .:: :..::: .:::::::::::::.:::::::: ::::::.::.::::.: .:::.: .
CCDS11 INMAFLDSYFSEKAYAYADEDEGRPANDCLLIYDHEGVGSPVGSIGCCSWIVDDLDESCM
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       .:: :::. ::.: :. :  :     .:   .. .:.:  :.      : ..:..     
CCDS11 ETLDPKFRTLAEICLNTEIEP-----FP---SHQACIPISTD-----LPLLGPNY----F
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CCDS11 VNESSGLTPSEVEFQEEMAASEPVVHGDIIVTETYGNADPCVQPTTIIFDPQLAPNVVVT
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CCDS11 EAVMAPV--YDIQGNICVPAELADYNNVIYAERVLA-SPGVP---------DMSNSSTTE
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         . :.  : :.. . ::.                                         
CCDS11 GCMGPV--MSGNILVGPEIQVMQMMSPDLPIGQTVGSTSPMTSRHRVTRYSNIHYTQQ  
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CCDS45 ATDADEENHLNSKIAYKIVSQEPSGAPMFILNRYTGEVCTMSSFLDREQHSMYNLVVRGS
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CCDS45 DRDGAADGLSSECDCRIKVLDVNDNFPTLEKTSYSASIEENCLSSELIRLQAIDLDEEGT
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CCDS45 DNWLAQYLILSGNDGNWFDIQTDPQTNEGILKVVKMLDYEQAPNIQLSIGVKNQADFHYS
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CCDS45 PEGLGTRFAPVPEGGEGVMQSWRIEGAHPEDRLFSAYALPGGGGTADGGGSVLGRCALQA
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pF1KB7 RRNS-----MRECREGGLNMNFMESYFCQKAYAYADEDEGRPSNDCLLIYDIEGVGSPAG
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CCDS45 RKRSSTMGTLRDYADADINMAFLDSYFSEKAYAYADEDEGRPANDCLLIYDHEGVGSPVG
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CCDS45 SIGCCSWIVDDLDESCMETLDPKFRTLAEICLNTEIEP-----FP---SHQACIPISTD-
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pF1KB7 VVSGHPPISPHFGTTTVISEST--YPSGPGVLHPKPILDPLGYGNVTVTESYTTSDT-LK
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CCDS45 ----LPLLGPNY----FVNESSGLTPSEVEFQEEMAASEPVVHGDIIVTETYGNADPCVQ
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pF1KB7 PSVHVHDNRPASNVVVTERVVGPISGADLHGMLEMP-DLRDGSNVIVTERVIAPSSSLPT
       :.. . : . : :::::: :..:.   :..: . .: .: : .::: .:::.: : ..: 
CCDS45 PTTIIFDPQLAPNVVVTEAVMAPV--YDIQGNICVPAELADYNNVIYAERVLA-SPGVP-
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pF1KB7 SLTIHHPRESSNVVVTERVIQPTSGMIGSLSMHPELANAHNVIVTERVVSGAGVTGISGT
               . ::  .::  . :.  : :.. . ::.                        
CCDS45 --------DMSNSSTTEGCMGPV--MSGNILVGPEIQVMQMMSPDLPIGQTVGSTSPMTS
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CCDS45 RHRVTRYSNIHYTQQ                                             
         1050                                                      

>>CCDS11898.1 DSG3 gene_id:1830|Hs108|chr18               (999 aa)
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CCDS11 MMGLFPRTTGALAIFVVVILVHGELRIETKGQYDEEEMTMQ-QAKRRQKREWVKFAKPCR
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pF1KB7 EGEDNSKRNPIAKIHSDCAANQQVTYRISGVGIDQPPYGIFVINQKTGEINITSIVDREV
       :::::::::::::: ::  :.:..:::::::::::::.::::....::.::::.::::: 
CCDS11 EGEDNSKRNPIAKITSDYQATQKITYRISGVGIDQPPFGIFVVDKNTGDINITAIVDREE
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       :: :.: :::::..: :.:.:: : :..:::::::::::.  : :.::::: .:.:::::
CCDS11 TPSFLITCRALNAQGLDVEKPLILTVKILDINDNPPVFSQQIFMGEIEENSASNSLVMIL
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       :::::::::.:::::::::. :::. .:::...:::::.::..: ::::: ..: :.: :
CCDS11 NATDADEPNHLNSKIAFKIVSQEPAGTPMFLLSRNTGEVRTLTNSLDREQASSYRLVVSG
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pF1KB7 SDRDGGADGMSAECECNIKILDVNDNIPYMEQSSYTIEIQENTLNSNLLEIRVIDLDEEF
       .:.::  .:.:..::::::. :::::.:....:.:. .:.:: :.:.::...: :::::.
CCDS11 ADKDG--EGLSTQCECNIKVKDVNDNFPMFRDSQYSARIEENILSSELLRFQVTDLDEEY
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pF1KB7 SANWMAVIFFISGNEGNWFEIEMNERTNVGILKVVKPLDYEAMQSLQLSIGVRNKAEFHH
       . ::.:: :: ::::::::::. . ::: ::::::: :::: .::..:::.:.::::::.
CCDS11 TDNWLAVYFFTSGNEGNWFEIQTDPRTNEGILKVVKALDYEQLQSVKLSIAVKNKAEFHQ
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pF1KB7 SIMSQYKLKASAISVTVLNVIEGPVFRPGSKTYVVTGNMGSNDKV----GDFVATDLDTG
       :..:.:..... ... :.:: :: .:::.:::..:  ...:.  :    : . : : ::.
CCDS11 SVISRYRVQSTPVTIQVINVREGIAFRPASKTFTVQKGISSKKLVDYILGTYQAIDEDTN
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pF1KB7 RPSTTVRYVMGNNPADLLAVDSRTGKLTLKNKVTKEQYNMLGGKYQGTILSIDDNLQRTC
       . ...:.:::: : .  : .::.:... . .......  ...    . .:.::.   .: 
CCDS11 KAASNVKYVMGRNDGGYLMIDSKTAEIKFVKNMNRDSTFIVNKTITAEVLAIDEYTGKTS
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pF1KB7 TGTININIQSFGN---------DDRTNTEPNTKITTNT--GR------------------
       :::. . . .:..         :   .. :.. ... :  .:                  
CCDS11 TGTVYVRVPDFNDNCPTAVLEKDAVCSSSPSVVVSARTLNNRYTGPYTFALEDQPVKLPA
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pF1KB7 ----------------QESTSSTNYDTSTTSTDSSQVYSSEPGNGAKDLLS-DNV-----
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CCDS11 VWSITTLNATSALLRAQEQIPPGVYHISLVLTDSQNNRCEMPRSLTLEVCQCDNRGICGT
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pF1KB7 --------------H---FGPAGIGLLIMGFLVLGLVPFLMICCDCGGAPRSAA--GFEP
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CCDS11 SYPTTSPGTRYGRPHSGRLGPAAIGLLLLGLLLLLLAPLLLLTCDCGAGSTGGVTGGFIP
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pF1KB7 VPECSDGAIHSWAVEGPQPEPRDITTVIPQIPPDNANIIECIDNSGVYTNEYG-GREMQD
       ::. :.:.::.:..:: .:: ..::..   .:: .::  . ...: : :: :. :  .. 
CCDS11 VPDGSEGTIHQWGIEGAHPEDKEITNIC--VPPVTANGADFMESSEVCTNTYARGTAVEG
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pF1KB7 LGGGERMT------------GFEL-TEGVKTSGMPE-----ICQE-YSGTLR-RNSM---
        .: :  :            ::   : .  .::.       ::.   :::.: :.:    
CCDS11 TSGMEMTTKLGAATESGGAAGFATGTVSGAASGFGAATGVGICSSGQSGTMRTRHSTGGT
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pF1KB7 -RECREGGLNMNFMESYFCQKAYAYADEDEGRPSNDCLLIYDIEGV---GSPAGSVGCCS
        ..  .:...:::..::: :::.: :.::.:. .:::::::: ::.   :::.:::::::
CCDS11 NKDYADGAISMNFLDSYFSQKAFACAEEDDGQEANDCLLIYDNEGADATGSPVGSVGCCS
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pF1KB7 FIGEDLDDSFLDTLGPKFKKLADISLGKESYPDLDPSWPPQSTEPVCLPQETEPVV---S
       ::..::::::::.:::::::::.:::: ..  .     ::..     . .  .:.    .
CCDS11 FIADDLDDSFLDSLGPKFKKLAEISLGVDG--EGKEVQPPSKDSGYGIESCGHPIEVQQT
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pF1KB7 GHPPISPHFGTTTVISESTYPS-GPGVLHPKPILDPLGYGNVTVTESYTTSDTL-KPSVH
       :    .   :.  . . ::  :  :.:  :    ::: .::  :::.:..: .: .::. 
CCDS11 GFVKCQTLSGSQGASALSTSGSVQPAVSIP----DPLQHGNYLVTETYSASGSLVQPSTA
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pF1KB7 VHDNRPASNVVVTERVVGPISGADLHGMLEMP-DLRDGSNVIVTERVIAPSSSLPTSLTI
         :   ..::.:::::. :::  .. : :  : .:: . ... ::               
CCDS11 GFDPLLTQNVIVTERVICPIS--SVPGNLAGPTQLRGSHTMLCTEDPCSRLI        
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pF1KB7 HHPRESSNVVVTERVIQPTSGMIGSLSMHPELANAHNVIVTERVVSGAGVTGISGTTGIS

>>CCDS42423.1 DSG2 gene_id:1829|Hs108|chr18               (1118 aa)
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             :. :.: ..:.  .:.: ...:: .  ..:  .  :  . :::: ::   .: :
CCDS42 MARSPGRAYALL-LLLICFNVGSGLHLQVLSTRNENKLLPKHPHLVRQKRAWITAPVALR
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pF1KB7 EGEDNSKRNPIAKIHSDCAANQ--QVTYRISGVGIDQPPYGIFVINQKTGEINITSIVDR
       :::: ::.::::::::: : ..  ..::. .: :: .::.::::.:. :::.:.:::.::
CCDS42 EGEDLSKKNPIAKIHSDLAEERGLKITYKYTGKGITEPPFGIFVFNKDTGELNVTSILDR
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pF1KB7 EVTPFFIIYCRALNSMGQDLERPLELRVRVLDINDNPPVFSMATFAGQIEENSNANTLVM
       : ::::..   ::.. :...:.:::::..::::::: :::.. .:.:..:: : :.::::
CCDS42 EETPFFLLTGYALDARGNNVEKPLELRIKVLDINDNEPVFTQDVFVGSVEELSAAHTLVM
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pF1KB7 ILNATDADEPNNLNSKIAFKIIRQEPSDSPMFIINRNTGEIRTMNNFLDREQYGQYALAV
        .:::::::::.:::::...:.  ::.  :.: .:..:::: : .  ::::....:.:.:
CCDS42 KINATDADEPNTLNSKISYRIVSLEPAYPPVFYLNKDTGEIYTTSVTLDREEHSSYTLTV
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pF1KB7 RGSDRDGGA-DGMSAECECNIKILDVNDNIPYMEQSSYTIEIQENTLNSNLLEIRVIDLD
       .. : .: . :    . . .:.::::::::: .:..     ..:: .: .. .:.:.: :
CCDS42 EARDGNGEVTDKPVKQAQVQIRILDVNDNIPVVENKVLEGMVEENQVNVEVTRIKVFDAD
     240       250       260       270       280       290         

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pF1KB7 EEFSANWMAVIFFISGNEGNWFEIEMNERTNVGILKVVKPLDYEAMQSLQLSIGVRNKAE
       :  : ::.: . : :::::..:.:: . .:: ::. ..: .::: :..:..:. : ::: 
CCDS42 EIGSDNWLANFTFASGNEGGYFHIETDAQTNEGIVTLIKEVDYEEMKNLDFSVIVANKAA
     300       310       320       330       340       350         

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pF1KB7 FHHSIMSQYKLKASAISVTVLNVIEGPVFRPGSKTYVVTGNMGSNDK---VGDFVATDLD
       ::.:: :.::     :.: : :: ::  :. .  .  :. .:  ..:   .:.: : : :
CCDS42 FHKSIRSKYKPTPIPIKVKVKNVKEGIHFKSSVISIYVSESMDRSSKGQIIGNFQAFDED
     360       370       380       390       400       410         

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pF1KB7 TGRPSTTVRYVMGNNPADLLAVDSRTGKLTLKNKVTKEQYNMLGGKYQGTILSIDDNLQR
       :: :. . :::  ..  . ..::: :... : .    :.  . .: :   :..:...  :
CCDS42 TGLPAHA-RYVKLEDRDNWISVDSVTSEIKLAKLPDFESRYVQNGTYTVKIVAISEDYPR
     420        430       440       450       460       470        

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pF1KB7 -TCTGTININIQSFGNDDRTNTEPNTKIT----------------TNTG-----------
        : :::. ::.......  :  ::   :                  :.:           
CCDS42 KTITGTVLINVEDINDNCPTLIEPVQTICHDAEYVNVTAEDLDGHPNSGPFSFSVIDKPP
      480       490       500       510       520       530        

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pF1KB7 ---------RQESTSSTNY----------------DTSTTSTDSSQVYSSE-----PGNG
                ::::::                    :..  :   .:: .        :.:
CCDS42 GMAEKWKIARQESTSVLLQQSEKKLGRSEIQFLISDNQGFSCPEKQVLTLTVCECLHGSG
      540       550       560       570       580       590        

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pF1KB7 AKDLLSDN-VHFGPAGIGLLIMGFLVLGLVPFLMICCDCGGAPRSAAGFEPVPECSDGAI
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CCDS42 CREAQHDSYVGLGPAAIALMILAFLLLLLVPLLLLMCHCG---KGAKGFTPIPGTIE-ML
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CCDS42 HPWNNEGAPPEDK----VVPSFLPVDQGGSLVGRNGVGGMAKEATMKGSSSASIVKGQHE
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CCDS42 MSEMDGRWEEHRSLLSGRATQFTGATGAIMTTETTKTARATGASRDMAGAQAAAVALNEE
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       :...:: .:: .:..:::.. ..::::.:. : . :  .:.::::::  .::: ::: ::
CCDS42 FLRNYFTDKAASYTEEDENHTAKDCLLVYSQEETESLNASIGCCSFIEGELDDRFLDDLG
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        ::: ::.. ::.  .   ...    : .       .. .:   . .  .   ::   :.
CCDS42 LKFKTLAEVCLGQKIDINKEIEQRQKPATETSMNTASHSLCEQTMVNSENTYSSGSSFPV
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pF1KB7 SPHFG-------TTTVISESTYPSGPGVLHPKPILDPLGYGNVTVTE-SYTTSDTLKPSV
          .        :  ...: .  :  .     :. ::..  :: .:: ::.:..:. :..
CCDS42 PKSLQEANAEKVTQEIVTERSVSSRQAQKVATPLPDPMASRNVIATETSYVTGSTMPPTT
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pF1KB7 HVHDNRPASNVVVTERVVGPISGADLHGMLEMPDLRDGSNVIVTERVIAPSSSLPTSLT-
        .      ....::::: .: :      ....:   .:. :.:::::: : ..  . :  
CCDS42 VILGPSQPQSLIVTERVYAPAST-----LVDQPYANEGT-VVVTERVIQPHGGGSNPLEG
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pF1KB7 IHHPRESSNVVVTER--VIQPTSGMIGSLSMHPELANAHNVIVTERVVSGAGVTGISGTT
        .: ..   :.: ::   . :.::.  .:.: :..: ..:: :::::.. :..       
CCDS42 TQHLQDVPYVMVRERESFLAPSSGVQPTLAM-PNIAVGQNVTVTERVLAPAST-------
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CCDS42 -----LQSSYQIPTENSMTARNTTVSGAGVPGPLPDFGLEESGHSNSTITTSSTRVTKHS
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pF1KB7 IGSASPSTARSRITKYSTVQYSK
                              
CCDS42 TVQHSYS                
                              

>>CCDS32810.1 DSC3 gene_id:1825|Hs108|chr18               (896 aa)
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CCDS32 DKRKQTQKEVTVLLEHQKKVSKTRHTRETVLRRAKRRWAPI--PCSMQENSLGPFPLFLQ
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pF1KB7 KIHSDCAANQQVTYRISGVGIDQPPYGIFVINQKTGEINITSIVDREVTPFFIIYCRALN
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CCDS32 QVESDAAQNYTVFYSISGRGVDKEPLNLFYIERDTGNLFCTRPVDREEYDVFDLIAYAST
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pF1KB7 SMGQDLERPLELRVRVLDINDNPPVFSMATFAGQIEENSNANTLVMILNATDADEPNNLN
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CCDS32 ADGYSADLPLPLPIRVEDENDNHPVFTEAIYNFEVLESSRPGTTVGVVCATDRDEPDTMH
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pF1KB7 SKIAFKIIRQEPSDSPMFIINRNTGEIRTMNNFLDREQYGQYALAVRGSDRDGGADGMSA
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CCDS32 TRLKYSILQQTPRSPGLFSVHPSTGVITTVSHYLDREVVDKYSLIMKVQDMDGQFFGLIG
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pF1KB7 ECECNIKILDVNDNIPYMEQSSYTIEIQENTLNSNLLEIRVIDLDEEFSANWMAVIFFIS
          : : . : ::: : ..:..:   ..::..: ..:.: . : :   .::: . . ...
CCDS32 TSTCIITVTDSNDNAPTFRQNAYEAFVEENAFNVEILRIPIEDKDLINTANWRVNFTILK
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pF1KB7 GNEGNWFEIEMNERTNVGILKVVKPLDYEAMQSLQLSIGVRNKAEFHHSIMSQYKLKASA
       :::.. :.:  ...:: :.:.:::::.::  ....: ::: :.: : ..:     :. . 
CCDS32 GNENGHFKISTDKETNEGVLSVVKPLNYEENRQVNLEIGVNNEAPFARDIPRVTALNRAL
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pF1KB7 ISVTVLNVIEGPVFRPGSKTYVVTGNMGSNDKVGDFVATDLDTGRPSTTVRYVMGNNPAD
       ..: : .. :::   :...   .  :.. ..:.. . : :   .: .. .::   ..:  
CCDS32 VTVHVRDLDEGPECTPAAQYVRIKENLAVGSKINGYKAYD-PENRNGNGLRYKKLHDPKG
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        ...:  .:..  .. . .:  .  .  :. :.:.:: . .:.::::. .::..  ::. 
CCDS32 WITIDEISGSIITSKILDREVETPKNELYNITVLAIDKD-DRSCTGTLAVNIEDV-NDNP
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pF1KB7 TNT--------EPNTKIT----TNTGRQESTSSTNYDTSTTSTDSSQVYSSEPGNGAKDL
        .         .:.   :    ..  .    .   ..  .:: . :...:    : .   
CCDS32 PEILQEYVVICKPKMGYTDILAVDPDEPVHGAPFYFSLPNTSPEISRLWSLTKVNDTAAR
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       ::   :. :    : . .      . . .: .  :.:    .  :  .     : :.:  
CCDS32 LSYQKNAGFQEYTIPITVKDRAGQAATKLLRVNLCECTHPTQCRATSR-----STGVILG
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pF1KB7 SWAVE----GPQPEPRDITTVI---------PQIPPDNA--NII-----------ECIDN
       .::.     :       . :..          ..: : :  :.:            :  :
CCDS32 KWAILAILLGIALLFSVLLTLVCGVFGATKGKRFPEDLAQQNLIISNTEAPGDDRVCSAN
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pF1KB7 SGVY--TNEYGGREMQDLGGGERMTGFELTEGVKTSGMP-EICQEYSGTLRRNSMRECRE
       . .   ::. .      .:.: .  : :  : .: ...  : :.   :. .....  :: 
CCDS32 GFMTQTTNNSSQGFCGTMGSGMKNGGQETIEMMKGGNQTLESCR---GAGHHHTLDSCRG
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pF1KB7 GGLNMN-----------FMESYFCQKAYAYADEDEGRPSNDCLLIYDIEGVGSPAGSVGC
       :  ...           : .  . .: .   ....  ::.: .: :. :: :::::::::
CCDS32 GHTEVDNCRYTYSEWHSFTQPRLGEKLHRCNQNEDRMPSQDYVLTYNYEGRGSPAGSVGC
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pF1KB7 CSFIGEDLDDSFLDTLGPKFKKLADISLGKESYPDLDPSWPPQSTEPVCLPQETEPVVSG
       ::   :.   .::..: :::  ::.                                   
CCDS32 CSEKQEEDGLDFLNNLEPKFITLAEACTKR                              
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>>CCDS77172.1 CDH2 gene_id:1000|Hs108|chr18               (875 aa)
 initn: 795 init1: 385 opt: 848  Z-score: 693.2  bits: 139.6 E(32554): 2.7e-32
Smith-Waterman score: 936; 28.2% identity (56.1% similar) in 765 aa overlap (42-764:119-872)

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pF1KB7 LFIFLVVVEVNSEFRIQVRDYNTKNGTIKWHS--IRRQKREWIKFAAACREGEDNSKRNP
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CCDS77 KLSLKPTLTEESVKESAEVEEIVFPRQFSKHSGHLQRQKRDWVIPPINLPENSRGPFPQE
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pF1KB7 IAKIHSDCAANQQVTYRISGVGIDQPPYGIFVINQKTGEINITSIVDREVTPFFIIYCRA
       ...:.::   : .. : ..: : :::: :::.::  .:....:. .:::    : .  .:
CCDS77 LVRIRSDRDKNLSLRYSVTGPGADQPPTGIFIINPISGQLSVTKPLDREQIARFHLRAHA
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pF1KB7 LNSMGQDLERPLELRVRVLDINDNPPVFSMATFAGQIEENSNANTLVMILNATDADEPNN
       ..  :...: :... . :.:.::: : :   .. : . :.:. .: :: ..: :::.:: 
CCDS77 VDINGNQVENPIDIVINVIDMNDNRPEFLHQVWNGTVPEGSKPGTYVMTVTAIDADDPNA
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pF1KB7 LNSKIAFKIIRQEPSD-SP-MFIINRNTGEIRTMNNFLDREQYGQYALAVRGSDRDGGAD
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CCDS77 LNGMLRYRIVSQAPSTPSPNMFTINNETGDIITVAAGLDREKVQQYTLIIQATDMEGNPT
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pF1KB7 -GMSAECECNIKILDVNDNIPYMEQSSYTIEIQENTLNSNLLEIRVIDLDEEFSANWMAV
        :.:      : . ::::: : .   ..  :. :: ..  . .. : : :.  .  : ::
CCDS77 YGLSNTATAVITVTDVNDNPPEFTAMTFYGEVPENRVDIIVANLTVTDKDQPHTPAWNAV
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pF1KB7 IFFISGNEGNWFEIEMNERTNVGILKVVKPLDYEAMQSLQLSIGVRNKAEFHHSIMSQYK
         . .:.  . : :. .  .: :.. ::::.:.:. . . :.....:.. . ..:  :. 
CCDS77 YRISGGDPTGRFAIQTDPNSNDGLVTVVKPIDFETNRMFVLTVAAENQVPLAKGI--QHP
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pF1KB7 LKASA-ISVTVLNVIEGPVFRPGSKTYVVTGNMGSNDKVGDFVATDLDTGRPSTTVRYVM
        ...: .::::..: :.: : :. :      .. ..  .  :.: : :    . ..::. 
CCDS77 PQSTATVSVTVIDVNENPYFAPNPKIIRQEEGLHAGTMLTTFTAQDPDR-YMQQNIRYTK
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pF1KB7 GNNPADLLAVDSRTGKLTLKNKVTKEQYNMLGGKYQGTILSIDDNLQ-RTCTGTININIQ
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       : .: ::.: ::   .. ..      ...:  :. .. ..   .  .  .:       ..
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CCDS11 LVRIRSDRDKNLSLRYSVTGPGADQPPTGIFIINPISGQLSVTKPLDREQIARFHLRAHA
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       ..  :...: :... . :.:.::: : :   .. : . :.:. .: :: ..: :::.:: 
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pF1KB7 -GMSAECECNIKILDVNDNIPYMEQSSYTIEIQENTLNSNLLEIRVIDLDEEFSANWMAV
        :.:      : . ::::: : .   ..  :. :: ..  . .. : : :.  .  : ::
CCDS11 YGLSNTATAVITVTDVNDNPPEFTAMTFYGEVPENRVDIIVANLTVTDKDQPHTPAWNAV
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CCDS11 YRISGGDPTGRFAIQTDPNSNDGLVTVVKPIDFETNRMFVLTVAAENQVPLAKGI--QHP
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CCDS11 PQSTATVSVTVIDVNENPYFAPNPKIIRQEEGLHAGTMLTTFTAQDPDR-YMQQNIRYTK
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CCDS11 LSDPANWLKIDPVNGQITTIAVLDRESPNVKNNIYNATFLASDNGIPPMSGTGTLQIYLL
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pF1KB7 NVHFGPAGIGLLIMGFLVLGLVPFLMICCDCGGAPRSAAGFEPVP--------ECSD---
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CCDS11 RLNGDFAQLNLKIK-FLEAGIYEVPIIITDSGNPPKSNISILRVKVCQCDSNGDCTDVDR
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pF1KB7 --GA-IHSWAVEGP----------------QPEPRDITTVIPQIPPDNANIIECIDNSGV
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       : .: ::.: ::   .. ..      ...:  :. .. ..   .  .  .:       ..
CCDS11 YDEEGGGEEDQDYDLSQLQQPDTVEPDAIKPVGIRRMDERPIHAEPQYPVRSAAPHPGDI
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pF1KB7 NFMESYFCQKAYAYADEDEGRPSNDCLLIYDIEGVGSPAGSVGC--CSFIGEDLDDSFLD
           . : ...   ::.:   :  : ::..: :: :: :::..    :  : . : ..:.
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pF1KB7 TLGPKFKKLADISLGKESYPDLDPSWPPQSTEPVCLPQETEPVVSGHPPISPHFGTTTVI
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CCDS11 DWGPRFKKLADMYGGGDD                                          
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>>CCDS11893.1 DSC2 gene_id:1824|Hs108|chr18               (847 aa)
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CCDS11 ILLSNTENQEKKKIFVFLEHQTKVLKKRHTKEKVLRRAKRRWAPI--PCSMLENSLGPFP
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pF1KB7 I--AKIHSDCAANQQVTYRISGVGIDQPPYGIFVINQKTGEINITSIVDREVTPFFIIYC
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CCDS11 LFLQQVQSDTAQNYTIYYSIRGPGVDQEPRNLFYVERDTGNLYCTRPVDREQYESFEIIA
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pF1KB7 RALNSMGQDLERPLELRVRVLDINDNPPVFSMATFAGQIEENSNANTLVMILNATDADEP
        : .  :   : :: : ... : ::: :.:.  :..  : ::  ..: :  . ::: :::
CCDS11 FATTPDGYTPELPLPLIIKIEDENDNYPIFTEETYTFTIFENCRVGTTVGQVCATDKDEP
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pF1KB7 NNLNSKIAFKIIRQEPSDSPMFIINRNTGEIRTMNNFLDREQYGQYALAVRGSDRDGGAD
       ....... ..:: : : .  .: .. .:: : : .. ::::   .: : .. .: ::   
CCDS11 DTMHTRLKYSIIGQVPPSPTLFSMHPTTGVITTTSSQLDRELIDKYQLKIKVQDMDGQYF
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pF1KB7 GMSAECECNIKILDVNDNIPYMEQSSYTIEIQENTLNSNLLEIRVIDLDEEFSANWMAVI
       :...   : :.: ::::..: . ..::.  ..:::.. ..:.. : : :   .::: :  
CCDS11 GLQTTSTCIINIDDVNDHLPTFTRTSYVTSVEENTVDVEILRVTVEDKDLVNTANWRANY
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pF1KB7 FFISGNEGNWFEIEMNERTNVGILKVVKPLDYEAMQSLQLSIGVRNKAEFHHSIMSQYKL
        ...:::.. :.:  . .:: :.: :::::.::  :.. :.::: :.: : .    .  .
CCDS11 TILKGNENGNFKIVTDAKTNEGVLCVVKPLNYEEKQQMILQIGVVNEAPFSREASPRSAM
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pF1KB7 KASAISVTVLNVIEGPVFRPGSKTYVVTGNMGSNDKVGDFVATDLDTGRPSTTVRYVMGN
       ......:.: .  :::   :  .:  .  :   .   . . : : .: : :. .::   .
CCDS11 STATVTVNVEDQDEGPECNPPIQTVRMKENAEVGTTSNGYKAYDPET-RSSSGIRYKKLT
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pF1KB7 NPADLLAVDSRTGKLTLKNKVTKEQYNMLGGKYQGTILSIDDNLQRTCTGTININIQSFG
       .:.  ...:  ::.. .  .. .:  .. .: :. :.:. :..  ::::::..: .:.  
CCDS11 DPTGWVTIDENTGSIKVFRSLDREAETIKNGIYNITVLASDQG-GRTCTGTLGIILQDV-
            520       530       540       550        560       570 

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pF1KB7 NDDRTNTEPNT----KITTNTGR------QESTSSTNYDTSTTSTDS--SQVYSSEPGNG
       ::.      .:    : : ....      .:   .  .: :  :. :  ....  .  : 
CCDS11 NDNSPFIPKKTVIICKPTMSSAEIVAVDPDEPIHGPPFDFSLESSTSEVQRMWRLKAIND
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pF1KB7 AKDLLS--DNVHFGPAGIGLLIMGFLVLGLVPFLMIC-CDCGGAPRSAAGFEPVPECSDG
       .   ::  ..  ::   . . .   : .. :  : .  :::    ..    .  :. . :
CCDS11 TAARLSYQNDPPFGSYVVPITVRDRLGMSSVTSLDVTLCDC--ITENDCTHRVDPRIGGG
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