seq1 = pF1KE3240.tfa, 1686 bp seq2 = pF1KE3240/gi568815597f_77182314.tfa (gi568815597f:77182314_77658667), 476354 bp >pF1KE3240 1686 >gi568815597f:77182314_77658667 (Chr1) 1-60 (100001-100060) 100% -> 61-247 (104628-104814) 100% -> 248-415 (111480-111647) 100% -> 416-585 (115246-115415) 100% -> 586-699 (115521-115634) 99% -> 700-891 (158064-158255) 100% -> 892-982 (228668-228758) 100% -> 983-1059 (235326-235402) 100% -> 1060-1102 (301004-301046) 100% -> 1103-1147 (303995-304039) 100% -> 1148-1311 (336251-336414) 100% -> 1312-1428 (339514-339630) 100% -> 1429-1620 (353534-353725) 100% -> 1621-1686 (376289-376354) 100% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGAACACCAACGATGCCAAGGAGTATCTGGCCCGGAGGGAAATCCCTCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100001 ATGAACACCAACGATGCCAAGGAGTATCTGGCCCGGAGGGAAATCCCTCA 50 . : . : . : . : . : 51 GCTTTTTGAG AGCCTTTTGAATGGACTGATGTGTTCTAAGC ||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||| 100051 GCTTTTTGAGGTA...CAGAGCCTTTTGAATGGACTGATGTGTTCTAAGC 100 . : . : . : . : . : 92 CCGAAGATCCAGTAGAATACTTGGAAAGTTGTTTACAAAAAGTAAAGGAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 104659 CCGAAGATCCAGTAGAATACTTGGAAAGTTGTTTACAAAAAGTAAAGGAA 150 . : . : . : . : . : 142 CTGGGTGGCTGTGACAAGGTGAAATGGGATACATTTGTAAGCCAGGAAAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 104709 CTGGGTGGCTGTGACAAGGTGAAATGGGATACATTTGTAAGCCAGGAAAA 200 . : . : . : . : . : 192 GAAGACCTTACCTCCACTAAATGGAGGACAGTCACGGAGATCCTTTCTAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 104759 GAAGACCTTACCTCCACTAAATGGAGGACAGTCACGGAGATCCTTTCTAA 250 . : . : . : . : . : 242 GAAATG TAATGCCTGAAAACTCAAACTTTCCATATCGGCGG ||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||| 104809 GAAATGGTA...CAGTAATGCCTGAAAACTCAAACTTTCCATATCGGCGG 300 . : . : . : . : . : 283 TATGACCGGCTCCCTCCAATCCATCAATTCTCCATAGAAAGTGACACGGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 111515 TATGACCGGCTCCCTCCAATCCATCAATTCTCCATAGAAAGTGACACGGA 350 . : . : . : . : . : 333 TCTCTCTGAGACTGCAGAGTTGATTGAGGAGTATGAGGTTTTTGATCCTA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 111565 TCTCTCTGAGACTGCAGAGTTGATTGAGGAGTATGAGGTTTTTGATCCTA 400 . : . : . : . : . : 383 CCAGACCTCGACCAAAAATCATTCTTGTTATAG GTGGTCCA |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||| 111615 CCAGACCTCGACCAAAAATCATTCTTGTTATAGGTA...TAGGTGGTCCA 450 . : . : . : . : . : 424 GGAAGTGGAAAGGGTACTCAGAGTTTGAAAATTGCAGAACGATATGGATT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 115254 GGAAGTGGAAAGGGTACTCAGAGTTTGAAAATTGCAGAACGATATGGATT 500 . : . : . : . : . : 474 CCAATACATTTCTGTGGGAGAATTATTAAGAAAGAAGATCCACAGTACCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 115304 CCAATACATTTCTGTGGGAGAATTATTAAGAAAGAAGATCCACAGTACCA 550 . : . : . : . : . : 524 GCAGCAATAGGAAATGGAGTCTTATTGCCAAGATAATTACAACTGGAGAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 115354 GCAGCAATAGGAAATGGAGTCTTATTGCCAAGATAATTACAACTGGAGAA 600 . : . : . : . : . : 574 TTGGCCCCACAG GAAACAACAATTACAGAGATAAAGCAAAA ||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||| ||||| 115404 TTGGCCCCACAGGTA...AAGGAAACAACAATTACAGAGATAAAACAAAA 650 . : . : . : . : . : 615 ATTGATGCAAATACCTGATGAAGAGGGCATTGTTATTGATGGATTTCCAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 115550 ATTGATGCAAATACCTGATGAAGAGGGCATTGTTATTGATGGATTTCCAA 700 . : . : . : . : . : 665 GAGATGTTGCCCAGGCTCTATCTTTTGAGGACCAA ATCTGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||| 115600 GAGATGTTGCCCAGGCTCTATCTTTTGAGGACCAAGTA...CAGATCTGT 750 . : . : . : . : . : 706 ACCCCCGATTTGGTGGTATTCCTGGCTTGTGCTAATCAGAGACTCAAAGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 158070 ACCCCCGATTTGGTGGTATTCCTGGCTTGTGCTAATCAGAGACTCAAAGA 800 . : . : . : . : . : 756 AAGATTACTGAAGCGTGCAGAACAGCAGGGCCGACCAGACGACAATGTAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 158120 AAGATTACTGAAGCGTGCAGAACAGCAGGGCCGACCAGACGACAATGTAA 850 . : . : . : . : . : 806 AAGCTACCCAAAGGAGACTAATGAACTTCAAGCAGAATGCTGCTCCATTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 158170 AAGCTACCCAAAGGAGACTAATGAACTTCAAGCAGAATGCTGCTCCATTG 900 . : . : . : . : . : 856 GTTAAATACTTCCAGGAAAAGGGGCTCATCATGACA TTTGA ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||| 158220 GTTAAATACTTCCAGGAAAAGGGGCTCATCATGACAGTA...CAGTTTGA 950 . : . : . : . : . : 897 TGCCGACCGCGATGAGGATGAGGTGTTCTATGACATCAGCATGGCAGTTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 228673 TGCCGACCGCGATGAGGATGAGGTGTTCTATGACATCAGCATGGCAGTTG 1000 . : . : . : . : . : 947 ACAACAAGTTATTTCCAAACAAAGAGGCTGCAGCAG GTTCA ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||| 228723 ACAACAAGTTATTTCCAAACAAAGAGGCTGCAGCAGGTA...TAGGTTCA 1050 . : . : . : . : . : 988 AGTGACCTTGATCCTTCGATGATATTGGACACTGGAGAGATCATTGATAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 235331 AGTGACCTTGATCCTTCGATGATATTGGACACTGGAGAGATCATTGATAC 1100 . : . : . : . : . : 1038 AGGATCTGATTATGAAGATCAG GGTGATGACCAGTTAAATG ||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||| 235381 AGGATCTGATTATGAAGATCAGGTA...CAGGGTGATGACCAGTTAAATG 1150 . : . : . : . : . : 1079 TATTTGGAGAGGACACTATGGGAG GTTTCATGGAAGATTTG ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||| 301023 TATTTGGAGAGGACACTATGGGAGGTG...AAGGTTTCATGGAAGATTTG 1200 . : . : . : . : . : 1120 AGAAAGTGTAAAATTATTTTCATAATTG GTGGTCCTGGCTC ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||| 304012 AGAAAGTGTAAAATTATTTTCATAATTGGTG...AAGGTGGTCCTGGCTC 1250 . : . : . : . : . : 1161 TGGCAAAGGCACACAGTGTGAAAAGCTGGTGGAAAAATATGGATTTACAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 336264 TGGCAAAGGCACACAGTGTGAAAAGCTGGTGGAAAAATATGGATTTACAC 1300 . : . : . : . : . : 1211 ATCTCTCAACTGGCGAGCTCCTGCGTGAGGAACTGGCATCAGAATCTGAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 336314 ATCTCTCAACTGGCGAGCTCCTGCGTGAGGAACTGGCATCAGAATCTGAA 1350 . : . : . : . : . : 1261 AGAAGCAAATTGATCAGAGACATTATGGAACGTGGAGACCTGGTGCCCTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 336364 AGAAGCAAATTGATCAGAGACATTATGGAACGTGGAGACCTGGTGCCCTC 1400 . : . : . : . : . : 1311 A GGCATCGTTTTGGAGCTCCTGAAGGAGGCCATGGTGGCCA |>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 336414 AGTA...CAGGGCATCGTTTTGGAGCTCCTGAAGGAGGCCATGGTGGCCA 1450 . : . : . : . : . : 1352 GCCTCGGGGACACCAGGGGCTTCCTGATTGACGGCTATCCTCGGGAGGTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 339554 GCCTCGGGGACACCAGGGGCTTCCTGATTGACGGCTATCCTCGGGAGGTG 1500 . : . : . : . : . : 1402 AAGCAAGGGGAAGAGTTCGGACGCAGG ATTGGAGACCCACA |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||| 339604 AAGCAAGGGGAAGAGTTCGGACGCAGGGTG...CAGATTGGAGACCCACA 1550 . : . : . : . : . : 1443 GTTGGTGATCTGTATGGACTGCTCGGCAGACACCATGACCAACCGCCTTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 353548 GTTGGTGATCTGTATGGACTGCTCGGCAGACACCATGACCAACCGCCTTC 1600 . : . : . : . : . : 1493 TCCAAAGGAGCCGGAGCAGCCTGCCTGTGGACGACACCACCAAGACCATC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 353598 TCCAAAGGAGCCGGAGCAGCCTGCCTGTGGACGACACCACCAAGACCATC 1650 . : . : . : . : . : 1543 GCCAAGCGCCTAGAAGCCTACTACCGAGCGTCCATCCCCGTGATCGCCTA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 353648 GCCAAGCGCCTAGAAGCCTACTACCGAGCGTCCATCCCCGTGATCGCCTA 1700 . : . : . : . : . : 1593 CTACGAGACAAAAACACAGCTACACAAG ATAAATGCAGAGG ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||| 353698 CTACGAGACAAAAACACAGCTACACAAGGCG...TAGATAAATGCAGAGG 1750 . : . : . : . : . : 1634 GAACACCAGAGGACGTTTTTCTTCAACTCTGCACAGCTATTGACTCTATT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 376302 GAACACCAGAGGACGTTTTTCTTCAACTCTGCACAGCTATTGACTCTATT 1800 1684 TTC ||| 376352 TTC