Result of SIM4 for pF1KE2355

seq1 = pF1KE2355.tfa, 2886 bp
seq2 = pF1KE2355/gi568815596r_98694535.tfa (gi568815596r:98694535_98946800), 252266 bp

>pF1KE2355 2886
>gi568815596r:98694535_98946800 (Chr2)

(complement)

1-70  (100001-100070)   100% ->
71-239  (108514-108682)   100% ->
240-375  (113804-113939)   100% ->
376-540  (114289-114453)   100% ->
541-735  (119632-119826)   100% ->
736-2416  (123264-124944)   100% ->
2417-2604  (149264-149451)   100% ->
2605-2749  (150537-150681)   100% ->
2750-2886  (152130-152266)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATTTCCACAAGGGTGATGGACATTAAGCTTCGGGAGGCTGCAGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATTTCCACAAGGGTGATGGACATTAAGCTTCGGGAGGCTGCAGAAGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTTGGGGAGGACAGCACAG         GAAAGAAAAAATCTAAATTCA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100051 CCTTGGGGAGGACAGCACAGGTA...TAGGAAAGAAAAAATCTAAATTCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AAACTTTTAAGAAGTTTTTTGGGAAGAAGAAGAGAAAAGAATCGCCGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108535 AAACTTTTAAGAAGTTTTTTGGGAAGAAGAAGAGAAAAGAATCGCCGTCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TCCACAGGAAGTAGCACCTGGAAACAAAGTCAGACGAGGAATGAGGTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108585 TCCACAGGAAGTAGCACCTGGAAACAAAGTCAGACGAGGAATGAGGTCAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGCCATCGAATCCGGGCCAGTGGGCTACGACTCCGAGGATGAGCTGGA  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 108635 TGCCATCGAATCCGGGCCAGTGGGCTACGACTCCGAGGATGAGCTGGAGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    240        GGAGTCGAGGGGCACGCTGGGCAGCCGGGCCCTTTCTCACGAC
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108685 A...TAGGGAGTCGAGGGGCACGCTGGGCAGCCGGGCCCTTTCTCACGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AGTATTTTCATTCCTGAGTCCGGACAGGACGCTACTCGGCCTGTGCGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113847 AGTATTTTCATTCCTGAGTCCGGACAGGACGCTACTCGGCCTGTGCGGGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GTTTTCCCAAGAAAATGTGTGTGATCGGATTAAAGCTCTGCAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 113897 GTTTTCCCAAGAAAATGTGTGTGATCGGATTAAAGCTCTGCAGGTA...T

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    376   TTAAAAATACAGTGTAATGTGAAAATGGGGCCACCACCTCCTCCAGGG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114287 AGTTAAAAATACAGTGTAATGTGAAAATGGGGCCACCACCTCCTCCAGGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GGGCTTCCTGCCAAGCGGGGAGAGGATGCCGGCATGAGCTCTGAGGACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114337 GGGCTTCCTGCCAAGCGGGGAGAGGATGCCGGCATGAGCTCTGAGGACGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CGGGCTGCCCAGGAGCCCCCCAGAGATGTCTCTGCTGCACGACGTGGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114387 CGGGCTGCCCAGGAGCCCCCCAGAGATGTCTCTGCTGCACGACGTGGGTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CTGGTACCACCATAAAG         GTCTCTGTCGTGTCTCCAGACCAC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 114437 CTGGTACCACCATAAAGGCA...AAGGTCTCTGTCGTGTCTCCAGACCAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GTGAGCGACAGCACCGTCTCTGCCCGGATCTCAGACAACAGCCTGGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119656 GTGAGCGACAGCACCGTCTCTGCCCGGATCTCAGACAACAGCCTGGCACC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 AGTGGCTGACTTCAGTTATCCTGCAGAATCCTCCTCCTGCCTGGACAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119706 AGTGGCTGACTTCAGTTATCCTGCAGAATCCTCCTCCTGCCTGGACAACT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CTGCAGCTAAGCACAAGCTCCAGGTCAAGCCCCGCAACCAGCGGTCGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119756 CTGCAGCTAAGCACAAGCTCCAGGTCAAGCCCCGCAACCAGCGGTCGAGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 AAGATGAGGCGGCTCTCATCG         CGCGCTCAGTCTGAATCCCT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 119806 AAGATGAGGCGGCTCTCATCGGTA...CAGCGCGCTCAGTCTGAATCCCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 GAGCGACCTGACGTGCACCCCAGAGGAGGAGGAAAACGAGGAGAAGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123284 GAGCGACCTGACGTGCACCCCAGAGGAGGAGGAAAACGAGGAGAAGCCAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 TTTTGGAAGTCAGCCCAGAAGAGCGCCCCAGCTCTGGGCAGCAGGACGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123334 TTTTGGAAGTCAGCCCAGAAGAGCGCCCCAGCTCTGGGCAGCAGGACGTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 GCGCCAGACAGAGGCCCTGAGCCTGGGCCACCGGCGCCCTTGCCGCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123384 GCGCCAGACAGAGGCCCTGAGCCTGGGCCACCGGCGCCCTTGCCGCCACC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 CGGAGGGGCCCGTGCCAGACGCGCCCGCCTGCAGCACTCCTCCGCGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123434 CGGAGGGGCCCGTGCCAGACGCGCCCGCCTGCAGCACTCCTCCGCGCTCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 CGGCCAGCGTGGAGGAGGGGGGCGTCCCCGGGGAGGACCCCTCAAGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123484 CGGCCAGCGTGGAGGAGGGGGGCGTCCCCGGGGAGGACCCCTCAAGCCGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 CCGGCCACCCCGGAGCTCGCCGAGCCCGAGTCGGCCCCCACTCTCCGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123534 CCGGCCACCCCGGAGCTCGCCGAGCCCGAGTCGGCCCCCACTCTCCGCGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 GGAGCCCCCGTCCCCGCCGGAGGGCCCCCCGAATCCCGGTCCCGACGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123584 GGAGCCCCCGTCCCCGCCGGAGGGCCCCCCGAATCCCGGTCCCGACGGCG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 GAAAGCAGGATGGGGAGGCGCCCCCCGCAGGCCCGTGTGCCCCGGCCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123634 GAAAGCAGGATGGGGAGGCGCCCCCCGCAGGCCCGTGTGCCCCGGCCACG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 GACAAGGCGGAGGAGGTGGTCTGTGCTCCCGAAGACGTCGCGAGCCCGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123684 GACAAGGCGGAGGAGGTGGTCTGTGCTCCCGAAGACGTCGCGAGCCCGTT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1206 TCCCACCGCCATCCCTGAGGGGGACACGACTCCCCCCGAGACTGACCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123734 TCCCACCGCCATCCCTGAGGGGGACACGACTCCCCCCGAGACTGACCCCG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1256 CCGCCACCTCAGAGGCGCCCTCTGCTCGCGACGGGCCAGAACGCAGTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123784 CCGCCACCTCAGAGGCGCCCTCTGCTCGCGACGGGCCAGAACGCAGTGTC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1306 CCGAAGGAAGCGGAGCCGACGCCGCCCGTGCTCCCGGATGAGGAGAAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123834 CCGAAGGAAGCGGAGCCGACGCCGCCCGTGCTCCCGGATGAGGAGAAGGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1356 GCCCCCAGGGCCGGCGCCTGAGCCCGAGAGAGAAGCGGAGACGGAGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123884 GCCCCCAGGGCCGGCGCCTGAGCCCGAGAGAGAAGCGGAGACGGAGCCCG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1406 AGAGAGGAGCGGGGACCGAGCCCGAGAGAATTGGGACCGAGCCCTCCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123934 AGAGAGGAGCGGGGACCGAGCCCGAGAGAATTGGGACCGAGCCCTCCACG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1456 GCGCCCGCCCCGAGCCCGCCGGCGCCCAAGAGCTGCCTGAAACACCGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123984 GCGCCCGCCCCGAGCCCGCCGGCGCCCAAGAGCTGCCTGAAACACCGGCC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1506 CGCGGCCGCCAGCGAGGGCCCCGCCGCGTCCCCGCCGCTTGCCGCTGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124034 CGCGGCCGCCAGCGAGGGCCCCGCCGCGTCCCCGCCGCTTGCCGCTGCGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1556 AGTCTCCCCCGGTGGAGCCCGGCCCCGGTTCCCTCGACGCAGAGGCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124084 AGTCTCCCCCGGTGGAGCCCGGCCCCGGTTCCCTCGACGCAGAGGCCGCC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1606 GCCCCGGAGCGCCCCAAGGCCGAGCGAGCCGAGGCGCCACCGGCGGGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124134 GCCCCGGAGCGCCCCAAGGCCGAGCGAGCCGAGGCGCCACCGGCGGGCGC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1656 CGAGAGGGCGGCGCCAGAGCGGAAGGCGGAGAGGGGCGGTGCCGAGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124184 CGAGAGGGCGGCGCCAGAGCGGAAGGCGGAGAGGGGCGGTGCCGAGCTGC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1706 GAGGCGCGAAGAAGTTCTCGGTGTCCTCGTGCCGAGCGCGGCCTCGTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124234 GAGGCGCGAAGAAGTTCTCGGTGTCCTCGTGCCGAGCGCGGCCTCGTCCG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1756 GGCGTCTCCCGCCCGCTGGAACGGGCCAGCGGCCGCCTGCCCCTCGCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124284 GGCGTCTCCCGCCCGCTGGAACGGGCCAGCGGCCGCCTGCCCCTCGCGAG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1806 GAGCGGCCCGGTCTGGAGGAGCGAGGCGGCTCTTGACGACCTCCAGGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124334 GAGCGGCCCGGTCTGGAGGAGCGAGGCGGCTCTTGACGACCTCCAGGGTC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1856 TCCCCGAGCCCCAGCACGCGAAACCTGGCCCTCGGAAGCTGGCGGAGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124384 TCCCCGAGCCCCAGCACGCGAAACCTGGCCCTCGGAAGCTGGCGGAGCGC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1906 GGCCCTCAGGACTCGGGGGACAGGGCGGCCAGCCCGGCCGGGCCGCGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124434 GGCCCTCAGGACTCGGGGGACAGGGCGGCCAGCCCGGCCGGGCCGCGCAA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1956 GAGCCCTCAGGAGGCGGCCGCCGCGCCCGGCACGAGAGAGCCCTGCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124484 GAGCCCTCAGGAGGCGGCCGCCGCGCCCGGCACGAGAGAGCCCTGCCCAG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2006 CCGCCCAGGAGCCGGCCCCGAGTGAGGACAGAAACCCCTTCCCCGTCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124534 CCGCCCAGGAGCCGGCCCCGAGTGAGGACAGAAACCCCTTCCCCGTCAAG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2056 CTCCGGTCCACCTCCCTCTCGCTCAAATACAGGGATGGCGCCTCTCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124584 CTCCGGTCCACCTCCCTCTCGCTCAAATACAGGGATGGCGCCTCTCAGGA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2106 GGTGAAGGGTGTGAAGAGGTACAGTGCCGAGGTCCGGTTAGAAAGGTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124634 GGTGAAGGGTGTGAAGAGGTACAGTGCCGAGGTCCGGTTAGAAAGGTCGC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2156 TGACCGTGCTCCCGAAGGAGGAGAAGTGTCCCCTCGGGACGGCCCCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124684 TGACCGTGCTCCCGAAGGAGGAGAAGTGTCCCCTCGGGACGGCCCCCGCC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2206 CTTCGAGGCACCAGGGCCCCCAGCGACCAAGGAAAGGGGAAGGCCCGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124734 CTTCGAGGCACCAGGGCCCCCAGCGACCAAGGAAAGGGGAAGGCCCGGCC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2256 CCCCGAGCCGCTCAGCTCCAAGCCGCCCCTGCCCCGGAAGCCGCTTCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124784 CCCCGAGCCGCTCAGCTCCAAGCCGCCCCTGCCCCGGAAGCCGCTTCTGC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2306 AGAGCTTCACGCTCCCGCACCAGCCCGCGCCCCCCGACGCCGGCCCGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124834 AGAGCTTCACGCTCCCGCACCAGCCCGCGCCCCCCGACGCCGGCCCGGGA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2356 GAGCGGGAACCCAGGAAGGAGCCCAGGACGGCGGAGAAAAGGCCGCTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124884 GAGCGGGAACCCAGGAAGGAGCCCAGGACGGCGGAGAAAAGGCCGCTGCG

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2406 CAGGGGAGCTG         AAAAGAGTCTGCCGCCTGCAGCAACAGGGC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 124934 CAGGGGAGCTGGTA...CAGAAAAGAGTCTGCCGCCTGCAGCAACAGGGC

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2447 CTGGAGCTGATGGGCAGCCTGCGCCACCCTGGATCACCGTCACTCGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149294 CTGGAGCTGATGGGCAGCCTGCGCCACCCTGGATCACCGTCACTCGGCAG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2497 AAGCGGAGGGGGACCTTGGACCAGCCACCCAACCAGGAAGACAAGCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149344 AAGCGGAGGGGGACCTTGGACCAGCCACCCAACCAGGAAGACAAGCCTGG

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2547 GGCACGGACCCTGAAGTCTGAACCAGGAAAGCAAGCCAAGGTGCCCGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149394 GGCACGGACCCTGAAGTCTGAACCAGGAAAGCAAGCCAAGGTGCCCGAGA

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2597 GAGGCCAG         GAGCCTGTGAAGCAAGCTGACTTTGTTCGCAGC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 149444 GAGGCCAGGTG...CAGGAGCCTGTGAAGCAAGCTGACTTTGTTCGCAGC

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2638 AAGTCTTTCCTGATAACCCCTGTGAAGCCCGCTGTGGACCGGAAGCAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150570 AAGTCTTTCCTGATAACCCCTGTGAAGCCCGCTGTGGACCGGAAGCAGGG

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2688 GGCAAAGCTCAACTTCAAGGAGGGGCTGCAAAGAGGAATCTCATTGTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150620 GGCAAAGCTCAACTTCAAGGAGGGGCTGCAAAGAGGAATCTCATTGTCCC

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2738 ATCAGAACTTGG         CTCAGTCTGCAGTGATGATGGAGAAGGAA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 150670 ATCAGAACTTGGGTA...CAGCTCAGTCTGCAGTGATGATGGAGAAGGAA

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2779 CTGCATCAGCTGAAGAGAGCCAGTTATGCCAGTACAGATCAGCCATCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152159 CTGCATCAGCTGAAGAGAGCCAGTTATGCCAGTACAGATCAGCCATCCTG

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2829 GATGGAACTTGCCAGAAAGAAATCTCAAGCTTGGAGTGACATGCCCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152209 GATGGAACTTGCCAGAAAGAAATCTCAAGCTTGGAGTGACATGCCCCAGA

   2950     .
   2879 TTATAAAA
        ||||||||
 152259 TTATAAAA

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