seq1 = pF1KE2619.tfa, 1368 bp
seq2 = pF1KE2619/gi568815590r_65619293.tfa (gi568815590r:65619293_65888941), 269649 bp

>pF1KE2619 1368
>gi568815590r:65619293_65888941 (Chr8)

(complement)

1-60  (100001-100060)   100% ->
61-121  (106099-106159)   100% ->
122-205  (109139-109222)   100% ->
206-357  (141139-141290)   100% ->
358-421  (143472-143535)   100% ->
422-517  (149345-149440)   100% ->
518-618  (154048-154148)   100% ->
619-750  (161641-161772)   100% ->
751-842  (161976-162067)   100% ->
843-987  (164021-164165)   100% ->
988-1087  (164591-164691)   98% ->
1088-1165  (165324-165401)   100% ->
1166-1368  (169447-169649)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGAATTACATTGATCTGGTGTCTGGCCTTGGTTCTTATCAAGTGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGAATTACATTGATCTGGTGTCTGGCCTTGGTTCTTATCAAGTGGAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CACCTCTAAG         AGGCGTGGAGCTATTTCCTATGACAGTTCTG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CACCTCTAAGGTA...TAGAGGCGTGGAGCTATTTCCTATGACAGTTCTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ATCAGACTGCATTATACATTCGTATGCTAG         GAGATGTACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 106130 ATCAGACTGCATTATACATTCGTATGCTAGGTA...CAGGAGATGTACGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 GTAAGGAGCCGAGCAGGATTTGAATCAGAAAGAAGAGGTTCTCACCCATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109150 GTAAGGAGCCGAGCAGGATTTGAATCAGAAAGAAGAGGTTCTCACCCATA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TATTGATTTTCGTATTTTCCACT         CTCAATCTGAAATTGAAG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 109200 TATTGATTTTCGTATTTTCCACTGTA...CAGCTCAATCTGAAATTGAAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 TGTCTGTCTCTGCAAGGAATATCAGAAGGCTACTAAGTTTCCAGCGATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141157 TGTCTGTCTCTGCAAGGAATATCAGAAGGCTACTAAGTTTCCAGCGATAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 CTTAGATCTTCACGCTTTTTTCGTGGTACTGCGGTTTCAAATTCCCTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141207 CTTAGATCTTCACGCTTTTTTCGTGGTACTGCGGTTTCAAATTCCCTAAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CATTTTAGATGATGATTATAATGGACAAGCCAAG         TGTATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 141257 CATTTTAGATGATGATTATAATGGACAAGCCAAGGTG...CAGTGTATGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 TGGAAAAAGTTGGAAATTGGAATTTTGATATCTTTCTATTTGATAGACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143479 TGGAAAAAGTTGGAAATTGGAATTTTGATATCTTTCTATTTGATAGACTA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 ACAAATG         GAAATAGTCTAGTAAGCTTAACCTTTCATTTATT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143529 ACAAATGGTA...TAGGAAATAGTCTAGTAAGCTTAACCTTTCATTTATT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 TAGTCTTCATGGATTAATTGAGTACTTCCATTTAGATATGATGAAACTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149379 TAGTCTTCATGGATTAATTGAGTACTTCCATTTAGATATGATGAAACTTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 GTAGATTTTTAG         TTATGATTCAAGAAGATTACCACAGTCAA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 149429 GTAGATTTTTAGGTA...CAGTTATGATTCAAGAAGATTACCACAGTCAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 AATCCTTACCATAACGCAGTCCACGCTGCGGATGTTACTCAGGCCATGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154077 AATCCTTACCATAACGCAGTCCACGCTGCGGATGTTACTCAGGCCATGCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 CTGTTACTTAAAGGAACCTAAG         CTTGCCAATTCTGTAACTC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 154127 CTGTTACTTAAAGGAACCTAAGGTA...CAGCTTGCCAATTCTGTAACTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    638 CTTGGGATATCTTGCTGAGCTTAATTGCAGCTGCCACTCATGATCTGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161660 CTTGGGATATCTTGCTGAGCTTAATTGCAGCTGCCACTCATGATCTGGAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 CATCCAGGTGTTAATCAACCTTTCCTTATTAAAACTAACCATTACTTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161710 CATCCAGGTGTTAATCAACCTTTCCTTATTAAAACTAACCATTACTTGGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 AACTTTATACAAG         AATACCTCAGTACTGGAAAATCACCACT
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 161760 AACTTTATACAAGGTT...TAGAATACCTCAGTACTGGAAAATCACCACT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 GGAGATCTGCAGTGGGCTTATTGAGAGAATCAGGCTTATTCTCACATCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162004 GGAGATCTGCAGTGGGCTTATTGAGAGAATCAGGCTTATTCTCACATCTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 CCATTAGAAAGCAG         GCAACAAATGGAGACACAGATAGGTGC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 162054 CCATTAGAAAGCAGGTA...CAGGCAACAAATGGAGACACAGATAGGTGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    870 TCTGATACTAGCCACAGACATCAGTCGCCAGAATGAGTATCTGTCTTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164048 TCTGATACTAGCCACAGACATCAGTCGCCAGAATGAGTATCTGTCTTTGT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 TTAGGTCCCATTTGGATAGAGGTGATTTATGCCTAGAAGACACCAGACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164098 TTAGGTCCCATTTGGATAGAGGTGATTTATGCCTAGAAGACACCAGACAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 AGACATTTGGTTTTACAG         ATGGCTTTGAAATGTGCTGATAT
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 164148 AGACATTTGGTTTTACAGGTA...TAGATGGCTTTGAAATGTGCTGATAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1011 TTGTAACCCATGTCGGACGTGGGAATTAAGCAAGCAGTGGAGTGAAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164614 TTGTAACCCATGTCGGACGTGGGAATTAAGCAAGCAGTGGAGTGAAAAAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1061 TAACGGAGGAATTCTTCCATCAAGG AG         ATATAGAAAAAAA
        |||||||||||||||||||||||||-| >>>...>>>|||||||||||||
 164664 TAACGGAGGAATTCTTCCATCAAGGCAAGTT...GAGATATAGAAAAAAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 ATATCATTTGGGTGTGAGTCCACTTTGCGATCGTCACACTGAATCTATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165337 ATATCATTTGGGTGTGAGTCCACTTTGCGATCGTCACACTGAATCTATTG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 CCAACATCCAGATTG         GTTTTATGACTTACCTAGTGGAGCCT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 165387 CCAACATCCAGATTGGTA...AAGGTTTTATGACTTACCTAGTGGAGCCT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192 TTATTTACAGAATGGGCCAGGTTTTCCAATACAAGGCTATCCCAGACAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169473 TTATTTACAGAATGGGCCAGGTTTTCCAATACAAGGCTATCCCAGACAAT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1242 GCTTGGACACGTGGGGCTGAATAAAGCCAGCTGGAAGGGACTGCAGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169523 GCTTGGACACGTGGGGCTGAATAAAGCCAGCTGGAAGGGACTGCAGAGAG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1292 AACAGTCGAGCAGTGAGGACACTGATGCTGCATTTGAGTTGAACTCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169573 AACAGTCGAGCAGTGAGGACACTGATGCTGCATTTGAGTTGAACTCACAG

   1450     .    :    .    :    .
   1342 TTATTACCTCAGGAAAATCGGTTATCA
        |||||||||||||||||||||||||||
 169623 TTATTACCTCAGGAAAATCGGTTATCA